Microorganismos encontrados en el monitoreo de la calidad de aguas del año 2020 de la bahía de Tumaco, Nariño
Citation
Parada Gutiérrez J L, Ortiz Vallecilla C G, Payán Bastidas C I, Durán Machuca E Y, Bastidas Caguazanga J A, Bermúdez Rivas C (2024). Microorganismos encontrados en el monitoreo de la calidad de aguas del año 2020 de la bahía de Tumaco, Nariño. Version 1.1. Dirección General Marítima. Sampling event dataset https://doi.org/10.15472/4wkott accessed via GBIF.org on 2024-12-15.Description
Se realizó la toma de muestras de agua de mar en 15 estaciones ubicadas en la bahía de Tumaco; todas las muestras fueron tomadas en ambos estados mareales (marea alta y baja) durante marzo del 2020. Las muestras de agua fueron tomadas con botella Niskin a profundidad superficial, transferidas a frascos de vidrio borosilicato estériles de 1L y conservadas en refrigeración hasta el análisis en el laboratorio.
Las bacterias indicadoras de contaminación fecal identificadas fueron los Coliformes totales, Escherichia coli y los Enterococos de origen intestinal. Adicionalmente, se aisló e identificó el grupo de bacterias patógenas pertenecientes al género de Vibrio sp. Todas las muestras fueron analizadas en condiciones de asepsia en el Laboratorio de Dimar Sede Pacífico, siguiendo los procedimientos técnicos establecidos como parte del Sistema de Gestión de calidad del Laboratorio.
Purpose
Los conjuntos de datos oceanográficos (físicos, químicos y geológicos) y de Calidad de Aguas fueron obtenidos de muestras de aguas marinas y sedimentos recopiladas en 15 estaciones en la Bahía de Tumaco, durante un muestreo realizados en marzo de 2020 por parte del Centro de Investigaciones Oceanográficas e Hidrográficas del Pacífico (CCCP), como iniciativa ocasional de monitoreo de calidad de aguas de la Sección de Protección del Medio Marino. Las muestras fueron tomadas en la superficie del agua en los ciclos de marea alta y marea baja.
Sampling Description
Study Extent
Bahía de Tumaco, Nariño.Sampling
Se realizó la toma de muestras con botella Niskin de 8L a una profundidad superficial; un volumen de 1L fue transferido asépticamente a una botella de vidrio borosilicato previamente estéril. La muestra fue almacenada en refrigeración y protegida de la luz hasta su análisis en el Laboratorio.Quality Control
La verificación de la temperatura de almacenamiento se realizó con un termómetro calibrado por un organismo acreditado. La recepción de la muestra se realizó siguiendo el procedimiento establecido por el laboratorio de Dimar sede Pacífico, garantizando la integridad de esta. Se usó material de referencia certificado para el aseguramiento de la calidad de los ensayos. Los equipos usados fueron previamente calibrados por un organismo acreditado. Los reactivos empleados cumplen con lo descrito en cada uno de los procedimientos técnicos.Method steps
- Las muestras fueron trasladadas al área de microbiología en el Laboratorio de Dimar Sede pacífico para su posterior análisis. La técnica usada para las determinaciones microbiológicas fue Filtración por Membrana para lo cual se empleó una unidad de filtración de acero inoxidable previamente estéril con trampa de vacío; se usaron pinzas estériles y membranas de 0,45 µm para la retención de las bacterias de interés.
- Para la determinación de Coliformes totales se tomó un volumen de 10mL de la muestra, el cual fue filtrado y enjuagado con agua peptona estéril al 0.1%. El filtro de membrana fue dispuesto sobre la superficie del agar m-Endo LES, e incubado a 35 ± 0,5 °C por 22 a 24 horas. Pasado este periodo, se realizó el conteo de colonias típicas y atípicas las cuales fueron confirmadas bioquímicamente usando Caldo Lauryl Triptosa y Caldo Brila.
- Para la determinación de Escherichia coli se tomó un volumen de 10mL de la muestra, el cual fue filtrado y enjuagado con agua peptona estéril al 0.1%. El filtro de membrana fue dispuesto sobre la superficie del agar mFC, e incubado a 44,5 ± 0,2°C por 24±2 horas. Pasado este periodo, se realizó el conteo de colonias típicas y atípicas las cuales fueron confirmadas bioquímicamente usando caldo EC-MUG, Caldo Lauryl Triptosa y Caldo Triptófano.
- Para la determinación de los Enterococos se tomó un volumen de 100mL de la muestra, el cual fue filtrado y enjuagado con agua peptona estéril al 0.1%. El filtro de membrana fue dispuesto sobre la superficie del agar m-Enterococcus e incubado a 35±0,5°C por 48±3 horas. Pasado este periodo, se realizaron diferentes pruebas bioquímicas (Agar bilis esculina, agar BHI, Caldo BHI con NaCl y Caldo BHI) con el fin de confirmar el aislamiento del grupo bacteriano.
- Para el aislamiento e identificación de Vibrio sp. se tomó un volumen de 100mL de la muestra, el cual fue filtrado y enjuagado con agua peptona estéril al 0.1%. El filtro de membrana fue dispuesto en 100mL de Agua Peptona Alcalina e incubado a 36±2°C por 7-9 horas. Tras la incubación, se tomó una asada del caldo y fue sembrada en agar TCBS para la identificación de colonias típicas del género. Posteriormente se realizaron pruebas bioquímicas para la confirmación del género (test de oxidasa y prueba de la cuerda). Los datos obtenidos en cada uno de los métodos de ensayo fueron registrados en los formatos usados para este fin según el Sistema de Gestión de Calidad del laboratorio de la Dimar.
Additional info
Estos datos se relacionan con el conjunto de datos denominado: Conjunto de datos oceanográficos obtenidos en monitoreo de calidad de aguas en la Bahía de Tumaco, Colombia. Marzo de 2020, depositado en el repositorio del Centro Colombiano de Datos Oceanográficos (CECOLDO). https://cecoldo.dimar.mil.co. Dirección General Marítima. (2023). Conjunto de datos oceanográficos obtenidos en monitoreo de calidad de aguas en la Bahía de Tumaco, Colombia. Marzo de 2020. [Indique el subconjunto utilizado]. Centro Colombiano de Datos Oceanográficos. https://doi.org/10.26640/cecoldo.dataset_00546Taxonomic Coverages
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Escherichia colicommon name: E.Coli rank: species
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Enterococcuscommon name: Enterococos de origen intestinal rank: genus
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Vibriocommon name: Vibrio rank: genus
Geographic Coverages
Bibliographic Citations
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César Giovanni Ortiz Vallecilla
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Claudia Inés Payán Bastidas
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Edith Yaneth Durán Machuca
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Jesús Amanda Bastidas Caguazanga
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Christian Bermúdez Rivas
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