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Códigos de barras del ADN de mamíferos topotipos de México Fase I: Noroeste mexicano

Dataset homepage

Citation

Álvarez Castañeda S T, Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad C (2025). Códigos de barras del ADN de mamíferos topotipos de México Fase I: Noroeste mexicano. Version 1.18. Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/xmwfcf accessed via GBIF.org on 2025-06-20.

Description

El topotipo es un espécimen colectado en la misma localidad que el ejemplar tipo (con el que se describe a una especie) y que se presume pertenece a la misma especie, por lo que tiene implicaciones importantes en el reconocimiento de la especie. Por ser de la misma localidad, se considera que los topotipos pertenecen a la misma población del ejemplar tipo; por lo tanto, tienen los mismos atributos taxonómicos como coloración, morfología, tamaño y forma, y en el caso particular que nos ocupa, es extremadamente probable que tenga el mismo haplotipo (información genética mitocondrial) que el ejemplar tipo. El topotipo tiene la ventaja de ser un tejido fresco, recientemente colectado, de esta manera se pueden obtener secuencias de mejor calidad que del ejemplar tipo, el cual es viejo y está sujeto a las limitaciones del conservador. Por ello, el topotipo es la mejor alternativa, sobre todo cuando los especimenes tipos no estén disponibles. En el proyecto se obtendrán los códigos de barras de ADN mitocondrial (COI) para topotipos de al menos 150 taxa de mamíferos terrestres (carnívoros, quirópteros, didelfiomorfos, insectívoros, lagomorfos y roedores) del noroeste de México, para ser integradas a la base de datos del sistema BOLD. El proyecto contribuirá con información aplicable a la identificación de especies de mamíferos mexicanos resolviendo problemas taxonómicos que muchas de ellas presentan. Analizando la literatura reciente, así como observaciones propias del personal que presenta este proyecto, se ha detectado una gran cantidad de especies crípticas que han sido erróneamente identificadas en el pasado. Con la obtención de las secuencias del COI de los topotipos de las especies de mamíferos se podrán identificar correctamente a las poblaciones y evitar que problemas taxonómicos de este tipo sigan ocurriendo en el futuro, sobretodo cuando se desea implementar una librería de referencia. La mayor parte del material biológico (principalmente tejidos) de las especies a estudiar se encuentra albergado en la Colección de Mamíferos del Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste (CIBNOR) y cuentan con un número de catálogo, localidades georeferenciadas, datos de colecta y han sido identificados por un experto en los mamíferos de la región. Sin embargo, hay algunas de las especies que cuentan con un tamaño de muestra reducido (1 espécimen), por lo que durante el proyecto se hará trabajo de campo para incluir una muestra representativa para cada taxa. Cabe hacer la aclaración que las poblaciones y áreas geográficas propuestas aquí no están representadas en el sistema BOLD. El material biológico de las especies que incluye el proyecto será procesado bajo los protocolos estandarizados por el iBOL en el Nodo Regional CIBNOR. La base de datos final que se incorporará al sistema BOLD cumplirá con todas las características estipuladas para ello. Palabras clave: Identificación taxonómica, mamíferos, México, noroeste, topotipos

Reino: 1 Filo: 1 Clase: 1 Orden: 7 Familia: 15 Género: 29 Subgénero: 1 Especie: 61

Taxonomic Coverages

Reino: Animalia Filo: Chordata Clase: Mammalia Orden: Rodentia, Chiroptera, Carnivora, Lagomorpha, Artiodactyla, Didelphimorphia, Soricomorpha Familia: Geomyidae, Heteromyidae, Cricetidae, Vespertilionidae, Sciuridae, Canidae, Phyllostomidae, Leporidae, Molossidae, Procyonidae, Cervidae, Didelphidae, Felidae, Soricidae, Mormoopidae
  1. Animalia
    rank: kingdom
  2. Chordata
    rank: phylum
  3. Mammalia
    rank: class
  4. Rodentia
    rank: order
  5. Chiroptera
    rank: order
  6. Carnivora
    rank: order
  7. Lagomorpha
    rank: order
  8. Artiodactyla
    rank: order
  9. Didelphimorphia
    rank: order
  10. Soricomorpha
    rank: order
  11. Geomyidae
    rank: family
  12. Heteromyidae
    rank: family
  13. Cricetidae
    rank: family
  14. Vespertilionidae
    rank: family
  15. Sciuridae
    rank: family
  16. Canidae
    rank: family
  17. Phyllostomidae
    rank: family
  18. Leporidae
    rank: family
  19. Molossidae
    rank: family
  20. Procyonidae
    rank: family
  21. Cervidae
    rank: family
  22. Didelphidae
    rank: family
  23. Felidae
    rank: family
  24. Soricidae
    rank: family
  25. Mormoopidae
    rank: family
  26. Thomomys
    rank: genus
  27. Chaetodipus
    rank: genus
  28. Peromyscus
    rank: genus
  29. Cratogeomys
    rank: genus
  30. Myotis
    rank: genus
  31. Sciurus
    rank: genus
  32. Canis
    rank: genus
  33. Spermophilus
    rank: genus
  34. Dipodomys
    rank: genus
  35. Neotoma
    rank: genus
  36. Leptonycteris
    rank: genus
  37. Sylvilagus
    rank: genus
  38. Tadarida
    rank: genus
  39. Bassariscus
    rank: genus
  40. Procyon
    rank: genus
  41. Urocyon
    rank: genus
  42. Vulpes
    rank: genus
  43. Odocoileus
    rank: genus
  44. Ammospermophilus
    rank: genus
  45. Perognathus
    rank: genus
  46. Didelphis
    rank: genus
  47. Lynx
    rank: genus
  48. Lepus
    rank: genus
  49. Notiosorex
    rank: genus
  50. Antrozous
    rank: genus
  51. Reithrodontomys
    rank: genus
  52. Cynomys
    rank: genus
  53. Mormoops
    rank: genus
  54. Liomys
    rank: genus
  55. Neotoma
    rank: subgenus
  56. Thomomys anitae
    rank: species
  57. Chaetodipus goldmani
    common name: ratón de abazones de Goldman, ratón de bolsas Sonorense, ratón de campo rank: species
  58. Thomomys bottae
    common name: tuza, tuza de Botta, tuza del norte, tuza del suroeste rank: species
  59. Peromyscus merriami
    common name: ratón de Merriam, ratón de campo, ratón de los mezquites rank: species
  60. Peromyscus eva
    common name: ratón de Baja California, ratón de Baja California Sur, ratón de campo rank: species
  61. Cratogeomys goldmani
    common name: tuza, tuza de Goldman, tuza del altiplano rank: species
  62. Chaetodipus pernix
    common name: ratón de abazones sinaloense, ratón de bolsas de Sinaloa, ratón de campo rank: species
  63. Chaetodipus siccus
    common name: ratón de abazones arenero, ratón de bolsas de Isla Cerralvo rank: species
  64. Chaetodipus arenarius
    common name: ratón de abazones, ratón de abazones arenero, ratón de bolsas abazones de Baja California, ratón de campo rank: species
  65. Myotis peninsularis
    common name: miotis peninsular, murciélago rank: species
  66. Sciurus griseus
    common name: ardilla, ardilla gris, ardilla gris del oeste rank: species
  67. Chaetodipus rudinoris
    common name: ratón de abazones de Baja California, ratón de bolsas de Baja California rank: species
  68. Chaetodipus spinatus
    common name: ratón de abazones, ratón de abazones de Baja California, ratón de bolsas espinoso, ratón de campo rank: species
  69. Peromyscus fraterculus
    common name: ratón, ratón de las Californias rank: species
  70. Canis latrans
    common name: coyote, coyotl (Yuto-nahua) rank: species
  71. Spermophilus atricapillus
    common name: ardilla terrestre, ardillón, ardillón de Baja California rank: species
  72. Dipodomys merriami
    common name: rata canguro, rata canguro de Merriam, rata canguro mexicana rank: species
  73. Neotoma bryanti
    common name: rata de campo de Baja California, rata de campo de Cedros, rata magueyera rank: species
  74. Dipodomys simulans
    common name: rata canguro, rata canguro de Baja California rank: species
  75. Leptonycteris yerbabuenae
    common name: murciélago, murciélago hocicudo menor, murciélago magueyero menor rank: species
  76. Peromyscus truei
    common name: ratón de campo, ratón piñonero, ratón piñonero del norte rank: species
  77. Sylvilagus audubonii
    common name: conejo, conejo del desierto, rowi (Yuto-nahua) rank: species
  78. Myotis yumanensis
    common name: miotis de yuma, murciélago, murciélago ratón pequeño rank: species
  79. Peromyscus eremicus
    common name: ratón, ratón de cactus, ratón de campo, ratón de los catus rank: species
  80. Peromyscus maniculatus
    rank: species
  81. Peromyscus boylii
    common name: chikúri (Yuto-nahua), ratón, ratón arbustero, ratón de campo, ratón de los matorrales rank: species
  82. Thomomys umbrinus
    common name: ripósi (Yuto-nahua), tuza, tuza mexicana rank: species
  83. Tadarida brasiliensis
    common name: murciélago cola suelta brasileño, murciélago guanero, murciélago mexicano de cola libre, sopichí (Yuto-nahua) rank: species
  84. Chaetodipus fallax
    common name: ratón de abazones de San Diego, ratón de bolsas San Diego, ratón de campo rank: species
  85. Bassariscus astutus
    common name: babisuri, cacomixtle, cacomixtle norteño, rikamúchi (Yuto-nahua), sietillo, tejón rank: species
  86. Spermophilus beecheyi
    common name: ardilla, ardillón, ardillón de California rank: species
  87. Procyon lotor
    common name: a'ka'bak (Maya), batú (Yuto-nahua), batúi (Yuto-nahua), mapache, mapache común, mapachtli (Yuto-nahua), me'el (Maya), osito lavador rank: species
  88. Urocyon cinereoargenteus
    common name: ch'amac (Maya), gato de monte, kiyóchi (Yuto-nahua), kióchi (Yuto-nahua), leoncillo, ostotl (Yuto-nahua), w'ash (Maya), zorra gris rank: species
  89. Vulpes macrotis
    common name: zorra del desierto, zorra norteña rank: species
  90. Chaetodipus artus
    common name: ratón de abazones cabeza angosta, ratón de bolsas de cara delgada, ratón de campo rank: species
  91. Odocoileus hemionus
    common name: mazatl (Yuto-nahua), venado bura rank: species
  92. Ammospermophilus leucurus
    common name: ardilla, ardilla antílope cola blanca, ardilla listada coliblanca, ardilla terrestre, juancito rank: species
  93. Perognathus longimembris
    common name: ratón canguro, ratón de abazones, ratón de abazones menor, ratón de bolsas minúsculo rank: species
  94. Dipodomys ordii
    common name: rata canguro, rata canguro común rank: species
  95. Myotis californicus
    common name: miotis californiano, murciélago, murciélago ratón de California rank: species
  96. Peromyscus leucopus
    common name: chikúri (Yuto-nahua), ratón, ratón de campo, ratón de patas blancas rank: species
  97. Didelphis virginiana
    common name: tlacuache, tlacuache cola pelada, tlacuache común, tlacuache norteño, tlakuatzin (Yuto-nahua), zarigüeya norteña rank: species
  98. Chaetodipus penicillatus
    common name: ratón de abazones desértico, ratón de bolsas del desierto, ratón de campo rank: species
  99. Lynx rufus
    common name: gato montés, lince, lince americano, lince rojo, ruchí (Yuto-nahua) rank: species
  100. Sylvilagus mansuetus
    common name: conejo de isla San José rank: species
  101. Lepus californicus
    common name: liebre cola negra, liebre de cola negra, ruwé (Yuto-nahua), ruyé (Yuto-nahua) rank: species
  102. Chaetodipus baileyi
    common name: ratón de abazones sonorense, ratón de bolsas gigante, ratón de campo rank: species
  103. Neotoma lepida
    common name: rata cambalachera desértica, rata de campo, rata de campo del desierto, rata magueyera rank: species
  104. Chaetodipus hispidus
    common name: ratón de abazones crespo, ratón de bolsas de los pastizales, ratón de campo rank: species
  105. Notiosorex crawfordi
    common name: musaraña, musaraña del desierto común, musaraña desértica norteña rank: species
  106. Antrozous pallidus
    common name: murciélago, murciélago desertícola, murciélago desértico norteño, murciélago pálido rank: species
  107. Reithrodontomys megalotis
    common name: ratón, ratón cosechero común, ratón de campo, sotóchi (Yuto-nahua) rank: species
  108. Neotoma (Neotoma) fuscipes
    rank: species
  109. Cynomys mexicanus
    common name: perrito de las praderas, perrito de las praderas mexicano, perro llanero, perro llanero mexicano, tuza rank: species
  110. Sciurus nayaritensis
    common name: ardilla, ardilla arborícola, ardilla de Nayarit, chimorí láname (Yuto-nahua) rank: species
  111. Peromyscus crinitus
    common name: ratón de campo, ratón de cañada, ratón de las cañadas rank: species
  112. Mormoops megalophylla
    common name: murciélago, murciélago barba arrugada norteño, murciélago cara arrugada rank: species
  113. Liomys pictus
    common name: rata de bolsas espinosa pintado, ratón espinoso, ratón espinoso pintado rank: species
  114. Spermophilus spilosoma
    common name: ardilla de tierra manchada, ardilla moteada, ardilla terrestre, ardillón punteado, juancito manchado rank: species
  115. Reithrodontomys fulvescens
    common name: ratón cosechero leonado, ratón de campo rank: species
  116. Sylvilagus floridanus
    common name: conejo, conejo del este, conejo serrano, rowi (Yuto-nahua), tochtli (Yuto-nahua) rank: species

Geographic Coverages

País: MEXICO (BAJA CALIFORNIA, BAJA CALIFORNIA SUR, CHIHUAHUA, COAHUILA DE ZARAGOZA, DURANGO, NAYARIT, SINALOA, SONORA)

Bibliographic Citations

Contacts

Sergio Ticul Álvarez Castañeda
originator
position: Responsable
Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste SC
La Paz
23090
Baja California Sur
MX
Telephone: Tel 01 (612) 123 8486 01 (612) 123 3625 01 (612) 125 3633 Fax 01 1 125 3625 - 612 12 38 486 -
email: sticul@cibnor.mx
CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad
metadata author
position: Dirección General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
MÉXICO
14010
Tlalpan
MX
Telephone: 50045000
email: patricia.ramos@conabio.gob.mx
homepage: https://www.gob.mx/conabio
Patricia Ramos Rivera
administrative point of contact
position: Directora General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
México
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email: patricia.ramos@conabio.gob.mx
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