Microorganismos asociados al proyecto COMUNIC
Citation
Ghneim-Herrera T (2023). Microorganismos asociados al proyecto COMUNIC. Version 1.1. Universidad Icesi. Occurrence dataset https://doi.org/10.15472/uorkmc accessed via GBIF.org on 2024-12-11.Description
El Proyecto de Investigación de Microorganismos de la Universidad ICESI (COMUNIC) constituye una iniciativa dedicada al estudio y preservación de microorganismos (hongos y bacterias) puros y estables. Este proyecto busca mantener intactas las características originales de estos organismos y la información asociada, con el propósito de apoyar actividades educativas y de investigación. Se realiza bajo estrictos estándares de calidad, acordes a las regulaciones nacionales e internacionales en la materia
El presente recurso contiene la información asociada a 50 registros del reino Bacteria provenientes de la ciudad de Cali entre los años 2017 y 2019, identificadas por secuenciación del 16S.
Sampling Description
Study Extent
El área de estudio de comprende toda América del Sur.Sampling
Las semillas se esterilizaron superficialmente con Nistatina, luego se transfirieron a una solución desinfectante durante 20 minutos. Posteriormente, las semillas se lavaron, se sumergieron en cloruro mercúrico y se volvieron a lavar con agua estéril. Para el aislamiento de las bacterias endofíticas, las semillas esterilizadas en superficie se descascarillaron asépticamente y se maceraron en un mortero y luego se transfirieron a placas de Petri que contenían agar nutritivo. Tras una semana de incubación a 30°C, se aislaron y caracterizaron colonias macroscópicamente diferentes. Los aislados bacterianos resultantes se mezclaron con glicerol esterilizado.Method steps
- Las semillas se esterilizaron superficialmente con Nistatina (0,01%) agitándolas durante 20 minutos y luego se transfirieron a una solución desinfectante (NaClO 0,09%, NaCl 30 g. L-1, NaOH 1,5 g. L-1) durante 20 minutos.
- Posteriormente, las semillas se lavaron cuatro veces con agua estéril durante 3 minutos, se sumergieron en cloruro mercúrico durante 14 minutos y se volvieron a lavar con agua estéril.
- La eficacia del método de esterilización se verificó colocando las semillas esterilizadas en caldo nutritivo durante 48 horas.
- Para el aislamiento de las bacterias endofíticas, las semillas esterilizadas en superficie se descascarillaron asépticamente y se maceraron en un mortero con una solución salina al 0,8% y luego se transfirieron a placas de Petri que contenían agar nutritivo.
- Tras una semana de incubación a 30°C, se aislaron y caracterizaron colonias macroscópicamente diferentes. Los aislados bacterianos resultantes se mezclaron con glicerol esterilizado a una concentración final del 10% (vol/vol) y se almacenaron a -80°C.
- Los microorganismos se mantiene bajo condiciones criogénicas, depositados en ultra-congeladores a -80°C.
Taxonomic Coverages
Todos los microorganismos se identificaron a nivel de género o especie.
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Agrobacteriumrank: genus
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Arthrobacterrank: genus
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Bacillusrank: genus
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Chitinophagarank: genus
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Chryseobacteriumrank: genus
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Curtobacteriumrank: genus
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Dyadobacterrank: genus
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Enterobacterrank: genus
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Herbaspirillumrank: genus
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Kocuriarank: genus
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Neorhizobiumrank: genus
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Novosphingobiumrank: genus
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Paenibacillusrank: genus
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Pantoearank: genus
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Paracoccusrank: genus
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Pseudarthrobacterrank: genus
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Pseudomonasrank: genus
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Ralstoniarank: genus
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Rhizobiumrank: genus
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Shinellarank: genus
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Sphingobiumrank: genus
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Staphylococcusrank: genus
Geographic Coverages
Los registros reportados tienen depósito en la ciudad de Cali (Colombia), y corresponde microorganismos endófitos aislados de semillas de especies de arroz recolectadas en campos de los Llanos de Venezuela.
Bibliographic Citations
Contacts
Thaura Ghneim-Herreraoriginator
position: Profesora Titular
Universidad Icesi
Calle 18, 122-135, Pance
Cali
76001
Valle del Cauca
CO
email: tghneim@icesi.edu.co
userId: http://orcid.org/0000-0001-5716-0900
Thaura Ghneim-Herrera
metadata author
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Thaura Ghneim-Herrera
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