Anfibios y Reptiles del Centro Universitario Regional Noreste (UdelaR)
Citation
Camargo A, Sensseber M, Grattarola F (2021). Anfibios y Reptiles del Centro Universitario Regional Noreste (UdelaR). Version 1.1. Biodiversidata. Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/s2zwpe accessed via GBIF.org on 2024-09-01.Description
El conjunto de datos contiene datos primarios de especímenes de anfibios y reptiles depositados en la Colección de Vertebrados del Centro Universitario Regional Noreste Sede Rivera de la Universidad de la República. Incluye 697 especímenes recolectados en salidas de campo y muestreos no estandarizados, entre el 2009 y el 2019 a lo largo del territorio de Uruguay y en el sur de Brasil.Sampling Description
Study Extent
El conjunto de datos incluye 697 especímenes colectados en localidades de Uruguay en el estado de Rio Grande do Sul en Brasil, en el período entre enero de 2009 y diciembre de 2019.Sampling
Los registros son especímenes recolectados mediante diferentes técnicas como captura manual y trampas de caída, que luego fueron fijados en formol y preservados en etanol 70%. La gran mayoría de las georeferencias provienen de coordenadas geográficas tomadas mediante GPS, y secundariamente, mediante localización de puntos de muestreo en Google Earth. También en la mayoría de los casos los registros corresponden a campañas de muestreo para tesis y pasantías de investigación de grado y posgrado.Quality Control
Se chequearon errores en los nombres científicos, localización geográfica y fechas. Se agregaron datos sobre la autoría de los nombres científicos de las especies y se completaron los rangos taxonómicos desde Reino hasta el rango infraespecífico, se incluyó el término de rango taxonómico según el nivel de detalle de la especie. Se asignó a cada registro el nivel administrativo de Estado/Provincia y se incorporaron datos sobre la incertidumbre y precisión de la localización geográfica. El código de R utilizado para la limpieza de datos está disponible en nuestro repositorio de GitHub (https://github.com/bienflorencia/rBiodiversidata).Method steps
- Chequeo de nombres científicos. Verificación de errores ortográficos en los nombres científicos usando los paquetes de R 'taxize' (Chamberlain et al. 2020) y actualización de nombres científicos de acuerdo a Amphibian Species of the World (Frost 2021). El nombre original de la especie se mantuvo bajo el término "previousIdentifications".
- Recuperación completa de rangos taxonómicos superiores, inclusión del término de rango infraespecífico y la autoridad taxonómica para los nombres científicos.
- Verificación de errores o valores atípicos o inexactos en la localización geográfica. Incorporación de los campos de incertidumbre y precisión para los valores de latitud y longitud proporcionados.
- Identificación del estado/provincia geográfica a través de la base de datos del GeoNames Gazetteer utilizando el paquete R 'geonames' (Rowlingson 2019). Inclusión de términos estándares para los rangos geográficos más altos que el nivel de localidad (continente y país).
Taxonomic Coverages
El conjunto de datos reune un total de 32 especies de anfibios (6 familias) y 20 especies de reptiles (11 familias).
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Amphibiacommon name: Anfibios rank: class
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Reptiliacommon name: Reptiles rank: class
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Alsodidaerank: family
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Bufonidaerank: family
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Hylidaerank: family
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Leptodactylidaerank: family
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Microhylidaerank: family
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Odontophrynidaerank: family
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Amphisbaenidaerank: family
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Colubridaerank: family
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Diploglossidaerank: family
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Dipsadidaerank: family
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Gekkonidaerank: family
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Gymnophthalmidaerank: family
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Leptotyphlopidaerank: family
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Phyllodactylidaerank: family
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Teiidaerank: family
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Tropiduridaerank: family
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Viperidaerank: family
Geographic Coverages
Los datos tienen una cobertura geográfica que incluye 171 localidades de 16 departamentos de Uruguay y 4 localidades del estado de Rio Grande do Sul en Brasil.
Bibliographic Citations
- Chamberlain S, Szoecs E, Foster Z, Arendsee Z, Boettiger C, Ram K, Bartomeus I, Baumgartner J, O'Donnell J, Oksanen J, Tzovaras BG, Marchand P, Tran V, Salmon M, Li G, Grenié M (2020). taxize: Taxonomic information from around the web. R package version 0.9.98. - https://github.com/ropensci/taxize
- Frost DR (2021). Amphibian Species of the World: an online reference. Version 6.1 (2021-07-14). American Museum of Natural History, New York, USA. - https://amphibiansoftheworld.amnh.org/index.php
- Grattarola F (2021). rBiodiversidata: R Scripts. Zenodo, version 2.0. - https://doi.org/10.5281/zenodo.2642135
- Rowlingson B (2019). geonames: Interface to the "Geonames" Spatial Query Web Service. R package version 0.999. - https://CRAN.R-project.org/package=geonames
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