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Códigos de barras del ADN de mamíferos topotipos de México Fase I: Noroeste mexicano

Dataset homepage

Citation

Álvarez Castañeda S T, Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad C (2021). Códigos de barras del ADN de mamíferos topotipos de México Fase I: Noroeste mexicano. Version 1.9. Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/xmwfcf accessed via GBIF.org on 2022-07-05.

Description

El topotipo es un espécimen colectado en la misma localidad que el ejemplar tipo (con el que se describe a una especie) y que se presume pertenece a la misma especie, por lo que tiene implicaciones importantes en el reconocimiento de la especie. Por ser de la misma localidad, se considera que los topotipos pertenecen a la misma población del ejemplar tipo; por lo tanto, tienen los mismos atributos taxonómicos como coloración, morfología, tamaño y forma, y en el caso particular que nos ocupa, es extremadamente probable que tenga el mismo haplotipo (información genética mitocondrial) que el ejemplar tipo. El topotipo tiene la ventaja de ser un tejido fresco, recientemente colectado, de esta manera se pueden obtener secuencias de mejor calidad que del ejemplar tipo, el cual es viejo y está sujeto a las limitaciones del conservador. Por ello, el topotipo es la mejor alternativa, sobre todo cuando los especimenes tipos no estén disponibles. En el proyecto se obtendrán los códigos de barras de ADN mitocondrial (COI) para topotipos de al menos 150 taxa de mamíferos terrestres (carnívoros, quirópteros, didelfiomorfos, insectívoros, lagomorfos y roedores) del noroeste de México, para ser integradas a la base de datos del sistema BOLD. El proyecto contribuirá con información aplicable a la identificación de especies de mamíferos mexicanos resolviendo problemas taxonómicos que muchas de ellas presentan. Analizando la literatura reciente, así como observaciones propias del personal que presenta este proyecto, se ha detectado una gran cantidad de especies crípticas que han sido erróneamente identificadas en el pasado. Con la obtención de las secuencias del COI de los topotipos de las especies de mamíferos se podrán identificar correctamente a las poblaciones y evitar que problemas taxonómicos de este tipo sigan ocurriendo en el futuro, sobretodo cuando se desea implementar una librería de referencia. La mayor parte del material biológico (principalmente tejidos) de las especies a estudiar se encuentra albergado en la Colección de Mamíferos del Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste (CIBNOR) y cuentan con un número de catálogo, localidades georeferenciadas, datos de colecta y han sido identificados por un experto en los mamíferos de la región. Sin embargo, hay algunas de las especies que cuentan con un tamaño de muestra reducido (1 espécimen), por lo que durante el proyecto se hará trabajo de campo para incluir una muestra representativa para cada taxa. Cabe hacer la aclaración que las poblaciones y áreas geográficas propuestas aquí no están representadas en el sistema BOLD. El material biológico de las especies que incluye el proyecto será procesado bajo los protocolos estandarizados por el iBOL en el Nodo Regional CIBNOR. La base de datos final que se incorporará al sistema BOLD cumplirá con todas las características estipuladas para ello. Palabras clave: Identificación taxonómica, mamíferos, México, noroeste, topotipos

Reino: 1 Filo: 1 Clase: 1 Orden: 7 Familia: 15 Género: 32 Subgénero: 1 Especie: 68

Taxonomic Coverages

Reino: Animalia Filo: Chordata Clase: Mammalia Orden: Rodentia, Chiroptera, Lagomorpha, Soricomorpha, Carnivora, Artiodactyla, Didelphimorphia Familia: Geomyidae, Heteromyidae, Cricetidae, Vespertilionidae, Sciuridae, Leporidae, Soricidae, Canidae, Procyonidae, Mormoopidae, Phyllostomidae, Molossidae, Cervidae, Didelphidae, Felidae
  1. Animalia
    rank: kingdom
  2. Chordata
    rank: phylum
  3. Mammalia
    rank: class
  4. Rodentia
    rank: order
  5. Chiroptera
    rank: order
  6. Lagomorpha
    rank: order
  7. Soricomorpha
    rank: order
  8. Carnivora
    rank: order
  9. Artiodactyla
    rank: order
  10. Didelphimorphia
    rank: order
  11. Geomyidae
    rank: family
  12. Heteromyidae
    rank: family
  13. Cricetidae
    rank: family
  14. Vespertilionidae
    rank: family
  15. Sciuridae
    rank: family
  16. Leporidae
    rank: family
  17. Soricidae
    rank: family
  18. Canidae
    rank: family
  19. Procyonidae
    rank: family
  20. Mormoopidae
    rank: family
  21. Phyllostomidae
    rank: family
  22. Molossidae
    rank: family
  23. Cervidae
    rank: family
  24. Didelphidae
    rank: family
  25. Felidae
    rank: family
  26. Thomomys
    rank: genus
  27. Chaetodipus
    rank: genus
  28. Dipodomys
    rank: genus
  29. Peromyscus
    rank: genus
  30. Cratogeomys
    rank: genus
  31. Myotis
    rank: genus
  32. Sciurus
    rank: genus
  33. Sylvilagus
    rank: genus
  34. Sorex
    rank: genus
  35. Canis
    rank: genus
  36. Neotoma
    rank: genus
  37. Spermophilus
    rank: genus
  38. Bassariscus
    rank: genus
  39. Mormoops
    rank: genus
  40. Leptonycteris
    rank: genus
  41. Ammospermophilus
    rank: genus
  42. Tadarida
    rank: genus
  43. Procyon
    rank: genus
  44. Urocyon
    rank: genus
  45. Sigmodon
    rank: genus
  46. Vulpes
    rank: genus
  47. Odocoileus
    rank: genus
  48. Perognathus
    rank: genus
  49. Didelphis
    rank: genus
  50. Lynx
    rank: genus
  51. Lepus
    rank: genus
  52. Notiosorex
    rank: genus
  53. Antrozous
    rank: genus
  54. Reithrodontomys
    rank: genus
  55. Cynomys
    rank: genus
  56. Pipistrellus
    rank: genus
  57. Liomys
    rank: genus
  58. Neotoma
    rank: subgenus
  59. Thomomys anitae
    rank: species
  60. Chaetodipus penicillatus
    common name: ratón de abazones desértico, ratón de campo rank: species
  61. Dipodomys merriami
    common name: rata canguro, rata canguro de Merriam rank: species
  62. Chaetodipus goldmani
    common name: ratón de abazones de Goldman, ratón de campo rank: species
  63. Thomomys bottae
    common name: tuza, tuza de Botta rank: species
  64. Peromyscus fraterculus
    common name: ratón rank: species
  65. Peromyscus merriami
    common name: ratón de Merriam, ratón de campo rank: species
  66. Peromyscus eva
    common name: ratón de Baja California Sur, ratón de campo rank: species
  67. Cratogeomys goldmani
    common name: tuza, tuza de Goldman rank: species
  68. Chaetodipus pernix
    common name: ratón de abazones sinaloense, ratón de campo rank: species
  69. Chaetodipus siccus
    common name: ratón de abazones arenero rank: species
  70. Chaetodipus arenarius
    common name: ratón de abazones, ratón de abazones arenero, ratón de campo rank: species
  71. Myotis peninsularis
    common name: miotis peninsular, murciélago rank: species
  72. Peromyscus crinitus
    common name: ratón de campo, ratón de cañada rank: species
  73. Sciurus griseus
    common name: ardilla, ardilla gris rank: species
  74. Sylvilagus mansuetus
    common name: conejo de isla San José rank: species
  75. Dipodomys simulans
    common name: rata canguro rank: species
  76. Chaetodipus rudinoris
    common name: ratón de abazones de Baja California rank: species
  77. Chaetodipus spinatus
    common name: ratón de abazones, ratón de abazones de Baja California, ratón de campo rank: species
  78. Sorex ornatus
    common name: musaraña, musaraña adornada rank: species
  79. Canis latrans
    common name: coyote rank: species
  80. Neotoma bryanti
    common name: rata de campo de Cedros, rata magueyera rank: species
  81. Spermophilus atricapillus
    common name: ardilla terrestre, ardillón, ardillón de Baja California rank: species
  82. Bassariscus astutus
    common name: cacomixtle, cacomixtle norteño, tejón rank: species
  83. Mormoops megalophylla
    common name: murciélago, murciélago barba arrugada norteño rank: species
  84. Leptonycteris yerbabuenae
    common name: murciélago, murciélago hocicudo menor rank: species
  85. Peromyscus truei
    common name: ratón de campo, ratón piñonero rank: species
  86. Ammospermophilus leucurus
    common name: ardilla, ardilla antílope cola blanca, ardilla terrestre, juancito rank: species
  87. Sylvilagus audubonii
    common name: conejo, conejo del desierto rank: species
  88. Myotis yumanensis
    common name: miotis de yuma, murciélago rank: species
  89. Peromyscus eremicus
    common name: ratón, ratón de cactus, ratón de campo rank: species
  90. Peromyscus maniculatus
    common name: ratón de campo, ratón norteamericano, ratón venado rank: species
  91. Peromyscus boylii
    common name: ratón, ratón arbustero, ratón de campo rank: species
  92. Thomomys umbrinus
    common name: tuza, tuza mexicana rank: species
  93. Dipodomys spectabilis
    common name: rata canguro, rata canguro cola de bandera rank: species
  94. Tadarida brasiliensis
    common name: murciélago cola suelta brasileño, murciélago guanero rank: species
  95. Chaetodipus fallax
    common name: ratón de abazones de San Diego, ratón de campo rank: species
  96. Neotoma albigula
    common name: rata cambalachera garganta blanca, rata magueyera rank: species
  97. Myotis californicus
    common name: miotis californiano, murciélago rank: species
  98. Spermophilus beecheyi
    common name: ardilla, ardillón, ardillón de California rank: species
  99. Procyon lotor
    common name: mapache, mapache común, osito lavador rank: species
  100. Urocyon cinereoargenteus
    common name: gato de monte, leoncillo, zorra gris rank: species
  101. Chaetodipus intermedius
    common name: ratón de abazones de roca, ratón de campo rank: species
  102. Sigmodon hispidus
    common name: rata algodonera crespa, rata cañera rank: species
  103. Vulpes macrotis
    common name: zorra del desierto, zorra norteña rank: species
  104. Chaetodipus artus
    common name: ratón de abazones cabeza angosta, ratón de campo rank: species
  105. Odocoileus hemionus
    common name: venado bura rank: species
  106. Perognathus longimembris
    common name: ratón canguro, ratón de abazones, ratón de abazones menor rank: species
  107. Dipodomys ordii
    common name: rata canguro, rata canguro común rank: species
  108. Peromyscus leucopus
    common name: ratón, ratón de campo, ratón de patas blancas rank: species
  109. Didelphis virginiana
    common name: tlacuache, tlacuache cola pelada, tlacuache común, tlacuache norteño rank: species
  110. Spermophilus tereticaudus
    common name: ardilla de tierra de cola redonda, ardilla terrestre, ardillón cola redonda, juancito rank: species
  111. Lynx rufus
    common name: gato montés, lince, lince americano rank: species
  112. Lepus californicus
    common name: liebre cola negra rank: species
  113. Chaetodipus baileyi
    common name: ratón de abazones sonorense, ratón de campo rank: species
  114. Neotoma lepida
    common name: rata cambalachera desértica, rata de campo, rata magueyera rank: species
  115. Chaetodipus hispidus
    common name: ratón de abazones crespo, ratón de campo rank: species
  116. Notiosorex crawfordi
    common name: musaraña, musaraña desértica norteña rank: species
  117. Antrozous pallidus
    common name: murciélago, murciélago desértico norteño rank: species
  118. Reithrodontomys megalotis
    common name: ratón, ratón cosechero común, ratón de campo rank: species
  119. Neotoma (Neotoma) fuscipes
    rank: species
  120. Cynomys mexicanus
    common name: perrito de las praderas, perro llanero, perro llanero mexicano, tuza rank: species
  121. Sciurus nayaritensis
    common name: ardilla, ardilla arborícola, ardilla de Nayarit rank: species
  122. Pipistrellus hesperus
    rank: species
  123. Liomys pictus
    common name: ratón espinoso, ratón espinoso pintado rank: species
  124. Spermophilus spilosoma
    common name: ardilla moteada, ardilla terrestre, ardillón punteado rank: species
  125. Reithrodontomys fulvescens
    common name: ratón cosechero leonado, ratón de campo rank: species
  126. Sylvilagus floridanus
    common name: conejo, conejo serrano rank: species

Geographic Coverages

Bibliographic Citations

Contacts

Sergio Ticul Álvarez Castañeda
originator
position: Responsable
Centro de Investigaciones Biológicas del Noroeste SC
MX
CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad
metadata author
position: Dirección General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
MÉXICO
14010
Tlalpan
MX
Telephone: 50045000
email: patricia.ramos@conabio.gob.mx
homepage: https://www.gob.mx/conabio
Patricia Ramos Rivera
administrative point of contact
position: Dirección General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
México
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