Bacterias de la glándula mamaria bovina recolectadas en 11 fincas en el municipio de Pereira
Citation
Siller López F, Colonia Orozco A M, Siller López F R (2023). Bacterias de la glándula mamaria bovina recolectadas en 11 fincas en el municipio de Pereira. Universidad Libre. Occurrence dataset https://doi.org/10.15472/croz7l accessed via GBIF.org on 2024-09-01.Description
Este conjunto de datos es el resultado del procedimiento llevado a cabo para el establecimiento de un cepario de bacterias potenciales productoras de sustancias inhibitorias tipo bacteriocinas. Los datos presentados provienen del proyecto de investigación financiado por el Sistema General de Regalías “Identificación de bacteriocinas producidas por bacterias de la glándula mamaria con uso potencial para el tratamiento de mastitis bovina.” Correspondiente al Contrato de Acceso a Recursos Genéticos y sus Productos Derivados No 273 del 07 de noviembre de 2019 y con resolución de otorga No. 1887 del 20 de noviembre de 2019, suscrito entre el Ministerio de Ambiente y Desarrollo Sostenible y la Universidad Libre – Seccional Pereira. Este estudio tuvo como objetivo aislar bacterias productoras de bacteriocina a partir de muestras compuestas de leche de vaca, producir, purificar y caracterizar una bacteriocina con actividad contra los principales patógenos de mastitis. Se colectaron 275 muestras de leche de vacas en el Municipio de Pereira (Risaralda). El muestreo se realizó según lo recomendado por el Consejo Nacional de Mastitis (NMC, 2004). Las muestras de leche se evaluaron mediante pruebas bacteriológicas. Se inocularon 10 ml de leche sobre la superficie agar sangre con esculina y agar Edwards. Se incubaron y se realizó la lectura tanto a las 24 h como a las 48 h según los estándares del Consejo Nacional de Mastitis (NMC, 1999). Se seleccionaron y se criopreservaron cepas de estafilococos coagulasa negativos, Enterococcus spp. y Streptococcus spp. diferentes a Streptococcus agalactiae. Las cepas de bacterias acido lácticas (BAL) fueron aisladas mediante el método descrito por Espeche et al. (Espeche et al., 2012). Se extendieron100 ul de muestra de leche sobre la superficie de una placa de agar Man-Rogosa-Sharpe (MRS) y se incubaron a 37°C durante 48 h, con una atmósfera de 5% de CO2. Las colonias con diferentes características morfológicas fueron conservadas en caldo MRS con glicerol al 20% (v/v) y almacenadas a -80°C. De un total de 895 aislados bacterianos (bacterias del ácido láctico - LAB, estafilococos coagulasa negativos - SNC, Streptococcus spp. y Enterococcus spp.), 41 aislados mostraron la capacidad de producir sustancias inhibidoras tipo bacteriocina contra Staph. aureus y Strep. agalactiae. De los 41 aislados con actividad antimicrobiana frente a ambos patógenos de mastitis, se seleccionó el denominado 1096A por su alta capacidad de producción de bacteriocinas, que luego fue identificado como Staphylococcus agnetis tras la secuenciación del gen 16S rDNA.Sampling Description
Study Extent
La selección de predios se basó en un estudio realizado entre diciembre de 2013 y junio de 2014 por el grupo de Calidad de Leche y Epidemiología Veterinaria (CLEV) de la Universidad de Caldas, en el que se llevó a cabo el diagnóstico microbiológico en muestras de leche de tanque y cantina en predios pertenecientes al municipio de Pereira. Se preseleccionaron 25 predios distribuidos en las zonas 1 y 4, teniendo en cuenta que los tanques y cantinas de estas fincas presentaron una alta prevalencia de los patógenos de interés (Staphylococcus aureus y Streptococcus agalactiae) y a que se encontró un alto porcentaje de fincas positivas a estafilococos coagulasa negativos (CNS).Sampling
Los resultados de las pruebas microbiológicas permitieron hacer la selección de 11 predios, en cada uno de los cuales se eligieron 25 vacas al azar, con el fin de realizar la toma de muestras compuestas de leche durante el ordeño. El muestreo se realizó según lo recomendado por el Consejo Nacional de Mastitis. Las zonas de muestreo seleccionadas están distribuidas en las zonas 1 y 4 del municipio de Pereira.Method steps
- Aislamiento de cepas de campo de Staphylococcus aureus y Streptococcus agalactiae: Las muestras de leche se evaluaron mediante pruebas bacteriológicas. Se inocularon 10 µl de leche sobre la superficie de media placa de agar sangre con esculina y media placa de agar Edwards. Se incubaron durante 48 h a 37°C, realizando la identificación tanto a las 24 h como a las 48 h según los estándares del Consejo Nacional de Mastitis (14). Staphylococcus aureus y Staphylococcus spp. fueron identificados por su patrón hemolítico, prueba de coagulasa y catalasa. Streptococcus agalactiae, fueron identificados por su perfil de hidrólisis de esculina y la prueba de CAMP (esquema de identificación presentado en la figura 2). Las cepas de Staphylococcus aureus y Streptococcus agalactiae fueron criopreservadas en caldo con glicerol al 10%, hasta la evaluación de la actividad antimicrobiana sobre cepas de campo.
- Se seleccionaron y criopreservaron cepas de CNS, Enterococcus spp. y Streptococcus spp. diferentes a Streptococcus agalactiae. Las cepas de bacterias acido lácticas (BAL) fueron aisladas mediante el método descrito por Lee & Lee. Se cultivaron 100 µl de muestra de leche sobre la superficie de una placa de agar Man-Rogosa-Sharpe con azul de bromofenol (BPB-MRS) y se incubaron a 37°C durante 48 h, con una atmósfera de 5% de CO2. Las colonias con diferentes características morfológicas fueron conservadas en caldo MRS con glicerol al 10% (v/v) y almacenadas a -80°C.
- La información sobre los aislamientos bacterianos obtenidos en las secciones fue registrada en una base de datos con la siguiente información: código de identificación de la vaca, código de bacteria aislada, fecha de cultivo, código de identificación de la muestra, fecha de almacenamiento de la bacteria y observaciones. Se asignaron códigos alfa numéricos para la discriminación de los diferentes aislamientos de acuerdo a los grupos de interés. Para tal fin, se designó un código de cuatro dígitos identificador de cada vaca muestreada en las diferentes fincas visitadas, seguidamente fueron dispuestas letras para discriminar las cepas aisladas de cada una de las cajas de siembra y un número final para identificar los grupos bacterianos, siendo el número 1 el código identificador de S. agalactiae, 2 para Streptococcus spp., 3 para S. aureus, 4 para Staphylococcus coagulasa negativos (CNS), 34 para Streptococcus uberis, 36 para Enterococcus spp y 37 para las bacterias ácido lácticas (BAL). De esta manera, un microorganismo con código identificador 1050C-37 corresponderá a la tercera cepa ácido láctica aislada de la Vaca 1050 en la Finca 1.
Taxonomic Coverages
Este conjunto de datos comprende 1.065 registros biológicos del reino Bacteria. Se encuentran distribuidos en 2 ordenes, 3 familias, 3 géneros y 3 especies. Un 51% está clasificado a nivel de orden, 27% a género y 20% a especie.
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Enterococcusrank: genus
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Staphylococcusrank: genus
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Streptococcusrank: genus
Geographic Coverages
Las muestras se tomaron en 11 predios en el municipio de Pereira, Risaralda.
Bibliographic Citations
- (U.S.) NMC. Microbiological Procedures for the Diagnosis of Bovine Udder Infection and Determination of Milk Quality [Internet]. NMC; 2004. Available from: https://books.google.com.co/books?id=DXsPHQAACAAJ -
- Lee HM, Lee Y. A differential medium for lactic acid-producing bacteria in a mixed culture. Lett Appl Microbiol [Internet]. 2008 Jun [cited 2018 May 2];46(6):676–81. Available from: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18444977 -
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