Base de datos biogeográfica del Fondo de Investigación Pesquera y de Acuicultura (1999-2019), Subsecretaría de Pesca y Acuicultura

Study Extent

Esta base de datos contiene los especímenes registrados en 284 evaluaciones y estudios pesqueros mandatados por la Subsecretaría de Pesca y Acuicultura y financiados por FIPA durante el periodo 1999-2019, basado en los intereses asociados a recursos pelágicos, demersales, crustáceos, altamente migratorios, condrictios y especies de aguas profundas. Los estudios realizados se encuentran principalmente en el margen oriental del Pacífico Sur, frente a las costas de Chile.

Sampling

Los métodos de muestreo utilizados para la obtención de los registros biológicos que componen la base de datos son diversos y particulares a cada estudio o proyecto. Estos incluyen: muestreo directo por redes de arrastre o cerco, trampas, buceo, cuantificación indirecta por muestreo hidroacústico, botellas Niskin, redes bongo, entre otros. La generación de la base de datos unificada se realizó mediante un marco metodológico de análisis, sistematización, curatoría, e integración de las diversas fuentes de información.

Quality Control

Se corrigieron y estandarizaron los componentes geográficos de las diferentes fuentes de datos. En paralelo, se realizó un proceso curatorial de la taxonomía, donde se corrigieron nombres mal escritos, se actualizaron sinonimias, se homologaron nombres vernaculares y se realizaron correcciones de las bases de datos originales de acuerdo a la metadata disponible. Es importante destacar que, con la finalidad de mantener la trazabilidad sobre las modificaciones realizadas, se mantuvieron nombres e información original cuando fue posible. Finalmente, se procedió a realizar un proceso curatorial de los datos mediante pipelines en Rstudio y Microsoft Excel a modo de control de calidad de datos.

Method steps

1. Utilizando como insumo la base de datos georreferenciada desarrollada por el proyecto FIPA 2020-26, se desarrolló un pipeline en RStudio que permitiera unificar las tablas de la base de datos original. Posteriormente, se procedió a homologar los nombres de cabecera a el EML Darwin Core y generar la estructura de la nueva base de datos compuesta por Eventos de Muestreo (Core), Registro biológico (Ocurrencia), y Extended Measurements&Facts. En este sentido tanto el archivo "Extended Measurements&Facts", como el campo "DynamicProperties" (core) mantienen el contenido que se detalla a continuación: -Extended Measurement & Facts: Corresponde a toda la información que no puede ser categorizada según Evento (Core) o Registro biológico (ocurrence). En este ítem se detallan todas las características morfométricas cuantitativas (talla y peso) que se describen en los estudios sistematizados. Además, se detalla la información hidroacústica obtenida en energía acústica retrodispersada (NASC) y lectura acústica, así como también se especifica la información obtenida para los recursos de tipo fitoplancton y zooplancton (clorofila y biomasa). En este sentido, esta categoría está intrínsecamente relacionada con el Registro Biológico, y se pueden asociar mediante el occurrenceID y/o eventID. -DynamicProperties: Columna que detalla características adicionales sobre registros asociados principalmente a datos oceanográficos y temperatura superficial del agua de la categoría Evento (Core). Se describe con el tipo de medida, unidad de medida y su valor. Las características se encuentran separadas por comas y tabulaciones. Ej: |SalinidadEnPSU:34.05| , |DensidadEnSigma-t:25.79| , |OxigenoDisueltoEnMl/L:5.9566| , |ClorofilaAEnMg/m3:0.134777|

Se reportan registros asociados a 17 Phyla, las unidades taxonómicas menores varían de acuerdo con la aproximación metodológica utilizada en la obtención de cada registro, así como también para los diversos grupos taxonómicos.

1. Chordata
   common name: Cordados rank: phylum
2. Mollusca
   common name: Moluscos rank: phylum
3. Arthropoda
   common name: Artrópodos rank: phylum
4. Cnidaria
   common name: Cnidarios rank: phylum
5. Echinodermata
   common name: Equinodermos rank: phylum
6. Bryozoa
   common name: Briozoos rank: phylum
7. Porifera
   common name: Poriferos rank: phylum
8. Annelida
   common name: Anélidos rank: phylum
9. Brachiopoda
   common name: Braquiópodos rank: phylum
10. Chaetognatha
    common name: Quetognatos rank: phylum
11. Ctenophora
    common name: Ctenóforos rank: phylum
12. Cyanobacteria
    common name: Cianobacterias rank: phylum
13. Foraminifera
    common name: Foraminíferos rank: phylum
14. Hemichordata
    common name: Hemicordados rank: phylum
15. Myzozoa
    common name: Miozoos rank: phylum
16. Ochrophyta
    common name: Ocrofitas rank: phylum
17. Radiozoa
    common name: Radiolarios rank: phylum

Los eventos de muestreo se encuentran principalmente en el margen oriental del Pacífico Sur, con un número menor de registros en el Atlántico Sur