Colecta de muestras fecales de primates (Atelidae y Cebidae) para la determinación de prevalencia de Plasmodium sp.
Citation
González C, Rondón S, Link A (2021). Colecta de muestras fecales de primates (Atelidae y Cebidae) para la determinación de prevalencia de Plasmodium sp.. Universidad de los Andes. Occurrence dataset https://doi.org/10.15472/ewldlr accessed via GBIF.org on 2024-10-07.Description
El presente estudio busca evaluar la prevalencia de Plasmodium sp. en tres especies de primates no humanos (Cebus albifrons, Ateles hybridus, Alouatta seniculus) y los vectores del género Anopheles asociados a la transmisión, en cuatro sitios con diferente grado de fragmentación, localizados a lo largo del Magdalena Medio. Se colectaron muestras fecales de los primates, a partir de las cuales se realizaron extracciones de ADN mediante el kit QIAamp DNA stool, PCR, electroforesis y secuenciación para identificación de Plasmodium sp. Adicionalmente se colectaron mosquitos del género Anopheles por medio de trampas CDC con atrayente, que fueron identificados taxonómicamente. Se seleccionaron las hembras para realizar extracción de ADN mediante el kit ZR Tissue &Insect DNA MiniPrep, PCR, electroforesis y secuenciación con el fin de llevar a cabo la identificación de Plasmodium sp. Este recurso contiene la información de 21 muetras (sangre y heces) de 3 especies de primates, colectadas en el año 2017 en los departamentos de Antioquia y Santander.Sampling Description
Study Extent
Las áreas donde se realizaron las colectas fueron en 4 sitios localizados a lo largo del valle del rio Magdalena, con diferente grado de fragmentación.Sampling
Se realizaron colectas de materia fecal de monos araña café (Ateles hybridus), monos cariblancos (Cebus albifrons), y monos aulladores rojos (Alouatta seniculus). Posterior a ello se realizó una extracción de ADN y una electroforesis en gel de agarosa.Method steps
- En primates no humanos: Se colectaron muestras fecales de monos araña café (Ateles hybridus), monos cariblancos (Cebus albifrons), y monos aulladores rojos (Alouatta seniculus). Las muestras se recogieron del suelo inmediatamente después de que los individuos defecaran, y se preservaron a temperatura ambiente en tubos Falcon con solución RNAlater.
- Extracción de ADN: para detección de patógenos a partir de las muestras fecales, mediante el kit QIAamp DNA stool con su respectivo protocolo QIAamp DNA Stool Handbook. PCR detección de Plasmodium sp.
- Electroforesis y Secuenciación: Se realizó PCR anidada, usando primers género-específicos en la primera amplificación y primers especie específicos para la segunda amplificación, para detección de Plasmodium falciparum, Plasmodium brasilianum y Plasmodium simium. En ambas reacciones se usó GoTaq Master Mix. Al obtener el producto final de PCR se realizaró electroforesis en gel de agarosa, las muestras positivas fueron sometidas a secuenciación.
Taxonomic Coverages
Los 21 registros corresponden a las familias de Atelidae y Cebidae, abarcando las especies Alouatta seniculus (11), Cebus versicolor (69) y Ateles hybridus (4).
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Alouatta seniculuscommon name: Mono aullador rank: species
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Ateles hybriduscommon name: Mono araña café rank: species
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Cebus versicolorcommon name: Mico rank: species
Geographic Coverages
La colecta de muestras fue llevada a cabo en la localidad de San Juan, municipio de Puerto Parra (Santander) y en la localidad de El Silencio en el municipio de Yondó (Antioquia).
Bibliographic Citations
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Andrés Link
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Camila González
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