Microorganismos asociados a la pudrición de raices, en plántulas de aguacate procedentes de viveros de los departamentos del Valle del Cauca, Risaralda y Quindío

Study Extent

Viveros de los departamentos del Valle del Cauca, Quindió y Risaralda.

Sampling

Se realizó un muestreo de plantas con síntomas de marchitez, clorosis y pudrición de raíces, posterior aislamiento en medios de cultivo, purificación mediante cultivos monospóricos e identificación morfológica mediante claves taxonómicas.

Quality Control

Caracterización morfologica usando las claves taxónomicas de Leslie & Summerell, (2006) para el género Fusarium; claves de Lombard & Crous (2012) para hongos del género Gliocladiopsis; claves de Lombard et al., (2010) para el género Calonectria; claves de Lombard et al., (2012) para el género Cylindrocladiella; claves de Chaverri et al., (2011) y Ulloa & Hanlin, (2000) para Ilyonectria; claves de Halleen et al., (2004), para Campylocarpon; claves de  Drenth & Sendall, (2001) para Phytophthora; claves de Van Der Plaats-Niterink, A. J. (1981) para Pythium; claves de Barnett & Hunter, (1987) para Trichoderma, Xenoacremonium, Acremonium, Nigrospora.

Method steps

1. Se realizaron visitas a 30 viveros productores y comercializadores de aguacate ubicados en los departamentos de Risaralda, Quindío y Valle del Cauca; registrados ante el ICA. En cada vivero se recolectaron plantas individuales de diferentes edades con sintomatologías asociadas a clorosis, marchitez, caída de hojas y plantas asintomáticas. Al momento del muestreo se realizó una descripción detallada y registro fotográfico de los síntomas encontrados. Las muestras fueron llevadas al laboratorio de fitopatología del C.I. Palmira para su respectivo procesamiento y posterior diagnóstico.
2. Para la obtención de aislamientos se procesaron las muestras de tejido vegetal afectado, tomando trozos de raíz de 0.5 cm de largo, con presencia de necrosis. Los trozos fueron desinfectados superficialmente mediante suspensión en hipoclorito al 1% durante 45 segundos, alcohol al 70% durante 1 minuto y 3 lavados con agua destilada estéril. Posteriormente se sembraron en cajas de Petri con agar APDA y se incubaron a 25°C hasta observar crecimiento.
3. Una vez obtenido el crecimiento micelial a partir de muestras de raíces se procedió a aislar colonias individuales para la obtención, identificación y conservación de cultivos puros. Los cultivos fueron incubados a 25°C en oscuridad hasta observar crecimiento, con posterior obtención de cultivos individuales.
4. De los aislados obtenidos se realizaron cultivos monospóricos, para esto se preparó una solución con tubos con agua destilada estéril (ADE) donde se adicionó un disco de 0.5mm con unidades formadoras de colonia del hongo, de esta suspensión se prepararon diluciones (hasta reducir la concentración de esporas). Se tomaron 10 µl de la suspensión más diluida para siembra por duplicado mediante la técnica de agotamiento con asa de argolla sobre una caja de Petri con PDA más cloranfenicol (0,05g/L). Los cultivos se incubaron a 25°C hasta germinación de una espora que fue transferida a una nueva caja con medio de cultivo PDAc (French & Hebert, 1980). Los asilamientos que no produjeron estructuras reproductivas se purificaron usando el método de monomicelio o punta de hifa (Cañedo & Ames, 2004).
5. La identificación morfológica de los aislamientos se basó en características macroscópicas (crecimiento y color de la colonia) y microscópicas (tipo de micelio y estructuras reproductivas) del cultivo. La identificación a nivel de género se realizó mediante la aplicación de claves taxonómicas.

Este conjunto de datos contiene la información de 122 microorganismos de los cuales 111 son hongos y 11 pertenecen a oomycetes.

1. Fungi
   common name: Fungi rank: kingdom
2. Chromista
   rank: kingdom
3. Dothideomycetes
   rank: class
4. Sordariomycetes
   rank: class
5. Peronosporea
   rank: class

Se visitaron 30 viveros de aguacate registrados ante el Instituto Colombiano Agropecuario (ICA) y se colectaron plantas con sintomas asociados a pudrición de raíces. Se visitaron 16 viveros en el departamento del Valle del Cauca, 9 viveros en el Quindío y 5 viveros en Risaralda.