Código de barras genético de cinco grupos críticos de la flora de México
Citation
Gernandt D, Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad C (2021). Código de barras genético de cinco grupos críticos de la flora de México. Version 1.10. Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/au5bgj accessed via GBIF.org on 2022-05-21.Description
Los códigos de barras genéticos consisten en secuencias cortas y estandarizadas de DNA que permiten la identificación de las especies de organismos conocidas y el descubrimiento de especies desconocidas. A diferencia de muchos animales (y otros eucariontes) para los que el gen mitocondrial CO1 es fácil de secuenciar y altamente informativo, las plantas terrestres presentan problemas particulares para la selección de un código de barras. Esto se debe a la baja tasa de substitución y la frecuencia de rearreglos del genoma mitocondrial. También existen problemas debidos a poliploidía y paralogía en los genes nucleares. Aunque existe consenso en que el genoma del cloroplasto es la fuente más prometedora de códigos de barras genéticos para plantas, la tasa de evolución relativamente baja de muchos genes de plástidos hace necesaria la concatenación de varias secuencias para incrementar la resolución. En este proyecto se generarán códigos de barras de DNA de cloroplasto de 319 ejemplares de c. 170 especies pertenecientes a nueve familias de plantas vasculares de gran relevancia biológica, ecológica, económica y cultural en México, incluyendo Agavaceae, Cactaceae, Crassulaceae, Cupressaceae, Orchidaceae, Pinaceae, Podocarpaceae y Taxaceae. En la selección de los grupos de estudio se priorizaron los taxones listados en la Norma Oficial Mexicana NOM-059-ECOL-2001. Los códigos propuestos consistirán de secuencias concatenadas de cuatro regiones en total. Candidatos por evaluar incluyen las regiones codificantes de los genes matK, rbcL y rpoC1, y los espaciadores intergénicos trnH-psbA, psbK-psbI y dos más hipervariables por definir en el curso de este estudio.
Reino: 1 Filo: 1 Clase: 1 Orden: 1 Familia: 1 Género: 13 Especie: 22
Taxonomic Coverages
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Plantaerank: kingdom
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Tracheophytarank: phylum
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Equisetopsidarank: class
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Asparagalesrank: order
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Orchidaceaerank: family
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Eurystylesrank: genus
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Cyrtochiloidesrank: genus
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Galeandrarank: genus
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Epidendrumrank: genus
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Vanillarank: genus
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Clowesiarank: genus
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Oncidiumrank: genus
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Laeliarank: genus
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Rhynchostelerank: genus
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Prosthechearank: genus
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Pelexiarank: genus
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Cuitlauzinarank: genus
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Corallorhizarank: genus
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Eurystyles borealisrank: species
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Cyrtochiloides ochmatochilacommon name: oncidium de abanico rank: species
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Galeandra greenwoodianarank: species
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Epidendrum lowilliamsiirank: species
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Epidendrum dorsocarinatumrank: species
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Vanilla pomponacommon name: platanillo, plátano vainilla, vainilla, vainilla boba, vainilla pompona, vainillán, vainillón rank: species
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Clowesia thylaciochilarank: species
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Oncidium pollardiirank: species
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Laelia ancepscommon name: camote de San Diego, flor de todos los santos, lirio, vara de San Diego rank: species
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Rhynchostele rossiirank: species
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Rhynchostele cordatacommon name: manuelitos, odontoglossum acorazonado, tigrillas rank: species
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Prosthechea chondylobulboncommon name: conchitas rank: species
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Vanilla parviflorarank: species
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Prosthechea pseudopygmaearank: species
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Epidendrum parkinsonianumcommon name: baros, lirio, lirio pata de gallo, lirio pata de paloma, pata de gallo, pata de paloma rank: species
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Pelexia funckianarank: species
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Cuitlauzina pendulacommon name: chorrito, cola de borrego, cuitlauzina perfumada, pozolillo rank: species
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Oncidium sphacelatumcommon name: flor de la santa cruz, flor de mayo, mayitos rank: species
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Prosthechea cochleatacommon name: araña, conchita, flor de concha, lirio, pulpito rank: species
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Epidendrum raniferumcommon name: lluvia de estrellas rank: species
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Corallorhiza striatarank: species
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Clowesia rosearank: species
Geographic Coverages
Bibliographic Citations
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