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    Cubos de presencia de especies en GBIF

    Agregación de datos de presencia en dimensiones espaciales, temporales y taxonómicas para crear "cubos de datos" para la gestión de la biodiversidad y la toma de decisiones políticas

    Illustration of a Pacific Pilot Whale <a href="https://www.gbif.org/species/2440605"><i>Pacific Globicephala macrorhynchus</i> Gray, 1846</a> from The marine mammals of the north-western coast of North America, New York, 1974. Shared under <a href="https://creativecommons.org/publicdomain/mark/1.0/">Public Domain</a> by the <a href="https://www.biodiversitylibrary.org/page/16226214#page/145/mode/1up">Biodiversity Heritage Library</a>.
    Illustration of a Pacific Pilot Whale Pacific Globicephala macrorhynchus Gray, 1846 from The marine mammals of the north-western coast of North America, New York, 1974. Shared under Public Domain by the Biodiversity Heritage Library.

    GBIF permite a los usuarios crear y descargar cubos de datos para utilizarlos como base de modelos e indicadores de la biodiversidad pasada, actual y futura. Aunque la generación de cubos se basa en la GBIF API de descarga SQL, los usuarios pueden definir cubos fácilmente seleccionando la dimensión taxonómica, temporal y/o espacial deseada a partir de una sencilla lista de opciones preestablecidas. La consulta SQL generada puede personalizarse aún más antes de iniciar la descarga.

    Dimensiones

    Las opciones para generar cubos incluyen

    Los usuarios pueden añadir dimensiones adicionales basadas en datos categóricos, por ejemplo, etapas de la vida, categorías de la Lista Roja de la UICN, etc. afinando la consulta SQL.

    Medidas

    Para cada combinación de categorías de dimensiones (grupo), se calcula una medida. Como mínimo, incluye un recuento de ocurrencias, pero el usuario también puede añadir información sobre la incertidumbre temporal y de coordenadas.

    Formato, metadatos y FAIRness

    Al igual que con otros formatos de descarga de ocurrencias GBIF, los cubos se generan como archivos CSV delimitados por tabulaciones. Los metadatos del cubo se conservarán en una página de descarga en la que se detallará la consulta SQL, los conjuntos de datos de GBIF subyacentes que contribuyen al cubo, así como un enlace para descargar el cubo. Al igual que las descargas normales, a los cubos se les asigna un DOI para facilitar su citación.

    Documentación técnica y ejemplos

    Consulte la documentación para obtener todos los detalles sobre las opciones de creación, personalización y envío de consultas para los cubos de ocurrencia.

    Más información sobre los cubos de presencia de especies

    • Desmet P, Oldoni D, Blissett M, Robertson T (2023). Especificación de los cubos de aparición de especies y su producción. https://docs.b-cubed.eu/guides/occurrence-cube/
    • Groom Q, Abraham L, Adriaens T, Breugelmans L, Clarke D, Fernández M, et al. B-Cubed: Aprovechamiento de conjuntos de datos de biodiversidad listos para análisis y computación en la nube para un monitoreo oportuno y procesable de la biodiversidad. Biodiversity Information Science and Standards [Internet]. 2023 Ago 9;7. Disponible en: https://doi.org/10.3897/biss.7.110734
    • Oldoni D, Groom Q, Adriaens T, Davis AJS, Reyserhove L, Strubbe D, et al. Cubos de ocurrencia: un nuevo paradigma para agregar datos de ocurrencia de especies. 2020 Mar 25; Disponible en: https://doi.org/10.1101/2020.03.23.983601

    B3 logo completo

    Unión Europea (//images.ctfassets.net/uo17ejk9rkwj/6DO53L2kCckOgSKiyoU28i/73ce7be12fe8c9e90dd4c2516db099b7/flag-yellow-low.jpg)El desarrollo de los cubos de presencia de especies de GBIF forma parte del paquete de trabajo 2 de B-Cubed (Biodiversity Building Blocks for Policy), dirigido por el Instituto de Investigación para la Naturaleza y los Bosques (RIOC) y financiado por el Programa de Investigación e Innovación Horizonte Europa de la Unión Europea (ID nº 101059592)._.