This is a test site. The production site with full data is available at GBIF.org
{{nav.loginGreeting}}
  • Get data
      • Occurrences
      • GBIF API
      • Species
      • Datasets
      • Occurrence snapshots
      • Hosted portals
      • Trends
  • How-to
    • Share data

      • Quick-start guide
      • Dataset classes
      • Data hosting
      • Standards
      • Become a publisher
      • Data quality
      • Data papers
    • Use data

      • Featured data use
      • Citation guidelines
      • GBIF citations
      • Citation widget
      • Guides and documentation
  • Tools
    • Publishing

      • IPT
      • Data validator
      • GeoPick
      • New data model
      • GRSciColl
      • Suggest a dataset
      • Metabarcoding data toolkit
    • Data access and use

      • Hosted portals
      • Scientific collections
      • Data processing
      • Derived datasets
      • rgbif
      • pygbif
      • MAXENT
      • Tools catalogue
    • GBIF labs

      • Species matching
      • Name parser
      • Sequence ID
      • Relative observation trends
      • GBIF data blog
  • Community
    • Network

      • Participant network
      • Nodes
      • Publishers
      • Network contacts
      • Community forum
      • alliance for biodiversity knowledge
    • Volunteers

      • Mentors
      • Ambassadors
      • Translators
      • Citizen scientists
    • Activities

      • Capacity development
      • Programmes & projects
      • Training and learning resources
      • Data Use Club
      • Living Atlases
  • About
    • Inside GBIF

      • What is GBIF?
      • Become a member
      • Governance
      • Strategic framework
      • Work Programme
      • Funders
      • Partnerships
      • Release notes
      • Contacts
    • News & outreach

      • News
      • Subscribe
      • Events
      • Awards
      • Science Review
      • Data use
      • Thematic communities
  • User profile

Equinodermos de las Colecciones Biológicas de la Universidad del Magdalena

Dataset homepage

Citation

Pertuz L, Berben A, Quiroga S (2023). Equinodermos de las Colecciones Biológicas de la Universidad del Magdalena. Universidad del Magdalena. Occurrence dataset https://doi.org/10.15472/hujyqa accessed via GBIF.org on 2025-07-18.

Description

El presente conjunto de datos contiene a los equinodermos de las Colecciones Biológicas adscritas al Centro de Colecciones Científicas (CCC) de la Universidad del Magdalena. El recurso cuenta actualmente con 29 registros biológicos de especímenes que fueron recolectados en distintos puntos del Caribe colombiano entre los 2.5 y 150 metros de profundidad. El 73% de los lotes disponibles hasta el momento, provienen de proyectos desarrollados por la universidad y el restante (27%) de proyectos externos. Los especímenes están depositados bajo el acrónimo CBUMAG: ECH.

La colección de este grupo biológico fue documentada, digitalizada y publicada por primera vez durante la ejecución del proyecto BID-CA2020-055-NAC "Incremento de la accesibilidad de información marina de las Colecciones de Historia Natural de Colombia, mediante la movilización de datos, el fortalecimiento de la infraestructura y el entrenamiento". El presente conjunto de datos es el producto de dicho proceso realizado entre 2021-07-01 y 2023-06-30, como parte del entregable “Colección de biología marina del Centro de Colecciones Biológicas de la Universidad del Magdalena – CBUMAG” aportado por la UniMagdalena al proyecto.

This data set contains the echinoderms from the Biological Collections attached to the Center for Scientific Collections (CCC) of the Universidad del Magdalena. The resource currently has 29 biological records of specimens that were collected at different points in the Colombian Caribbean between 2.5 and 150 meters deep. 73% of the lots available to date come from projects developed by the university and the remaining (27%) from external projects. The specimens are deposited under the acronym CBUMAG: ECH.

The collection of this biological group was documented, digitized and published for the first time during the execution of the BID-CA2020-055-NAC project "Increasing the accessibility of marine information of the Natural History Collections of Colombia, through data mobilization, infrastructure strengthening and training". The present dataset is the product of that process carried out between 2021-07-01 and 2023-06-30, as part of the deliverable "Marine Biology Collection of the Biological Collections Center of the University of Magdalena - CBUMAG" contributed by UniMagdalena to the project.

Sampling Description

Study Extent

1. Isla de San Andrés, Archipiélago de San Andrés, Providencia y Santa Catalina 2. Isla de Providencia, Archipiélago de San Andrés, Providencia y Santa Catalina 3. Ciénaga, Magdalena 4. Santa Marta, Magdalena 5. Sitionuevo, Magdalena 6. Dibulla, La Guajira

Sampling

Los ejemplares obtenidos a través de distintos métodos de muestreo como: 1. Corazonador de 0.16 m y 20 cm de profundidad (5 corazonadores/estación) 3. Estructuras Autónomas de Monitoreo Arrecifal (ARMS) 4. Draga Van Veen (0.12 metros cuadrados) con esfuerzo de muestreo de 30min

Quality Control

Se ejecutaron distintos pasos como parte de las etapas de curaduría física y de la información asociada a los lotes de la colección. Se tuvieron en cuenta cuatro criterios para el control de calidad: Criterios curatoriales (verificación física del lote y su información), Criterios taxonómicos (validación taxonómica), Criterios espaciales (validación de georreferenciación), y Criterios documentales (estandarización DwC, siguiendo los lineamientos nacionales para datos marinos y costeros (OBiS Colombia y SiB Colombia) y los criterios requeridos por los sistemas globales (OBiS y GBIF). Durante la aplicación de cada uno de los criterios se utilizaron las herramientas recomendadas para optimizar los procesos de control de calidad (https://data.canadensys.net/tools/coordinates, https://www.marineregions.org/gazetteer.php?p=search, Google Earth Pro 2022, versión 7.3.6.9345, https://www.marinespecies.org, Open Refine, GBIF Data Validator).

Method steps

  1. Verificación de la existencia de datos
  2. Informe diagnóstico del estado inicial de la colección
  3. Realización de etiquetas
  4. Revisión de los lotes utilizando un estereoscopio
  5. Recambio de alcohol y de un frasco a tubo Eppendorf
  6. Agrupación de lotes por categorias taxonómicas (creación de anidadores)
  7. Digitalización de datos asociados a cada registro teniendo en cuenta las definiciones, vocabularios e instrucciones de la nueva plantilla Darwin Core 4.0
  8. Verificación de categoría taxonómico y estado del taxón
  9. Recuperación de información
  10. Conversión de coordenadas a través de herramientas como Canadensys
  11. Verificación de coordenadas utilizando Google Earth
  12. Correcciones dadas por la asistente de curaduría
  13. Control de calidad de los datos a través de Open Refine y GBIF Validator

Taxonomic Coverages

La Colección de Equinodermos está representada por ejemplares pertenecientes a 3 Clases, 6 Ordenes, 12 Familias, 1 Subfamilia, y 5 Géneros. Del total de lotes solo 2 se encuentran identificados hasta el nivel de especie.
  1. Echinodermata
    common name: Equinodermos rank: phylum
  2. Echinoidea
    rank: class
  3. Holothuroidea
    rank: class
  4. Ophiuroidea
    rank: class
  5. Amphilepidida
    rank: order
  6. Cidaroida
    rank: order
  7. Dendrochirotida
    rank: order
  8. Ophiacanthida
    rank: order
  9. Ophiurida
    rank: order
  10. Synallactida
    rank: order
  11. Amphiuridae
    rank: family
  12. Cidaridae
    rank: family
  13. Ophiacanthidae
    rank: family
  14. Ophiactidae
    rank: family
  15. Ophiocomidae
    rank: family
  16. Ophiodermatidae
    rank: family
  17. Ophiolepididae
    rank: family
  18. Ophionereididae
    rank: family
  19. Ophiotrichidae
    rank: family
  20. Ophiuridae
    rank: family
  21. Phyllophoridae
    rank: family
  22. Stichopodidae
    rank: family

Geographic Coverages

La colección incluye ejemplares del Caribe colombiano, recolectados en localidades de los siguientes departamentos: Magdalena, La Guajira y Archipiélago de San Andrés, Providencia, y Santa Catalina. Los individuos se encontraron en profundidades entre 8.5 a 150 metros y en hábitats como formaciones coralinas y fondos blandos, como parte del macrobentos.

Bibliographic Citations

  1. Rocío García-Urueña, Sven Zea, Hernando A. Hernández Hamón, Mirle Cabarcas Jiménez, Eliana M. Pineda Munive, Néstor E. Ardila Espitia, Arturo Acero Pizarro. 2021. El banco de las ánimas: valoración de su biodiversidad. Entre Contextos, 3: 53-55. - https://revistas.unimagdalena.edu.co/index.php/entretextos/article/view/4519

Contacts

Luciani Pertuz
originator
position: Pasante
Universidad del Magdalena
Carrera 32 #22-08 Edificio Centro de Colecciones Científicas
Santa Marta
470003
Magdalena
CO
Telephone: (605) 4381000
email: lucianipertuzam@unimagdalena.edu.co
userId: http://orcid.org/0000-0002-2003-3438
Amanda Berben
originator
position: Asistente de Curaduría
Universidad del Magdalena
Carrera 32 #22-08 Edificio Centro de Colecciones Científicas
Santa Marta
470003
Magdalena
CO
Telephone: (605) 4381000
email: aberben@unimagdalena.edu.co
userId: http://orcid.org/0000-0002-8005-1689
Sigmer Quiroga
originator
position: Curador
Universidad del Magdalena
Carrera 32 #22-08 Edificio Centro de Colecciones Científicas
Santa Marta
470003
Magdalena
CO
Telephone: (605) 4381000
email: sigmerquiroga@unimagdalena.edu.co
userId: http://orcid.org/0000-0002-3321-1360
Luciani Pertuz
metadata author
position: Pasante
Universidad del Magdalena
Carrera 32 #22-08 Edificio de Centro de Colecciones Científicas
Santa Marta
470003
Magdalena
CO
Telephone: (605) 4381000
email: lucianipertuzam@unimagdalena.edu.co
userId: http://orcid.org/0000-0002-2003-3438
Amanda Berben
metadata author
position: Asistente de Curaduría
Universidad del Magdalena
Carrera 32 #22-08 bloque 8 - Gorgona
Santa Marta
470004
Magdalena
CO
Telephone: (605) 4381000
email: aberben@unimagdalena.edu.co
userId: http://orcid.org/0000-0002-8005-1689
Rocío García
content provider
position: Docente
Universidad del Magdalena
Carrera 32 #22-08
Santa Marta
470003
Magdalena
CO
Telephone: 6054381000
email: rgarciau@unimagdalena.edu.co
userId: http://orcid.org/0000-0002-9667-3386
John Ortiz
content provider
position: Gerente
AQUABIOSFERA S.A.S.
Calle 115 No. 50-13. La Alhambra
Bogotá
110911
Cundinamarca
CO
Telephone: 57-1-3229080
email: contactenos@aquabiosfera.com
homepage: https://aquabiosfera.com/
Carlos Linero
content provider
position: Biológo
Universidad del Magdalena
Carrera 32 #22-08
Santa Marta
470003
Magdalena
CO
Telephone: (605) 4381000
userId: https://www.linkedin.com/profile/view?id=carlos-alberto-linero-rosado-3494a011a
Shirly Bello
content provider
position: Auxiliar de investigación
Universidad de Bogotá Jorge Tadeo Lozano
Carrera 2 # 11 - 68 Edificio Mundo Marino
Santa Marta
470004
Magdalena
CO
userId: http://orcid.org/0000-0002-3212-3553
Erika Montoya-Cadavid
reviewer
position: Data Manager OBiS Colombia, Investigadora científica
Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras - Invemar
Calle 25 # 2-55 - Rodadero - Playa Salguero
Santa Marta
470006
Magdalena
CO
email: erika.montoya@invemar.org.co
userId: http://orcid.org/0000-0002-9709-6787
Sigmer Quiroga
curator
position: Curador de invertebrados no insectos
Universidad del Magdalena
Carrera 32 #22-08 Edificio Centro de Colecciones Científicas
Santa Marta
470003
Magdalena
CO
Telephone: (605) 4381000
email: sigmerquiroga@unimagdalena.edu.co
userId: http://orcid.org/0000-0002-3321-1360
Luciani Pertuz
administrative point of contact
position: Pasante
Universidad del Magdalena
Carrera 32 #22-08 Edificio Centro de Colecciones Científicas
Santa Marta
470003
Magdalena
CO
Telephone: (605) 4381000
email: lucianipertuzam@unimagdalena.edu.co
userId: http://orcid.org/0000-0002-2003-3438
Roberto Guerrero
administrative point of contact
position: Director
Universidad del Magdalena
Carrera 32 #22-08 Edificio Centro de Colecciones Científicas
Santa Marta
470003
Magdalena
CO
Telephone: (605) 4381000
email: rguerrero@unimagdalena.edu.co
userId: http://orcid.org/0000-0003-3244-2754
Sigmer Quiroga
administrative point of contact
position: Curador
Universidad del Magdalena
Carrera 32 #22-08 Edificio de Centro de Colecciones Científicos
Santa Marta
470003
Magdalena
CO
Telephone: (605) 4381000
email: sigmerquiroga@unimagdalena.edu.co
userId: http://orcid.org/0000-0002-3321-1360
Amanda Berben
administrative point of contact
position: Asistente de Curaduría
Universidad del Magdalena
Carrera 32 #22-08 Edificio de Centro de Colecciones Científicas
Santa Marta
470003
Magdalena
CO
Telephone: (605) 4381000
email: aberben@unimagdalena.edu.co
userId: http://orcid.org/0000-0002-8005-1689
What is GBIF? API FAQ Newsletter Privacy Terms and agreements Citation Code of Conduct Acknowledgements
Contact GBIF Secretariat Universitetsparken 15 DK-2100 Copenhagen Ø Denmark
GBIF is a Global Core Biodata Resource