DFO Quebec Region Fish and invertebrate assemblages in coastal areas of the St. Lawrence Estuary (north shore) sampled with a beam trawl

Study Extent

The north shore of the St. Lawrence Estuary between Portneuf-sur-Mer and Pointe-des-Monts at depths ranging from 10 to 50 meters. Data were collected in various cruises: • June 28th to July 5th 2019 (NGCC Leim) • September 30th to October 9th 2019 (NGCC Leim) • October 1st to October 10th 2020 (NGCC Leim) • April 22nd to May 5th 2021 (NGCC Perley) • October 15th to October 24th 2021 (NGCC Perley) // Rive nord de l’Estuaire du Saint-Laurent entre Portneuf-sur-Mer et Pointe-des-Mont à des profondeurs entre 10 et 50 mètres. Les données ont été récoltées lors de différentes missions en mer : • 28 juin au 5 juillet 2019 (NGCC Leim) • 30 septembre au 9 octobre 2019 (NGCC Leim) • 1er octobre au 10 octobre 10 2020 (NGCC Leim) • 22 avril au 5 may 2021 (NGCC Perley) • 15 octobre au 24 octobre 2021 (NGCC Perley)

Sampling

The beam trawl used to generate this data set consists of a frame (width of 2.8 m, height of 0.8 m) equipped with a 6.5 m long net with 40 mm diamond mesh, which is lined with a net (skirt) of square mesh (5 mm) at the cod-end (length 2 m) and a protective apron (75 mm mesh) on the ventral portion. Three skid chains are linked at the base of the skates. Each station corresponds to a 5 to 10 minutes tow along an isobath at a speed of about 2 knots. At each haul, the trawl catch was placed on a sorting table on the deck and the organisms were sorted and identified at the best possible taxonomic resolution. Most taxa were independently weighed. Some invertebrates taxa were subsampled, counted and weighted in order to estimate their contribution (weight and number) to the total catch. Additionally, the first 30 fish of each species were measured and weighed individually. // Le chalut à perche utilisé pour générer ce jeu de données est constitué d’un cadre, d’une largeur de 2.8 m et d’une hauteur de 0.8 m, équipé d’un filet de 6.5 m de long en mailles diamant 40 mm, lequel est doublé d’un filet (jupette) de mailles carrées (5 mm) au niveau du cul-de-chalut (longueur 2 m) et d’un tablier protecteur (mailles 75 mm) sur la portion ventrale. Au niveau de la partie inférieure de l’engin, trois chaînes débusqueuses sont tendues à la base des patins. Chaque station correspond à un trait de chalut d’une durée de 5 à 10 minutes réalisé le long d’un isobathe à une vitesse d’environ 2 nœuds. La capture de chaque trait a été déposée sur une table de tri sur le pont et les organismes ont été triés et identifiés à la meilleure résolution taxonomique possible. La plupart des taxon ont été pesés séparément. Certains taxons d’invertébrés ont été sous-échantillonnés, dénombrés et pesés afin d’estimer leur contribution (en poids et en nombre) à la capture totale. De plus, les 30 premier poissons de chaque espèce ont été mesurés et pesés individuellement.

Quality Control

Taxonomic names were verified on the World Register of Marine Species (WoRMS) to match recognized standards. The WoRMS match has been put in the scientificNameID field in the occurrence file. Data quality control was performed using the R packages obistools and worrms. All sampling locations were plotted on a map to perform a visual check confirming that the latitude and longitude coordinates were within the described sampling area. // Tous les noms taxonomiques ont été vérifiés sur le registre mondial des espèces marines (WoRMS) pour correspondre aux normes reconnues. La correspondance WoRMS a été placée dans le champ scientificNameID du fichier d'occurrence. Le contrôle de la qualité des données a été effectué à l'aide des packages R obistools et worrms. Tous les emplacements d'échantillonnage ont été reportés sur une carte afin d'effectuer un contrôle visuel confirmant que les coordonnées de latitude et de longitude se trouvaient dans la zone d'échantillonnage décrite.

Method steps

1. The organisms were identified using: Chabot, Robert and Anne Rossignol. 2003. Algues et faune du littoral du Saint-Laurent maritime : Guide d'identification. Institut des Sciences de la mer de Rimouski, Rimouski; Pêches et Océans Canada (Institut Maurice-Lamontagne), Mont-Joli. 113 pages. Nozères, C., Archambault, D., Chouinard, P.-M., Gauthier, J., Miller, R., Parent, E., Schwab, P., Savard, L., and Dutil, J.-D. 2010. Identification guide for marine fishes of the estuary and northern Gulf of St. Lawrence and sampling protocols used during trawl surveys between 2004 and 2008. Can. Tech. Rep. Fish. Aquat. Sci. 2866: xi + 243 p Nozères C., Archambault, D. and Miller, R. 2014. Photocatalogue of invertebrates of the Estuary and northern Gulf of St. Lawrence from trawl surveys (2005-2013). Can. Manuscr. Rep. Fish. Aquat. Sci. 3035 : iv + 221 p Savard, L. and Nozères, C. 2012. Atlas of shrimp species of the Estuary and northern Gulf of St. Lawrence. Can. Tech. Rep. Fish. Aquat. Sci. 3007: vi + 67 p Scott, W. B. et M. G. Scott. 1988. Atlantic fishes of Canada. Can. Bull. Fish. Aquat. Sci. 219: 731 pages. Scientific name matching with WoRMS was made as follows. Records were extracted from the Biodiversity database (data management section of scientific advice, information and support branch, Science Branch, Quebec Region, Fisheries and Oceans Canada) using SQL. Les organismes ont été identifiés à l'aide de : Chabot, Robert et Anne Rossignol. 2003. Algues et faune du littoral du Saint-Laurent maritime : Guide d'identification. Institut des Sciences de la mer de Rimouski, Rimouski ; Pêches et Océans Canada (Institut Maurice-Lamontagne), Mont-Joli. 113 pages. Nozères, C., Archambault, D., Chouinard, P.-M., Gauthier, J., Miller, R., Parent, E., Schwab, P., Savard, L. et Dutil. J.-D. 2010. Guide d’identification des poissons marins et protocoles d’échantillonnage utilisés lors des relevés annuels de l’abondance du poisson de fond dans l’estuaire et le nord du golfe Saint-Laurent (2004-2009). Rapp. tech. can. sci. hal. aquat. 2866 : xi + 243 p. Nozères C., Archambault, D. et Miller, R. 2014. Photo-catalogue d'invertébrés de l’estuaire et du nord du golfe du Saint-Laurent des relevés au chalut (2005-2013). Rapp. manus. can. sci. halieut. aquat. 3035 : iv + 222 p. Savard, L. et Nozères, C. 2012. Atlas des espèces de crevettes de l’estuaire et du nord du golfe du Saint-Laurent. Rapp. tech. can. sci. halieut. aquat. 3007: vi + 67 p. Scott, W. B. et M. G. Scott. 1988. Atlantic fishes of Canada. Can. Bull. Fish. Aquat. Sci. 219: 731 pages. La correspondance des noms scientifiques avec WoRMS a été assurée comme suit. Les enregistrements ont été extraits de la base de données sur la biodiversité (section de gestion des données de la Direction des avis, de l'information et du soutien scientifiques, Direction des sciences, Région du Québec, Pêches et Océans Canada) en utilisant SQL.

The north shore of the St. Lawrence Estuary between Portneuf-sur-Mer and Pointe-des-Monts at depths ranging from 0 to 50 meters. Rive nord de l’Estuaire du Saint-Laurent entre Portneuf-sur-Mer et Pointe-des-Mont à des profondeurs entre 0 et 50 mètres.