Microorganismos asociados a enfermedades del cultivo de quinua en el departamento del Cauca - Colombia

Study Extent

Municipios: Totoró y Bolívar. Departamento: Cauca

Sampling

Para realizar el muestreo se seleccionaron parcelas comerciales de quinua en diferentes estadios fenológicos del cultivo. En cada parcela comercial se realizó un recorrido en para el reconocimiento de síntomas y signos asociados a enfermedades. De cada síntoma observado se colectaron cinco muestras de tejido vegetal (raíz, hoja, tallo, panoja) con síntomas iniciales e intermedios.

Quality Control

Los datos de muestreo, calculo de incidencia y procesamiento de muestras en laboratorio se consignaron en la base de datos del proyecto.

Method steps

1. La selección de fincas productoras de quinua se realizó con el apoyo de líderes de asociaciones, funcionarios de Umata y secretaría de agricultura de Totoró y Bolívar, teniendo en cuenta criterios como accesibilidad a las fincas y la presencia de cultivos de quinua en los diferentes estadios fenológicos.
2. Se firmó formato de autorización de toma de muestras, donde se evidencia el consentimiento otorgado por el agricultor para que los colaboradores de AGROSAVIA lleven a cabo tanto el recorrido como la recolección de muestras. Adicionalmente se diligenció una encuesta que abordó temas como el manejo agronómico del cultivo, la capacidad del agricultor para reconocer enfermedades y las prácticas implementadas en su manejo.
3. Para la toma de las muestras y cálculo de incidencia de cada patología, se realizó un recorrido en zig-zag en la parcela, se tomaron muestras de tejido afectado (lesiones iniciales e intermedias), que se depositaron en bolsas de cierre hermético y se rotularon de acuerdo a la codificación definida por el equipo de trabajo. Todas las muestras se embalaron en neveras de icopor y se llevaron al laboratorio de microbiología agrícola del Centro de Investigación Palmira de AGROSAVIA.
4. De cada muestra se seleccionaron fragmentos de tejido afectado y se desinfectaron con etanol al 70%, hipoclorito de sodio al 1% y agua destilada estéril. Posteriormente se sembraron en medios de cultivo PDA y semiselectivos, se incubaron en oscuridad a temperatura ambiente. Cuando se observó crecimiento de colonias se procedió a realizar el aislamiento y purificación de los diferentes microorganismos y la observación al microscopio de sus estructuras para la respectiva identificación morfológica.

Todos los microorganismos del reino Fungi se clasificaron a nivel de género. Las bacterias se clasificaron a nivel de reino y se encuentran en proceso de identificación.

1. Peronospora
   common name: Peronospora rank: genus
2. Passalora
   common name: Passalora rank: genus
3. Cladosporium
   common name: Cladosporium rank: genus
4. Fusarium
   common name: Fusarium rank: genus

El muestreo se realizó en los municipios de Totoró y Bolívar, departamento del Cauca.