Detección de patógenos emergentes (SARS-CoV-2) y re-emergentes (Rickettsias) en caninos procedentes del área metropolitana de Bucaramanga
Citation
Sandoval Ramírez C M (2022). Detección de patógenos emergentes (SARS-CoV-2) y re-emergentes (Rickettsias) en caninos procedentes del área metropolitana de Bucaramanga. Universidad de Santander - UDES. Occurrence dataset https://doi.org/10.15472/vbmxn1 accessed via GBIF.org on 2024-12-14.Description
Estudios previos en diversas latitudes han demostrado que la infección natural por SARS-CoV-2 en animales de compañía es probable, pero su ocurrencia en las diversas regiones del país no ha sido suficientemente documentada. El objetivo de este estudio se enfocó en la detección de infecciones por SARS-CoV-2 en caninos procedentes del área metropolitana de Bucaramanga, Santander.
El presente conjunto de datos, consta de 3 registros biológicos provenientes de las colectas temporales realizadas en caninos mediante hisopados orofaríngeos y rectales para la detección del SARS-CoV-2, realizadas en el mes de junio y septiembre del año 2021 en Floridablanca y Bucaramanga, Santander.
Sampling Description
Study Extent
Se ubicó en las cabeceras municipales de Bucaramanga, Floridablanca y Piedecuesta.Sampling
Se realizó una búsqueda pasiva de caninos infectados por SARS - Cov- 2 en clínicas veterinarias de los municipios de Bucaramanga, Floridablanca y Piedecuesta. La toma de muestra (hisopo orofarígeo y rectal), fue realizada por médicos veterinarios durante los meses de mayo a diciembre de 2021, previo consentimiento escrito del propietario. Cada perro fue examinado y registrado su estado de salud general a través de historia clínica.Quality Control
En el proceso de estructuración y validación de los datos, se realizó el control de la calidad de la información. A continuación, se enumeran los procesos asociados a esta actividad: 1. Revisión de la información documentada asociada a los datos biológicos; 2. Estructuración de los datos en el estándar Darwin Core (DwC) según elementos, definiciones y vocabularios controlados; 3. Validación y limpieza de la información consignada en el DwC.Method steps
- Criterio inclusión: mascotas que ingresaron a clínicas veterinarias y que tuvieron en los últimos quince días con pacientes humanos confirmados o sospechosos de infección por SARS-CoV-2.
- Examen Clínico: Atención por médico veterinario, examen físico e Historia clínica de la mascota. Previo consentimiento firmado por el tenedor del canino.
- Toma de muestra en seis Clínicas veterinarias de los municipios de Bucaramanga, Floridablanca y Piedecuesta. (dos muestras por canino, un hisopo orofaríngeo y otro rectal).
- Detección y caracterización de SARS-CoV-2 por técnicas de Biología Molecular: a). La extracción de ARN se llevó a cabo utilizando el kit de extracción QIAamp Viral RNA, siguiendo las instrucciones del fabricante para las muestras tomadas con hisopos. b). La detección de ARN viral se realizó mediante la detección del gen E de SARS-CoV-2 por RT-qPCR siguiendo el protocolo de Charité Berlin. https://virologie-ccm.charite.de/en/ (2020).
Taxonomic Coverages
Los 3 registros biológicos que corresponden al agente viral fueron identificados hasta especie.
-
Severe acute respiratory syndrome-related coronaviruscommon name: SARS-CoV-2 rank: species
Geographic Coverages
El muestreo se realizó en caninos residentes en áreas urbanas de los municipios de Bucaramanga y Floridablanca (Santander).
Bibliographic Citations
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