Dane dostępne za pośrednictwem sieci GBIF są bezpłatne dla wszystkich—ale nie są wolne od zobowiązań. Zgodnie z warunkami umowy użytkownika danych GBIF data user agreement, użytkownicy, którzy pobierają poszczególne zbiory danych lub wyniki wyszukiwania i wykorzystują je w badaniach lub polityce, zgadzają się na zacytowanie ich za pomocą DOI, bądź identyfikatora obiektu cyfrowego.
Dobre praktyki w zakresie cytowania zapewniają przejrzystość naukową oraz odtwarzalność poprzez kierowanie innych badaczów do oryginalnych źródeł informacji. Wynagradzają one również instytucje publikujące dane oraz pojedyncze osoby poprzez wzmocnienie wartości wymiany otwartych danych i wykazanie ich wpływu na udziałowców i fundatorów. Zestawy danych publikowane poprzez GBIF są autoryzowanymi elektronicznymi publikacjami danych, więc w związku z tym powinny być traktowane jako pierwszorzędne wyniki oraz być prawidłowo cytowane.
Wszystkie przykładowe cytaty poniżej są sformatowane w stylu Harvard, natomiast prosimy o dostosowanie ich do formatu, którego wymaga Pańska instytucja, wydawca lub agencja. Jednakże, proszę podać każdy element z treści—w szczególności DOI w formie adresu URL.
Cytowanie danych
- Pobieranie danych o wystąpieniach
- Indywidualne zbiory danych
- Individual occurrences (specimens/observations)
- Strony o gatunkach
- Pochodne zbiory danych
- Dane o wystąpieniach uzyskane przy użyciu narzędzi ze stron trzecich (np. rgbif, pygbif, spocc, dyski itp.)
- Dane o wystąpieniach dostępne za pośrednictwem interfejsu wyszukiwania wydarzeń API należącego do GBIF
- Dane o wystąpieniach dostępne w chmurze
Citing images and other media
Cytowanie zawartości innych niż dane
Pobieranie danych o występowaniu
Following a successful download of occurrence data from GBIF.org, the user will be redirected to the download landing page that includes the following information:
Ten przypis pojawia się ponownie w wiadomości e-mail zawierającej potwierdzenie, która jest wysłana do zarejestrowanego użytkownika. Prosimy o zachowanie tego odniesienia w razie potrzeby cytowania. Szczegóły poprzednich pobrań są dostępne u zarejestrowanego użytkownika w każdej chwili w liście pobrań list of downloads. W razie potrzeby pomocy w znalezieniu poprzedniego pobrania prosimy o kontakt z GBIF.
Strona pobierania zawiera listę wszystkich dostarczonych zbiorów danych, jak i również zrzut ekranu wszystkich wyszukiwanych haseł, filtrów i aspektów. Użytkownicy mogą szybko aktualizować wyniki wyszukiwania ze strony pobierania oraz będą również widzieć linki do wszelkich cytatów po ich odebraniu w programie śledzącym literaturę GBIF (przykładowo).
Cytowanie filtrowanych pobrań
Jeśli pobrane dane zostały przefiltrowane w znacznym stopniu, można utworzyć zestaw danych pochodnych, aby cytować tylko zapisy używane w dalszej analizie. Wymaga to zachowania kolumny datasetKey podczas etapów filtrowania.
Cytowanie wielu pobrań
Jeśli użyto wielu pobrań, umieszczenie wszystkich cytatów na liście referencyjnej artykułu może zostać uniemożliwione. W takim przypadku zalecamy uwzględnienie dodatkowej listy lub uzupełnienia wszystkich wykorzystanych pobrań. Możliwe jest również streszczenie połączonych danych przy użyciu pochodnego zbioru danych. Warto zapamiętać, że system pobierania GBIF pozwala na wiele taksonów (do 100 000) w pojedynczym żądaniu pobrania.
Indywidualne zbiory danych
Większość pobrań z GBIF.org zawiera zapisy z wielu zbiorów danych (jak wyżej), ale w niektórych przypadkach, takich jak sprawozdania wewnętrzne lub poprzednia publikacja zbioru danych w celach badawczych, użytkownicy chcą bądź muszą przytoczyć pojedynczy zbiór danych, jak w tym przykładzie:
Rivas Pava M D P, Muñoz Lara D G, Ruiz Camayo M A, Fernández Trujillo L F, Muñoz Castro F A, Pérez Muñoz N (2017). Colección Mastozoológica del Museo de Historia Natural de la Universidad del Cauca. Wersja 1.1. Universidad del Cauca. Dane o występowaniu, https://doi.org/10.15472/ciasei dostępne za pośrednictwem GBIF.org, 2020-03-02.
Warto zapamiętać, że zbiory danych ulegają zmianom wraz z upływem czasu, a nawet pojedynczym pobraniom zbiorów danych są przypisywane nowe, unikalne identyfikatory DOI, które powinny być używane w cytatach. W stosownych przypadkach można to zrobić w połączeniu z oryginalnym cytowaniem zbioru danych, np.:
### Individual occurrencesTelenius A, Jonsson C (2017). Molluscs of the Gothenburg Natural History Museum (GNM) ("Mięczaki Muzeum Historii Naturalnej w Göteborgu"). GBIF-Szwecja. Dane o występowaniu, https://doi.org/10.15468/dl.f14yjv dostępne za pośrednictwem GBIF.org, 2020-03-02.
If you wish to cite a specific occurrence record, whether based on a specimen or an observation, you can use the suggested citation string shown at the bottom of the occurrence page. For example, this macaw palm (Acrocomia aculeata) specimen should be cited as:
Bernacci L C (2025). IAC - Herbário do Instituto Agronômico de Campinas. Version 1.124. Instituto Agronômico (IAC). Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/w48pii accessed via GBIF.org on 2025-01-01. https://www.gbif.org/occurrence/1090581569
If you're unable to include both the DOI URL of the dataset and the URL of the occurrence itself, the citation can be changed, for example:
Bernacci L C (2025). Occurrence ID: 1090581569. IAC - Herbário do Instituto Agronômico de Campinas. Version 1.124. Instituto Agronômico (IAC). Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/w48pii accessed via GBIF.org on 2025-01-01.
Note: If you wish to cite several records, we recommend that you create a download of those specific records, giving you a single reference to cite. This can be accomplished through an occurrence search (example), filtering by the GBIF ID of the occurrence records (as specified in the URL, https://www.gbif.org/occurrence/<GBIF ID>). Once all relevant records are included in the search, you can initiate the download to create a single DOI for easy citation.
Strony o gatunkach
Każda strona o gatunkach zawiera domyślne cytaty, na przykład:
Sekretariat GBIF: GBIF Backbone Taxonomy. https://doi.org/10.15468/39omei dostępny przez https://www.gbif.org/species/5284517
[13 stycznia 2020 r.]
Uwaga: W przypadku twierdzeń o dystrybucji danego taksonu, należy rozważyć pobranie pobrań o występowaniu. Zapewni to trwały i zanotowany w czasie zrzut ekranu danych z DOI, który można przytoczyć w taki sam sposób, jak pobieranie danych o występowaniu.
Pochodne zbiory danych
Derived datasets are citable records of GBIF-mediated occurrence data derived either from, e.g.:
- pobrania GBIF.org, które zostało przefiltrowane/znacząco zredukowane, lub
- several downloads combined into a single dataset, or
- danych dostępnych w chmurze, lub
- data obtained by any means for which no DOI was assigned (e.g. tools relying on the GBIF occurrence search API)
Po utworzeniu pochodnego zestawu danych, przypisuje się mu unikalny identyfikator DOI, który może być użyty do cytowania danych. Aby utworzyć zbiór danych należy uwierzytelnić za pomocą konta GBIF.org i dostarczyć wykaz zbiorów danych GBIF (przy użyciu DOI lub datasetKey), z których pochodzą dane, najlepiej z ilością wpisów wniesionych przez każdy zestaw danych.
Dane o wystąpieniach uzyskane przy użyciu narzędzi ze stron trzecich (np. rgbif, pygbif, spocc, dyski itp.)
Dostęp do danych o wystąpieniach z GBIF w R, Pythonie i w innych językach programowania jest szybki i łatwy. Należy jednak zawsze pamiętać, że nadal obowiązują wymagania dotyczące cytowania zawarte w zgodzie użytkownika danych GBIF.
Uzyskanie danych o zdarzeniach przy użyciu funkcji occ_download() pakietu rgbif jest wysoce zalecane dla większości użytkowników, ponieważ zapewnia to przypisanie plików DOI do łatwego cytowania.
Narzędzia zwracające wyniki bezpośrednio z interfejsu API, GBIF (np. spocc, dismo, occ_data() i occ_search() funkcje rgbif), nie przypisze pojedynczych DOI do pobranych danych. Powinnością użytkownika jest identyfikacja jednostek publikujących zbiory danych i odpowiednie uznanie każdej z nich podczas przytaczania danych.
W przypadku danych uzyskanych za pomocą wyszukiwania wystąpień poprzez narzędzia oparte na interfejsie API zalecane jest użycie pochodnego zbioru danych jako łatwego sposobu uzyskania numeru DOI do cytowania danych. Strona dokumentacji rOpenSci dostarcza instrukcji dotyczących cytowania danych za pośrednictwem GBIF w rgbif.
Środowiska chmury
GBIF udostępnia miesięczne zrzuty ekranów przedstawiające dane o wystąpieniach dostępne do analizy w wielu środowiskach przetwarzania w chmurze:
Użytkownicy uzyskujący dostęp, bądź analizujący dane w takim środowisku chmury, powinni odnosić się do szczegółowych instrukcji zawartych w repozytoriach przetwarzania w chmurze. W cytacie należy uwzględnić co najmniej numer DOI pochodzący z odpowiedniego zrzutu ekranu (patrz: tabela). Dla analiz, w których dane są w znacznym stopniu filtrowane, należy prześledzić użyte DatasetKeys oraz użyć spisu pochodnego zbioru danych do przytaczania danych.
Citing images
Media associated with occurrence records
Images and other media associated with occurrence records may carry their own licences and terms for reuse which should be respected, such as giving attribution to the creator. In addition, we recommend citing media by their parent occurrence record(s), following the guidelines for aggregrated downloads or individual records.
Cytowanie zawartości GBIF innych niż dane
GBIF.org
W celu przytoczenia strony internetowej GBIF, użytkownicy mogą posłużyć się poniższym przykładem:
GBIF.org (rok), Strona Główna GBIF. Dostępne pod adresem: https://www.gbif.org
[13 stycznia 2020].
Materiał zautoryzowany na GBIF.org (strona internetowa)
W podobny sposób użytkownicy mogą powoływać się na strony niezawierające danych na stronie internetowej GBIF, na przykład:
GBIF.org (rok) Wytyczne dotyczące cytatów. Dostępne pod adresem: https://www.gbif.org/citation-guidelines
[13 stycznia 2020].
Uwaga: to podejście nie jest akceptowaną alternatywą dla cytowania pobierania danych.
GBIF jako infrastruktura/jednostka
Zalecamy, aby ci, którzy chcą cytować GBIF w szerszym i bardziej ogólnym kontekście, stosowali następujące cytaty:
GBIF: Global Biodiversity Information Facility (rok) Czym jest GBIF?. Dostępne pod adresem: https://www.gbif.org/what-is-gbif
[13 stycznia 2020].