Skip to main content

    Stručný průvodce publikováním dat prostřednictvím GBIF.org

    Získejte informace o nástrojích, procesech a osvědčených postupech pro publikování datových sad prostřednictvím sítě GBIF

    GBIF.org podporuje zveřejňování čtyř tříd datových sad s využitím široce uznávaných standardů pro údaje o biologické rozmanitosti.

    V současné době síť GBIF zveřejňuje pouze datové sady přímo od organizací. Jednotlivci, kteří chtějí publikovat příslušné datové sady, by měli pracovat prostřednictvím svých přidružených organizací (viz níže "Žádost o schválení") nebo zvážit předložení článku o datech v některém z rostoucího počtu časopisů.

    Občanští vědci mohou přispět k záznamům o výskytu nepřímo účastí na rostoucím počtu projektů po celém světě, které zveřejňují své datové sady prostřednictvím sítě GBIF.

    Zajištění institucionální dohody

    Jakmile se rozhodnete sdílet data prostřednictvím sítě GBIF, měli byste na své plány publikovat jménem své instituce upozornit správce. Sdílení otevřených dat může zvýšit viditelnost a dopad institucí a navázat na tradiční metody, jako jsou akademické publikace a půjčování vzorků, a odhalit nové možnosti spolupráce a prostřednictvím citací založených na DOI přímo navázat na využití ve výzkumu (příklad).

    Žádost o schválení

    Chcete-li se stát vydavatelem dat, musí vaše organizace požádat komunitu GBIF o schválení. Po prostudování dohody s vydavatelem dat a po zásadním souhlasu se sdílením dat vám doporučujeme, abyste co nejdříve požádali o schválení pro vaši organizaci, abyste se vyhnuli zpoždění při zveřejňování dat.

    Výběr publikačních nástrojů a partnerů

    Velká část dat, která jsou nyní sdílena s GBIF, se nachází na jedné z desítek instalací GBIF IPT: Integrated Publishing Toolkit a stále častěji na národních instalacích platformy Living Atlases, kterou původně vyvinula organizace Atlas of Living Australia.

    Existují i jiné alternativní dohody, včetně dohod o hostování dat v rámci dané instituce vydávající data i mimo ni. Vysoce kvalifikovaní vydavatelé mohou také použít rozhraní API k programové registraci datových sad (pro více informací kontaktujte help desk GBIF).

    Spravujeme také znalostní databázi nástrojů a další dokumentaci.

    Příprava dat ke zveřejnění

    Držitelé dat, kteří se rozhodnou sdílet svá data pomocí archivů Darwin Core (viz datové standardy), se mohou s formátem seznámit pomocí šablon tabulkových procesorů vytvořených pro datové sady o výskytu, kontrolní seznamy a datové sady sběru vzorků.

    Držitelé dat se mohou rozhodnout, jaká opatření přijmou pro hostování dat. Někteří se rozhodli hostovat a spravovat instance sady integrovaných publikačních nástrojů Integrated Publishing Toolkit (IPT), což je bezplatný softwarový nástroj s otevřeným zdrojovým kódem vyvinutý sekretariátem GBIF. Existují však i jiné alternativy, včetně hostovaných služeb IPT dostupných prostřednictvím národních a tematických uzlů a regionálních služeb založených na cloudu, které spravuje sekretariát.

    Pomocí aktualizovaného nástroje GBIF Data Validator můžete před zveřejněním zkontrolovat datové sady a získat konkrétní doporučení k jejich vylepšení a vyčištění. Zpráva pomůže například tím, že označí duplicitní záznamy, neúplná pole a rozpoznané nesrovnalosti ve formátování.

    Můžete také připravit datové sady tak, aby splňovaly požadavky GBIF na kvalitu dat.

    Výběr licence Creative Commons

    V souladu s rozhodnutím správní rady GBIF z roku 2014 musí vydavatelé dat přidělit jednu ze tří licencí Creative Commons každé datové sadě, která se vyskytne:

    • CC0, pro data zpřístupněná k libovolnému použití bez jakýchkoli omezení
    • CC BY, pro data zpřístupněná k jakémukoli použití s příslušným uvedením autora
    • CC BY-NC, pro data zpřístupněná k jakémukoli nekomerčnímu použití s příslušným uvedením autora



    Všimněte si, že licence CC-BY-NC mají významný vliv na opakované použití dat. GBIF vyzývá vydavatele dat, aby pokud možno volili co nejotevřenější variantu.

    Zveřejnění datových sad

    Pokud používáte IPT, jednoduše klikněte na tlačítko pro "registraci" vaší datové sady v GBIF. Po zveřejnění můžete zobrazit některé rychlé metriky vaší datové sady (příklad), aktivitu uživatelů při stahování (příklad) a dohledatelné citace literatury (příklad).

    Pobídky pro zveřejňování dat o biologické rozmanitosti s otevřeným přístupem

    Důležitou součástí poslání GBIF je podporovat kulturu, v níž si lidé uvědomují výhody zveřejňování dat o biologické rozmanitosti s otevřeným přístupem, a to jak pro sebe, tak pro širší společnost.

    • Tím, že svá data zpřístupníte prostřednictvím GBIF a podobných informačních infrastruktur, přispějete ke globálním znalostem o biologické rozmanitosti, a tím i k řešením, která podpoří její ochranu a udržitelné využívání.
    • Zveřejňování dat umožňuje integraci datových sad z celého světa a odhaluje nové možnosti spolupráce mezi vlastníky dat a výzkumnými pracovníky.
    • Zveřejňování dat umožňuje jednotlivcům a institucím, aby byli náležitě oceněni za svou práci při vytváření a kurátorství dat o biologické rozmanitosti, a to díky zviditelnění publikujících institucí prostřednictvím kvalitních metadat. Toto uznání lze dále rozvíjet, pokud jste autorem recenzovaného článku o datech, čímž získáte vědecké uznání za publikaci souborů dat o biologické rozmanitosti.
    • Správci sbírek mohou sledovat využití a citace digitalizovaných dat publikovaných jejich institucemi a zpřístupněných prostřednictvím GBIF a podobných infrastruktur.
    • Některé agentury pro financování nyní vyžadují, aby výzkumní pracovníci, kteří dostávají veřejné prostředky, po skončení projektu volně zpřístupnili data.