Colección Ictiológica del Instituto Alexander von Humboldt

Kevin-Giancarlo Borja-Acosta

doi:10.15472/7oysm0

Colección Ictiológica del Instituto Alexander von Humboldt

Citation

Borja-Acosta K (2018). Colección Ictiológica del Instituto Alexander von Humboldt. Version 32.5. Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt. Occurrence Dataset https://doi.org/10.15472/7oysm0 accessed via GBIF.org on 2018-05-23.

Description

La Colección de Peces de Agua Dulce del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IAvH-P) fue fundada en 1971 en Bogotá y luego trasladada a su ubicación actual en Villa de Levya en 1995. La colección de peces es uno de los repositorios ictiológicos mas grandes de Colombia con más de 16000 lotes catalogados y sistematizados en el software Specify. Esta colección contiene muestras de alrededor de 2000 localidades de los principales sistemas hidrográficos (Amazonas, Orinoco, Magalena-Cauca y las vertientes del Caribe y el Pacífico), ademas de todos los departamentos Colombianos. En términos taxonómicos, se encuentran representadas alrededor de 990 especies, aproximadamente el 66% del número total de especies dulceacuícolas nativas registradas para el país. El IAvH-P almacena también especies procedentes de otros países neotropicales (Brasil, Costa Rica, Ecuador, Guayana Francesa, Guyana, Panamá, Perú y Venezuela). Más de 60 especies nominales están representadas por ejemplares tipo, de las cuales 13 corresponden a holotipos y la información asociada se encuentra disponible en el catálogo de ejemplares tipo en línea, con imágenes en alta resolución. Los registros se encuentran disponibles a través de las plataformas SIB-Colombia, GBIF y CEIBA. En la actualidad, estamos desarrollando un aplicativo que permita obtener la información de los diferentes repositorios en línea, unificando los datos asociados a un espécimen (fotografía, radiografía, enlaces a las secuencias publicadas de ADN, así como los archivos de los artículos científicos, entre otros contenidos multimedia).

Sampling Description

Study Extent

Colombia

Sampling

Los ejemplares de la colección han sido capturados con métodos como: atarraya, electropesca, captura manual entre otros, sin embargo existe una incertidumbre grande pues se desconoce en gran parte dada la a antigüedad y procedencia de la colección.

Quality Control

Los ejemplares deben haber sido fijados en formol al 10% y preservados en etanol al 70%. Los ejemplares deben encontrarse fijados en una posición natural (i.e. no retorcidos) y enteros (i.e. sin disecciones y órganos internos no removidos). La información mínima asociada a los ejemplares incluye (para el caso de ejemplares provenientes de Colombia): datos completos de localidad de captura (departamento, municipio, nombre o descripción de la localidad específica, coordenadas geográficas), fecha de captura, nombres completos de los colectores e información detallada del permiso de colecta que avala la captura de los ejemplares. Información adicional (ejemplo hora de captura, arte pesca o método de captura, descripción del hábitat, medición de parámetros fisicoquímicos del cuerpo de agua donde se obtuvieron los ejemplares, mediciones de los ejemplares) es también documentada.

Method steps

Transcripción de catálogos físicos en Hoja de Excel (Archivo de Migración), validación de información geográfica de registros por parte de I2D, verificación de número de ejemplares por registro e identificación taxonómica hasta el nivel más detallado posible, ingreso de nuevos Números de Catálogo directamente en el Archivo de Migración, migración de registros desde Archivo de Migración a Specify y generación de archivo Darwin Core desde Specify.

Taxonomic Coverages

Los ejemplares están determinados a Familia, Género o Especie, el estatus o validez de los nombres científicos sigue la versión en línea más reciente del Catalog of Fishes de California Academy of Sciences: http://researcharchive.calacademy.org/research/ichthyology/catalog/fishcatmain.asp (Eschmeyer et al.), ademas para la clasificación de taxones de rangos taxonómicos superiores (Clase a Subrorden) se siguió a Betancur-R. et al. (2017). Para los siguientes grupos se siguieron los trabajos señalados: Orden Gymnotiformes: Tagliacollo et al. (2016), orden Characiformes: Mirande (2009, 2010) y Oliveira et al. (2011), orden Siluriformes: Sullivan et al. (2006), superfamilia Doradoidea: Birindelli (2014), superfamilia Pimelodoidea: Sullivan et al. (2013), familia Cichlidae: López-Fernández et al. (2010), subfamilia Stevardiinae: Thomaz et al. (2015), subfamilia Hypostominae: Lujan et al. (2015), subfamilias Hypoptopomatinae y Otothyrinae: Roxo et al. (2014), subfamilia Loricariinae: Covain et al. (2016), los grupos restantes: Nelson et al. (2016).

Actinopterygii
rank: class
Chondrichthyes
rank: class
Sarcopterygii
rank: class
Siluriformes
rank: order
Characiformes
rank: order
Perciformes
rank: order
Cyprinodontiformes
rank: order
Synbranchiformes
rank: order
Gymnotiformes
rank: order
Tetraodontiformes
rank: order
Clupeiformes
rank: order
Myliobatiformes
rank: order
Pleuronectiformes
rank: order
Beloniformes
rank: order
Osteoglossiformes
rank: order
Salmoniformes
rank: order
Batrachoidiformes
rank: order
Orectolobiformes
rank: order
Scorpaeniformes
rank: order
Anguilliformes
rank: order
Rajiformes
rank: order
Albuliformes
rank: order
Elopiformes
rank: order
Atheriniformes
rank: order
Syngnathiformes
rank: order
Gasterosteiformes
rank: order
Aulopiformes
rank: order
Lepidosireniformes
rank: order
Cypriniformes
rank: order

Geographic Coverages

Los registros de la colección son principalmente de Colombia, La clasificación departamental y municipal sigue la clasificación del DANE a marzo 2012 (http://190.25.231.237/dvpbuscar/dvpbuscar.html). Adicionalmente cuenta con registros de los siguientes países: Costa Rica, Ecuador, Guayana Francesa, Guyana, Panamá, Perú y Venezuela. Cuenta con registros de especímenes de los 32 departamentos de Colombia.

Bibliographic Citations

Betancur-R. R, Wiley EO, Arratia G, Acero A, Bailly N, Miya M, Lecointre G, Ortí G (2017) Phylogenetic classification of bony fishes. BMC Evolutionary Biology 2017: 162. https://doi.org/10.1186/s12862-017-0958-3 -
Birindelli JLO (2014) Phylogenetic relationships of the South American Doradoidea (Ostariophysi: Siluriformes) Neotropical Ichthyology 12: 451–564. https://doi.org/10.1590/1982-0224-20120027. -
Covain R, Fisch-Muller S, Oliveira C, Mol JH, Montoya-Burgos JI, Dray S (2016) Molecular phylogeny of the highly diversified catfish subfamily Loricariinae (Siluriformes, Loricariidae) reveals incongruences with morphological classification. Molecular Phylogenetics and Evolution 94: 492–517. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2015.10.018 -
Eschmeyer WN, Fricke R, van der Laan R (eds). CATALOG OF FISHES: GENERA, SPECIES, REFERENCES. http://researcharchive.calacademy.org/research/ichthyology/catalog/fishcatmain.asp -
López-Fernández H, Winemiller KO, Honeycutt RL (2010) Multilocus phylogeny and rapid radiations in Neotropical cichlid fishes (Perciformes: Cichlidae: Cichlinae). Molecular Phylogenetics and Evolution 55: 1070–1086. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2010.02.020 -
Lujan NK, Armbruster JW, Lovejoy NR, López-Fernández H (2015) Multilocus molecular phylogeny of the suckermouth armored catfishes (Siluriformes: Loricariidae) with a focus on subfamily Hypostominae. Molecular Phylogenetics and Evolution 82: 269–288. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2014.08.020 -
Mirande JM (2009) Weighted parsimony phylogeny of the family Characidae (Teleostei: Characiformes). Cladistics 25: 1–40. https://doi.org/10.1111/j.1096-0031.2009.00262.x. -
Mirande JM (2010) Phylogeny of the family Characidae (Teleostei: Characiformes) from characters to taxonomy. Neotropical Ichthyology 8: 385–568. https://doi.org/10.1590/S1679-62252010000300001. -
Nelson JS, Grande T, Wilson MVH (2016) Fishes of the world. Fifth edition. John Wiley & Sons, Hoboken, 707 pp. https://doi.org/10.1002/9781119174844. -
Oliveira C, Avelino GS, Abe KT, Mariguela TC, Benine RC, Ortí G, Vari RP Corrêa e Castro RM (2011) Phylogenetic relationships within the speciose family Characidae (Teleostei: Ostariophysi: Characiformes) based on multilocus analysis and extensive ingroup sampling. BMC Evolutionary Biology 11: 275. https://doi.org/10.1186/1471-2148-11-275. -
Roxo FF, Albert JS, Silva GSC, Zawadzki CH, Foresti F, Oliveira C (2014) Molecular phylogeny and biogeographic history of the armored Neotropical catfish subfamilies Hypoptopomatinae, Neoplecostominae and Otothyrinae (Siluriformes: Loricariidae). PLoS ONE 9: e105564. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0105564. -
Sullivan JP, Lundberg JG, Hardman M (2006) A phylogenetic analysis of the major groups of catfishes (Teleostei: Siluriformes) using rag1 and rag2 nuclear gene sequences. Molecular Phylogenetics and Evolution 41: 636–662. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2006.05.044. -
Sullivan JP, Muriel-Cunha, J Lundberg JG (2013) Phylogenetic relationships and molecular dating of the major groups of catfishes of the Neotropical superfamily Pimelodoidea (Teleostei, Siluriformes) Proceedings of the Academy of Natural Sciences of Philadelphia 162: 89–110. https://doi.org/10.1635/053.162.0106. -
Tagliacollo VA, Bernt MJ, Craig JM, Oliveira C, Albert JS (2016) Model-based total evidence phylogeny of Neotropical electric knifefishes (Teleostei, Gymnotiformes) Molecular Phylogenetics and Evolution 95: 20–33. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2015.11.007. -
Thomaz AT, Arcila D, Ortí G, Malabarba LR (2015) Molecular phylogeny of the subfamily Stevardiinae Gill, 1858 (Characiformes: Characidae): classification and the evolution of reproductive traits. BMC Evolutionary Biology 15: 146. https://doi.org/10.1186/s12862-015-0403-4. -

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