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Herbario Amazónico Colombiano Dairon Cárdenas López

Citation

Cárdenas D, Sua S, Castaño Arboleda N (2025). Herbario Amazónico Colombiano Dairon Cárdenas López. Version 9.15. Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas - SINCHI. Occurrence dataset https://doi.org/10.15472/l7odt1 accessed via GBIF.org on 2025-05-13.

Description

Colección biológica del Herbario Amazónico Colombiano COAH, perteneciente al Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas SINCHI y que se encuentra registrado ante el Registro Nacional de Colecciones desde el 28 de marzo de 2001. Los registros han sido colectados desde el año 1856 hasta el año 2024, abarcando toda la región amazónica, cubriendo 5 países en total con un 99% de los registros en Colombia.

Este recurso cuenta a la fecha con 113.923 registros de plantas, pertenecientes a 239 familias, abarcando plantas vasculares y no vasculares. Un 89% se encuentra clasificado a nivel de especie, 9% a nivel de género y 2% a nivel de familia. Se incluyen 244 secuencias de ADN asociadas a 244 registros.

Sampling Description

Study Extent

Cuenca Amazónica Colombiana, aunque también se tiene información de la cuenca completa.

Sampling

No hay una metodología de muestreo dado que se trata de inventarios especialmente en áreas en donde hay vacíos de información.

Quality Control

Hay un proceso desde la colecta en campo hasta la publicación de los datos y cada uno tiene un control de calidad. En el proceso de estructuración y validación de los datos, se realizó el control de la calidad de la información proporcionada por COAH. A continuación, se enumeran los procesos asociados a esta actividad: 1. Revisión de la información documentada asociada a los datos biológicos; 2. Estructuración de los datos en el estándar Darwin Core (DwC) según elementos, definiciones y vocabularios controlados; 3. Unificar el conjunto de datos ya publicado con los nuevos registros suministrados; 4. Validación y limpieza de la información consignada en el DwC, 4.1. Corrección de errores de tipeo, para esta tarea se usó OpenRefine, adicionalmente se identificaron datos erróneos como sinonimias, con el uso de la API de GBIF para validación taxonómica https://github.com/SIB-Colombia/data-quality-open-refine/blob/master/ValTaxonomicAPIGBIF_ValTaxonomicaAPIGBIF.txt, complementado con la información encontrada en tropicos https://www.tropicos.org/home y el catalogo de plantas y líquenes de Colombia https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=catalogo_plantas_liquenes 4.2. Se realizó la conversión de las fechas, acorde a lo exigido en el estándar, 4.3. Se llevó a cabo la visualización de las coordenadas para su validación utilizando el proyecto de QGIS https://sib-colombia.github.io/Formacion/LAB/lab02/lab_valCoord.html del SiB Colombia y http://iobis.github.io/plotter/; 5. Finalmente, la base datos DwC se validó haciendo uso del Validador de datos - GBIF.

Method steps

  1. Esta metodología esta de acuerdo con el Proceso de Colecciones definido para la Gestión de Calidad. COLECTA Y PROCESAMIENTO DE EJEMPLARES BOTANICOS: La colección de las muestras botánicas se realiza en campo. Las cuales se prensan y numeran y a su vez en el cuaderno de campo se realiza la descripción de cada ejemplar con el número de colección, las muestras son alcoholizadas y enviadas como embalaje al Herbario Amazónico Colombiano COAH en Bogotá. Una vez en Bogotá, el material se coloca en el horno especializado para su deshidratación, a 80°C durante 12 horas, las muestras se separan con láminas de aluminio y cartón. Paralelamente, los datos de campo del cuaderno se digitan en un formato de fichas técnicas, éstas fichas una vez impresas se ingresan en cada una de las muestras botánicas ya secas. Con este paso se realiza una corroboración de ejemplares disecados frente al cuaderno de campo y sus datos.
  2. IDENTIFICACIÓN DEL MATERIAL Y SELECCIÓN PARA MONTAJE: Las colecciones botánicas secas se determinan taxonómicamente mediante comparación con la colección general del Herbario y con la ayuda de claves taxonómicas especializadas. Posteriormente se selecciona el material que va a ser montado, el cual se almacena en el taller de montaje.
  3. MONTAJE, SELLADO Y NUMERACIÓN DE EJEMPLARES BOTÁNICOS: Los ejemplares botánicos identificados taxonómicamente que están en buen estado y tienen alguna estructura fértil (flor o fruto) son montados en cartulina (cosidos y pegados), a cada ejemplar montado se le asigna un número de herbario consecutivo. Se almacenan en el taller para ser enviados a digitación.
  4. INGRESO A LA BASE DE DATOS: La información de cada ejemplar montado (ficha técnica y número de herbario único) se verifica e ingresa a la base datos conforme a "Serie de estándares para la gestión de información sobre biodiversidad en Colombia" (Suárez 2007). Se ingresa al congelador y son refrigerados por 24 horas, luego se almacena el sarcófago para clasificarlo e incorporado a la colección.
  5. INGRESO A LA COLECCIÓN: Una vez la información del ejemplar ha ingresado a la base de datos, cada ejemplar es incluido en la colección física del Herbario en la carpeta de acuerdo con el taxón correspondiente.
  6. FOTOGRAFIAS DE LA ESPECIE: Se selecciona un ejemplar representativo de la especie del cual se toma una fotografía digital, la cual se edita con las características definidas (600 x 800 pixeles) y posteriormente se copia al servidor en la carpeta correspondiente.
  7. PUBLICACION DE EJEMPLARES EN EL HERBARIO VIRTUAL: La información que ingresa a la base de datos se actualiza en el servidor web (Herbario Virtual) y se verifica, de acuerdo con el manual de usuario de la aplicación Herbario Virtual, cada seis meses se actualiza la información en el IPT SINCHI.

Additional info

Estos ejemplares están depositados en el Herbario Amazónico Colombiano COAH. La actualización, estructuración y validación de los registros, se realizó con el apoyo de la Agencia Nacional de Hidrocarburos – ANH, en el Convenio Marco Interadministrativo No. 20-099 donde se suscribe el Convenio Interadministrativo No. 20-115, cuyo objeto es “Aunar esfuerzos técnicos, financieros, jurídicos y administrativos para consolidar información de medio Biótico, que permita la construcción de una línea base regional para el departamento del Putumayo que facilite los procesos de planeación para los sectores productivos y la empresa privada, como herramientas estratégicas para la toma de decisiones por parte de la Autoridad Ambiental”. Agradecemos a la ANH y al SiB Colombia por facilitar la publicación de estos datos asegurando que estén disponibles de manera libre y gratuita para las personas de la región y para el público interesado en familiarizarse con la gran diversidad y riqueza natural que alberga esta zona de la Amazonia colombiana.

Taxonomic Coverages

La colección Herbario Amazónico Colombiano se encuentra organizada filogenéticamente bajo el sistema de Cronquist, A. 1981, esta colección cuenta con cerca de 120.000 ejemplares de plantas vasculares y 7.500 de plantas no vasculares catalogados. De la totalidad de plantas vasculares, el 99% cuenta con determinación taxonómica hasta el nivel de familia, el 98% hasta género y el 84% hasta especie. Mientras que del total de plantas no vasculares, el 90% cuentan con determinación a familia, el 85% determinación hasta género y el 62% determinación hasta especie.
  1. Acanthaceae
    rank: family
  2. Actinidiaceae
    rank: family
  3. Agavaceae
    rank: family
  4. Alismataceae
    rank: family
  5. Amaranthaceae
    rank: family
  6. Anacardiaceae
    rank: family
  7. Anemiaceae
    rank: family
  8. Anisophylleaceae
    rank: family
  9. Annonaceae
    rank: family
  10. Apiaceae
    rank: family
  11. Apocynaceae
    rank: family
  12. Aquifoliaceae
    rank: family
  13. Araceae
    rank: family
  14. Araliaceae
    rank: family
  15. Arecaceae
    rank: family
  16. Aristolochiaceae
    rank: family
  17. Asclepiadaceae
    rank: family
  18. Aspleniaceae
    rank: family
  19. Asteraceae
    rank: family
  20. Balanophoraceae
    rank: family
  21. Balsaminaceae
    rank: family
  22. Begoniaceae
    rank: family
  23. Bignoniaceae
    rank: family
  24. Bixaceae
    rank: family
  25. Blechnaceae
    rank: family
  26. Bombacaceae
    rank: family
  27. Boraginaceae
    rank: family
  28. Brassicaceae
    rank: family
  29. Bromeliaceae
    rank: family
  30. Brunelliaceae
    rank: family
  31. Burmanniaceae
    rank: family
  32. Burseraceae
    rank: family
  33. Cabombaceae
    rank: family
  34. Cactaceae
    rank: family
  35. Caesalpiniaceae
    rank: family
  36. Campanulaceae
    rank: family
  37. Cannabinaceae
    rank: family
  38. Cannaceae
    rank: family
  39. Capparaceae
    rank: family
  40. Caprifoliaceae
    rank: family
  41. Caricaceae
    rank: family
  42. Caryocaraceae
    rank: family
  43. Caryophyllaceae
    rank: family
  44. Cecropiaceae
    rank: family
  45. Celastraceae
    rank: family
  46. Chenopodiaceae
    rank: family
  47. Chloranthaceae
    rank: family
  48. Chrysobalanaceae
    rank: family
  49. Clethraceae
    rank: family
  50. Clusiaceae
    rank: family
  51. Cochlospermaceae
    rank: family
  52. Combretaceae
    rank: family
  53. Commelinaceae
    rank: family
  54. Connaraceae
    rank: family
  55. Convolvulaceae
    rank: family
  56. Costaceae
    rank: family
  57. Crassulaceae
    rank: family
  58. Cucurbitaceae
    rank: family
  59. Cupressaceae
    rank: family
  60. Cyatheaceae
    rank: family
  61. Cycadaceae
    rank: family
  62. Cyclanthaceae
    rank: family
  63. Cyperaceae
    rank: family
  64. Cyrillaceae
    rank: family
  65. Davalliaceae
    rank: family
  66. Dennstaedtiaceae
    rank: family
  67. Dichapetalaceae
    rank: family
  68. Dicksoniaceae
    rank: family
  69. Dilleniaceae
    rank: family
  70. Dioscoreaceae
    rank: family
  71. Dipterocarpaceae
    rank: family
  72. Droseraceae
    rank: family
  73. Dryopteridaceae
    rank: family
  74. Ebenaceae
    rank: family
  75. Elaeocarpaceae
    rank: family
  76. Equisetaceae
    rank: family
  77. Ericaceae
    rank: family
  78. Eriocaulaceae
    rank: family
  79. Erythroxylaceae
    rank: family
  80. Euphorbiaceae
    rank: family
  81. Fabaceae
    rank: family
  82. Flacourtiaceae
    rank: family
  83. Gentianaceae
    rank: family
  84. Geraniaceae
    rank: family
  85. Gesneriaceae
    rank: family
  86. Gleicheniaceae
    rank: family
  87. Gnetaceae
    rank: family
  88. Haemodoraceae
    rank: family
  89. Heliconiaceae
    rank: family
  90. Hernandiaceae
    rank: family
  91. Hippocastanaceae
    rank: family
  92. Hippocrateaceae
    rank: family
  93. Hugoniaceae
    rank: family
  94. Humiriaceae
    rank: family
  95. Hydrangeaceae
    rank: family
  96. Hydrocharitaceae
    rank: family
  97. Hydrophyllaceae
    rank: family
  98. Hymenophyllaceae
    rank: family
  99. Icacinaceae
    rank: family
  100. Iridaceae
    rank: family
  101. Ixonanthaceae
    rank: family
  102. Lacistemataceae
    rank: family
  103. Lamiaceae
    rank: family
  104. Lauraceae
    rank: family
  105. Lecythidaceae
    rank: family
  106. Lentibulariaceae
    rank: family
  107. Lepidobotryaceae
    rank: family
  108. Liliaceae
    rank: family
  109. Limnocharitaceae
    rank: family
  110. Lindsaeaceae
    rank: family
  111. Lissocarpaceae
    rank: family
  112. Loasaceae
    rank: family
  113. Loganiaceae
    rank: family
  114. Lomariopsidaceae
    rank: family
  115. Loranthaceae
    rank: family
  116. Lycopodiaceae
    rank: family
  117. Lygodiaceae
    rank: family
  118. Lythraceae
    rank: family
  119. Magnoliaceae
    rank: family
  120. Malpighiaceae
    rank: family
  121. Malvaceae
    rank: family
  122. Marantaceae
    rank: family
  123. Marattiaceae
    rank: family
  124. Marcgraviaceae
    rank: family
  125. Marsileaceae
    rank: family
  126. Mayacaceae
    rank: family
  127. Melastomataceae
    rank: family
  128. Meliaceae
    rank: family
  129. Mendonciaceae
    rank: family
  130. Menispermaceae
    rank: family
  131. Menyanthaceae
    rank: family
  132. Metaxyaceae
    rank: family
  133. Metteniusaceae
    rank: family
  134. Mimosaceae
    rank: family
  135. Monimiaceae
    rank: family
  136. Moraceae
    rank: family
  137. Musaceae
    rank: family
  138. Myricaceae
    rank: family
  139. Myristicaceae
    rank: family
  140. Myrsinaceae
    rank: family
  141. Myrtaceae
    rank: family
  142. Nyctaginaceae
    rank: family
  143. Nymphaeaceae
    rank: family
  144. Ochnaceae
    rank: family
  145. Olacaceae
    rank: family
  146. Oleaceae
    rank: family
  147. Oleandraceae
    rank: family
  148. Onagraceae
    rank: family
  149. Opiliaceae
    rank: family
  150. Orchidaceae
    rank: family
  151. Oxalidaceae
    rank: family
  152. Papaveraceae
    rank: family
  153. Passifloraceae
    rank: family
  154. Pedaliaceae
    rank: family
  155. Phytolaccaceae
    rank: family
  156. Piperaceae
    rank: family
  157. Plantaginaceae
    rank: family
  158. Poaceae
    rank: family
  159. Podocarpaceae
    rank: family
  160. Podostemaceae
    rank: family
  161. Polemoniaceae
    rank: family
  162. Polygalaceae
    rank: family
  163. Polygonaceae
    rank: family
  164. Polypodiaceae
    rank: family
  165. Pontederiaceae
    rank: family
  166. Portulacaceae
    rank: family
  167. Primulaceae
    rank: family
  168. Proteaceae
    rank: family
  169. Pteridaceae
    rank: family
  170. Quiinaceae
    rank: family
  171. Ranunculaceae
    rank: family
  172. Rapateaceae
    rank: family
  173. Rhamnaceae
    rank: family
  174. Rhizophoraceae
    rank: family
  175. Rosaceae
    rank: family
  176. Rubiaceae
    rank: family
  177. Rutaceae
    rank: family
  178. Sabiaceae
    rank: family
  179. Salicaceae
    rank: family
  180. Salviniaceae
    rank: family
  181. Sapindaceae
    rank: family
  182. Sapotaceae
    rank: family
  183. Schizaeaceae
    rank: family
  184. Scrophulariaceae
    rank: family
  185. Selaginellaceae
    rank: family
  186. Simaroubaceae
    rank: family
  187. Smilacaceae
    rank: family
  188. Solanaceae
    rank: family
  189. Sphenocleaceae
    rank: family
  190. Staphyleaceae
    rank: family
  191. Sterculiaceae
    rank: family
  192. Strelitziaceae
    rank: family
  193. Styracaceae
    rank: family
  194. Symplocaceae
    rank: family
  195. Taccaceae
    rank: family
  196. Tectariaceae
    rank: family
  197. Tepuianthaceae
    rank: family
  198. Tetrameristaceae
    rank: family
  199. Theaceae
    rank: family
  200. Thelypteridaceae
    rank: family
  201. Theophrastaceae
    rank: family
  202. Thurniaceae
    rank: family
  203. Thymelaeaceae
    rank: family
  204. Tiliaceae
    rank: family
  205. Tovariaceae
    rank: family
  206. Trigoniaceae
    rank: family
  207. Triuridaceae
    rank: family
  208. Turneraceae
    rank: family
  209. Ulmaceae
    rank: family
  210. Urticaceae
    rank: family
  211. Velloziaceae
    rank: family
  212. Verbenaceae
    rank: family
  213. Violaceae
    rank: family
  214. Viscaceae
    rank: family
  215. Vitaceae
    rank: family
  216. Vochysiaceae
    rank: family
  217. Woodsiaceae
    rank: family
  218. Xyridaceae
    rank: family
  219. Zamiaceae
    rank: family
  220. Zingiberaceae
    rank: family
  221. Zygophyllaceae
    rank: family

Geographic Coverages

Datos de colección de la cuenca amazónica en 5 países: Colombia (113.167), Perú (385), Brasil (227), Ecuador (85) y Venezuela (59).

Bibliographic Citations

Contacts

Dairon Cárdenas
originator
position: Curador – Director Herbario Amazónico Colombiano – COAH
Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas
Calle 20 #5-44
Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO
Telephone: +57 14442060
email: dcardenas@sinchi.org.co
homepage: http://www.sinchi.org.co/
userId: https://orcid.org/0000-0002-7495-7564
Sonia Sua
originator
position: Investigadora
Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas
Calle 20 #5-44
Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO
Telephone: +57 14442060
email: ssua@sinchi.org.co
homepage: http://www.sinchi.org.co/
userId: https://orcid.org/0000-0002-5975-1816
Nicolás Castaño Arboleda
originator
position: Investigador
Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas
Calle 20 #5-44
Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO
email: ncastano@sinchi.org.co
homepage: http://www.sinchi.org.co/
userId: https://orcid.org/0000-0003-2892-1074
Sonia Sua
metadata author
position: Investigadora
Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas
Calle 20 #5-44
Bogotá D.C.
Bogotá D.C.
CO
Telephone: +57 14442060
email: ssua@sinchi.org.co
homepage: http://www.sinchi.org.co/
userId: https://orcid.org/0000-0002-5975-1816
Luz Marina Mantilla Cárdenas
custodian steward
position: Directora General
Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas Sinchi
Calle 20 # 5 - 44
Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO
Telephone: +57 14442060
email: luzmarmantilla@sinchi.org.co
homepage: http://www.sinchi.org.co/
Nerieth Goretti Leuro Robles
processor
position: Contratista
SiB Colombia
Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO
email: goreleuro@gmail.com
userId: https://orcid.org/0000-0001-7172-7213
Dairon Cárdenas
administrative point of contact
position: Curador – Director Herbario Amazónico Colombiano – COAH
Instituto Amazónico de Investigaciones Científicas
Calle 20 #5-44
Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
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Telephone: +57 14442060
email: dcardenas@sinchi.org.co
homepage: http://www.sinchi.org.co/
userId: https://orcid.org/0000-0002-7495-7564
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