Colección Biológica Grupo de Estudio Relación Parásito Hospedero (UNAL:GERPH)

Study Extent

En esta versión de publicación de datos se incluyen localidades con los ambientes: sabanas inundables, sabana tropical, ecotono Orinoco-Amazonas bosque de niebla, Páramo y paisajes urbanos transformados. Las localidades abarcan un rango de alturas entre 130 y 3950 m s. n. m.

Sampling

La metodología general de muestreo de aves incluye la captura mediante redes de niebla, captura manual, identificación con guías de campo, toma de fotografías y medidas morfométricas. Las sangre de las aves se muestrean por punción de la vena braquial o corte distal de uña en el caso de aves de pequeño tamaño. Los anfibios se capturaron manualmente y se muestrearon mediante punción de la vena maxilar o por punción cardiaca después de realizar la eutanasia. Para el diagnostico de los parásitos se realizan extendidos sanguíneos con las muestras de sangres que son fijado con Metanol y teñido con Giemsa. Una parte de la sangre se guarda en microtubos con EDTA, Etanol o SET para análisis moleculares posteriores. Los extendidos sanguíneos se diagnostican por microscopia de luz a 400 y 1000 aumentos, son fotografiados con microscopios con cámara y su morfología se compara con claves taxonómicas especificas para cada grupo de parásitos.

Quality Control

La identidad de los hospederos tomada en campo fue contrastada con las fotografías y guías de campo para su identificación final. La información sobre los diagnósticos de infección e identidad de parásitos fue confirmada por los curadores de la colección, teniendo en cuenta el registro fotográfico de los mismos y/o su identificación molecular. Se unificaron los nombres de las localidades, los colectores e identificadores de los distintos grupos taxonómicos.

Method steps

1. Se capturaron las aves mediante redes de niebla, se identificaron en campo con la guía Hilty, Brown W, Brown L (1986), se fotografiaron, midieron, pesaron y anillaron (excepto colibríes). De cada ave se obtuvo por corte distal de uña (para colibríes) o punción de la vena braquial una cantidad pequeña de sangre que fue utilizada para hacer al menos tres extendidos sanguíneos y una parte para ser almacenada en Etanol absoluto, EDTA o buffer SET para posteriores análisis moleculares. Los anfibios se capturaron manualmente y se muestrearon mediante punción de la vena maxilar o por punción cardiaca después de realizar la eutanasia.
2. Las laminas fueron fijadas con metanol absoluto por 5 minutos y teñidas con Giemsa pH 7.2 por 45 minutos. Mediante microscopia de luz se observaron los extendidos, primero a menor aumento en 100X por 10 minutos y posteriormente a 1000x por cuarenta minutos. En los casos de diagnósticos positivos los parásitos fueron fotografiados con un microscopio con cámara referencia Leica DM570. A partir de las fotografías se tomaron algunas medidas morfológicas necesarias para la identificación de acuerdo a las claves propuestas por Valkiunas (2005) para los haemosporidios, y se indicó genero Trypanosoma para los tripanosomatidos encontrados, así como superfamilia Filaroidea para las larvas (microfilarias) halladas en la sangre.
3. En algunos casos la presencia de los parásitos haemosporidios fue confirmada mediante diagnostico molecular. Para esto se realizo la extracción del ADN genómico mediante el método de Fenol-Cloroformo modificado de Sambrook et al. (1989), seguido de la amplificación de una sección del gen Citocromo b del parásito usando los primers de Waldenstrom et al. (2004), Beadell et al. (2004) y Pacheco et al. (2011). Adicionalmente los productos de amplificación se secuenciaron y dicha infamación se depositó en el GenBank y la base especializada MalAvi (Bensch et al., 2009).

Se presentan registros de aves, anfibios, mamíferos, reptiles y sus parásitos nematodos, tripanosomatidos y Apicomplexa. Los hospederos vertebrados fueron identificados hasta especie en su mayoría, los parásitos protozooarios hasta género y algunos a especie, los parásitos nemátodos se categorizan hasta superfamilia. La mayoría de los registros corresponden a aves e incluyen las familias Accipitridae, Anatidae, Trochilidae, Caprimulgidae, Charadriidae, Jacanidae, Scolopacidae, Columbidae, Alcedinidae, Cuculidae, Falconidae, Galbulidae, Odontophoridae, Thamnophilidae, Corvidae, Emberizidae, Fringillidae, Furnariidae, Hirundinidae, Icteridae, Mimidae, Parulidae, Passerellidae, Pipridae, Rhinocryptidae, Thamnophilidae, Thraupidae, Tityridae, Troglodytidae, Turdidae, Tyrannidae, Vireonidae, Picidae, Ramphastidae, Psittacidae y Strigidae

1. Filaroidea
   common name: filarias rank: superfamily
2. Haemoproteidae
   rank: family
3. Leucocytozoidae
   rank: family
4. Plasmodiidae
   common name: malaria rank: family
5. Trypanosomatidae
   common name: tripanosomas rank: family
6. Anseriformes
   common name: Patos rank: order
7. Apodiformes
   common name: Colibries, vencejos rank: order
8. Charadriiformes
   rank: order
9. Columbiformes
   common name: Palomas, torcasas rank: order
10. Coraciiformes
    rank: order
11. Cuculiformes
    rank: order
12. Gruiformes
    rank: order
13. Passeriformes
    common name: pajaros rank: order
14. Pelecaniformes
    rank: order
15. Piciformes
    rank: order
16. Trogoniformes
    common name: trogones rank: order
17. Conoidasida
    rank: class
18. Eucocidiorida
    rank: order
19. Dactylosomatidae
    rank: family
20. Accipitriformes
    common name: Rapaces rank: order
21. Caprimulgiformes
    common name: Chotacabras rank: order
22. Charadriiformes
    rank: order
23. Galliformes
    common name: Gallinas, pavas rank: order
24. Psittaciformes
    common name: Loros, guacamayos rank: order
25. Strigiformes
    common name: Buhos, lechuzas rank: order
26. Hylidae
    rank: family
27. Microhylidae
    rank: family
28. Craugastoridae
    rank: family
29. Leptodactylidae
    rank: family
30. Plethodontidae
    rank: family
31. Bufonidae
    rank: family
32. Ranidae
    rank: family
33. Caeciliidae
    rank: family
34. Falconiformes
    common name: Halcones y afines rank: order
35. Galbuliformes
    common name: Jacamares y afines rank: order
36. Chiroptera
    rank: order
37. Crocodylia
    common name: Cocodrilos y caimanes rank: order
38. Squamata
    rank: order
39. Testudines
    rank: order
40. Alligatoridae
    common name: Caimanes rank: family
41. Crocodylidae
    common name: Cocodrílidos rank: family
42. Boidae
    common name: Boidos rank: family
43. Colubridae
    common name: Colúbridos rank: family
44. Dactyloidae
    rank: family
45. Gekkonidae
    rank: family
46. Iguanidae
    rank: family
47. Teiidae
    rank: family
48. Tropiduridae
    rank: family
49. Viperidae
    rank: family
50. Emydidae
    rank: family
51. Geoemydidae
    rank: family
52. Podocnemididae
    rank: family
53. Testudinidae
    rank: family
54. Phyllostomidae
    rank: family
55. Vespertilionidae
    rank: family

La colección cuenta con ejemplares de 13 departamentos en Colombia, donde se incluyen los ambientes de sabanas inundables, sabana tropical, ecotono Orinoco-Amazonas selva amazónica, selva tropical, bosque de niebla, Páramo, selva lluviosa del Chocó biogeográfica y paisajes urbanos transformados.