Familia Udoteaceae (Chlorophyta) de la colección ficológica "Germán Bula Meyer", de la Universidad del Magdalena

Study Extent

Para Colombia las macroalgas fueron colectadas en los departamentos de: Archipiélago de San Andrés, Providencia y Santa Catalina, Bolívar, Guajira y Magdalena. Adicionalmente hay datos de los siguientes países: Las Bahamas y Estados Unidos.

Sampling

Se tomó inicialmente la matriz Darwin Core de las macroalgas de Germán Bula Meyer, y se extrajo el Phyllum de las Ochlophytas y de este se escogió la Familia Udoteaceae. Y lo documentado por otros autores hasta el año 2017. Adicionalmente se realizaron validaciones taxonómicas con el programa OpenRefine. Se hizo revisión de los nombres de las especies y se incluyeron los actualmente aceptados usando la plataforma en línea Algaebase. Al final los sitios de muestreo fueron validados con el Script Davipola.

Quality Control

Toda la información de las etiquetas de los ejemplares, transcrita a la base de datos (como localidad, taxones y autorías) se revisó con el fin de garantizar que no existieran duplicados o errores ortográficos. La base de datos de la familia Udoteaceae estuvo sujeta a una limpieza rigurosa; donde se utilizó la herramienta en línea Algaebase para confirmar o actualizar la taxonomía. Seguidamente fue validada a través de Data validador (GBIF)(https://www.gbif.org/tools/data-validator). Se convirtieron las coordenadas geográficas de DDMMSS a grados decimales por medio de la plataforma Canadensys (https://data.canadensys.net/tools/coordinates). La validación de los datos taxonómicos se realizó por la aplicación de escritorio de código abierto OpenRefine, al igual que los sitios de recolección, estos últimos utilizando el script de DIVIPOLA.

Method steps

1. Inicialmente se separaron los ejemplares de Chlorophytas depositadas en la colección de macroalgas para corroborar su determinación taxonómica; se utilizó la clave taxonómica de Littler y Littler 2000. Para la revisión de los nombres de cada especie se utilizó la herramienta en línea abierta Algaebase y el registro mundial de especies marinas (WORMS); se incluyeron los nombres actualmente aceptados.
2. Posteriormente se corroboró que la información que se encontraba en los apuntes originales y etiquetas de cada espécimen estuviese correctamente escrita en la planilla Darwin Core.
3. Como no se contaba con las coordenadas de las localidades, se procedió a realizar una estimación de cada una de ellas con base a los datos correspondiente de cada localidad o cabecera municipal, cada dato fue validado por el sistema de información geográfica de software libre y de código abierto (QGIS).
4. En caso de presentar varias formas de escrituras para la misma localidad, hábitat o taxón se unifico de acuerdo a los criterios del Sistema de Información Sobre Biodiversidad de Colombia (SIB Colombia).
5. Después se realizó la validación de la matriz Darwin Core a través de diferentes plataformas y/o aplicaciones como: Global Biodiversity Informatión Facility (GBIF) y la herramienta o aplicación de código abierto; OpenRefine para validar toda su información.

Este conjunto de datos comprende 105 registros biológicos de la familia Udoteaceae dispuestoos en la colección ficológica German Bula Meyer. Representado en 3 géneros y 11 especies. Un 78.09% está determinado a nivel de especies y un 21.9% a nivel de género.

1. Udotea
   rank: genus
2. Penicillus
   rank: genus
3. Rhipocephalus
   rank: genus

Para Colombia las macroalgas fueron colectadas en los departamentos de: Archipiélago de San Andrés, Providencia y Santa Catalina, Bolívar, Guajira, Choco y Magdalena. Adicionalmente hay datos de los siguientes países: Las Bahamas y Estados Unidos.