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Código de barras genético y riqueza taxonómica de la herpetofauna del Parque Nacional Natural Sanquianga y el Parque Nacional Natural Gorgona, Colombia

Citation

Betancourt E, Acosta Peña A, Lozano Osorio R, Cuéllar Chacón A, Hurtado D, Rodriguez Cuero F, Montaño Yesquen L, Reina Salas B, Estupiñan Estupiñan E, Reina Midina F (2023). Código de barras genético y riqueza taxonómica de la herpetofauna del Parque Nacional Natural Sanquianga y el Parque Nacional Natural Gorgona, Colombia. Version 1.1. Universidad Nacional de Colombia. Occurrence dataset https://doi.org/10.15472/ltzhrj accessed via GBIF.org on 2024-12-15.

Description

En este trabajo, se recolectaron muestras de ADN de la herpetofauna de los PNNs Sanquianga y Gorgona para identificarlas y compararlas con las secuencias de especies registradas en bibliotecas de referencia. El Laboratorio de Ecología Molecular de Vertebrados Acuáticos (LMVA) de la Universidad de los Andes extrajo ADN de 61 muestras recolectadas en campo y obtuvo secuencias de tres marcadores moleculares mitocondriales: Citocromo Oxidasa I (COI), Citocromo b (CytB) y 16S. Se obtuvieron 177 pares de secuencias, de las cuales 110 mantuvieron una calidad entre regular y muy buena, y 67 se sugiere repetir porque hubo muy escasa amplificación.

Los resultados obtenidos en esta expedición demuestran la importancia de la aplicación de herramientas moleculares para la identificación precisa de la biodiversidad y el monitoreo de los ecosistemas. Este trabajo representa un aporte importante al conocimiento de la biodiversidad de anfibios y reptiles de los PNNs Sanquianga y Gorgona, y abre la posibilidad de continuar con investigaciones similares en otras regiones del país. En general, estos resultados pueden tener un impacto significativo en la toma de decisiones para la conservación y protección de la biodiversidad en el país.

Sampling Description

Study Extent

El Parque Nacional Natural Sanquianga y el Parque Nacional Natural Isla Gorgona.

Sampling

Para la caracterización de la herpetofauna en los sitios de estudio se llevaron a cabo dos salidas de campo simultáneas, una en el Parque Nacional Natural Sanquianga y la otra en el Parque Nacional Natural Isla Gorgona durante la Expedición Científica Pacífico Bocas de Sanquianga entre el 10 y el 18 de mayo del año 2021.

Quality Control

Ajuste de diferentes elementos del DwC: Realizado por el Equipo Coordinador del SIB Colombia de acuerdo a la naturaleza de los datos. Validación de las plantillas DwC con la herramienta GBIF Validator.

Method steps

  1. Recolección e identificación de la herpetofauna: La recolección se realizó de forma manual y los individuos de anfibios encontrados se depositaron en bolsas plásticas, mientras que los reptiles se recolectaron en bolsas de tela; posteriormente, la identificación se realizó utilizando claves taxonómicas y consultando los registros previos existentes para la región, además de la revisión de especímenes en Colecciones Biológicas y la comparación de las secuencias disponibles en bibliotecas especializadas.
  2. Levantamiento y caracterización de anfibios y reptiles en el Parque Nacional Natural Gorgona: Se llevó a cabo a través de la búsqueda libre sin restricciones, y la búsqueda selectiva en hábitats y microhábitats. El muestreo se llevó a cabo durante el día y la noche de forma intensiva, procurando abarcar la mayor extensión de área posible en cada jornada, prestando especial atención a los sitios en los cuales fuera más probable encontrar anfibios y reptiles. Durante el día la búsqueda se concentró en individuos que se encontraran termorregulando en bordes de camino, árboles o cerca a fuentes de agua, así como de renacuajos en los fondos lodosos de cuerpos de agua lénticos estacionarios. Tiempo de muestreo en cada jornada: 4h/observador, y cada observador se tomó como una unidad de muestreo. Por otra parte, para la búsqueda selectiva en hábitats y microhábitats se realizó una estratificación incluyendo: Vegetación a la orilla de los cuerpos de agua, vegetación arbustiva, vegetación arbórea, troncos, rocas, hojarasca y suelo desnudo.
  3. Levantamiento y caracterización de anfibios y reptiles en el Parque Nacional Natural Sanquianga: Se realizaron dos campañas de campo: una en el sector del Consejo Comunitario Punta Mulatos y otra en el Consejo Comunitario Río Sanquianga. En estos sectores, se empleó la metodología de trayectos de banda fija de 200 m x 4 m, en los que se registraron todos los hábitats disponibles como troncos, piedras, hojarasca, entre otros, capturando individuos por relevamiento por encuentro visual (REV) (Heyer et al., 1994; Angulo et al., 2006).
  4. Recolección de tejidos: Para la recolección de material genético se disectaron muestras de tejido que fueron preservadas en ET-OH 96%, el protocolo seguido fue adaptado del presentado en Crawford y Paz, 2017.
  5. Consolidación de colección de referencia de los PNNs Gorgona y Sanquianga: Los especímenes fueron depositados en las colecciones del Instituto de Ciencias Naturales (ICN) de la Universidad Nacional de Colombia y de la Universidad del Valle, mientras que las muestras de material genético se depositaron en el Banco de ADN y Tejidos de la Biodiversidad (BTBC) del Instituto de Genética (IGUN) de la Universidad Nacional de Colombia. Para ello se llevaron a cabo los procedimientos de manipulación, sacrificio y preservación aprobados por la Sociedad Americana de Ictiólogos y Herpetólogos (American Society of Ichthyologists and Herpetologists) en 1987. Se recolectaron series de ejemplares por morfotipo que permitan determinar la variación morfológica, con excepción de animales catalogados en alguna categoría de Amenaza, o aquellos cuya recolecta no es necesaria para su identificación.
  6. Consolidación lista de especies: Se construyó la primera lista preliminar de especies del Parque Nacional Natural Sanquianga con 14 especies de anfibios y 18 de reptiles registradas; mientras que, en el Parque Nacional Natural Gorgona se registraron 7 especies de anfibios y 15 de reptiles.
  7. Análisis de los datos: Para el análisis de los datos y la confirmación de la identificación de los individuos registrados en la Expedición se realizó la revisión morfológica de los especímenes recolectados comparados con aquellos disponibles en las Colecciones Biológicas, y el uso de marcadores moleculares de Barcoding. A través de este método, las muestras de ADN recolectadas en campo se identificaron y comprobaron con las especies registradas en las bibliotecas de referencia del International Barcode of Life project (iBOL), Ratnasingham y Hebert (2013) y GenBank (NCBI, 2022).

Taxonomic Coverages

La Isla Gorgona presentó un total de 60 registros de herpetofauna, de los cuales 39 se identificaron a nivel de especie (2 a subespecie), 11 a género y 8 a orden. En total se identificaron un total de 10 especies y todos los registros incluyen 3 clases (Amphibia, Crocodylia y Lepidosauria), 5 órdenes, 16 familias y 19 géneros. La organización de los taxa se presenta a nivel de orden y género.
  1. Anura
    rank: order
  2. Caudata
    rank: order
  3. Crocodylia
    rank: order
  4. Gymnophiona
    rank: order
  5. Squamata
    rank: order
  6. Anolis
    rank: genus
  7. Atelopus
    rank: genus
  8. Basiliscus
    rank: genus
  9. Boa
    rank: genus
  10. Caecilia
    rank: genus
  11. Caiman
    rank: genus
  12. Chironius
    rank: genus
  13. Clelia
    rank: genus
  14. Diasporus
    rank: genus
  15. Enyalioides
    rank: genus
  16. Epipedobates
    rank: genus
  17. Hemidactylus
    rank: genus
  18. Holcosus
    rank: genus
  19. Imantodes
    rank: genus
  20. Leptophis
    rank: genus
  21. Micrurus
    rank: genus
  22. Oedipina
    rank: genus
  23. Pristimantis
    rank: genus
  24. Thecadactylus
    rank: genus
El área del Parque Nacional Natural Sanquianga presentó un total de 26 registros de herpetofauna, de los cuales 21 se identificaron a nivel de especie y 5 a nivel de género. En total se identificaron un total de 21 especies y todos los registros incluyen 3 clases (Amphibia, Squamata y Testudines), 3 órdenes, 15 familias y 19 géneros. La organización de los taxa se presenta a nivel de género.
  1. Basiliscus
    rank: genus
  2. Boa
    rank: genus
  3. Boana
    rank: genus
  4. Bothrops
    rank: genus
  5. Caecilia
    rank: genus
  6. Craugastor
    rank: genus
  7. Diasporus
    rank: genus
  8. Epipedobates
    rank: genus
  9. Gonatodes
    rank: genus
  10. Holcosus
    rank: genus
  11. Iguana
    rank: genus
  12. Imantodes
    rank: genus
  13. Kinosternon
    rank: genus
  14. Leptodactylus
    rank: genus
  15. Leptodeira
    rank: genus
  16. Ninia
    rank: genus
  17. Rhinoclemmys
    rank: genus
  18. Scinax
    rank: genus
  19. Trachyboa
    rank: genus

Geographic Coverages

El área de estudio corresponde a la subregión Sanquianga-Gorgona. El muestreo se realizó en la Isla Gorgona, Parque Nacional Natural Gorgona y dentro del Parque Nacional Natural Sanquianga, en el sector de Boca de Guaba, Olaya Herrera, Nariño.

Bibliographic Citations

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Contacts

Esteban Betancourt
originator
position: Investigador principal
Universidad Nacional de Colombia
CO
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Augusto Acosta Peña
originator
position: Coinvestigador
Universidad Javeriana
CO
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Rodrigo Lozano Osorio
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position: Investigador principal
Parque Nacional Natural Sanquianga
CO
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Andrés Cuéllar Chacón
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position: Coinvestigador
Dirección Territorial Pacífico - Parques Nacionales Naturales de Colombia
CO
email: sirap.pacifico@parquesnacionales.gov.co
Danilo Hurtado
originator
position: Investigador local
Consejo Counitario de la Comunidad Negra Rio Sanquianga
CO
Felix Rodriguez Cuero
originator
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Consejo Counitario de la Comunidad Negra Rio Sanquianga
CO
Luciano Montaño Yesquen
originator
position: Investigador local
Consejo Counitario de la Comunidad Negra Rio Sanquianga
CO
Bernardo Reina Salas
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position: Investigador local
Consejo Counitario de la Comunidad Negra Punta Mulatos
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Emilio Estupiñan Estupiñan
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Francisco Reina Midina
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Consejo Counitario de la Comunidad Negra Punta Mulatos
CO
Esteban Betancourt
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Universidad Nacional de Colombia
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Rodrigo Lozano Osorio
metadata author
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