MGC Herbarium of University of Malaga…

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Full Title

MGC Herbarium of University of Malaga (Spain): MGC-Cormof dataset

Description

El Herbario de la Universidad de Málaga (Herbario MGC) está constituido por cuatro colecciones biológicas. La colección de plantas vasculares (MGC Cormof) es la colección principal del herbario. La base de datos MGC-Cormof tiene como objetivo la digitalización y publicación de los datos asociados con los más de 80.000 ejemplares depositados en la colección, de los cuales el 97,4% de las muestras se encuentran identificadas a nivel de especie. Desde 2011, los Servicios Centrales de Investigación (SCAI) de la Universidad de Málaga son responsables de mantener el herbario y sus respectivas bases de datos. Esta colección está en continuo crecimiento, con una incorporación anual de unos 1.500 ejemplares. El 97% de la colección está digitalizada a través del programa Herbar v3.7.1 (F. Pando et al. 1996-2011) por lo que más de 77.800 especímenes son accesibles a través de la red de GBIF (http://www.gbif.org/dataset/962cceea-f762-11e1-a439-00145eb45e9a). Actualmente, la colección MGC-Cormof está constituida por 242 familias y 8.274 taxones, distribuidos en angiospermas (92,56%), helechos y plantas afines (6.23%) y gimnospermas (1,21%). Las familias y géneros mejor representados en la colección son Compositae, Leguminosae, Gramineae, Labiatae, Caryophyllaceae, Teucrium, Silene, Asplenium, Linaria y Quercus. La mayoría de los especímenes provienen de la región del Mediterráneo Occidental, fundamentalmente del sur de España (Andalucía: 83.4% de las muestras) y del norte de Marruecos (2,1%). Aproximadamente, el 65,5% de las muestras se encuentran georreferenciadas. La identificación de los ejemplares de la colección ha sido realizada por personal del departamento de biología vegetal de la Universidad de Málaga y además un 40% de los ejemplares ha sido revisado por especialistas en taxonomía. La base de datos MGC-Cormof ha sido revisada mediante la herramienta DarwinTest v3.2 (Ortega-Maqueda and Pando 2008) antes de ser publicada en GBIF. Los datos incluidos en esta base de datos son importantes para trabajos de conservación, taxonomía, flora, cartografía, fenología, palinología, entre otros. El herbario MGC es uno de los herbarios de referencia para Flora Iberica (Castroviejo 1986-2012) y para la Flora Vascular de Andalucía Oriental (Blanca et al. 2009). La revista Acta Botanica Malacitana (B. Cabezudo 1975-) (http://www.biolveg.uma.es/abm/abm.html) está estrechamente relacionada con el herbario MGC y periódicamente publica artículos que están basados en datos incluidos en su colección. The herbarium of University of Málaga (MGC Herbarium) is formed by four biological collections. The vascular plants collection (MGC-Cormof ) is the main collection of the herbarium. MGC-Cormof dataset aims to digitize and publish data associated with over 80000 specimens deposited in the collection, of which 97.4% of the specimens are identified at species level. Since 2011, the University of Malaga’s Central Research Service (SCAI) has been responsible for maintaining the herbarium and their datasets. The collection is growing continuously, with an annual intake of about 1.500 specimens. Nearly 97% of the collection is digitized by Herbar v3.7.1 software (F. Pando et al. 1996-2011), making over 77.800 specimens accessible through the GBIF network (http://www.gbif.org/dataset/962cceea-f762-11e1-a439-00145eb45e9a). At present, 242 families and 8.274 taxa, distributed in angiosperms (92.56%), ferns and fern allies (6.23%) and gymnosperms (1.21%), constitute the MGC-Cormof collection. The families and genera best represented in the collection are Compositae, Leguminosae, Gramineae, Labiatae, Caryophyllaceae, Teucrium, Silene, Asplenium, Linaria and Quercus. Most of the specimens are from the Western Mediterranean Region, fundamentally Southern Spain (Andalusia: 83.4% of specimens) and Northern Morocco (2.1%). Approximately, 65.5% of the specimens are georeferenced. The identification of the specimens in the collection has been carried out by the plant biology department at the University of Malaga and plus 40% of the specimens has been reviewed by experts. The MGC-Cormof dataset has been revised by DarwinTest v3.2 tool (Ortega-Maqueda and Pando 2008) before being published in GBIF. The data included in this database are important for conservation works, taxonomy, flora, cartography, phenology, palynology, among others. MGC herbarium is one of the reference herbaria for Flora Iberica (Castroviejo 1986-2012) and Vascular Flora in Eastern Andalusia (Flora Vascular de Andalucía Oriental) (Blanca et al. 2009). The journal Acta Botanica Malacitana (B. Cabezudo 1975-) (http://www.biolveg.uma.es/abm/abm.html) is closely associated with the MGC Herbarium and periodically publishes papers that are based on data included in its dataset.

Temporal coverages

Date range: Jan 1, 1837 - Jan 1, 2014

Language of Metadata

ENGLISH

Language of Data

SPANISH

Administrative contact
José García Sánchez
Herbarium Curator
University of Málaga Servicios Centrales de Apoyo a la Investigación - SCAI. Bulevar Louis Pasteur, 33. Campus de Teatinos 29071 Málaga Málaga Spain +34 952137414
Metadata author
José García Sánchez
Herbarium Curator
University of Málaga Servicios Centrales de Apoyo a la Investigación (SCAI). Bulevar Louis Pasteur, 33. Campus de Teatinos 29071 Málaga Málaga Spain +34 952131912
Originator
Baltasar Cabezudo Artero
Scientific Manager
University of Málaga Departament of Plant Biology, (Botany Area). Faculty of Sciences, University of Málaga. Campus Teatinos s/n. 29071 Málaga Málaga Spain +34 952131944

doi:10.15468/2gfyxk

Published by

University of Malaga

Publication Date

Jul 2, 2015

Registration Date

Feb 19, 2009

Hosted by

GBIF-Spain

Served by

GBIF Spain IPT

Links

Alternative Identifiers

External Data

Metadata Documents

50,799 Georeferenced data

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All records | In viewable area

Description

Most of the data refer to the Western Mediterranean Region, mainly Southern Spain (Andalusia 83.4% of sheets) and Northern more

About

What does this map show?

Other Contacts

Principal investigator
Baltasar Cabezudo Artero

Taxonomic Coverage

The 77600 sheets of the MGC-Cormof collection are grouped into 242 families, 1578 genera, 6138 species and 8274 taxa (including infraspecific categories). Most of the specimens are angiosperms (94%), followed by ferns and fern allies (4.9%) and gymnosperms (1.1%). The main families in order of abundance are Compositae (10.2%), Leguminosae (9.7%), Gramineae (8.5%), Labiatae (7.5%), Caryophyllaceae (4.8%), Cruciferae (3.8%), Scrophulariaceae (3.5%), Cistaceae (3.1%), Umbelliferae (2.4%) and Liliaceae (2.1%). Main genera in order of abundance are Teucrium (2.5%), Silene (1.6%), Asplenium (1.4%), Linaria (1.2%), Quercus (1.1%), Centaurea (1.1%), Helianthemum (1%), Cistus (1%), Trifolium (1%) and Galium (1%). It is important to mention that this collection contains a wide representation of plants from several Protected Areas of southern Spain (Cabezudo et al. 2005; Pérez Latorre et al. 1998, 1999, 2002), endemic species (Blanca et al. 2009; Salvo et al. 1983), threatened species (Blanca et al. 1999, 2000, 2009; Cabezudo et al. 2005; Salvo et al. 1983), invasive species (Dana et al. 2005), ornamental species and many weeds. Total families represent are 247. The top ten is compound by Compositae (10.2%), Leguminosae (9.7%), Gramineae (8.5%), Labiatae (7.5%), Caryophyllaceae (4.8%), Cruciferae (3.8%), Scrophulariaceae (3.5%), Cistaceae (3.1%), Umbelliferae (2.4%) and Liliaceae (2.1%). Total genus represent are 1551. The top ten is compound by Teucrium (2.48%), Silene (1.62%), Asplenium (1.43%), Linaria (1.20%), Quercus (1.10%), Centaurea (1.08%), Helianthemum (1.02%), Cistus (1.02%), Trifolium (1.01%) and Galium (1.01%). It is important to mention that this collection has a good representation of plants from some Protected Areas of southern Spain, endemic species, threatened species, ornamental species and furthermore a lot of weeds.

KINGDOM
Plantae (Plants)
SUBKINGDOM
Tracheophyta or Cormophyta (Tracheophytes, Cormophytes, Vascular Plants)
FAMILY
Compositae (Sunflowers), Leguminosae (Legumes), Gramineae (True Grasses), Labiatae (Mints), Caryophyllaceae (Pinks), Cruciferae (Crucifers or Mustard), Scrophulariaceae (Figworts), Cistaceae (Rock Roses), Umbelliferae (Parsley or Carrot family), Liliaceae (Lyli family)
GENUS
Teucrium (Germander), Silene (Campion), Asplenium (Petako Rauriki), Linaria (Spurred Snapdragon), Quercus (Oak), Centaurea (Knapweed), Helianthemum (Rock Rose), Cistus (Rock Rose), Trifolium (Clover), Galium (Bedstraw)

Digitalización y Gestión de las Bases de Datos del Herbario MGC de la Universidad de Málaga

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Funding

>>>> Scientific research project: "Informatización del Herbario de la Universidad de Málaga (MGC)". Reference: CLEG2004-21156-E Fund: Ministerio de Educación y Ciencia (Spain). Length: 2006 January - 2009 September. Principal researcher: Dr. Baltasar Cabezudo Artero. >>>>Scientific research project: "Realización de una prestación de servicios para el mantenimiento e inclusión de pliegos del proyecto Flora de Andalucía Oriental en el Herbario público de la Universidad de Málaga". Reference: 8.06/03.3353 Fund: Junta de Andalucía Length: 2010 February - 2011 February. Principal researcher: Dr. Baltasar Cabezudo Artero. >>>>Scientific research project: "Digitalización y Gestión de las Bases de Datos del Herbario MGC de la Universidad de Málaga". Reference: 8.06/03.3353 Fund: Ministerio de Ciencia e Innovación (Spain). Subprograma Personal Técnico de Apoyo Length: 2012 January - 2014 December. Principal responsible: Dr. José García Sánchez. >>>>Temporary staff for assistance in fieldworks, contracted through Junta de Andalucía (Spain) research group: Biodiversidad, Conservación y Recursos Vegetales; Group code: RNM-115.

Project Personnel

Principal investigator
Baltasar Cabezudo Artero

Methodology

Study extent

Most plants are from Southern Spain (Andalusia), Malaga province being the most widely represented area, the aim being to cover the widest degree of plant biodiversity for this territory. In addition, the collection contains plants from Northern Morocco and several places from the rest of Spain and countries from Europe, Africa and South America.

Sampling description

The plants of this collection were mainly gathered by researchers of the Botany Area of the Department of Plant Biology at University of Malaga, as well as by members of the herbarium. A small component of the collection comes from exchanges or donations from other research centres or researchers.

Quality control

Every specimen of the MGC-Cormof collection has been identified by researchers of the Botany Area of the Department of Plant Biology at University of Malaga. Moreover, 40% of the specimens of this collection have subsequently been taxonomically revised for regional or national studies of flora or taxonomical revisions. Each taxonomic modification is incorporated into the database. The dataset is analysed in search of digitalisation errors before uploading to the GBIF Portal. This check is carried out by the DarwinTest v3.2 tool (Ortega-Maqueda and Pando 2008), provided by the Spanish GBIF Node. This tool looks for mistakes in taxonomy, dates, geospatial information, collectors, identifiers, etc. Any sheets belonging to J. Lara Ruiz have been deleted from this dataset because these specimens have uncertain information.

Method Steps

  1. Before incorporating new plants in the herbarium, the steps described below are followed. First, the material is pressed and dried, mounted on double A2 standard size (42 × 59.4 cm) sheets which perfectly cover and protect the specimen. Inside each sheet, an identification label provides the following information: taxonomy, country, province, county, locality, georeference, date, ecology, collectors and determinations. To kill any insects contained in the sheets, they are frozen at -20 °C for 72 hours. Periodically, the herbarium room is fumigated. The specimens are kept in compact shelving cabinets and arranged taking into account three main taxonomic groups: pteridophytes, gymnosperms and angiosperms. Within each group, the specimens are alphabetically arranged by families, genera and species.

Specimen Preservation method

Dried and pressed

Curational Units

  • 77,605 ± 0 sheets
  • 6,138 ± 0 species
  • 1,578 ± 0 genus
  • 242 ± 0 families
  • 8,274 ± 0 taxa

References

PUBLICATIONS FROM THIS DATASET - García-Sánchez J, Cabezudo B (2013) Herbarium of the University of Malaga (Spain): Vascular Plants Collection. PhytoKeys 26: 7-19. - García-Sánchez J, Cabezudo B (2014) El herbario MGC de la Universidad de Málaga. Boletín de la Asociación de Herbarios Ibero-Macaronésicos (AHIM) 16: 20-26.

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