Colección de Microorganismos endófitos aislados de plantas de banano (Musa sp)

Study Extent

Colección de microorganismos endófitos aislados de plantas de banano (Musa sp).

Sampling

Los microorganismos endófitos fueron aislados de cinco tejidos diferentes de plantas de banano variedad Valery, provenientes de fincas productoras de banano de exportación de la región del Urabá antioqueño, Colombia.

Method steps

1. Se aislaron microorganismos de tejidos libres de la enfermedad del Moko (Finca El Cortijo; Sistema de coordenadas de referencia (SCR): 07°49´24.172"/ 076°39´23.915) y de plantas con tejidos sintomáticos de la enfermedad (Finca Mi Capi; SCR: 07°54´50.05429"/ 76°38´29.35407"), tomando tres muestras de las hojas 2, 5 y 10, cormo y pseudotallo, cada muestra de tejido proveniente de la misma planta, para un total de tres plantas pertenecientes al mismo lote de la finca seleccionada. Una vez en el laboratorio las muestras fueron procesadas antes de 48 h después de colectadas, obteniendo una muestra compuesta de las tres réplicas de un mismo tejido.
2. Los microorganismos endófitos presentes en las raíces de plantas de banano variedad Williams a nivel invitro con aproximadamente 9 meses de desarrollo in vitro y sembradas en medio MS(s) a 30°C y fotoperíodo 12 h/12h, se emplearon 5 g de raíces, se desinfectaron con hipoclorito de sodio al 1,5% por 15 min, 3 lavados con ADE, etanol 70% por 20 min y tres lavados finales con ADE.
3. Las raíces desinfectadas se llevaron a 45 mL de buffer fosfato pH 7,4 en un Ultraturrax IKA 20 W para macerar las raíces por 10 min a 2000 rpm. A la suspensión resultante se le realizaron diluciones seriadas entre 100 hasta 10-3 y se sembraron por superficie 100 L de cada una de las diluciones en los medios TSA x 0,5 (9 g/L de bactoagar BD y 20 g/L de TSA 105458, Merck), AIA (0,1 g/L de L- Asparagina; 0,5 g/L de K2HPO4; 0,001 g/L de FeSO47H2O; 2 g/L de caseinato de sodio; 0,1 g/L de MgSO47H2O y 15 g/L de Agar), YDC (20 g/L de CaCO3, 20 g/L de glucosa, 10 g/L de extracto de levadura y 15 g/L de bactoagar a pH 7,0) y PIA (1,4 g/L de MgCl2; 20 g/L de proteosa peptona; 10 g/L de sulfato de potasio; 0,025 g/L de triclosán y 13,6 g/L de bactoagar (281210, Difco) a pH 7,0).
4. Las cajas Petri se incubaron por 5 días a 30°C y posteriormente se determinó el tamaño de la población microbiana mediante al conteo de unidades formadoras de colonia (UFC) en aquellas cajas donde hubiera entre 30 y 300 colonias por caja. De dichas cajas se determinó la morfología de las colonias y su abundancia, y se conservó 1 colonia por morfotipo/réplica.

El presente conjunto de datos cuenta con 994 registros biológicos, distribuidos en 2 reinos: Bacteria (98%) y Fungi (1.91%). Un 44% está clasificado a nivel de especie, 12% a género y un 43% a reino. Microorganismos (Bacterias y Levaduras). Filo Proteobacteria (familias: Burkholderiaceae, Comamonadaceae, Enterobacteriaceae, Pseudomonadaceae, Rhizobiaceae, Xanthomonadaceae). Filo Actinobacteria (familias Microbacteriaceae, Mycobacteriaceae). Filo Firmicutes (familia: Bacillaceae) Filo Bacteriodetes (familia: Flavobacteriaceae)

1. Xhantomonas
   common name: Xhantomonas rank: genus
2. Variovorax
   common name: Variovorax rank: genus
3. Rhizobium
   common name: Rhizobium rank: genus
4. Bacillus
   common name: Bacillus rank: genus
5. Microbacterium
   common name: Microbacterium rank: genus
6. Stenotrophomonas
   common name: Stenotrophomonas rank: genus
7. Pantoea
   common name: Pantoea rank: genus
8. Curtobacterium
   common name: Curtobacterium rank: genus
9. Enterobacter
   common name: Enterobacter rank: genus
10. Candida
    common name: Candida rank: genus
11. Acitenobacter
    common name: Acitenobacter rank: genus
12. Herbaspirillum
    common name: Herbaspirillum rank: genus
13. Rhodotorula
    common name: Rhodotorula rank: genus
14. Methylobacterium
    common name: Methylobacterium rank: genus
15. Acinetobacter
    common name: Acinetobacter rank: genus
16. Staphylococcus
    common name: Staphylococcus rank: genus
17. Paenibacillus
    common name: Paenibacillus rank: genus

Se aislaron microorganismos de tejidos libres de la enfermedad del Moko en la Finca El Cortijo; Sistema de coordenadas de referencia (SCR): 07°49´24.172"/ 076°39´23.915) y de plantas con tejidos sintomáticos de la enfermedad en la Finca Mi Capi; SCR: 07°54´50.05429"/ 76°38´29.35407".