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Código de barras de ejemplares de la Colección Nacional de Mamíferos del Instituto de Biología, UNAM

Dataset homepage

Citation

Cervantes Reza F A, Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad C (2020). Código de barras de ejemplares de la Colección Nacional de Mamíferos del Instituto de Biología, UNAM. Version 1.7. Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/wso3fw accessed via GBIF.org on 2021-06-18.

Description

El propósito de este proyecto es contribuir a la obtención de información genética de especies mexicanas de mamíferos que permita su identificación específica y a la construcción del catálogo de código de barras de los mamíferos mexicanos. Estos esfuerzos comprenden los ejemplares de la Colección Nacional de Mamíferos (CNMA) del Instituto de Biología, UNAM, institución miembro de la Red MexBol, de los que se procesarán muestras de tejidos congelados para la secuenciación del gen mitocondrial citocromo oxidasa subunidad I de acuerdo con protocolos estandarizados sugeridos por el IBOL. La muestra a examinar comprende 250 ejemplares de 40 especies de diversas regiones geográficas de México. La extracción de ADN se hará por medio de kits comerciales, la amplificación del fragmento del Citocromo Oxidasa I se efectuará por la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) utilizando primer específicos, la purificación de los productos de PCR y la secuenciación de sus nucleótidos en un secuenciador automatizado. Las secuencias serán editadas, alineadas y comparadas con resultados reportados en la literatura. También se producirán fotografias o ilustraciones de los ejemplares secuenciados que se acompañarán de sus datos de colecta. Finalmente, estos resultados con los códigos de barras serán incorporados a la base de datos del Sistema Bold en un período de 12 meses.

Reino: 1 Filo: 1 Clase: 1 Orden: 6 Familia: 13 Género: 40 Subgénero: 1 Especie: 78

Taxonomic Coverages

Reino: Animalia Filo: Chordata Clase: Mammalia Orden: Didelphimorphia, Carnivora, Rodentia, Soricomorpha, Chiroptera, Lagomorpha Familia: Didelphidae, Mephitidae, Cricetidae, Soricidae, Procyonidae, Phyllostomidae, Geomyidae, Leporidae, Felidae, Ursidae, Vespertilionidae, Mustelidae, Canidae
  1. Animalia
    rank: kingdom
  2. Chordata
    rank: phylum
  3. Mammalia
    rank: class
  4. Didelphimorphia
    rank: order
  5. Carnivora
    rank: order
  6. Rodentia
    rank: order
  7. Soricomorpha
    rank: order
  8. Chiroptera
    rank: order
  9. Lagomorpha
    rank: order
  10. Didelphidae
    rank: family
  11. Mephitidae
    rank: family
  12. Cricetidae
    rank: family
  13. Soricidae
    rank: family
  14. Procyonidae
    rank: family
  15. Phyllostomidae
    rank: family
  16. Geomyidae
    rank: family
  17. Leporidae
    rank: family
  18. Felidae
    rank: family
  19. Ursidae
    rank: family
  20. Vespertilionidae
    rank: family
  21. Mustelidae
    rank: family
  22. Canidae
    rank: family
  23. Didelphis
    rank: genus
  24. Spilogale
    rank: genus
  25. Conepatus
    rank: genus
  26. Microtus
    rank: genus
  27. Nelsonia
    rank: genus
  28. Peromyscus
    rank: genus
  29. Cryptotis
    rank: genus
  30. Sorex
    rank: genus
  31. Megasorex
    rank: genus
  32. Bassariscus
    rank: genus
  33. Tylomys
    rank: genus
  34. Reithrodontomys
    rank: genus
  35. Marmosa
    rank: genus
  36. Carollia
    rank: genus
  37. Cratogeomys
    rank: genus
  38. Sylvilagus
    rank: genus
  39. Lepus
    rank: genus
  40. Panthera
    rank: genus
  41. Leopardus
    rank: genus
  42. Osgoodomys
    rank: genus
  43. Ursus
    rank: genus
  44. Felis
    rank: genus
  45. Puma
    rank: genus
  46. Hodomys
    rank: genus
  47. Philander
    rank: genus
  48. Tlacuatzin
    rank: genus
  49. Mephitis
    rank: genus
  50. Myotis
    rank: genus
  51. Sturnira
    rank: genus
  52. Romerolagus
    rank: genus
  53. Xenomys
    rank: genus
  54. Neotoma
    rank: genus
  55. Baiomys
    rank: genus
  56. Lynx
    rank: genus
  57. Procyon
    rank: genus
  58. Rheomys
    rank: genus
  59. Mustela
    rank: genus
  60. Vulpes
    rank: genus
  61. Taxidea
    rank: genus
  62. Canis
    rank: genus
  63. Pedomys
    rank: subgenus
  64. Didelphis virginiana
    common name: tlacuache norteño, tlacuache común, tlacuache, tlacuache cola pelada rank: species
  65. Spilogale putorius
    common name: zorrillo manchado común, zorrillo manchado rank: species
  66. Didelphis marsupialis
    common name: tlacuache sureño, tlacuache común, tlacuache, zarigüeya rank: species
  67. Conepatus leuconotus
    common name: zorrillo narigón occidental, zorrillo rank: species
  68. Spilogale gracilis
    common name: zorrillo manchado rank: species
  69. Microtus mexicanus
    common name: meteoro mexicano, meteoro, meteorito, ratón de alfalfar rank: species
  70. Nelsonia neotomodon
    common name: rata cambalachera diminuta, rata rank: species
  71. Peromyscus aztecus
    common name: ratón azteca, ratón de campo rank: species
  72. Cryptotis alticola
    common name: musaraña rank: species
  73. Sorex saussurei
    common name: musaraña de Saussure, musaraña rank: species
  74. Cryptotis mayensis
    common name: musaraña orejillas parda, musaraña rank: species
  75. Megasorex gigas
    common name: musaraña desértica sureña, musaraña rank: species
  76. Bassariscus astutus
    common name: cacomixtle, cacomixtle norteño, tejón rank: species
  77. Tylomys nudicaudus
    common name: rata trepadora de Peter, rata arborícola rank: species
  78. Reithrodontomys mexicanus
    common name: ratón cosechero mexicano, ratón de campo rank: species
  79. Reithrodontomys chrysopsis
    common name: ratón cosechero de volcán, ratón de campo rank: species
  80. Marmosa mexicana
    common name: ratón tlacuache, tlacuache ratón, tlacuache ratón mexicano rank: species
  81. Cryptotis obscura
    common name: musaraña rank: species
  82. Sorex oreopolus
    common name: musaraña coluda mexicana, musaraña rank: species
  83. Carollia sowelli
    common name: murciélago rank: species
  84. Cratogeomys zinseri
    common name: tuza de Lagos de Moreno, tuza rank: species
  85. Microtus oaxacensis
    common name: meteoro de Tarabundí, meteoro, meteorito, ratón de alfalfar rank: species
  86. Sylvilagus mansuetus
    common name: conejo de isla San José rank: species
  87. Peromyscus melanophrys
    common name: ratón de meseta, ratón de campo rank: species
  88. Peromyscus levipes
    common name: ratón de La Malinche, ratón de campo rank: species
  89. Cryptotis parva
    common name: musaraña orejillas mínima, musaraña rank: species
  90. Lepus callotis
    common name: liebre torda, liebre rank: species
  91. Cryptotis nelsoni
    common name: musaraña rank: species
  92. Panthera onca
    common name: jaguar, tigre rank: species
  93. Microtus umbrosus
    common name: meteoro de Zempoaltepec, meteoro, meteorito, ratón de alfalfar rank: species
  94. Leopardus pardalis
    common name: ocelote rank: species
  95. Cryptotis goldmani
    common name: musaraña, musaraña orejillas de Goldman rank: species
  96. Osgoodomys banderanus
    common name: rata arrocera, ratón michoacano rank: species
  97. Ursus americanus
    common name: oso negro, oso negro americano rank: species
  98. Felis catus
    rank: species
  99. Lepus insularis
    common name: liebre negra rank: species
  100. Puma concolor
    common name: león de montaña, puma rank: species
  101. Lepus flavigularis
    common name: liebre de Tehuantepec, liebre, liebre tropical rank: species
  102. Hodomys alleni
    common name: rata cambalachera de Allen, tuza rank: species
  103. Sylvilagus floridanus
    common name: conejo, conejo serrano rank: species
  104. Cryptotis peregrina
    common name: musaraña rank: species
  105. Philander opossum
    common name: tlacuache cuatrojos gris, tlacuache cuatro ojos rank: species
  106. Cryptotis mexicana
    common name: musaraña orejillas mexicana, musaraña rank: species
  107. Tlacuatzin canescens
    common name: tlacuache ratón gris, ratón tlacuache, tlacuachín rank: species
  108. Mephitis macroura
    common name: zorrillo listado del sur, zorrillo listado rank: species
  109. Sorex veraepacis
    common name: musaraña de Verapaz, musaraña rank: species
  110. Myotis occultus
    common name: murciélago rank: species
  111. Peromyscus gratus
    common name: ratón de campo, ratón, ratón de Tlalpan, ratón piñonero rank: species
  112. Sturnira lilium
    rank: species
  113. Reithrodontomys fulvescens
    common name: ratón cosechero leonado, ratón de campo rank: species
  114. Sylvilagus audubonii
    common name: conejo, conejo del desierto rank: species
  115. Lepus californicus
    common name: liebre cola negra rank: species
  116. Sorex veraecrucis
    common name: musaraña de Saussure rank: species
  117. Cryptotis magna
    common name: musaraña orejillas mayor, musaraña rank: species
  118. Sylvilagus cunicularius
    common name: conejo, conejo mexicano rank: species
  119. Romerolagus diazi
    common name: teporingo, conejo teporingo, conejo de los volcanes, zacatuche rank: species
  120. Microtus quasiater
    common name: meteoro de Jalapa, meteoro, meteorito, ratón de alfalfar rank: species
  121. Xenomys nelsoni
    common name: rata de Magdalena, ratón de campo rank: species
  122. Neotoma lepida
    common name: rata cambalachera desértica, rata de campo, rata magueyera rank: species
  123. Puma yagouaroundi
    common name: jaguarundi, yaguarundi rank: species
  124. Baiomys musculus
    common name: ratón pigmeo sureño, ratón de campo, ratón pigmeo rank: species
  125. Lynx rufus
    common name: lince, lince americano, gato montés rank: species
  126. Cryptotis phillipsii
    common name: musaraña rank: species
  127. Neotoma mexicana
    common name: rata cambalachera mexicana, rata de campo, rata magueyera rank: species
  128. Procyon lotor
    common name: mapache común, mapache, osito lavador rank: species
  129. Reithrodontomys sumichrasti
    common name: ratón cosechero de Sumichrast, ratón de campo rank: species
  130. Rheomys mexicanus
    common name: ratón acuático mexicano, rata rank: species
  131. Cryptotis goodwini
    common name: musaraña orejillas garras grandes, musaraña rank: species
  132. Mustela frenata
    common name: comadreja cola larga, comadreja, onzita rank: species
  133. Cryptotis griseoventris
    common name: musaraña rank: species
  134. Vulpes macrotis
    common name: zorra norteña, zorra del desierto rank: species
  135. Taxidea taxus
    common name: tejón, tlalcoyote rank: species
  136. Canis lupus
    common name: lobo gris mexicano, lobo rank: species
  137. Conepatus semistriatus
    common name: zorrillo narigón rayado, zorrillo rank: species
  138. Lepus alleni
    common name: liebre antílope, liebre rank: species
  139. Peromyscus eremicus
    common name: ratón de cactus, ratón de campo, ratón rank: species
  140. Microtus (Pedomys) ochrogaster
    rank: species
  141. Mustela vison
    rank: species

Geographic Coverages

País: ESTADOS UNIDOS DE AMERICA (ALASKA, ARIZONA, INDIANA, LOUISIANA, NEW MEXICO, OREGON, TEXAS) País: MEXICO (BAJA CALIFORNIA SUR, CAMPECHE, CHIAPAS, CHIHUAHUA, CIUDAD DE MEXICO, COAHUILA DE ZARAGOZA, COLIMA, DISTRITO FEDERAL, DURANGO, GUANAJUATO, GUERRERO, HIDALGO, JALISCO, MEXICO, MICHOACAN DE OCAMPO, MORELOS, NAYARIT, NUEVO LEON, OAXACA, QUERETARO, QUINTANA ROO, SAN LUIS POTOSI, SINALOA, SONORA, TABASCO, TAMAULIPAS, TLAXCALA, VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE, YUCATAN) País: PERU (HUANUCO, PIURA, SAN MARTIN)

Bibliographic Citations

Contacts

Fernando Alfredo Cervantes Reza
originator
position: Responsable
Universidad Nacional Autónoma de MéxicoInstituto de BiologíaDepartamento de ZoologíaColección Nacional de Mamíferos
México
04510
Distrito Federal
MX
Telephone: Tel 5622 9143
email: fac@ib.unam.mx
CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad
metadata author
position: Dirección General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
MÉXICO
14010
Tlalpan
MX
Telephone: 50045000
email: patricia.ramos@conabio.gob.mx
homepage: https://www.gob.mx/conabio
Sonia Alejandra Careaga Olvera
administrative point of contact
position: Subcoordinadora en Información y Análisis
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
México
14010
Tlalpan
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