Ictioparasitologia_na_planicie_de_inundacao_do_alto_rio_parana_estudos_de_longo_prazo
Citation
Bonekcer C, Bonecker C (2020). Ictioparasitologia_na_planicie_de_inundacao_do_alto_rio_parana_estudos_de_longo_prazo. Sistema de Informação sobre a Biodiversidade Brasileira - SiBBr. Metadata dataset https://doi.org/10.15468/5sdwqi accessed via GBIF.org on 2024-05-08.Description
Este recurso contém os dados de ictioparasitas obtidos em doze ambientes amostrados dentro do projeto “A planície alagável do alto rio Paraná: estrutura e processos ambientais”. O monitoramento se iniciou em 2000. Todos os ambientes foram amostrados trimestralmente durante todo o tempo de estudo, exceto nos períodos em que os corpos de água isolados secaram completamente.Sampling Description
Study Extent
Foram amostrados trimestralmente em doze ambientes (entre rios, canais, ressacos, lagoas isoladas e lagoas conectadas aos rios principais), associados as três principais sub-bacias dessa planície de inundação do alto rio Paraná (rios Baía, Ivinhema e Paraná).Sampling
O ciclo de vida dos parasitas de peixes será estudado a partir da identificação molecular dos estágios larvais de diplostomídeos, e para tal é necessário verificar quais são as espécies de moluscos que estão atuando como hospedeiros intermediários desses parasitas na planície de inundação. Portanto, os moluscos foram amostrados em três pontos em cada ambiente, em transecto: dois na região marginal (M1 e M2) e um na região central (C). As amostras foram obtidas com auxílio de um pegador do tipo Petersen modificado (0,0345 m2). O material coletado foi lavado em uma série de peneiras de malhas: 2,0 mm; 1,0 mm e 0,2 mm. Os invertebrados retidos nas duas primeiras malhas foram retirados e imediatamente fixados em álcool 70%, e todo o material retido na última peneira foi fixado com álcool 80 %.Quality Control
Este material foi triado no Laboratório de Ecologia de Zoobentos no Nupélia, sob microscópio estereoscópico, onde os moluscos foram identificados e contados. A identificação dos digenéticos foi feita de acordo com Gibson et al. (2002). A extração de DNA foi realizada com Kit de extração em colunas, e a amplificação e o sequenciamento da região COI do DNA mitocondrial dos parasitos seguiram o protocolo descrito por Moszczynska et al. (2009). As sequências foram editadas e alinhadas utilizando o método MUSCLE e as divergências evolutivas (intra e interespecíficas) foram calculadas de acordo com a correção feita pelo modelo de substituição nucleotídica Kimura 2-parâmetros, com deleção parcial de gaps, com o auxílio do programa MEGA 5.0. Depois de alinhadas, as sequências obtidas foram utilizadas para confirmar a identificação das espécies de acordo com a comparação de dados previamente disponibilizados no GenBank. Além disso, foi construída uma árvore filogenética com o programa raxML, utilizando o método de Máxima Verossimilhança e modelo de substituição nucleotídica GTR (General Time Reversible), com 1000 reamostragens de bootstrap. Para cada espécie de diplostomídeo encontrada em mais de uma espécie de hospedeiro, a especificidade foi quantificada usando o número de espécies hospedeiras, assim como dois índices filogenéticos: distância filogenética dos hospedeiros e a variância da diversidade filogenética dos hospedeiros.Method steps
- Yamaguti’s systematic arrangement (1959), Vidal-Martinez et al. (2000) and Thatcher (2006). For Monogenea, the classification is in accordance with Cohen et al. (2013); for Digenea, Thatcher (1993) and Kohn et al. (2007); and for Nematoda, Moravec (1998), with some modifications substantiated from the recent literature.
Taxonomic Coverages
Phylum: Platyhelminthes
Phylum: Nematoda
Phylum: Acanthocephala
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Platyhelminthesrank: phylum
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Nematodarank: phylum
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Acanthocephalarank: phylum
Geographic Coverages
Planície de inundação do alto rio Paraná – PR/MS (Brasil)
Coordinates: 24°12'24.8''S and 22°21'0.27''S Latitude; 54°34'48.28''W and 52°44'3.75''W Longitude
Bibliographic Citations
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