Colección de algas del Museo de Historia Natural de la Universidad de la Amazonia

Study Extent

Los ejemplares que se encuentran actualmente en el proceso de ingreso y acreditación para la colección de algas de la UAM corresponden a la región Andino-amazónica específicamente al departamento de Caquetá y al sur oriente del departamento del Huila.

Sampling

Los ejemplares ingresados a la colección son procedentes de diferentes salidas de campo y trabajos de grado de estudiantes de la Universidad de la Amazonia

Quality Control

En el proceso de estructuración y validación de los datos, se realizó el control de la calidad de la información proporcionada por UAM. A continuación, se enumeran los procesos asociados a esta actividad: 1. Revisión de la información documentada asociada a los datos biológicos; 2. Estructuración de los datos en el estándar Darwin Core (DwC) según elementos, definiciones y vocabularios controlados; 3. Validación y limpieza de la información consignada en el DwC, 3.1. Corrección de errores de tipeo, para esta tarea se usó OpenRefine, adicionalmente se identificaron datos erróneos como sinonimias, con el uso de la API de GBIF para validación taxonómica https://github.com/SIB-Colombia/data-quality-open-refine/blob/master/ValTaxonomicAPIGBIF_ValTaxonomicaAPIGBIF.txt, apoyado de la información encontrada en tropicos https://www.tropicos.org/home y algadatabase https://www.algaebase.org/ 3.2. Se realizó la conversión de las fechas, acorde a lo exigido en el estándar, 3.3. Se llevó a cabo la visualización de las coordenadas para su validación utilizando el proyecto de QGIS https://sib-colombia.github.io/Formacion/LAB/lab02/lab_valCoord.html del SiB Colombia; 4. Finalmente, la base datos DwC se validó haciendo uso del Validador de datos - GBIF.

Method steps

1. Se colectan las muestras en campo y se preservan en formol al 4%

Se cuenta con un total de 215 registros que representan cinco reinos diferentes: Bacteria (47 registros), Chromista (85 registros), Eubacteria (8 registros), Plantae (64 registros) Protozoa (11 registros). Para el reino bacteria se reportan doce familias diferentes, donde las más representativas son Oscillatoriaceae (9 registros) y Merismopediaceae (5 registros).

1. Oscillatoriaceae
   rank: family
2. Merismopediaceae
   rank: family
3. Aphanothecaceae
   rank: family
4. Leptolyngbyaceae
   rank: family
5. Scytonemataceae
   rank: family
6. Spirulinaceae
   rank: family
7. Chroococcaceae
   rank: family
8. Hyellaceae
   rank: family
9. Microcoleaceae
   rank: family
10. Microcystaceae
    rank: family
11. Pseudanabaenaceae
    rank: family
12. Stigonemataceae
    rank: family

Del reino Chromista se reportan catorce familias, donde las más representativas son: Gomphonemataceae (10 registros), Bacillariaceae (6 registros), Sellaphoraceae (6 registros), Amphipleuraceae (5 registros).

1. Gomphonemataceae
   rank: family
2. Bacillariaceae
   rank: family
3. Sellaphoraceae
   rank: family
4. Amphipleuraceae
   rank: family
5. Eunotiaceae
   rank: family
6. Pinnulariaceae
   rank: family
7. Fragilariaceae
   rank: family
8. Achnanthidiaceae
   rank: family
9. Diadesmidaceae
   rank: family
10. Staurosiraceae
    rank: family
11. Ulnariaceae
    rank: family
12. Melosiraceae
    rank: family

Para el reino Eubacteria solo se cuenta con la representación de dos familias Microcystaceae (5 registros), Pseudanabaenaceae (3 registros).

1. Microcystaceae
   rank: family
2. Pseudanabaenaceae
   rank: family

El reino Plantae esta representado pos once familias siendo Desmidiaceae (15 registros) y Oedogoniaceae (13 registros) las que presentan mayor número de registros.

1. Desmidiaceae
   rank: family
2. Oedogoniaceae
   rank: family
3. Closteriaceae
   rank: family
4. Zygnemataceae
   rank: family
5. Chaetophoraceae
   rank: family
6. Coleochaetaceae
   rank: family
7. Volvocaceae
   rank: family
8. Nostocaceae
   rank: family
9. Selenastraceae
   rank: family
10. Mesotaeniaceae
    rank: family
11. Peniaceae
    rank: family

Por último, el reino Protozoa esta representado por tres familias: Phacidae (5 registros), Euglenaceae (3 registros), Euglenidae (3 registros).

1. Phacidae
   rank: family
2. Euglenaceae
   rank: family
3. Euglenidae
   rank: family

Se cuenta con ejemplares de Cartagena del Chairá departamento de Caquetá y Pitalito del departamento del Huila.