Colección de Mycobacterium tuberculosis del Instituto Nacional de Salud

Study Extent

Instituto Nacional de Salud de Colombia

Sampling

-Se hizo un estudio observacional analítico; se analizaron 234 aislamientos para determinar la sensibilidad a los fármacos antituberculosos y la estructura molecular usando spoligotyping. La información epidemiológica se recolectó utilizando el formato único de vigilancia de micobacterias. -Mediante regresiones logísticas bifactorial y multifactorial se analizó la asociación entre el tratamiento exitoso (curación o cumplimiento del tratamiento) y las características de los pacientes, y de los médicos, profesionales de enfermería y psicólogos vinculados al tratamiento. Se exploró la importancia del conocimiento en el manejo de los casos de TB-MDR mediante grupos focales con esos profesionales. -Se realizó un estudio observacional analítico que incluyó 741 aislamientos de M. tuberculosis de los pacientes. Los aislamientos procedían de 31 departamentos y se obtuvieron por sistema de vigilancia temática entre 1999 y 2012.

Method steps

1. Información epidemiológica: La información (origen indígena, sexo, edad, perfil ocupacional, posibles factores de riesgo y caracterización clínica de la tuberculosis) fue recopilada en una base de datos Excel 2013. Esta información se basó en 234 formularios únicos de vigilancia de micobacterias presentados al Grupo de Micobacterias del Instituto Nacional de Salud de Colombia durante el período 2009-2014 por las secretarías de salud de cada departamento.
2. Aislados clínicos: Del biobanco del Grupo de Micobacterias del Instituto Nacional de Salud se obtuvo un total de 234 aislamientos clínicos de M. tuberculosis de indígenas diagnosticados con tuberculosis entre 2009 y 2014. Los aislados crioconservados se recuperaron en medio sólido Löwenstein Jensen y se incubaron a 37°C durante dos a cuatro semanas para obtener biomasa bacilar.
3. Se realizó una investigación de implementación basada en un diseño transversal observacional, con método mixto concurrente. El estudio se realizó en las IPS de los municipios Medellín y Bello (departamento de Antioquia), Pereira y Dosquebradas (departamento de Risaralda), y Cali y Buenaventura (departamento de Valle del Cauca), que diagnosticaron mayor número de casos de TB-MDR entre enero de 2016 y junio de 2018.
4. El componente cuantitativo exploró las características individuales de los casos de TB-MDR y de los profesionales de la salud responsables del manejo programático de los casos de TB (médicos, profesionales de enfermería y psicólogos), así como su participación en eventos de capacitación en el último año. También se evaluó el nivel de conocimientos que tenían los médicos y los profesionales de enfermería sobre el manejo programático de los casos de TB-MDR. Para esto se aplicó un cuestionario con 10 preguntas de selección múltiple que exploraban la conceptualización de la TB-MDR, los esquemas y fases de tratamiento en pacientes nuevos o previamente tratados, la frecuencia de los controles por parte del médico general y el personal de enfermería, y el seguimiento bacteriológico.
5. Se realizó un estudio observacional analítico para evaluar la posible asociación de genotipos de M.tuberculosis identificados por espoligotipado de un grupo de aislados colombianos con susceptibilidad a fármacos de primera línea (rifampicina, isoniazida, estreptomicina y etambutol); asimismo, se evaluaron variables demográficas, clínicas y epidemiológicas. Este estudio incluyó aislamientos pertenecientes al complejo M. tuberculosis que se obtuvieron de 31 departamentos de Colombia entre 1999 y 2012; estos aislamientos fueron colectados a través de la vigilancia sistemática realizada por el Instituto Nacional de Salud.
6. En total, se recolectaron 741 cultivos del complejo M. tuberculosis entre 1999 y 2012 de pacientes con o sin antecedentes de tratamiento de 31 departamentos de Colombia; estos aislamientos se obtuvieron mediante la vigilancia sistemática realizada por el INS. Los aislamientos se almacenaron en el biobanco del grupo de micobacterias. Para el análisis, la muestra se dividió en dos períodos iguales de 7 años para determinar el cambio de genotipos. En total, se incluyeron 410 aislamientos en el primer período y 331 aislamientos en el segundo período.
7. Métodos para el estudio microbiológico: Cultura e identificación. Los aislamientos cultivados en medio Ogawa-Kudoh fueron enviados a las Secretarías Departamentales de Salud de Colombia y analizados para la identificación de especies siguiendo la metodología descrita en el manual de procedimientos del Laboratorio Nacional de Referencia del INS y los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades. Pruebas de susceptibilidad para medicamentos de primera línea. La prueba de susceptibilidad para los medicamentos de primera línea se realizó utilizando la metodología simplificada de proporciones múltiples de Canetti Rist y Grosset; Se utilizó la metodología automatizada Bactec MGIT 960 Beckton Dickinson USA.
8. Métodos de estudio para epidemiología molecular: Extracción de ADN. Los aislamientos identificados como complejo M. tuberculosis se resembraron en medio Lowenstein Jensen y se incubaron durante 15 días a 37°C. Luego se realizó la extracción de ADN como se describe por Van Soolingen et al. Genotipado (spoligotipado) del locus DR. El locus DR se genotipificó (tipo spoligo) siguiendo la metodología estándar descrita por Kamerbeer et al.

Este conjunto de datos comprende 3.304 registros biológicos. Se encuentran distribuidos en el reino Bacteria, filo Actinobacteriota, clase Actinomycetia, orden Mycobacteriales y familia Mycobacteriaceae. El 100% está clasificado a nivel de género.

1. Mycobacterium tuberculosis
   rank: species

Las muestras recolectadas se procesaron y analizaron en el Instituto Nacional de Salud, sede Teusaquillo, Avenida calle 26 No. 51-20