We’re sorry, but GBIF doesn’t work properly without JavaScript enabled.
Our website has detected that you are using an outdated insecure browser that will prevent you from using the site. We suggest you upgrade to a modern browser.
{{nav.loginGreeting}}
  • Get data

      • Occurrences
      • Species
      • Datasets
      • Publishers
      • Trends
      • Citation guidance
  • Share

      • Publishing data
      • Dataset classes
      • Data quality
      • Data hosting
      • Become a publisher
      • Standards
      • Data papers
      • Citizen science
  • Tools

    • Publishers

      • IPT
      • Data validator
      • Suggest a dataset
      • Data repository

    • Users

      • GBIF API
      • Data processing
      • rgbif
      • MAXENT
      • Tools catalogue

    • GBIF labs

      • Species matching
      • Name parser
      • Sequence ID
      • GBIF data blog
  • Inside GBIF

    • About

      • What is GBIF?
      • The GBIF network
      • Become a member
      • Governance
      • Funders
      • Partnerships
      • Strategic plan
      • Contacts

    • News & outreach

      • News
      • Featured data use
      • Events
      • Ebbe Nielsen Challenge
      • Young Researchers Award
      • Newsletters and lists
      • Mentoring
      • Ambassadors
      • Community forum

    • Programmes & projects

      • CESP: Capacity Enhancement Support Programme
      • BID: Biodiversity Information for Development
      • BIFA: Biodiversity Information Fund for Asia
      • Northern Eurasia
      • Living Atlases
  • Admin

      • Registry console
  • User profile

Código de barras de ejemplares de la Colección Nacional de Mamíferos del Instituto de Biología, UNAM

Dataset homepage

Citation

Cervantes Reza F A, Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad C (2018). Código de barras de ejemplares de la Colección Nacional de Mamíferos del Instituto de Biología, UNAM. Version 1.5. Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/wso3fw accessed via GBIF.org on 2019-10-17.

Description

El propósito de este proyecto es contribuir a la obtención de información genética de especies mexicanas de mamíferos que permita su identificación específica y a la construcción del catálogo de código de barras de los mamíferos mexicanos. Estos esfuerzos comprenden los ejemplares de la Colección Nacional de Mamíferos (CNMA) del Instituto de Biología, UNAM, institución miembro de la Red MexBol, de los que se procesarán muestras de tejidos congelados para la secuenciación del gen mitocondrial citocromo oxidasa subunidad I de acuerdo con protocolos estandarizados sugeridos por el IBOL. La muestra a examinar comprende 250 ejemplares de 40 especies de diversas regiones geográficas de México. La extracción de ADN se hará por medio de kits comerciales, la amplificación del fragmento del Citocromo Oxidasa I se efectuará por la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) utilizando primer específicos, la purificación de los productos de PCR y la secuenciación de sus nucleótidos en un secuenciador automatizado. Las secuencias serán editadas, alineadas y comparadas con resultados reportados en la literatura. También se producirán fotografias o ilustraciones de los ejemplares secuenciados que se acompañarán de sus datos de colecta. Finalmente, estos resultados con los códigos de barras serán incorporados a la base de datos del Sistema Bold en un período de 12 meses.

Reino: 1 Filo: 1 Clase: 1 Orden: 6 Familia: 13 Género: 41 Especie: 79

Taxonomic Coverages

Reino: Animalia Filo: Chordata Clase: Mammalia Orden: Didelphimorphia, Carnivora, Rodentia, Lagomorpha, Soricomorpha, Chiroptera Familia: Didelphidae, Procyonidae, Cricetidae, Felidae, Leporidae, Ursidae, Soricidae, Mephitidae, Canidae, Vespertilionidae, Phyllostomidae, Geomyidae, Mustelidae
  1. Animalia
    rank: kingdom
  2. Chordata
    rank: phylum
  3. Mammalia
    rank: class
  4. Didelphimorphia
    rank: order
  5. Carnivora
    rank: order
  6. Rodentia
    rank: order
  7. Lagomorpha
    rank: order
  8. Soricomorpha
    rank: order
  9. Chiroptera
    rank: order
  10. Didelphidae
    rank: family
  11. Procyonidae
    rank: family
  12. Cricetidae
    rank: family
  13. Felidae
    rank: family
  14. Leporidae
    rank: family
  15. Ursidae
    rank: family
  16. Soricidae
    rank: family
  17. Mephitidae
    rank: family
  18. Canidae
    rank: family
  19. Vespertilionidae
    rank: family
  20. Phyllostomidae
    rank: family
  21. Geomyidae
    rank: family
  22. Mustelidae
    rank: family
  23. Didelphis
    rank: genus
  24. Procyon
    rank: genus
  25. Peromyscus
    rank: genus
  26. Panthera
    rank: genus
  27. Bassariscus
    rank: genus
  28. Sylvilagus
    rank: genus
  29. Reithrodontomys
    rank: genus
  30. Ursus
    rank: genus
  31. Cryptotis
    rank: genus
  32. Spilogale
    rank: genus
  33. Canis
    rank: genus
  34. Megasorex
    rank: genus
  35. Myotis
    rank: genus
  36. Microtus
    rank: genus
  37. Lepus
    rank: genus
  38. Xenomys
    rank: genus
  39. Sorex
    rank: genus
  40. Nelsonia
    rank: genus
  41. Conepatus
    rank: genus
  42. Tlacuatzin
    rank: genus
  43. Puma
    rank: genus
  44. Neotoma
    rank: genus
  45. Myodes
    rank: genus
  46. Rheomys
    rank: genus
  47. Felis
    rank: genus
  48. Lynx
    rank: genus
  49. Philander
    rank: genus
  50. Leopardus
    rank: genus
  51. Romerolagus
    rank: genus
  52. Vulpes
    rank: genus
  53. Sturnira
    rank: genus
  54. Hodomys
    rank: genus
  55. Cratogeomys
    rank: genus
  56. Carollia
    rank: genus
  57. Baiomys
    rank: genus
  58. Mustela
    rank: genus
  59. Taxidea
    rank: genus
  60. Tylomys
    rank: genus
  61. Osgoodomys
    rank: genus
  62. Marmosa
    rank: genus
  63. Mephitis
    rank: genus
  64. Didelphis virginiana
    common name: tlacuache, tlacuache cola pelada, tlacuache común, tlacuache norteño, tlakuatzin, Virginia opossum rank: species
  65. Procyon lotor
    common name: a'ka'bak, batú, batúi, common raccoon, mapache, mapache común, mapachtli, me'el, osito lavador, raccoon rank: species
  66. Peromyscus melanophrys
    common name: plateau mouse, ratón de campo, ratón de meseta rank: species
  67. Panthera onca
    common name: balam, balúm, barum, bolon, jaguar, tigre rank: species
  68. Bassariscus astutus
    common name: cacomixtle, cacomixtle norteño, rikamúchi, ringtail, tejón rank: species
  69. Sylvilagus audubonii
    common name: conejo, conejo del desierto, desert cottontail, rowi rank: species
  70. Reithrodontomys mexicanus
    common name: Mexican harvest mouse, ratón cosechero mexicano, ratón de campo rank: species
  71. Ursus americanus
    common name: black bear, cuetlachtli, ohí, oso negro, oso negro americano rank: species
  72. Cryptotis phillipsii
    common name: musaraña, Phillips' small-eared shrew rank: species
  73. Spilogale putorius
    common name: zorrillo, zorrillo manchado, zorrillo manchado común rank: species
  74. Cryptotis peregrina
    common name: musaraña, Oaxacan broad-clawed shrew rank: species
  75. Canis lupus
    common name: cuitlachcóyotl, gray wolf, lobo, lobo gris mexicano, narigóchi, wolf rank: species
  76. Megasorex gigas
    common name: Merriam's desert shrew, Mexican shrew, musaraña, musaraña desértica sureña rank: species
  77. Cryptotis mexicana
    common name: Mexican small-eared shrew, musaraña, musaraña orejillas mexicana rank: species
  78. Myotis occultus
    common name: Arizona myotis, murciélago rank: species
  79. Microtus mexicanus
    common name: meteorito, meteoro, meteoro mexicano, Mexican vole, ratón de alfalfar rank: species
  80. Peromyscus eremicus
    common name: ratón, ratón de cactus, ratón de campo rank: species
  81. Lepus flavigularis
    common name: liebre, liebre de Tehuantepec, liebre tropical, Tehuantepec jack rabbit, tropical hare rank: species
  82. Cryptotis goodwini
    common name: Godwin small-eared shrew, musaraña, musaraña orejillas garras grandes rank: species
  83. Xenomys nelsoni
    common name: Magdalena rat, rata de Magdalena, ratón de campo rank: species
  84. Microtus oaxacensis
    common name: meteorito, meteoro, meteoro de Tarabundí, ratón de alfalfar, Tarabund vole rank: species
  85. Sorex veraepacis
    common name: musaraña, musaraña de Verapaz, Verapaz shrew rank: species
  86. Cryptotis magna
    common name: big small-eared shrew, musaraña, musaraña orejillas mayor rank: species
  87. Sorex oreopolus
    common name: Mexican long-tailed shrew, musaraña, musaraña coluda mexicana rank: species
  88. Nelsonia neotomodon
    common name: diminutive woodrat, rata, rata cambalachera diminuta rank: species
  89. Conepatus semistriatus
    common name: zorrillo, zorrillo narigón rayado rank: species
  90. Sorex veraecrucis
    common name: musaraña de Saussure rank: species
  91. Lepus alleni
    common name: antelope Jackrabbit, liebre, liebre antílope rank: species
  92. Tlacuatzin canescens
    common name: grayish mouse-opossum, ratón tlacuache, tlacuache ratón gris, tlacuachín rank: species
  93. Lepus californicus
    common name: liebre cola negra rank: species
  94. Microtus quasiater
    common name: Jalapa pine vole, meteorito, meteoro, meteoro de Jalapa, ratón de alfalfar rank: species
  95. Puma yagouaroundi
    common name: jaguarundi, otter cat, yaguarundi rank: species
  96. Reithrodontomys chrysopsis
    common name: ratón cosechero de volcán, ratón de campo, volcano harvest mouse rank: species
  97. Cryptotis obscura
    common name: grizzled mexican small-eared shrew, musaraña rank: species
  98. Neotoma lepida
    common name: desert woodrat, rata cambalachera desértica, rata de campo, rata magueyera rank: species
  99. Myodes rutilus
    rank: species
  100. Cryptotis parva
    common name: least shrew, musaraña, musaraña orejillas mínima rank: species
  101. Rheomys mexicanus
    common name: rata, rata acuatica, ratón acuático mexicano rank: species
  102. Felis catus
    rank: species
  103. Reithrodontomys fulvescens
    common name: fulvous harvest mouse, ratón cosechero leonado, ratón de campo rank: species
  104. Lynx rufus
    common name: gato montés, lince, lince americano rank: species
  105. Microtus umbrosus
    common name: meteorito, meteoro, meteoro de Zempoaltepec, ratón de alfalfar, Zempoaltepec vole rank: species
  106. Philander opossum
    common name: cuatro ojos, tlacuache cuatro ojos, tlacuache cuatrojos gris rank: species
  107. Leopardus pardalis
    common name: ocelote, zorra gris rank: species
  108. Cryptotis nelsoni
    common name: musaraña rank: species
  109. Romerolagus diazi
    common name: conejo de los volcanes, conejo teporingo, teporingo, volcano rabbit, zacatuche rank: species
  110. Lepus insularis
    common name: liebre negra rank: species
  111. Peromyscus levipes
    common name: La Malinche mouse, ratón de campo, ratón de La Malinche rank: species
  112. Puma concolor
    common name: cougar, león de montaña, mawiyá, mawiyaka, miz-tli, puma rank: species
  113. Vulpes macrotis
    common name: kit fox, zorra del desierto, zorra norteña rank: species
  114. Sturnira lilium
    common name: murciélago, murciélago de charreteras menor, yellow shoulder bat rank: species
  115. Cryptotis griseoventris
    common name: Guatemalan broad-clawed shrew, musaraña rank: species
  116. Sorex saussurei
    common name: musaraña, musaraña de Saussure rank: species
  117. Hodomys alleni
    common name: Allen's woodrat, rata cambalachera de Allen, tuza rank: species
  118. Spilogale gracilis
    common name: zorrillo manchado rank: species
  119. Cratogeomys zinseri
    common name: tuza, tuza de Lagos de Moreno, Zinzeri pocket gophers rank: species
  120. Reithrodontomys sumichrasti
    common name: ratón cosechero de Sumichrast, ratón de campo, Sumichrast's harvest mouse rank: species
  121. Sylvilagus floridanus
    common name: conejo, conejo serrano, eastern cottontail, rowi, tochtli rank: species
  122. Neotoma mexicana
    common name: Mexican woodrat, rata cambalachera mexicana, rata de campo, rata magueyera, rorí rank: species
  123. Microtus ochrogaster
    rank: species
  124. Peromyscus aztecus
    common name: Aztec mouse, ratón azteca, ratón de campo rank: species
  125. Peromyscus gratus
    common name: chikúri, ratón, ratón de campo, ratón de Tlalpan, ratón piñonero, Tlalpan mouse rank: species
  126. Carollia sowelli
    common name: murciélago, Sowell's short-tailed bat rank: species
  127. Baiomys musculus
    common name: ratón de campo, ratón pigmeo, ratón pigmeo sureño, Southern pygmy mouse rank: species
  128. Mustela frenata
    common name: comadreja, comadreja cola larga, onzita rank: species
  129. Cryptotis mayensis
    common name: musaraña, musaraña orejillas parda, Yucatan small-eared shrew rank: species
  130. Cryptotis goldmani
    common name: musaraña, musaraña orejillas de Goldman rank: species
  131. Taxidea taxus
    common name: American badger, North American badger, tejón, tlalcoyote rank: species
  132. Conepatus leuconotus
    common name: eastern hog-nose skunk, zorrillo, zorrillo narigón occidental rank: species
  133. Sylvilagus mansuetus
    common name: conejo de isla San José, San Jose brush rabbit rank: species
  134. Tylomys nudicaudus
    common name: Peter's climbing rat, rata arborícola, rata trepadora de Peter rank: species
  135. Sylvilagus cunicularius
    common name: conejo, conejo mexicano, Mexican cottontail rank: species
  136. Osgoodomys banderanus
    common name: Michoacan deermouse, rata arrocera, ratón michoacano rank: species
  137. Didelphis marsupialis
    common name: tlacuache, tlacuache común, tlacuache sureño, zarigüeya rank: species
  138. Marmosa mexicana
    common name: Mexican mouse-opossum, ratón tlacuache, tlacuache ratón, tlacuache ratón mexicano rank: species
  139. Cryptotis alticola
    common name: Central Mexican broad-clawed shrew, musaraña rank: species
  140. Mustela vison
    rank: species
  141. Mephitis macroura
    common name: zorrillo listado, zorrillo listado del sur rank: species
  142. Lepus callotis
    common name: liebre, liebre torda, white-sided Jackrabbit rank: species

Geographic Coverages

País: ESTADOS UNIDOS DE AMERICA (ALASKA, ARIZONA, INDIANA, LOUISIANA, NEW MEXICO, OREGON, TEXAS) País: MEXICO (BAJA CALIFORNIA SUR, CAMPECHE, CHIAPAS, CHIHUAHUA, COAHUILA DE ZARAGOZA, COLIMA, DISTRITO FEDERAL, DURANGO, GUANAJUATO, GUERRERO, HIDALGO, JALISCO, MEXICO, MICHOACAN DE OCAMPO, MORELOS, NAYARIT, NUEVO LEON, OAXACA, QUERETARO, QUINTANA ROO, SAN LUIS POTOSI, SINALOA, SONORA, TABASCO, TAMAULIPAS, TLAXCALA, VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE, YUCATAN) País: PERU (HUANUCO, PIURA)

Bibliographic Citations

Contacts

Fernando Alfredo Cervantes Reza
originator
position: Responsable
Universidad Nacional Autónoma de MéxicoInstituto de BiologíaDepartamento de ZoologíaColección Nacional de Mamíferos
México
04510
Distrito Federal
MX
Telephone: Tel 5622 9143
email: fac@ib.unam.mx
CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad
metadata author
position: Dirección General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
MÉXICO
14010
Tlalpan
MX
Telephone: 50045000
email: patricia.ramos@conabio.gob.mx
homepage: https://www.gob.mx/conabio
Sonia Alejandra Careaga Olvera
administrative point of contact
position: Subcoordinadora en Información y Análisis
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
México
14010
Tlalpan
MX
Telephone: 50045000
email: scareaga@conabio.gob.mx
homepage: https://www.gob.mx/conabio
What is GBIF? API FAQ Newsletter Privacy Terms and agreements Citation Acknowledgements
Contact GBIF Secretariat Universitetsparken 15 DK-2100 Copenhagen Ø Denmark