Registros de hongos fitopatógenos y hongos no patogénicos aislados de Tomate en Colombia

Study Extent

La zonas producturas del cultivo de Tomate con incidencia de marchitamiento vascular presentes en los departamentos de Antioquia, Boyacá, Cundinamarca y Caldas.

Sampling

Las muestras vegetales se tomaron en cultivos comerciales de Tomate afectados por marchitez vascular, donde a partir de la inspección visual se identificaron los focos que presentaban plantas con síntomas. A partir de allí, se realizó un muestreo dirigido hacia estas plantas y con una navaja previamente desinfectada se hicieron cortes transversales en la base del tallo y la corona de la raíz para identificar el estado de los haces vasculares, luego, se tomaron muestras de planta completa. Se tomaron muestras al azar en cada lote, dependiendo de disponibilidad de material y permiso de colecta del agricultor. Las muestras se envolvieron en papel y se transportaron en bolsas plásticas, debidamente etiquetadas de acuerdo con el formato de información de estas, luego se transportron al laboratorio del centro de investigación de Agrosavia.

Quality Control

Las muestras se transportaron en bolsas plásticas debidamente etiquetadas de acuerdo con el formato de información de estas, las cuales se ubicaron en recipientes en los que se mantuvo el aislamiento para su transporte al laboratorio del centro de investigación de Agrosavia.

Method steps

1. Se realizaron colectas de plantas de Tomate con síntomas de marchitez vascular en cultivos de Cundinamarca, Boyacá, Antioquia y Caldas. Para aquellas plantas que mostraron síntomas característicos de le enfermedad, se recolectó la planta completa, luego en laboratorio se realizaron los aislamientos de Fusarium spp.
2. Teniendo en cuenta que las especies del género Fusarium corresponden a un grupo de hongos cosmopolitas ampliamente distribuidos en el ambiente, se realizó el aislamiento de cada colonia identificada como Fusarium sp. en cajas de Petri de manera independiente, en medios de cultivo PDA.
3. La identificación se realizó hasta especie basados en el sistema reportado por Nelson et al (1983) y Leslie y Sumerrell (2007).
4. La caracterización macroscópica fue realizada en medio PDA y la identificación molecular se realizó a partir del ADN extraído con el protocolo el descrito por ZYMO Research Quick -DNA Kit fungal / bacteria Microprep, mediante amplificación de la región ITS, EF1a y genes SIX y comparación de secuencias con las bases de datos depositadas en el GeneBank.

Este recurso contiene en su mayoría hongos del género Fusarium (168), con registros adicionales de las familias Hypocreaceae (4), Peronosporaceae (13), Plectosphaerellaceae (9). Adicionalmente contiene 16 registros identificados a reino Bacteria y 6 a reino Fungi.

1. Fusarium
   rank: genus
2. Bacteria
   rank: kingdom
3. Chromista
   rank: kingdom
4. Fungi
   rank: kingdom
5. Hypocreaceae
   rank: family
6. Peronosporaceae
   rank: family
7. Plectosphaerellaceae
   rank: family

La zonas de colecta del material vegetal para el aislamiento se ubicaron en los departamentos de Antioquia (70), Boyacá (45), Caldas (2), Cundinamarca (53), La Guajira (2) y Nariño (4).