Metacomunidad de animales de charcos temporales de Rocha, Uruguay

Study Extent

El sitio de estudio está localizado en el Departamento de Rocha, Uruguay. Se trata de un sistema de charcos temporales que se forman en una matriz de pastizal inundable, en la cuenca de la Laguna Castillos. El muestreo se llevó a cabo en octubre de 2008.

Sampling

El muestreo siguió una rutina estandarizada. Se asumió una forma aproximadamente ovalada para los charcos. El número de estaciones de muestreo fue proporcional al tamaño de cada sistema. En general, se establecieron 10 estaciones de muestreo (cinco a lo largo del diámetro principal y cinco en el diámetro secundario). Cuando alguno de los diámetros midió menos de 10 o más de 50 m, se establecieron estaciones de muestreo cada dos y 10 m, respectivamente. Para más detalles, ver Rodríguez-Tricot & Arim 2020, Arim et al. 2011. Se colectaron peces, anfibios e invertebrados utilizando una red manual (15x20 cm, malla de 1 mm). A los individuos muestreados se les midió el largo, el alto y el ancho para estimar su biovolumen (Arim et al., 2010; Laufer et al., 2009), y se les asignó un grupo trófico con base en la literatura (Arim et al. 2010).

Quality Control

Se chequearon errores en la nomenclatura científica. Se agregaron datos sobre la autoría de los nombres científicos de las especies y se chequearon y completaron otros niveles de la jerarquía taxonómica, en el caso de que faltaran. Se incluyó el término de rango taxonómico según el nivel de resolución taxonómica alcanzada en la identificación. El código de R utilizado para la limpieza de datos está disponible en nuestro el repositorio de GitHub https://github.com/biodiversidata/rBiodiversidata (Grattarola 2021).

Method steps

1. El conjunto de datos se acondicionó para mejorar la capacidad de búsqueda, accesibilidad, interoperabilidad y reutilización de los datos recopilados. Se enriqueció la base incorporando algunos campos sugeridos por Darwin Core Biodiversity Data Standard (https://dwc.tdwg.org/). En particular se destacan los campos measurementType, measurementValue, measurementUnit.
2. Para la estandarización de la nomenclatura científica y la recuperación completa de las categorías taxonómicas, se utilizó el paquete R 'taxize' (Chamberlain and Szocs, 2013). Seguimos como referencia le Backbone taxonómico de GBIF y la base de datos del Sistema Integrado de Información Taxonómica (ITIS).

Anura; Arachnida; Branchiopoda; Characiformes; Clitellata; Collembola; Crustacea; Cyprinodontiformes; Gastropoda; Hydrozoa; Insecta; Malacostraca; Nematoda; Oligochaeta.

1. Coleoptera
   rank: order
2. Mollusca
   rank: phylum
3. Arthropoda
   rank: phylum
4. Insecta
   rank: class
5. Diptera
   rank: order
6. Amphipoda
   rank: order
7. Corixidae
   rank: family
8. Planorbidae
   rank: family
9. Hydrophilidae
   rank: family
10. Hymenoptera
    rank: order
11. Haliplidae
    rank: family
12. Hemiptera
    rank: order
13. Culicidae
    rank: family
14. Copepoda
    rank: class
15. Chironomidae
    rank: family
16. Animalia
    rank: kingdom
17. Clitellata
    rank: class
18. Hyalellidae
    rank: family
19. Carabidae
    rank: family
20. Brachyceridae
    rank: family
21. Annelida
    rank: phylum
22. Curculionidae
    rank: family
23. Cyclopoida
    rank: order
24. Scirtidae
    rank: family
25. Malacostraca
    rank: class
26. Gastropoda
    rank: class
27. Formicidae
    rank: family

Cuenca de la Laguna Castillos, Departamento de Rocha, Uruguay.