Microorganismos asociados a enfermedades en diferentes cultivares de cítricos en Colombia

Study Extent

Sampling

Method steps

1. Se recolectaron 70 muestras de árboles de cítricos con síntomas de gomosis, chancro ó agrietamiento de tronco y ramas; clorosis generalizada del árbol y marchitez, de las cuales 68 fueron colectadas en el lote experimental de cultivares de cítricos ubicado en el centro de investigación Palmira (Valle del Cauca) de Agrosavia y otras dos muestras que fueron tomadas en el lote de cultivares de cítricos establecido en el centro de investigación Nataima de Agrosavia (Espinal-Tolima).
2. De las 68 muestras colectadas en el lote de Agrosavia C. I. Palmira, 66 fueron tomadas del tronco y las ramas de los árboles afectados con gomosis (secreción gomosa de color ámbar), chancro ó agrietamiento y dos fueron tomadas del suelo de los árboles con clorosis y marchitez. Las dos muestras colectadas en el lote del C. I. Nataima de Agrosavia, fueron tomadas del tronco y las ramas de los árboles con síntomas de gomosis, chancro ó agrietamiento.
3. A partir de los muestreos realizados se obtuvo un total de 70 aislamientos, de los cuales se identificaron morfológicamente como: Lasiodiplodias sp. (54), Phytophthoras sp. (14), Pythium sp. (1) y Neofusicoccum sp. (1). Para Lasiodiplodia y Neofusicoccum se emplearon las claves taxonómicas de Phillips et. al, 2013. Para la identificación morfológica de los Oomycetes Phytophthora y Pythium se emplearon las claves dadas por Drenth & Sendall, (2001); Van Der Plaats-Niterink, (1998). Se realizó el registro de los aislados obtenidos con información relevante de origen e identificación.
4. Adicionalmente se colectó 23 muestras de árboles de cítricos con y sin síntomas de tristeza; retraso en el crecimiento de las plantas, aclaramiento de las nervaduras de las hojas, acucharamiento foliar, amarillamiento, marchitez y muerte de los árboles. La totalidad de las muestras fueron tomadas en el lote experimental de cultivares de cítricos ubicado en el centro de investigación Palmira (Valle del Cauca) de Agrosavia, las muestras consistieron en brotes jóvenes colectados en los 4 puntos cardinales de los árboles.
5. Finalmente se colectó 19 muestras de árboles de cítricos del lote experimental de cítricos del centro de investigación Caribia (Zona Bananera) de plantas con síntomas foliares y de frutos de HLB; deverdizado asimétrico con distribución desuniforme a lo largo de la planta, síntomas de deficiencias nutricionales y frutos asimétricos. Las muestras consitieron de brotes colectados a lo largo del dosel de la planta con los síntomas previamente descritos.
6. A partir de los muestreos se obtuvo un banco de RNA con 23 muestras y de DNA con 19 muestras de plantas de cítricos, mediante los cuales se logró la detección del virus de la tristeza de los cítricos y Candidatus Liberibacter respectivamente, haciendo uso de los cebadores específicos CN150-CN151 (Rubio et. al, 1996) y Oi1-Oi2c (Jagoueix et. al, 1996).

1. Lasiodiplodia
   rank: genus
2. Phytophthora
   rank: genus
3. Candidatus Liberibacter
   rank: genus
4. Neofusicoccum
   rank: genus
5. Pythium
   rank: genus
6. Citrus triteza virus
   rank: species