Registros de ectoparásitos para la detección de patógenos emergentes (SARS-CoV-2) y re-emergentes (Rickettsias) en caninos procedentes del departamento de Santander

Study Extent

Este estudio se desarrolló en los municipios de Bucaramanga, Floridablanca, Girón y Piedecuesta, ubicados en el departamento de Santander, Colombia (Gobernación de Santander, 2017). Esta región comprende un área geográfica de 1.479 km2. El régimen de lluvias es regular durante todo el año; sin embargo, se concentra en los meses de octubre a diciembre. Las características bioclimáticas de la región son muy similares y con una temperatura media anual de 23° C, con poca variación climática a lo largo del año. La altitud media se encuentra entre 600 y 1700 msnm y la precipitación media anual es de 1040 mm de agua, con un 78% de humedad relativa (Gobernación de Santander, 2017).

Sampling

SARS-CoV-2: En las clínicas veterinarias se tomaron hisopados en perros con y sin signos respiratorios. Ectoparásitos: Las garrapatas fueron extraídas mediante el método de colección directa. Se colectaron especies de garrapatas en diferentes estados evolutivos (larva, ninfa y adulto). Durante el mismo tiempo se colectaron las formas adultas de especies de pulgas. Los especímenes colectados fueron depositados en viales con etanol absoluto y etiquetados con la información de campo tales como fecha, albergue y tipo de hospedador.

Method steps

1. SARS-CoV-2: En las clínicas veterinarias se tomaron hisopados en perros con y sin signos respiratorios. Los hisopados fueron almacenados en una alícuota de RNAlater entre 4-20°C hasta la extracción de ARN. Además, se realizó una toma de muestra de sangre en tubos sin EDTA para extracción de suero.
2. Ectoparásitos: Las garrapatas fueron extraídas mediante el método de colección directa, consistente en la revisión de toda la superficie corporal de cada animal durante 15 minutos, en las partes del cuerpo donde generalmente se encuentran garrapatas (orejas, cabeza, cuello, patas delanteras y traseras, región torácica, abdominal y perianal). Durante ese tiempo, las garrapatas se desprendieron a contrapelo de la piel de los animales, mediante pinzas o con suaves movimientos de tracción (Benavidez-Montaño et al., 2018) y así evitar que el gnatosoma (aparato bucal) de la garrapata se desprenda del cuerpo del perro y quede clavado en el interior de la piel, lo cual inutiliza la muestra. Se colectaron especies de garrapatas en diferentes estados evolutivos (larva, ninfa y adulto). Durante el mismo tiempo se colectaron las formas adultas de especies de pulgas. Los especímenes colectados fueron depositados en viales con etanol absoluto y etiquetados con la información de campo tales como fecha, albergue y tipo de hospedador.
3. En paralelo con el proceso de identificación utilizando caracteres morfológicos, se seleccionó una muestra al azar de los ectoparásitos colectados en los diferentes albergues. Se procedió a la identificación taxonómica mediante biología molecular. En las pulgas se utilizó el marcador mitocondrial COII. Este fue amplificado con los primers F-Leu y R-Leu. Para la identificación de las garrapatas se utilizó el gen COI usando la pareja de primers S0725 y S0726. La secuenciación de los amplicones se realizó por la técnica de Sanger. El material recolectado fue destruido durante el procesamiento y, por lo tanto, no se depositó en ninguna colección de referencia.

El presente conjunto de datos cuenta con 151 registros biológicos, de los cuales 76 son de la especie Ctenocephalides felis, 70 de Rhipicephalus sanguineus, cuatro para el género Wolbachia y uno para Rickettsia.

1. Ctenocephalides
   common name: Pulga del gato rank: genus
2. Rhipicephalus
   common name: Garrapata del perro rank: genus
3. Rickettsia
   rank: genus
4. Wolbachia
   rank: genus

Área metropolitana de las ciudades de Bucaramanga, Floridablanca, Girón y Piedecuesta, jurisdicción del departamento de Santander.