Colección de microbiomas cultivables de insumos y alimentos orgánicos
Citation
Rueda Isaza Y X, Sierra Zapata L, Hernández Mejía S (2023). Colección de microbiomas cultivables de insumos y alimentos orgánicos. Universidad EAFIT. Occurrence dataset https://doi.org/10.15472/tsyaha accessed via GBIF.org on 2024-09-01.Description
ORGAENIK trabaja permanentemente para mejorar la calidad de sus productos y servicios, a través de la producción de hortalizas y vegetales inocuos, con alto contenido nutricional y orgánicos, simultáneo a la realización de investigación de las relaciones de los microorganismos en el suelo con la productividad y valor nutricional de sus productos; y así aportar procesos biotecnológicos que mejoren las labores del campo colombiano. La colección OGK tiene como Misión para la empresa ORGAENIK ser un repositorio en condiciones óptimas, de la biodiversidad microbiana de suelos, insumos y productos frescos producidos bajo practicas orgánicas, con el fin de generar conocimiento, ser objeto de estudio con fines no comerciales de procesos de producción sostenible en el sector agrícola en Colombia, que pueden ser una fuente potencial de desarrollos biotecnológicos para fomentar las capacidades de los microorganismos que directa o indirectamente aportan nutrientes o factores que benefician el crecimiento y desarrollo de las plantas.
Esta colección buscará ser ampliada a lo largo del tiempo para enriquecer y aportar el conocimiento en el país sobre agricultura y prácticas orgánicas de producción de alimentos basadas en la biodiversidad microbiana (levaduras y otros hongos, bacterias y arqueas) de nuestros suelos. La colección OGK tiene como Visión y en concordancia con la de la empresa ORGAENIK, contribuir al progreso de la Nación en conocimiento práctico y científico sobre producción orgánica de alimentos y biodiversidad de los suelos, mediante la conservación de microorganismos asociados a dichas prácticas y el acceso de la colección. Se proyecta categorizar taxonómicamente toda la colección y ampliarla para permitir el desarrollo de investigaciones científicas que fortalezcan el conocimiento sobre la nutrición vegetal y el aporte a las relaciones ecosistémicas que crea esta agricultura orgánica o biológica en suelos colombianos.
Actualmente, la colección OGK RNC:246 de la empresa ORGAENIK es custodiada por la Colección Biológica Universidad EAFIT RNC:277 en el marco de un convenio de investigación entre ambas entidades que tiene como objetivo fortalecer aspectos técnicos, curatoriales, científicos y administrativos/legales orientados a la correcta preservación de las muestras microbiológicas registradas en la colección OGK. Adicionalmente, la Colección Biológica Universidad EAFIT, brinda las instalaciones y equipos para el mantenimiento anual y verificación de pureza y viabilidad de las muestras.
Sampling Description
Study Extent
Suelos cultivables de orgánicos San Sebastián S.A.S (Vereda Cabeceras, Rionegro, Antioquia).Sampling
Se planearon dos momentos de recolección, uno en tiempo seco y otro en época de lluvia con el fin de verificar los cambios en la biodiversidad de acuerdo al cambio de condiciones climáticas. Cada momento se denomina Recolección Nº1 y Nº2, respectivamente.Method steps
- Recolección Nº1: muestras de 50 gr de suelos del cultivo, insumos orgánicos y alimentos de cosecha del momento.
- Aislamientos recolección Nº1.
- Conservación (criogénica o por liofilización) aislamientos de recolección Nº1.
- Recolección Nº2: muestras de 50 gr de suelos del cultivo, insumos orgánicos y alimentos de cosecha del momento.
- Aislamientos recolección Nº2.
- Conservación (criogénica o por liofilización) aislamientos de recolección Nº2.
- Se colectaron muestras de suelo empleando instrumentos estériles y autoclavados (espátulas y bolsas de polipropileno), de insumos orgánicos producidos en el cultivo y alimentos vegetales cosechados en las áreas de cultivos Orgaenik (orgánicos San Sebastián S.A.S). De dichas muestras se colectaron, mediante aislamientos en medios de cultivo semiselectivos, los microorganismos cultivables asociados a cada una.
- Las muestras de suelo se colectaron en seis puntos diferentes del cultivo, los insumos a muestrear y alimentos, se seleccionaron dependiendo de la época de cosecha y temporada a lo largo de la duración del proyecto.
- De cada muestra se realizaron aislamientos por diluciones seriadas y serán sembradas por triplicado en medios semiselectivos que permiten el crecimiento de familias microbianas seleccionadas, entre estos: YMA (para levaduras), R2YE (para actinomicetes), PIA (para pseudomonados), McConkey (para gram negativos), TSA (para firmicutes y bacteriodetes) y Sabouraud (para hongos).
- Finalmente se cuantificaron los aislamientos en términos de morfotipos y abundancias, con el fin de establecer la biodiversidad microbiana en cada etapa del cultivo y se seleccionaron dos colonias de cada morfotipo para ser conservadas en crioviales a -80ºC en medio de preservación más glicerol, con el fin de realizar posteriores estudios metabólicos con las cepas aisladas.
Taxonomic Coverages
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Bacteriascommon name: Bacterias rank: kingdom
-
Hongoscommon name: Levaduras rank: kingdom
Geographic Coverages
Bibliographic Citations
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