Presencia de Cryptococcus neoformans y Cryptococcus gattii en muestras ambientales de Bucaramanga y Cúcuta
Citation
Angarita Sánchez A K, Tapias Rivera J, Quimbaya Ramírez J J, Contreras A A, Escandón P (2022). Presencia de Cryptococcus neoformans y Cryptococcus gattii en muestras ambientales de Bucaramanga y Cúcuta. Version 1.3. Universidad de Santander - UDES. Occurrence dataset https://doi.org/10.15472/7g78lw accessed via GBIF.org on 2024-12-13.Description
El objetivo general de este proyecto es determinar la presencia de Cryptococcus neoformans y Cryptococcus gattii en muestras ambientales y veterinarias de los municipios de Bucaramanga y Cúcuta, mediante pruebas convencionales y moleculares.
Se evaluaron muestras ambientales tomadas en el parque General Santander y la sede de la Universidad de Santander del municipio de San José de Cúcuta entre junio y agosto del 2019 y en Bucaramanga el 18 de agosto del 2021, para lo cual se recolectaron muestras de suelo y corteza de diferentes de árboles. Estas muestras fueron procesadas mediante la técnica de extracción de buffer fosfato salino suplementando con antibiótico. Los aislados de Cryptococcus gattii y Cryptococcus neoformans (familia: Tremellaceae) corresponden a 35 registros y fueron identificados por espectrometría de masas utilizando la tecnología MALDI TOF.
Concomitantemente, a la toma de muestra se realizó registro de las variantes meteorológicas, las anomalías en las temperaturas obtenidas de la Administración Nacional Oceánica y Atmosférica (NOAA) y los datos de precipitación del Instituto de Hidrología, Meteorología y Estudios Ambientales (IDEAM) con el propósito de realizar la asociación entre variantes meteorológicas y aislamientos ambientales.
Sampling Description
Study Extent
Los datos contenidos en este recurso corresponden a los muestreos realizado en el Parque San Pio, en la ciudad de Bucaramanga y a los realizados en el parque Santander y los alrededores del estadio Plaza Banderas, en la ciudad de Cúcuta.Sampling
Se realizó un muestreo de suelo, corteza de árboles y excretas de paloma en las localidades: Parque San pio, estadio General Santander, Parque General Santander, Universidad de Santander (Campus Cúcuta), para aislar organismos del género Cryptococcus.Method steps
- Toma y procesamiento de muestras ambientales: Las muestras de suelo, corteza de árboles y excretas de paloma se recolectaron en bolsas plásticas 10 g aproximadamente.
- Estas muestras fueron procesadas mediante la técnica de extracción de buffer fosfato salino (PBS) suplementando con antibiótico (Paliwal and Randhawa 1978; Escandón, Quintero et al 2005), la cual consiste en pesar 5 g de muestra, resuspenderla en 25 ml de PBS 1X, homogenizar y dejar en reposo durante una hora.
- Posteriormente se siembran en agar semilla de girasol y se incuban a 27°C durante 20 días.
- Las colonias cremosas, elevadas, con bordes regulares y pigmento café se les hará una prueba de degradación de urea y agar canavanina glicina azul de bromotimol sódico.
- Los aislados serán identificados por espectrometría de masas utilizando la tecnología MALDI TOF.
- Concomitantemente, a la toma de muestra se realiza registro de las variantes meteorológicas, las anomalías en las temperaturas se descargarán de la Administración Nacional Oceánica y Atmosférica (NOAA) y los datos de precipitación serán proporcionados por el Instituto de Hidrología, Meteorología y Estudios Ambientales (IDEAM).
- Posteriormente, mediante el Sistema de Información Geográfica (SIG) software ArcGis v 10.2.16 y ArcView GIS 3.2 (Environmental Systems Research Institute Inc., Redlands, CA) se realizará la asociación entre variantes meteorológicas y aislamientos ambientales.
- Toma y procesamiento de muestras veterinarias: La muestra será tomada por un médico veterinario, a los animales seleccionados se les colocará un bozal y estarán sujetos por un auxiliar de investigación, este tipo de procedimiento de toma de muestra no generará dolor. Es un procedimiento poco invasivo y no generará ningún efecto secundario sobre la salud del animal.
- En este caso se tomarán muestras de hisopado nasal o muestra sanguínea en canino y felinos, las cuales serán conservadas a 4°C en una cava rotulada a los laboratorios de Microbiología de la Universidad de Santander campus Cúcuta.
Additional info
[autoridad]ANLA[numero]01749[titular]Universidad de Santander[nit o cedula]804001890-1[fecha]2017-12-29Taxonomic Coverages
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Cryptococcusrank: genus
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Cryptococcus neoformansrank: species
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Cryptococcus gattiirank: species
Geographic Coverages
Bibliographic Citations
- Escandón, P., Quintero, E., Granados, D., Huérfano, S., Ruiz, A., & Castañeda, E. (2005). Isolation of Cryptococcus gattii serotype B from detritus of Eucalyptus trees in Colombia. Biomedica, 25(3), 390-397. -
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- Paliwal, D. K., & Randhawa, H. S. (1978). A rapid pigmentation test for identification of Cryptococcus neoformans. Antonie van Leeuwenhoek, 44(2), 243-246. -
- Staib, F., Seibold, M., Antweiler, E., & Fröhlich, B. (1989). Staib Agar Supplemented with a Triple Antibiotic Combination for the Detection of Cryptococcus neoformtans in Clinical Specimens: Staib‐Agar mit einer Dreifach‐Antibiotika‐Kombination für den Nachweis von Cryptococcus neoformans in klinischem Untersuchungsmaterial. Mycoses, 32(9), 448-454. -
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