Herbario Nacional Colombiano (COL)

Study Extent

Ejemplares del Herbario Nacional Colombiano.

Sampling

Se seleccionaron familias importantes para sistematizar, se buscaron los ejemplares en los armarios, se codificaron y se fotografiaron. Luego se realizó la sistematización y georreferenciación a partir de las fotografías.

Quality Control

Se revisó cada semana el 1% de los ejemplares en busca de errores. Si se encontraron en más del 50% de ese 1%, se revisaron todos los ejemplares del lote y se corrigieron. Ajuste de vocabularios controlados en: 1) Elementos de registros: collectionID y type de acuerdo a la naturaleza de los datos; 2) Elementos geográficos: country, stateProvince y county.

Method steps

1. Los ejemplares de las colecciones son tomados y codificados con un código de barras. Los ejemplares de herbario son fotografiados bajo condiciones estandarizadas con una cámara de 21,1 megapixeles, pues el fotografiado de herbarios a gran escala, se recomienda como un medio para acelerar el proceso de descubrimiento de especies (Escocia et al, 2010). Estos procedimientos siguen manuales de buenas prácticas y protocolos generados y mejorados continuamente en el ICN.
2. Todos los datos de la etiqueta son capturados, incluido el hábitat y datos descriptivos de la morfología, en la base de datos del programa para colecciones biológicas Specify 6. Posteriormente los ejemplares son devueltos a su lugar en la colección. Los ejemplares de herbario son reingresados después de ser fotografiados y la sistematización se realiza con base en la fotografía.
3. Paralelo a este proceso, biólogos con asesoría de los especialistas del Instituto de Ciencias Naturales revisan y actualizan la información del árbol taxonómico de Specify de las especies en cuestión a medida que se sistematizan nuevos registros. Este árbol taxonómico es la base que servirá para la taxonomía del PIFFS.
4. Posteriormente, para enriquecer el valor de los datos, las localidades de los registros son georreferenciadas por un geógrafo, siguiendo el método del radio-punto (Chapman & Wieczorek 2006, SUA et al., 2004) estableciendo así un punto y una precisión. Un ingeniero apoya la administración de la base de datos y asiste a los sistematizadores en la solución de problemas.
5. Para la actualización y mantenimiento de la taxonomía en el PIFFS, otro ingeniero de sistemas instalará una plataforma estandarizada para el intercambio de información sobre biodiversidad (IPT) y trabajará junto con la empresa contratista que realice el PIFFS para que esta plataforma sirva de puente entre nuestra base de datos y el PIFFS.

Este conjunto de datos contiene un total de 346.537 registros del reino Plantae. Los datos están distribuidos en 17 filos, 34 clases, 159 ordenes, 535 familias, 4.304 géneros y 26.928 especies. Un 74% esta clasificado a especie, 18% a género, 2% a nivel de familia y 6% a otras categorías.

1. Plantae
   common name: Plantas rank: kingdom
2. Anthocerotophyta
   rank: phylum
3. Ascomycota
   rank: phylum
4. Basidiomycota
   rank: phylum
5. Bryophyta
   rank: phylum
6. Cercozoa
   rank: phylum
7. Charophyta
   rank: phylum
8. Chlorophyta
   rank: phylum
9. includeeditCycadophyta
   rank: phylum
10. Gnetophyta
    rank: phylum
11. Lycopodiophyta
    rank: phylum
12. Magnoliophyta
    rank: phylum
13. Marchantiophyta
    rank: phylum
14. Phaeophyta
    rank: phylum
15. Pinophyta
    rank: phylum
16. Pteridophyta
    rank: phylum
17. Rhodophyta
    rank: phylum
18. Tracheophyta
    rank: phylum

En su mayoría los ejemplares provienen de Colombia, sin embargo también existen ejemplares de muchos otros países, por ejemplo de las colecciones en Europa del Padre Enrique Pérez Arbeláez, fundador del Herbario Nacional Colombiano. En ese sentido la cobertura es mundial, pero se enfoca en Colombia.