Caracterización genética de (Caretta caretta) en el Caribe colombiano

Leidy Hernández Rivera; Shirly Bello Escobar; Yuri Fonseca Piracoca; Nelson Alejandro Lozano Mendoza; Ariel Alexander Cacante González; Brenda Mejia Guarnizo; Guiomar Aminta Jáuregui Romero

doi:10.15472/k8odji

Caracterización genética de (Caretta caretta) en el Caribe colombiano

Citation

Hernández Rivera L, Bello Escobar S, Fonseca Piracoca Y, Lozano Mendoza N A, Cacante González A A, Mejia Guarnizo B, Jáuregui Romero G A (2022). Caracterización genética de (Caretta caretta) en el Caribe colombiano. Version 1.1. Fundación Universidad de Bogotá Jorge Tadeo Lozano. Occurrence dataset https://doi.org/10.15472/k8odji accessed via GBIF.org on 2024-12-14.

Description

Siendo la tortuga Caguama (Caretta caretta), una especie filopatríca con una fuerte estructura genética, el análisis de ADN mitocondrial (ADNmt), puede ser usado para determinar eventos de colonización o de filogeografía, con el fin de evidenciar la conectividad entre áreas de anidamiento y su relación con las rutas migratorias a nivel global. Desde el año 2014 se abordó un enfoque genético para dilucidar la estructura poblacional de la especie en la región de Santa Marta, Caribe colombiano a traves de los años; para ello, se realizó la extracción de ADN mediante frotis bucales y dérmicos, una técnica no invasiva que no proporciona mayor estrés en los ejemplares. Finalmente, con el estudio de isotopos estables se identifico la dieta, la preferencia alimenticia y el nivel trófico, debido a que el carbono permite conocer cómo son los hábitos de los organismos (oceánico o nerítico) y el nitrógeno brinda una idea de la posición trófica que este ocupa. Entender la ecología trófica y la variabilidad genética de estas las especies es información especialmente crítica para el manejo y la conservación de especies amenazadas.

Sampling Description

Study Extent

Para la evaluación de la variabilidad genética de C. caretta, se obtuvieron especímenes provenientes del sector Mendihuaca- Don diego, Los individuos se encontraban en etapas de levante en las instalaciones del Acuario Mundo Marino-Programa de Conservación de Tortugas y Mamíferos Marinos (PROCTMM), ubicadas en sistemas cerrados, los cuales mantienen las condiciones ideales para su adecuado desarrollo y mantenimiento, logrando así su rehabilitación y sobrevivencia, de manera que puedan ser reintroducidos al medio natural una vez alcancen un tamaño adecuado. Actividad avalada por CORPAMAG al tratarse de una especie amenazada.

Sampling

A partir de frotis bucales con ayuda de un hisopo esterilizado previamente, se tomaron muestras de tortugas juveniles con 3 réplicas respectivamente. El uso de esta técnica para la obtención de muestras, se encuentra acorde a los principios de protección animal propuestos por Bosch et al. (2005), ya que no es invasiva y evita que se genere algún tipo de estrés agudo sobre el animal. A partir del manejo adecuado del animal, se abrieron cuidadosamente sus mandíbulas e inmediatamente se introdujo el hisopo dentro de su boca y de manera cuidadosa, se realizó un frotis suave por la lengua, paladar y mejillas, con el fin de recolectar la mayor cantidad de células dérmicas. Luego, se introdujo el hisopo en un tubo eppendorf con etanol para su conservación. Posteriormente se preservaron dentro de un congelador a -20°C para evitar el deterioro genético.

Method steps

Los individuos se encontraban en etapas de levante en las instalaciones del Acuario Mundo Marino-Programa de Conservación de Tortugas y Mamíferos Marinos (PROCTMM), ubicadas en sistemas cerrados, los cuales mantienen las condiciones ideales para su adecuado desarrollo y mantenimiento, logrando así su rehabilitación y sobrevivencia, de manera que puedan ser reintroducidos al medio natural una vez alcancen un tamaño adecuado. Actividad avalada por CORPAMAG al tratarse de una especie amenazada.
La extracción el material genético se realizó utilizando mediante frotis bucales y porsteriomente se utilizo el kit comercial Norgen Biotek Corporation Saliva DNA Collection, de acuerdo a las indicaciones de la casa fabricante para su extraccion.
El ADN se reveló después mediante electroforesis en gel de agarosa al 1.0 %, teñido con Gel Red diluido en buffer de carga de la compañía Bioline ®. El gel fue revelado en el fotodocumentador Biorad TM y se hizo el respectivo análisis con el programa Quantity One TM.
Se colectaron muestras de proceso acromio y hueso coracoides de necropsias de tortugas que fallecieron de manera natural durante el proceso de levante durante el 2019-2020. Las muestras se secaron en un horno a 60°C por 24 horas. Posterior a esto, a cada vial se le aplico éter de petróleo hasta cubrir la muestra y se centrifugo a 220 rpm durante 15 minutos. Posteriormente las muestras fueron lavadas con agua destilada para remover los excesos de urea. Una vez lavadas, éstas se secaron nuevamente a 60°C por un día, luego se procedió a macerar cada muestra en un mortero de vidrio, para que el hueso deshidratado quede lo más fino y homogéneo posible. Del hueso pulverizado se obtuvo una sub-muestra de 0,5 a 0,6 mg utilizando una balanza analítica y se colocaron en cápsulas de estaño (8 x 5 mm). Finalmente, Las muestras fueron analizadas en un espectrómetro de masas en el cual se identificarán las razones isotópicas de carbono (¿13C) y nitrógeno (¿15N).

Taxonomic Coverages

Se recopilo la información de individuos de la tortuga marina (Caretta caretta) para los años 2014-2015 (30 individuos), 2018 (24 individuos) y 2019-2020 (26 individuos).

Caretta caretta
common name: Caguama rank: species

Geographic Coverages

Para la evaluación de la variabilidad genética de C. caretta, se obtuvieron especímenes provenientes del sector Mendihuaca- Don diego (11° 16’N y 73°45’O), Los individuos se encontraban en etapas de levante en las instalaciones del Acuario Mundo Marino-Programa de Conservación de Tortugas y Mamíferos Marinos (PROCTMM), ubicadas en sistemas cerrados, los cuales mantienen las condiciones ideales para su adecuado desarrollo y mantenimiento, logrando así su rehabilitación y sobrevivencia, de manera que puedan ser reintroducidos al medio natural una vez alcancen un tamaño adecuado.

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