Muestras de suelo de bosque nublado en Cundinamarca para su caracterización: diversidad taxonómica y ecológica mediante una aproximación metagenómica

Study Extent

El muestreo se realizó en el departamento de Cundinamarca, en los municipios de Guasca y Ubalá, específicamente en La Concepción (cerca a Potrerito), en la vereda Sión (cerca a la quebrada San José) y cerca a la inspección de Chuscales.

Sampling

Las muestras de suelo de bosque serán obtenidas de núcleos de suelo por medio de un Core Sampler kit, posteriormente se les extraerá el ADN y se obtendrá el Metagenóma del suelo mediante secuenciación con tecnología Ilumina. Esta información será analizada mediante bioinformática, obteniéndose resultados sobre la composición taxonómica del microbioma y el nivel de diversidad presente.

Method steps

1. Se espera obtener muestras de núcleo de suelo en tres bosques nublados: Cárpatos, Carpanta y de las zonas de bosque natural primario, vereda Sion, municipio de Ubalá. Las muestras serán tomadas con el AMS Core Mini Kit Sampler, Marca Forestry. Este equipo es de fácil transporte y almacenamiento y se utiliza de manera manual.
2. En cada uno de los sitios de interés se realizará la misma metodología de muestreo la cual se basará en transectos. Cada área de estudio contará con un área de muestreo según la reserva y el recorrido que se pueda realizar dentro de cada una.
3. La profundidad aproximada de toma de muestra será la capa inmediatamente inferior a la capa vegetal en descomposición. Los núcleos serán almacenados en aluminio para conservar su estructura.
4. En el sitio se tomarán las coordenadas, la temperatura y las profundidades exactas de toma de muestra. Finalmente se retornara el suelo a las condiciones iniciales y se proseguirá a la toma de muestra en el siguiente punto. Este procedimiento se seguirá para todos los transectos dentro de cada reserva.
5. 500 gramos de cada muestra serán entregados al laboratorio de análisis de suelos de la Universidad Nacional quienes medirán los siguientes parámetros físicos: pH, textura, densidad y los siguientes parámetros químicos: nitrógeno, capacidad de intercambio catiónico y fosforo. Asimismo, se entregara 500g en los laboratorios de Ingeniería Civil y Ambiental de la Universidad de los Andes dónde se medirá permeabilidad, carbono orgánico y humedad.
6. Finalmente se realizará extracción de ADN para cada muestra, se realizarán librería para secuenciación en Illumina y su secuenciación.

El muestreo se realizó en el departamento de Cundinamarca, en los municipios de Guasca y Ubalá, específicamente en La Concepción (cerca a Potrerito), en la vereda Sión (cerca a la quebrada San José) y cerca a la inspección de Chuscales.