Microorganismos aislados de áreas para las conservación en Orinoquía y Magdalena medio del Piedemonte-Casanare y Magdalena Medio - Proyecto FIBRAS

doi:10.15472/jggknn

Microorganismos aislados de áreas para las conservación en Orinoquía y Magdalena medio del Piedemonte-Casanare y Magdalena Medio - Proyecto FIBRAS

Citation

Ecopetrol. S.A., Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (2023). Microorganismos aislados de áreas para las conservación en Orinoquía y Magdalena medio del Piedemonte-Casanare y Magdalena Medio - Proyecto FIBRAS. Ecopetrol S.A.. Occurrence dataset https://doi.org/10.15472/jggknn accessed via GBIF.org on 2024-12-13.

Description

Bajo el marco del convenio Fibras No. 19-155, entre el Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt y ECOPETROL S.A.S y la Universidad EAFIT, se llevó a cabo un muestreo de hongos. El muestreo se llevó a cabo entre marzo de 2021 y junio de 2021. E l presente conjunto de datos contiene un total de de 192 registros biológicos de bacterias distribuidos en 33 Familias, 30 géneros. La taxonomía se basó en los resultados obtenidos a partir de Silva; y para cada grupo a nivel genérico se emplearon claves o artículos científicos de Referencia.

Purpose

Aunar esfuerzos técnicos, administrativos y financieros entre el Instituto Alexander von Humboldt y la Universidad de los Andes para caracterizar la diversidad funcional de hongos y realizar la caracterización taxonómica y genética de hongos cultivables de las muestras ambientales, definidas por el supervisor del convenio por parte del Instituto, en el marco del Convenio No. 19-155 suscrito entre el Instituto Alexander von Humboldt y Ecopetrol S.A.

Sampling Description

Study Extent

Dentro de la región del Magdalena medio en el municipio de Barrancabermeja y en Aguazul en el departamento de Casanare dentro del Piedemonte Llanero.

Sampling

En el Magdalena medio se muestrearon 12 puntos y en el Casanare 9 puntos. En cada punto de muestreo se tomaron 3 réplicas en un transecto de 20 m y recogieron muestras de agua, suelo y sedimento.

Quality Control

Todas las muestras y procedimientos para el aislamiento y caracterización se realizaron bajo un modelo de investigación por triplicado. Además, para cada paso se aplicaron blancos o pruebas sin tratamientos para corroborar la inocuidad y éxito metodológico en campo y dentro del laboratorio.

Method steps

Toma de las muestras en campo: Manteniendo condiciones de esterilidad se tomaron muestras de agua suelo y sedimento en cada uno de los puntos de muestreo. Las muestra colectadas fueron transportadas en cadena de frío hasta su procesamiento en el laboratorio.
Procesamiento de las muestras ambientales: - Aislamiento de bacterias: Suelo y sedimento: Dilución y siembra en placa: Una muestra de suelo o sedimento (según corresponda), se suspendió en agua estéril y se procedió a diluir en una proporción de 1/10. Las diluciones 10e-1, 10e-3 y 10-5 se inocularon en cajas de agar R2A (0.5x).
Purificación de los aislamientos en cultivos axénicos: Siguiendo las recomendaciones básicas de bioseguridad en laboratorios de microbiología, las bacterias aisladas fueron aisladas de forma individual posterior a la confirmación de las características de colonia y celular. Se usaron medios generales de cultivo (R2A y TSB) y medios basales enriquecidos con crudo al 1%, para el aislamiento y caracterización de bacterias con potencial hidrocarbonoclasta.
Una vez se logró la corroboración de las características fenotípicas se procedió a los análisis moleculares para todos los aislamientos. La caracterización molecular para las bacterias se realizó a través de: la extracción de ADN ; amplificación del gen ribosomal 16s; la secuenciación por el método Sanger y la identificación taxonómica con Silva.

Taxonomic Coverages

Se obtuvo un total de 192 registros biológicos de bacterias distribuidos en 33 Familias, 30 generos. La taxonomía se basó en los resultados obtenidos a partir de Silva; y para cada grupo a nivel genérico se emplearon claves o artículos científicos de Referencia.

Bacillales
rank: order
Brevibacillales
rank: order
Burkholderiales
rank: order
Caulobacterales
rank: order
Enterobacterales
rank: order
Lactobacillales
rank: order
Micrococcales
rank: order
Paenibacillales
rank: order
Propionibacteriales
rank: order
Pseudomonadales
rank: order
Rhizobiales
rank: order
Rhodobacterales
rank: order
Sphingomonadales
rank: order
Staphylococales
rank: order
Streptomycetales
rank: order
Xanthomonadales
rank: order

Geographic Coverages

Zona de Magdalena medio en Santander (7°04′03″N, 73°50′50″W) y Piedemonte llanero en Casanare (5°10′08″N, 72°32′48″W).

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