Lista de especies representadas en las áreas protegidas de la Orinoquia Colombiana.

Study Extent

Áreas protegidas ubicadas en la cuenca del Orinoco Colombiano, Departamentos de Arauca, Guaviare, Casanare, Guainía, Meta, Vichada, Norte de Santander, Boyacá, Cundinamarca.

Sampling

La información utilizada fue producto de una recopilación de las bases de datos más importantes. Principalmente la información fue descargada del Visor de información Geográfica del Sistema de Información de Biodiversidad de Colombia que permite acceder a los registros biológicos consignados en varias instituciones.

Quality Control

Se hizo una revisión para eliminar duplicados de los registros y una depuración de los datos de tal forma que entraran dentro de la cuenca del Orinoco ya que no todos los departamentos entran completos en la cuenca. La información geográfica utilizada, se asoció con las figuras de conservación de la Orinoquia.

Method steps

1. La primera información fue descargada del Visor de información Geográfica del Sistema de Información de Biodiversidad de Colombia que permite acceder a los registros biológicos consignados en las siguientes instituciones: Instituto Humboldt, el Instituto de Ciencias Naturales, RNOA, Parientes Silvestres de organismos genéticamente modificados, Isagen, Corantioquia, Universidad Distrital Francisco José de Caldas, Colecciones del Instituto Humboldt, Jardín Botánico de Medellín, Asociación de Reservas Naturales de la Sociedad Civil, Asociación de Becarios del Casanare, Universidad del Valle, Selva: investigación para la conservación del Neotrópico y Plantas de Páramo de la Universidad de los Andes. La segunda parte de la información se descargó de la base de datos de Global Biodiversity Information Facility (GBIF). Por último se tomaron los datos de las especies de tortugas del libro de tortugas llamado “Biología y conservación de las tortugas continentales de Colombia”. Para el análisis de representatividad de especies, se sobrepusieron las diferentes capas de figuras de conservación que contaban con registros de especies, con el programa Arc View 9.3. se verificaron cuáles de las especies caen dentro de alguna figura de conservación del a Orinoquia. Para la eliminar incompatibilidades de la información obtenida se usó el programa R. Se hizo una unificación de los nombres diferentes de los departamentos, los espacios entre los nombres, y las mayúsculas y minúsculas para mayor compatibilidad con el programa. de los registros en la base de datos inicial se removieron los espacios vacíos (NAs) y duplicados entre los registros, finalmente se hizo un filtro teniendo en cuenta la consistencia de la información geográfica por departamento.
2. Se hizo un rastreo primario de la información técnica desarrollada por el Instituto en la región de la Orinoquia en la base de datos de contratación del IAvH, posteriormente se procedió a hacer un rastreo de ella en carpeta virtual de archivo disponible en el data center. Allí se identificaron documentos con información biológica clave a poner disponible a través del catalogador CEIBA. Para este conjunto de datos se extrajeron los registros de especies en áreas protegidas de la Orinoquia colombiana del documento word del contrato No. 12-12-024-058PS y se estructuraron en formato darwin core según plantilla de lista de especies de la I2D. Como parte de este proceso se utilizó la herramienta google refine y T-rex para la validación de nombres científicos. La obtención de la taxonomía superior y estatus taxonómico se hizo con el recurso catálogo de la vida, los LSID se obtuvieron de Ubio Namebank, los que no se encontraron en esta fuente se buscaron en otras fuentes especializadas. No se pudo obtener LSID para 15 especies, dado que estas no pudieron ubicarse en ninguna página o recurso especializado disponible en línea.

Se presentan 2122 registros de especies pertenecientes a 4 reinos Animalia (919 especies), Plantae (1109 especies), Fungi (67 especies), Bacteria (1 especies). La taxonomía superior y el estatus taxonómico se obtuvo del Catalogo de la vida y los LSID en su mayoría de Ubio NameBank, así como también de otros recursos especializados como Tropicos - Missouri Botanical Garden, Index to Organism Names, Index Fungorum, NCBI, GBIF, BioLib.cz. Ordenes de plantas: Alismatales,Andreaeales,Apiales,Aquifoliales,Arecales,Asparagales,Asterales,Boraginales,Brassicales,Bryales,Caryophyllales,Charales,Cucurbitales,Cyatheales,Dicranales,Dilleniales,Dioscoreales,Dipsacales,Equisetales,Ericales,Escalloniales,Fabales,Fissidentales,Funariales,Gentianales,Geraniales,Gleicheniales,Grimmiales,Hookeriales,Hymenophyllales,Hypnales,Isobryales,Isoetales,Jungermanniales,Lamiales,Laurales,Leucodontales,Liliales,Lycopodiales,Magnoliales,Malpighiales,Malvales,Marattiales,Marchantiales,Metzgeriales,Myrtales,Ophioglossales,Orthotrichales,Oxalidales,Pallaviciniales,Pandanales,Pelliales,Picramniales,Piperales,Poales,Polygonales,Polypodiales,Polytrichales,Porellales,Pottiales,Proteales,Ranunculales,Rosales,Santalales,Santales,Sapindales,Sapindales,,Saxifragales,Selaginellales,Seligerales,Solanales,Sphagnales,Vitales,Zingiberales Ordenes de animales: ,Accipitriformes,Anseriformes,Anura,Apodiformes,Artiodactyla,Characiformes,Charadriiformes,Chiroptera,Ciconiiformes,Clupeiformes,Coleoptera,Columbiformes,Coraciiformes,Craciformes,Crocodylia,Cuculiformes,Didelphimorphia,Diptera,Falconiformes,Galbuliformes,Galliformes,Gruiformes,Gymnotiformes,Hemiptera,Hymenoptera,Lepidoptera,Passeriformes,Pelecaniformes,Perciformes,Perissodactyla,Piciformes,Primates,Procellariiformes,Psittaciformes,Rhabdocoela,Rodentia,Siluriformes,Soricomorpha,Squamata,Strigiformes,Suliformes,Testudines,Tinamiformes,Trichoptera,Trogoniformes. Ordenes de hongos: Aphyllophorales,Arthoniales,Baeomycetales,Corticiales,Helotiales,Lecanorales,Ostropales,Peltigerales,Pertusariales,Teloschistales.

1. Sphagnopsida
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2. Actinopterygii
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3. Agaricomycetes
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4. Amphibia
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5. Andreaeopsida
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6. Arthoniomycetes
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7. Aves
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8. Bryopsida
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9. Charophyceae
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10. Equisetopsida
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11. Insecta
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12. Jungermanniopsida
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13. Lecanoromycetes
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14. Leotiomycetes
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15. Liliopsida
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16. Lycopodiopsida
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17. Magnoliopsida
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18. Mammalia
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19. Marattiopsida
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20. Marchantiopsida
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21. Polypodiopsida
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22. Psilotopsida
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23. Pteridophyta
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24. Reptilia
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25. Rhabditophora
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26. Sphagnopsida
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Áreas naturales protegidas ubicadas en la región de la Orinoquia, se presenta información de los PNN el Tuparro, Tinigua,Cocuy, Sumapaz, Chingaza, Pisba, Área de Manejo Especial de la Macarena, DMI Ariari-Guyabero, Reserva Nacional Natural Nukak, Puinawai,