Herbario de la Universidad de Granada: Colección GDA-Fanerogamia

Study Extent

La mayoría de los ejemplares de esta colección proceden de las recolecciones llevadas a cabo en Andalucía oriental, principalmente en las provincias de Granada y Almería y en menor medida en Jaén y Málaga, completándose con el resto de Andalucía. También componen dicha colección otras recolecciones del resto de España, Portugal y norte de Marruecos. Procedentes de cesiones, intercambios de material con otras instituciones o investigadores o la adquisición de exsiccatas, se tiene representación de algunos países europeos, y del Mediterráneo que amplían la cobertura natural de la colección.

Sampling

Los ejemplares que componen esta colección proceden, en su gran mayoría, de las recolecciones que tradicionalmente han realizado los investigadores del departamento de Botánica de la Universidad de Granada, empleando técnicas de muestreo adecuadas al grupo, punto de muestreo y a los objetivos perseguidos con la colecta, aunque sí son coincidentes en los métodos empleados para la recolección y secado de ejemplares de plantas vasculares y su posterior tratamiento curatorial. Desde principios de este siglo, también se han incorporado materiales procedentes de las campañas de herborización realizadas por el personal del herbario y por los componentes del grupo de investigación en su compromiso de ampliación y mejora de los fondos, de su representación taxonómica y geográfica. Sin embargo, no hay que olvidar que durante la primera mitad del siglo XX se produjo una importante incorporación de exsiccatas y de materiales de intercambios con otras instituciones o investigadores. De igual forma, cabe destacar que una pequeña muestra de sus fondos procede de la cesión del Herbario de la Sociedad Malagueña de Ciencias (H.S.M.S.) a la cátedra de Botánica de la Facultad de Farmacia donde quedó depositada para su estudio por L. Bellón y Laza Palacios, y más tarde fue incluida en la sección GDA. Entre éstos destaca una pequeña colección de Simón de Rojas Clemente y Rubio y otros botánicos del siglo XIX que se corresponden con los ejemplares más antiguos del Herbario GDA.

Quality Control

La calidad de los datos taxonómicos tradicionalmente se ha visto reforzada por las revisiones de los investigadores del departamento de Botánica y, entre finales del siglo XX y la actualidad, por las revisiones realizadas por investigadores de diversas instituciones como base de estudios para la publicación de floras nacionales y regionales tales como «Flora iberica» (Castroviejo S., coord. gen., 1986-2021), recientemente concluida, y «Flora vascular de Andalucía oriental» (Blanca G. et al. eds., 2009). Para asegurar la calidad de los datos incorporados en el juego de datos se ha llevado a cabo la limpieza previa de las bases de datos, haciendo especial hincapié en la revisión de nombres y autores de los táxones, de localidades y fechas. Se han eliminado los errores tipográficos y de formato que, durante los procesos de informatización y de migración entre los distintos software empleados, se hayan podido producir. En los últimos años, también se ha realizado la revisión de todas las colecciones del herbario con motivo de la detección y publicación de sus tipos nomenclaturales (Vizoso Paz 2019). En este sentido, se han detectado 571 tipos nomenclaturales, publicados en GBIF (https://doi.org/10.15470/k97bjm), de los cuales se actualizaron los datos referentes a las categorías de tipos y lugar de publicación.

Method steps

1. El Herbario de la Universidad de Granada acoge las colecciones procedentes del departamento de Botánica, de las Facultades de Ciencias y Farmacia de esta universidad, inicialmente surgieron como colecciones separadas con los acrónimos, validados por el Index Herbariorum, de GDAC y GDA, respectivamente. A partir de 2000 se produce la unificación de ambas colecciones en un único herbario que mantiene el acrónimo más antiguo (GDA) y que es la colección que sigue creciendo. La colección GDAC está cerrada pero mantiene su individualidad por lo que su consulta en el portal de datos de GBIF aparece en una URL (https://ipt.gbif.es/manage/metadata-methods.do?r=gdac-fanero) diferente a la de esta colección.
2. Informatización de la información de los ejemplares: ésta se inició en el año 1995 y desde entonces se ha desarrollado con diferentes software. Se inició con HERBARIO (Pando), luego pasó a ser digitalizada con SICIMA (Fajardo & Pérez, 2002), más tarde con HERBAR (Pando et al. 1994-2010) y finalmente fue migrada a ELYSIA (Pando et al. 2019).
3. Limpieza de la base de datos en ELYSIA: comprobación y limpieza de los nombres científicos utilizando los repositorios Flora iberica, Species 2000 & ITIS Catalogue of Life, así como de localidades, fechas, etc. Revisión y limpieza de los formatos de los distintos tipos de coordenadas para asegurar una correcta migración y conversión a coordenadas decimales. Revisión y adecuación del campo Camisa (que hace referencia a si el ejemplar está guardado bajo este nombre o no) para configurar la migración del juego de datos al formato DarwinCore.
4. Migración del conjunto de datos al formato DarwinCore: desde el formulario de Exportaciones de Elysia se configuró el archivo .mdb para su exportación al formato DarwinCore y se completó agregando algunos campos requeridos no existentes en la base de datos. Posteriormente, se validó con la herramienta Darwin Test (Ortega-Maqueda y Pando 2008) y se generó el Archivo Darwin Core.
5. Publicación del juego de datos en el Integrated Publishing Toolkit (IPT) de GBIF.es. Se incorporó el archivo generado en formato DarwinCore al IPT y se incorporaron directamente en esta herramienta los metadatos que describen el juego de datos.

Los ejemplares que componen esta colección se encuentran repartidos en 188 familias de las que unas 77 están representadas por más de 50 ejemplares. Para facilitar su análisis se han agrupado en táxones superiores siguiendo la clasificación establecida en Species 2000 & ITIS Catalogue of Life (Roskov 2017). La clase Magnoliopsida es la mejor representada con un 84% de los ejemplares, seguida de la clase Liliopsida con un 15% y la clase Pinopsida con un 1%. Sin embargo, las clases Gnetopsida, Ginkgoopsida y Cycadopsida, tienen una representación testimonial como corresponde a sus pocos representantes y falta de distribución en nuestra flora, salvo la familia Ephedraceae. Los órdenes con mayor representación son Asterales, Lamiales, Fabales, Poales, Caryophyllales y Brassicales y sus familias correspondientes Compositae (7419 ejemplares), Leguminosae (5988 ejemplares), Gramineae (3892), Lamiaceae (4551 ejemplares), Cruciferae (3530 ejemplares) y Caryophyllaceae (3320 ejemplares). Todas estas familias además de estar ampliamente representadas en nuestra flora, presentan numerosos géneros algunos de los cuales alcanzan una gran diversidad de especies en nuestro territorio. Éste es el caso de Centaurea, que es el representante de las asteráceas con mayor número de especies en la flora ibérica, aunque también los géneros Scorzonera, Senecio y Tragopogon destacan por el número de ejemplares que hay depositados en el herbario. Ononis, Astragalus, Trifolium y Anthyllis son los géneros de fabáceas más numerosos en ejemplares y éste último en especies. Entre las poáceas destacan Festuca, Bromus, Poa y Agrostis; entre las lamiáceas Teucrium, Sideritis y Thymus son los géneros más diversos en especies y con mayor número de ejemplares, igual que en las crucíferas lo son Alyssum, Erysimun y Biscutella, así como Silene, Arenaria y Cerastium en las cariofiláceas. Estas seis familias, todas ellas con más de 3000 ejemplares y una representación que va desde el 6 al 13%, componen casi la mitad de la colección. Sin embargo, también hay que destacar las familias Scrophulariaceae, Apiaceae, Ranunculaceae y Liliaceae que tienen una representación entre el 3 y 4%, y otras que también suponen un componente importante en esta colección, entre ellas Rosaceae, Boraginaceae, Cistaceae, Cyperaceae y Orchidaceae. El 25% de los ejemplares de esta colección pertenecen a otras 175 familias, algunas de ellas con muy pocos ejemplares al no ser de distribución ibérica o ser muy poco numerosas en géneros y especies o incluso ser monotípicas, sin embargo todas ellas contribuyen a ampliar el rango taxonómico de esta colección.

1. Plantae
   common name: plantas rank: kingdom
2. Tracheophyta
   rank: phylum
3. Magnoliopsida
   rank: class
4. Liliopsida
   rank: class
5. Pinopsida
   rank: class
6. Gnetopsida
   rank: class
7. Ginkgoopsida
   rank: class
8. Cycadopsida
   rank: class
9. Asterales
   rank: order
10. Lamiales
    rank: order
11. Fabales
    rank: order
12. Poales
    rank: order
13. Caryophyllales
    rank: order
14. Brassicales
    rank: order
15. Compositae
    rank: family
16. Leguminosae
    rank: family
17. Gramineae
    rank: family
18. Labiatae
    rank: family
19. Cruciferae
    rank: family
20. Caryophyllaceae
    rank: family
21. Umbelliferae
    rank: family
22. Scrophulariaceae
    rank: family
23. Liliaceae
    rank: family
24. Boraginaceae
    rank: family
25. Cistaceae
    rank: family
26. Ranunculaceae
    rank: family
27. Cyperaceae
    rank: family
28. Orchidaceae
    rank: family
29. Rosaceae
    rank: family
30. Papaveraceae
    rank: family
31. Rubiaceae
    rank: family
32. Euphorbiaceae
    rank: family
33. Chenopodiaceae
    rank: family
34. Amaryllidaceae
    rank: family
35. Campanulaceae
    rank: family
36. Geraniaceae
    rank: family
37. Saxifragaceae
    rank: family
38. Plumbaginaceae
    rank: family
39. Juncaceae
    rank: family
40. Solanaceae
    rank: family
41. Iridaceae
    rank: family
42. Plantaginaceae
    rank: family
43. Polygonaceae
    rank: family
44. Crassulaceae
    rank: family
45. Malvaceae
    rank: family
46. Valerianaceae
    rank: family
47. Resedaceae
    rank: family
48. Primulaceae
    rank: family
49. Gentianaceae
    rank: family
50. Salicaceae
    rank: family
51. Dipsacaceae
    rank: family
52. Linaceae
    rank: family
53. Convolvulaceae
    rank: family
54. Ericaceae
    rank: family
55. Caprifoliaceae
    rank: family
56. Thymelaeaceae
    rank: family
57. Violaceae
    rank: family
58. Polygalaceae
    rank: family
59. Urticaceae
    rank: family
60. Rhamnaceae
    rank: family
61. Guttiferae
    rank: family
62. Amaranthaceae
    rank: family
63. Cupressaceae
    rank: family
64. Onagraceae
    rank: family
65. Oleaceae
    rank: family
66. Fagaceae
    rank: family
67. Lythraceae
    rank: family
68. Rutaceae
    rank: family
69. Araceae
    rank: family
70. Aristolochiaceae
    rank: family
71. Zygophyllaceae
    rank: family
72. Aceraceae
    rank: family
73. Anacardiaceae
    rank: family
74. Santalaceae
    rank: family
75. Tamaricaceae
    rank: family
76. Potamogetonaceae
    rank: family
77. Verbenaceae
    rank: family
78. Orobanchaceae
    rank: family
79. Pinaceae
    rank: family
80. Aizoaceae
    rank: family
81. Asclepiadaceae
    rank: family
82. Cucurbitaceae
    rank: family
83. Frankeniaceae
    rank: family
84. Paeoniaceae
    rank: family
85. Ephedraceae
    rank: family
86. Oxalidaceae
    rank: family
87. Globulariaceae
    rank: family
88. Ulmaceae
    rank: family
89. Myrtaceae
    rank: family
90. Apocynaceae
    rank: family
91. Alismataceae
    rank: family
92. Capparaceae
    rank: family
93. Betulaceae
    rank: family
94. Berberidaceae
    rank: family
95. Loranthaceae
    rank: family
96. Dioscoreaceae
    rank: family
97. Moraceae
    rank: family
98. Callitrichaceae
    rank: family
99. Lauraceae
    rank: family
100. Celastraceae
     rank: family
101. Lentibulariaceae
     rank: family
102. Cneoraceae
     rank: family
103. Portulacaceae
     rank: family
104. Araliaceae
     rank: family
105. Buxaceae
     rank: family
106. Zannichelliaceae
     rank: family
107. Acanthaceae
     rank: family
108. Coriariaceae
     rank: family
109. Grossulariaceae
     rank: family
110. Vitaceae
     rank: family
111. Sparganiaceae
     rank: family
112. Taxaceae
     rank: family
113. Simaroubaceae
     rank: family
114. Aquifoliaceae
     rank: family
115. Lemnaceae
     rank: family
116. Tiliaceae
     rank: family
117. Juncaginaceae
     rank: family
118. Punicaceae
     rank: family
119. Ruppiaceae
     rank: family
120. Cornaceae
     rank: family
121. Elaeagnaceae
     rank: family
122. Droseraceae
     rank: family
123. Parnassiaceae
     rank: family
124. Phytolaccaceae
     rank: family
125. Rafflesiaceae
     rank: family
126. Bignoniaceae
     rank: family
127. Corylaceae
     rank: family
128. Haloragaceae
     rank: family
129. Typhaceae
     rank: family
130. Ceratophyllaceae
     rank: family
131. Myricaceae
     rank: family
132. Molluginaceae
     rank: family
133. Juglandaceae
     rank: family
134. Palmae
     rank: family
135. Pyrolaceae
     rank: family
136. Hippocastanaceae
     rank: family
137. Cannabaceae
     rank: family
138. Hydrangeaceae
     rank: family
139. Tropaeolaceae
     rank: family
140. Taxodiaceae
     rank: family
141. Empetraceae
     rank: family
142. Meliaceae
     rank: family
143. Myoporaceae
     rank: family
144. Sterculiaceae
     rank: family
145. Agavaceae
     rank: family
146. Balanophoraceae
     rank: family
147. Theligonaceae
     rank: family
148. Sapindaceae
     rank: family
149. Zosteraceae
     rank: family
150. Platanaceae
     rank: family
151. Casuarinaceae
     rank: family
152. Pittosporaceae
     rank: family
153. Nyctaginaceae
     rank: family
154. Magnoliaceae
     rank: family
155. Najadaceae
     rank: family
156. Posidoniaceae
     rank: family
157. Calycanthaceae
     rank: family
158. Elatinaceae
     rank: family
159. Bassellaceae
     rank: family
160. Hydrophyllaceae
     rank: family
161. Polemoniaceae
     rank: family
162. Balsaminaceae
     rank: family
163. Cactaceae
     rank: family
164. Theaceae
     rank: family
165. Proteaceae
     rank: family
166. Pontederiaceae
     rank: family
167. Ginkgoaceae
     rank: family
168. Passifloraceae
     rank: family
169. Menyanthaceae
     rank: family
170. Hydrocharitaceae
     rank: family
171. Ebenaceae
     rank: family
172. Martyniaceae
     rank: family
173. Hippuridaceae
     rank: family
174. Escalloniaceae
     rank: family
175. Butomaceae
     rank: family
176. Nymphaeaceae
     rank: family
177. Cycadaceae
     rank: family
178. Cannaceae
     rank: family
179. Adoxaceae
     rank: family
180. Buddlejaceae
     rank: family
181. Annonaceae
     rank: family
182. Cephalotaxaceae
     rank: family
183. Loganiaceae
     rank: family
184. Utriculariaceae
     rank: family
185. Eriocaulaceae
     rank: family
186. Bromeliaceae
     rank: family
187. Myrsinaceae
     rank: family
188. Rhizophoraceae
     rank: family
189. Hammamelidaceae
     rank: family
190. Aponogetonaceae
     rank: family
191. Styracaceae
     rank: family
192. Gesneriaceae
     rank: family
193. Staphyleaceae
     rank: family
194. Saururaceae
     rank: family
195. Menispermaceae
     rank: family
196. Commelinaceae
     rank: family
197. Monimiaceae
     rank: family
198. Clethaceae
     rank: family
199. Diapensiaceae
     rank: family
200. Nolanaceae
     rank: family
201. Nymphaceae
     rank: family
202. Cunoniaceae
     rank: family
203. Flacourtiaceae
     rank: family

Tan solo el 45% de esta colección se encuentra georreferenciada. El 84% de los fondos de la colección Fanerogamia son de procedencia española y ésta se completa con una pequeña representación del 6.7% originarias de Marruecos y un 2.6% de Portugal. Del resto, un 3% de los ejemplares no contiene información geográfica o los topónimos y localidades no se han podido ubicar correctamente. El 3% restante de las muestras corresponden a 37 países, de los cuales 15 países tienen una representación testimonial con menos de 5 ejemplares. Sin embargo, destacan Suecia, gracias a los aportes procedentes de la Academia Malagueña de Ciencias, Costa de Marfil por la donación de una colección de 364 orquídeas («Colección de Orquídeas de Costa de Marfil» cedida por el Dr. Francisco Pérez-Vera en 2005), Alemania, Francia, Italia, Rusia y Estados Unidos todos ellos con más de 100 ejemplares.
La colección contiene ejemplares de todas las provincias españolas, aunque su análisis corrobora claramente el carácter del herbario como referente de la flora de Andalucía oriental, una de las más ricas y diversas de la Península Ibérica. Más de la mitad de los ejemplares proceden de las provincias orientales entre las que destaca Granada, con casi la mitad de los ejemplares, seguida de Almería, Málaga y Jaén. Andalucía occidental, aunque con menor representación, también cuenta con un 2% de muestras para Cádiz y Huelva y con algo menos para Córdoba y Sevilla. El resto del territorio español también está bien representado y para casi todas las provincias se cuenta con más de 100 ejemplares.