Registros de microbioma endófita aislada de semillas de cacaco de la región de Tumaco

Study Extent

Tumaco, Nariño

Sampling

El material vegetal seleccionado correspondió a siete materiales de cacao provenientes de Tumaco, Nariño: IMC67, TCS01 y TCS19 de la colección del C.I. El Mira, y el material regional AC9. De cada uno de estos materiales, se enviaron cacotas al C.I. Tibaitatá, en donde, primero, se hizo una desinfección externa de las cacotas, luego, se hizo un corte transversal en el centro para la extracción de las semillas, y se colectaron solo las semillas que se encontraban en el centro y no las de los extremos de las cacotas.

Quality Control

Todos los aislamientos se hicieron en condiciones asegurando la esterilidad. Se hicieron identificación morfológica y molecular.

Method steps

1. A partir de las semillas y de plántulas de los materiales IMC67, TCS01, TCS19 y AC9 previamente conservadas, se seleccionó una de cada material, la cual se maceró en condiciones de esterilidad en cabina de flujo laminar.
2. Posteriormente, se colectó aproximadamente 1 g de cada macerado para hacer diluciones seriadas hasta 10-5 a una razón de 1/10 en solución salina al 0.85%.
3. Se sembraron 100 μL de las diluciones 10-2 a 10-5 en placas Petri con los medios LB y agar nutritivo, cada uno por triplicado.
4. Se incubaron a 30 ºC y se hizo seguimiento a las 24, 48 y 72 h. Posteriormente se realizó una descripción macroscópica de los diferentes aislamientos identificados (forma, elevación, borde, tamaño, superficie, consistencia, aspecto y color), se tomó un inóculo de cada uno y se sembró por agotamiento en una nueva placa de Petri con el mismo medio en el cual se identificó.
5. Luego se llevaron a incubación como se mencionó anteriormente. Adicionalmente, se hizo Tinción de Gram y verde de malaquita a los morfotipos purificados, con el fin de determinar su pureza, morfología, tipo de pared celular y formación de esporas.

Veintitrés aislamientos de bacterias de diferentes géneros fueron aislados a partir de material de semillas de cacao. De estos 38 se determinaron hasta género, 2 hasta familia y 3 hasta reino. Los géneros que presentan mayor número de registros son Pseudomonas (16 registros), Bacillus (11 registros) y Pantoea (6 registros).

1. Bacillus
   rank: genus
2. Pseudomonas
   rank: genus
3. Pantoea
   rank: genus
4. Stenotrophomonas
   rank: genus
5. Priestia
   rank: genus
6. Staphylococcus
   rank: genus
7. Rhizobiaceae
   rank: family

Los frutos fueron colectados en la región de Tumaco Nariño. Se conservan en AGROSAVIA Kilómetro 14 Vía Mosquera Cundinamarca