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Eventos de monitoreo de la especie plaga Didymosphenia geminata en cuerpos de agua de la zona centro sur austral de Chile, Etapa I (2016 - 2017)

Dataset homepage

Citation

Oyanedel A, Rojas Espinoza R, Ordóñez P, Figueroa Rojas C, Vera Torres P (2021). Eventos de monitoreo de la especie plaga Didymosphenia geminata en cuerpos de agua de la zona centro sur austral de Chile, Etapa I (2016 - 2017). Version 1.3. Subsecretaría de Pesca y Acuicultura. Sampling event dataset https://doi.org/10.15468/wryneh accessed via GBIF.org on 2024-12-12.

Description

Monitoreo de la especie plaga Didymosphenia geminata en cuerpos de agua de la Zona Centro Sur Austral de Chile, que incluye ríos y lagos de importancia para la acuicultura y pesca recreativa de las regiones del Ñuble, Biobío, La Araucanía, Los Ríos, Los Lagos, Aysén y Magallanes.

Se presentan 330 eventos de muestreo, ocurridos entre septiembre de 2016 y octubre de 2017, con 1.300 registros de ocurrencia y 990 medidas asociadas a los eventos.

El proyecto “Monitoreo de la especie plaga Didymosphenia geminata en cuerpos de agua de la zona centro, sur y austral de Chile”, que mantiene la Subsecretaría de Pesca y Acuicultura (SSPA) de acuerdo al Reglamento de Plagas (REPLA) y que es ejecutado por el Instituto de Fomento Pesquero (IFOP); en el marco del Título VII artículo 92, letra D, de la Ley General de Pesca y Acuicultura, que regula los estudios de Investigación permanente de la SSPA. Este monitoreo se inició el año 2016 y se encuentra en la Etapa V (2020-2021). Para efectos de la presente publicación, se presentan los datos de la Etapa I, que abarca el periodo entre septiembre de 2016 – y octubre 2017.

La Etapa l tuvo una duración total de 14 meses. Se realizaron 2 campañas de muestreo, la primera campaña fue ejecutada entre octubre y diciembre de 2016, en época de primavera-verano, considerando 180 sitios de muestreo que abarcaron cuerpos de agua distribuidos entre la Región del Biobío, que incluye parte de la actual Región del Ñuble, y la Región de Magallanes y la Antártica Chilena. La segunda campaña se realizó entre marzo y julio de 2017, en época de otoño-invierno e incluyó 150 estaciones de muestreo abarcando desde la Región del Maule a la Región de Magallanes y la Antártica Chilena, incluyéndose en esa campaña, además, ríos y lagos de Tierra del Fuego.

En cada sitio de muestreo se registraron variables in situ como la temperatura del agua (°C), conductividad (µS/cm), sólidos suspendidos totales (ppm) y pH con equipos multiparámetros portátiles, entre otros.

Durante la campaña primavera-verano se registró la presencia de D. geminata en fitobentos, ensamble de diatomeas, fitoplancton y floraciones en 80 de las 180 estaciones de muestreo. En cambio, para la campaña de otoño invierno, se registró la presencia de la plaga en las diferentes muestras en 71 estaciones de las 150 estaciones muestreadas. En 124 de los 203 sitios de muestreo monitoreados durante esta etapa del Monitoreo, se registró la presencia de D. geminata en el fitobentos, fitoplancton, floraciones y/o ensamble de diatomeas bentónicas.

Sampling Description

Study Extent

El estudio considera un total de 180 estaciones durante la primera campaña y 150 estaciones durante la segunda campaña, localizadas en ríos selectos de las regiones del Maule, del Biobío (cuencas del río Biobío y río Itata), La Araucanía (cuencas de río Valdivia y río Bueno), Los Lagos (cuencas de río Yelcho, río Puelo y río Palena), Aysén (cuencas de río Aysén y río Baker) y Magallanes, incluida Tierra del Fuego.

Sampling

En cada uno de los sitios de muestreo se efectuaron las siguientes actividades: Inspección visual y desarrollo de una ficha en terreno; muestreo bentónico y planctónico con colecta de muestras biológicas; registro de variables físicas y químicas in situ; toma de muestras de agua para la determinación de variables químicas; todo bajo procedimientos de bioseguridad. Se obtuvieron muestras de microalgas (fitoplancton y perifiton), macroinvertebrados bentónicos, se registraron los parámetros físicos y químicos. La obtención de muestras de fitoplancton se ejecutó empleando una red de plancton de 37 µm la cual fue instalada a contracorriente por 10 o 5 minutos en profundidades entre 0.3-0.6 metro de profundidad. A partir de esta muestra se verificó la presencia de didymo en la columna de agua y la composición de la comunidad fitoplanctónica. A partir del perifiton se obtuvieron muestras para el análisis de la comunidad perifítica completa, muestras para el análisis de diatomeas y muestras de floraciones, cuando esta última estuviera presente. Posteriormente, en laboratorio se procedió a la identificación de las microalgas en las diferentes muestras obtenidas. Los resultados de las muestras de perifiton y diatomeas bentónicas son de carácter cuantitativo en abundancia absoluta células/mm2, mientras que, para las muestras de floraciones, los resultados obtenidos tienen carácter cuantitativo, pero en abundancia relativa. Por último, las muestras de fitoplancton corresponden a muestras de carácter cualitativo representadas en presencia o ausencia de las especies en la muestra. -Análisis en laboratorio para muestras de perifiton, floraciones y fitoplancton presencia/ausencia El análisis de las muestras se realizó utilizando un microscopio invertido de marca Carl Zeiss modelo Primo Vert, en objetivo 40x siguiendo la técnica descrita por Utermöhl, 1958. Esta técnica consiste en sedimentar un volumen conocido en una cámara, el cual puede ser observado con el microscopio invertido. Se rellenará la base de sedimentación con 1 ml de muestra previamente homogeneizada y en el caso de floraciones, debido a la alta densidad será necesario tomar 1 ml de muestra y llevarla a 15 ml con agua filtrada, para luego de esa dilución tomar 1 ml y llevarlo a la base de sedimentación. Tanto para las muestras de fitoplancton (presencia/ausencia) como para las de fitobentos y floraciones se realizó la identificación taxonómica a nivel de género, mediante el uso de literatura especializada de Krammer & Lange-Bertalot, 2000; Komárek & Fott, 1983; Parra & Bicudo. 1996; Parra, 1975, 2006; Pereira & Parra, 1984; Parra et al. 1982, 1983, 2005; Rivera et al. 1973, 1983; Rumrich et al. 2000. Para efectuar el recuento se procede a contar un número determinado de campos ópticos elegidos al azar, una técnica utilizada para estandarizar este recuento es contabilizar como mínimo 100 campos ópticos y un mínimo de 300 células por muestra (Alveal et al. 1995). - Análisis en laboratorio para muestras de ensamble de diatomeas Previo a la oxidación de la muestra, se realizará el conteo de células viables, para posteriormente corregir las densidades totales obtenidas del análisis de diatomeas y, específicamente, el porcentaje de células viables de D. geminata. Luego, se efectuará la oxidación de la materia orgánica y eliminación de las sales disueltas, utilizando la metodología propuesta por Battarbee (1986), donde se extrae una alícuota de muestra, la que será sometida a calor más peróxido de hidrogeno al 30% en un baño maría modelo YCW-04M. Posteriormente se lavaran las muestras con agua destilada, utilizando una centrifuga SIGMA modelo 1-6P. 2010. Luego se tomará desde un volumen conocido de muestra, y se dejará secar. Posteriormente se realizarán muestras permanentes con resina Naphrax (I.R=1.7) como medio de montaje. Para cada muestra se realizará un conteo de 300 valvas como mínimo. La identificación se realizará a nivel de especie utilizando un microscopio Carl Zeiss modelo Primo Star, con objetivo de inmersión de 100X, literatura especializada para diatomeas (Barber & Carter, 1996; Krammer & Lange-Bertalot, 2000; Rivera et al., 1982; Rumrich et al., 2000) y sitios web con taxonomía actualizada (https://diatoms.org// & http://craticula.ncl.ac.uk/EADiatomKey/html/index.html) Posteriormente los resultados obtenidos se expresarán en abundancias absolutas (cel/mm2 ) y abundancias relativas siguiendo la metodología de Battarbee (1986).

Quality Control

Es importante destacar que este corresponde al primer monitoreo de la plaga D. geminata que integra un solo esfuerzo de muestreo, desde la Región del Maule hasta Magallanes incluida Tierra del Fuego, y aborda todas las cuencas donde se ha reportado la presencia de didymo en su fase macroscópica y microscópica. En relación con los datos obtenidos a partir de este monitoreo de la especie D. geminata es que se efectúa una revisión extensa de la base de datos original y la metadata proporcionada por el Instituto de Fomento Pesquero, con el objetivo de entender la estructuración de los datos, siguiendo los estándares de calidad generados en conjunto con el Ministerio del Medio Ambiente. El primer paso para efectuar la sistematización de los datos fue identificar el conjunto de datos como un “Evento de monitoreo” (Event core) y sus respectivas extensiones de “Ocurrencias” (“Occurrence”) y “Medidas y Hechos” (“measurementOrFact”). A continuación, se describe la estructuración del núcleo de evento, y las extensiones de Ocurrencia y Medidas y Hechos.

Method steps

  1. Evento de Muestreo Una vez identificadas las extensiones y el núcleo del evento, se hizo un mapeo de la información original para detectar aquellos campos que tenían una correspondencia directa con el Estándar Darwin Core, como es el caso de los campos del núcleo de evento: “eventTime”, “country”, “countryCode”, “stateProvince”, “county”, “municipality”, “waterBody”, “verbatimElevation”, “verbatimLatitude”, “verbatimLongitude”, “verbatimCoordinateSystem”, “decimalLatitude”, “decimalLongitude”, “geodeticDatum” e “institutionCode”. Para el caso de las fechas originales, estas fueron transformadas según la norma ISO 8601-1:2019 utilizando la herramienta “Date Parsing”. Por otro lado, fue necesaria la creación de nuevos campos como “eventID” y “parentEventID” para lo cual se empleó en términos generales el código de la institución a cargo (“SUBPESCA: IFOP”), la especie objetivo del monitoreo (“DIDYMO”), la estación, campaña y código completo de la estación (“cod_est”). La información que no se encontraba en la base de datos original fue completada a partir del informe “Monitoreo de la especie plaga Didymosphenia geminata” en cuerpos de agua de la zona centro-sur austral, Etapa l 2016-17”, desde donde fue posible extraer los campos de “hábitat”, “samplingProtocol”, “sampleSizeUnit”, “samplingEffort” y “geodeticDatum”. Por último, para el campo “locationRemarks” se construyó a partir de los campos originales de “cuenca”, “subcuenca” y “subsubcuenca”. En el caso del campo “locationID”, se le designó la información correspondiente a “cod_sscuenca” y para el campo “locality” se le designó la unión entre “cod_sscuenca” y el nombre de la subsubcuenca.
  2. Ocurrencias Los valores de presencia/ausencia de didymo se obtuvieron a partir de información obtenida en cada estación donde se monitoreó perifiton, diatomeas, fitoplancton y floraciones, estructurándose la presencia por cada estación de monitoreo y asociándose el valor de ocurrencia de la especie didymo para cada uno de los grupos anteriores. A partir del campo “eventID” se elaboró el “occurrenceID” con la concatenación de “eventID”, “collectionCode” y “catalogNumber”. Otros campos de esta extensión se completaron con la información existente en la base de datos original y el informe, que corresponden a los campos de “ScientificName”, “occurrenceStatus”, “organismQuantity”, “organismQuantityType”, “basisOfRecord”, “type”, “datasetName”. La taxonomía de las ocurrencias (kingdom, phylum, class, order, family, genus,specificEpithet, infraspecificEpithet) se completó utilizando la herramienta Species Matching de GBIF. Finalmente, para estructurar la presencia/ausencia de la especie plaga se utilizó el campo “occurrenceStatus”.
  3. Extensión de Medidas y Hechos Tal como se indicó en un comienzo, el monitoreo también consideró la obtención de parámetros fisicoquímicos, por lo que fue necesario agrupar al menos 3 de los parámetros más importantes (temperatura, conductividad eléctrica y fósforo total) en una extensión de medidas y hechos (“measurementOrFact”). La estructuración de los datos fue similar a la extensión de Ocurrencias, es decir, asociando a cada estación los datos de los parámetros antes señalados.
    Para esta extensión, se crearon los campos “measurementID” a partir del “eventID”, mientras que los otros campos fueron completados con la información disponible en la base de datos original, correspondientes a: “measurementType”, “measurementValue”, “measurementUnit”, “measurementDeterminedBy”, “measurementDeterminedDate” y “measurementMethod”.

Taxonomic Coverages

Para el caso del ensamble de diatomeas, se trabajó con resolución taxonómica a nivel de especie, mientras que, para las comunidades fitoplanctónica y fitobentónica la determinación taxonómica para todas las Clases (Chlorophyceae, Cyanobacteria, Chrysophyceae y Bacillariophyceae), fue realizada hasta el nivel de género en concordancia con las líneas metodológicas del programa de monitoreo.
  1. Didymosphenia geminata
    common name: Didymo rank: species

Geographic Coverages

El estudio considera estaciones localizadas en cuencas andinas y costeras de las regiones del Maule (cuenca del río Maule), Ñuble (cuenca del río Itata), Biobío (cuenca del río Biobío), La Araucanía (cuencas del río Biobío, Imperial y Toltén), Los Ríos (cuencas del río Valdivia y río Bueno), Los Lagos (cuencas del río Bueno, río Yelcho, río Puelo y río Palena), Aysén del General Carlos Ibáñez del Campo (cuencas del río Palena, Cisnes, Aysén y Baker) y Magallanes y de la Antártica Chilena (cuencas del río Serrano y Grande en Tierra del Fuego).

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