Moluscos de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle (CRM-UV)

Study Extent

Pacífico colombiano y Caribe colombiano

Sampling

Los especímenes de moluscos son colectados manualmente en su mayoría. Luego se les realiza un tratamiento con agua dulce para relajar a los organismos (en caso de ser necesario), donde posteriormente son fijados en alcohol al 70% y son envasados o empaquetados, con al menos un recambio de alcohol en el laboratorio. Finalmente son identificados hasta el nivel taxonómico más bajo posible y se les asigna su respectivo numero de catalogo para el ingreso a la colección de referencia. Por otro lado, respecto al proceso de curaduría en general, se realizó recambio de alcohol al 70% y de etiquetas a los lotes que lo requirieron y se les asignó un número de catálogo único a cada uno de los 64 nuevos registros que se ingresaron a la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle (CRM-UV).

Quality Control

Se realizó una limpieza de datos inicial, completando y depurando toda la información de los registros biológicos en el formato DwC ver. 4.0. Se estandarizaron los datos de fechas y coordenadas usando las herramientas "Date parsing" y "Coordinate conversion" respectivamente, de la plataforma web Canadensys. Además, para completar los datos de georreferenciación, se utilizaron las herramientas "Google Earth Pro v.7.3.6.9285" y el "Geoportal de la división político-administrativa del DANE (Colombia)", apoyándose a su vez, en la información del sitio de colecta registrado en los lotes. Se realizó una verificación cruzada de todos los registros y se corrigieron errores de ortografía y tipografía, así como depuración de comas y dobles espacios, usando la herramienta OpenRefine 3.5.2. Finalmente, se rectificaron y corrigieron/actualizaron los nombres taxonómicos en los registros biológicos, usando la herramienta "Match Taxa" de la página web World Register of Marine Species (WoRMS).

Method steps

1. Curaduría de información: Recopilación de datos provenientes de los lotes
2. Asignación de nuevos números de catálogo a cada nuevo registro
3. Estructuración global de la información en el formato Darwin Core versión 4.0
4. Depuración y completitud de la información faltante en los registros biológicos
5. Limpieza de datos: de aspectos de forma (ortografía, tipografía, comas y dobles espacios), rectificación/corrección de coordenadas, fechas y nombres taxonómicos en los registros
6. Curaduría física: Para los nuevos registros, se realizó la identificación de los organismos hasta el nivel taxonómico más bajo posible (tarea realizada por la tesista Diana Valeria Gallego-Sánchez, el profesor Edgardo Londoño-Cruz y la bióloga-investigadora Bellineth Valencia Ramirez). Posteriormente, se realizaron etiquetas físicas nuevas con su respectivo número de catálogo (siguiendo el estándar de la Universidad del Valle), incluyendo la información correspondiente de cada nuevo lote. Finalmente, se ubicaron los lotes dentro de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle (CRM-UV), organizándolos taxonómicamente por familia.
7. Curaduría física: Para los registros antiguos, se corroboró el estado del alcohol, del recipiente y de las etiquetas, reemplazando cada elemento por uno en perfectas condiciones en caso de ser requerido. En caso de que los organismos se encontraran deteriorados o que no estuvieran presentes en el contenedor, se daban de baja o se reportaban como extraviados respectivamente en la base de datos (CRM-UV).

Los 2630 registros de moluscos de la colección de referencia, están representados taxonómicamente por 3 clases, 20 órdenes, 102 familias, 221 géneros, 342 especies y 1 subespecie.

1. Gastropoda
   common name: Gasteropodos rank: class
2. Bivalvia
   common name: Bivalvos rank: class
3. Polyplacophora
   common name: Chitones rank: class
4. Aplysiida
   rank: order
5. Arcida
   rank: order
6. Cardiida
   rank: order
7. Carditida
   rank: order
8. Cephalaspidea
   rank: order
9. Chitonida
   rank: order
10. Cycloneritida
    rank: order
11. Ellobiida
    rank: order
12. Lepetellida
    rank: order
13. Littorinimorpha
    rank: order
14. Lucinida
    rank: order
15. Myida
    rank: order
16. Nudibranchia
    rank: order
17. Ostreida
    rank: order
18. Pleurobranchida
    rank: order
19. Siphonariida
    rank: order
20. Systellommatophora
    rank: order
21. Trochida
    rank: order
22. Venerida
    rank: order

Este conjunto de datos posee información de los moluscos del Pacífico colombiano, abarcando las regiones marino-costeras de los departamentos del Cauca, Valle del Cauca, Chocó y Nariño. En adición, se cuentan con 16 registros del Caribe colombiano, correspondientes al departamento del Archipiélago de San Andrés, Providencia y Santa Catalina. Además se cuentan con 2 registros externos de Colombia, donde 1 proviene de la Provincia de Santa Elena en Ecuador y el otro proviene de California en Estados Unidos. Los rangos de profundidades están comprendidos desde los 0 metros (superficie) hasta los 100 metros (más profundo).