Código de barras genético de cinco grupos críticos de la flora de México
Citation
Gernandt D, Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad C (2024). Código de barras genético de cinco grupos críticos de la flora de México. Version 1.17. Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/au5bgj accessed via GBIF.org on 2024-10-11.Description
Los códigos de barras genéticos consisten en secuencias cortas y estandarizadas de DNA que permiten la identificación de las especies de organismos conocidas y el descubrimiento de especies desconocidas. A diferencia de muchos animales (y otros eucariontes) para los que el gen mitocondrial CO1 es fácil de secuenciar y altamente informativo, las plantas terrestres presentan problemas particulares para la selección de un código de barras. Esto se debe a la baja tasa de substitución y la frecuencia de rearreglos del genoma mitocondrial. También existen problemas debidos a poliploidía y paralogía en los genes nucleares. Aunque existe consenso en que el genoma del cloroplasto es la fuente más prometedora de códigos de barras genéticos para plantas, la tasa de evolución relativamente baja de muchos genes de plástidos hace necesaria la concatenación de varias secuencias para incrementar la resolución. En este proyecto se generarán códigos de barras de DNA de cloroplasto de 319 ejemplares de c. 170 especies pertenecientes a nueve familias de plantas vasculares de gran relevancia biológica, ecológica, económica y cultural en México, incluyendo Agavaceae, Cactaceae, Crassulaceae, Cupressaceae, Orchidaceae, Pinaceae, Podocarpaceae y Taxaceae. En la selección de los grupos de estudio se priorizaron los taxones listados en la Norma Oficial Mexicana NOM-059-ECOL-2001. Los códigos propuestos consistirán de secuencias concatenadas de cuatro regiones en total. Candidatos por evaluar incluyen las regiones codificantes de los genes matK, rbcL y rpoC1, y los espaciadores intergénicos trnH-psbA, psbK-psbI y dos más hipervariables por definir en el curso de este estudio.
Reino: 1 Filo: 1 Clase: 1 Orden: 7 Familia: 8 Género: 61 Subgénero: 4 Especie: 163 Epitetoinfraespecifico: 4
Taxonomic Coverages
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Plantaerank: kingdom
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Tracheophytarank: phylum
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Equisetopsidarank: class
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Asparagalesrank: order
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Saxifragalesrank: order
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Ephedralesrank: order
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Pinalesrank: order
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Araucarialesrank: order
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Cupressalesrank: order
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Caryophyllalesrank: order
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Asparagaceaerank: family
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Crassulaceaerank: family
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Orchidaceaerank: family
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Ephedraceaerank: family
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Pinaceaerank: family
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Podocarpaceaerank: family
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Cupressaceaerank: family
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Cactaceaerank: family
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Agaverank: genus
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Yuccarank: genus
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Echeveriarank: genus
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Rhynchostelerank: genus
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Encycliarank: genus
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Beschorneriarank: genus
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Ephedrarank: genus
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Pinusrank: genus
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Eurystylesrank: genus
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Furcraearank: genus
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Sedumrank: genus
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Lepanthesrank: genus
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Oncidiumrank: genus
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Manfredarank: genus
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Galeoglossumrank: genus
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Podocarpusrank: genus
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Sobraliarank: genus
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Abiesrank: genus
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Callitropsisrank: genus
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Mammillariarank: genus
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Laeliarank: genus
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Cumariniarank: genus
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Mormodesrank: genus
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Rossioglossumrank: genus
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Graptopetalumrank: genus
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Ariocarpusrank: genus
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Corallorhizarank: genus
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Cyrtochiloidesrank: genus
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Bletiarank: genus
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Galeandrarank: genus
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Prosthechearank: genus
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Taxodiumrank: genus
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Clowesiarank: genus
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Papperitziarank: genus
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Helleriellarank: genus
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Pseudogoodyerarank: genus
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Ortegocactusrank: genus
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Trichopiliarank: genus
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Acharagmarank: genus
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Vanillarank: genus
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Juniperusrank: genus
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Echinocactusrank: genus
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Tacitusrank: genus
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Lycasterank: genus
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Epidendrumrank: genus
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Pelexiarank: genus
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Cuitlauzinarank: genus
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Sigmatostalixrank: genus
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Polianthesrank: genus
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Picearank: genus
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Phragmipediumrank: genus
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Lophophorarank: genus
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Astrophytumrank: genus
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Cypripediumrank: genus
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Masdevalliarank: genus
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Pseudotsugarank: genus
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Coeliarank: genus
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Geohintoniarank: genus
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Echinocereusrank: genus
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Echinomastusrank: genus
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Plectrophorarank: genus
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Agaverank: subgenus
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Pinusrank: subgenus
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Littaearank: subgenus
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Strobusrank: subgenus
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Agave (Agave) vizcainoensiscommon name: maguey, maguey de El Vizcaíno rank: species
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Yucca lacandonicarank: species
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Echeveria longissimarank: species
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Rhynchostele rossiirank: species
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Encyclia adenocaularank: species
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Echeveria setosarank: species
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Beschorneria calcicolacommon name: ahuimo mixteco rank: species
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Ephedra compactacommon name: canutillo, cañatilla, comida de víbora, pitamo real, retama real, sanguinaria, tepopote rank: species
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Pinus (Pinus) attenuatacommon name: pino rank: species
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Eurystyles borealisrank: species
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Furcraea guatemalensiscommon name: ishté (Tojolabal), maguey, maguey cimarrón, ojoyó (Zoque) rank: species
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Sedum tortuosumrank: species
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Lepanthes tenuilobarank: species
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Oncidium suttoniirank: species
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Pinus (Pinus) contortacommon name: pino, pino de San Pedro Mártir rank: species
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Agave (Littaea) striatacommon name: estoquillo, maguey, maguey espadín, palmita, peinecillo rank: species
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Manfreda nanchititlensiscommon name: amole de Nanchititla rank: species
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Rhynchostele apterarank: species
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Manfreda guttatarank: species
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Agave (Littaea) chiapensiscommon name: maguey, maguey chamula rank: species
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Manfreda longiflorarank: species
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Galeoglossum thysanochilumrank: species
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Rhynchostele maculatarank: species
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Galeoglossum cactorumrank: species
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Podocarpus matudaecommon name: cedro blanco, jarilla, lengua de pájaro, olivo, palmilla, palmillo, palmito, peinecillo, sabino rank: species
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Furcraea pubescensrank: species
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Echeveria derenbergiirank: species
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Rhynchostele cervantesiicommon name: lirio, mariposa, tigrillo rank: species
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Sobralia macdougalliirank: species
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Agave (Littaea) parvifloracommon name: amole, maguey, tauta rank: species
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Abies hickeliirank: species
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Callitropsis lusitanicacommon name: cedro, cedro blanco, cedro rojo, ciprés, pino, sabino, sësa'na (Mazahua), tatzcanti (Náhuatl), táscate rank: species
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Mammillaria huitzilopochtlicommon name: biznaga, biznaga del dios sol y guerra rank: species
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Rhynchostele cordatacommon name: manuelitos, odontoglossum acorazonado, tigrillas rank: species
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Laelia superbienscommon name: candelaria de la vara larga, flor de la candelaria, laelia de San José, lirios, palo de águila, tanal rank: species
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Beschorneria rigidarank: species
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Laelia speciosacommon name: chichiltepetzacuxóchitl (Náhuatl), deuntzá (Otomí), flor de corpus, itzamacua (Tarasco), juritzquiri-tzitzica (Tarasco), lirio rank: species
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Laelia ancepscommon name: camote de San Diego, flor de todos los santos, lipa-nish-nopf-ni (Chontal de Oaxaca), lirio, tekxochitl (Náhuatl), tzicxóchitl (Náhuatl), vara de San Diego rank: species
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Cumarinia odoratacommon name: biznaga, biznaga olorosa, biznaga partida olorosa rank: species
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Mormodes sotoanarank: species
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Rossioglossum splendensrank: species
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Graptopetalum macdougalliirank: species
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Ariocarpus kotschoubeyanuscommon name: biznaga maguey, biznaga maguey pata de venado, falso peyote, pata de venado, peyote, pezuña de venado rank: species
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Agave (Littaea) titanotacommon name: maguey, maguey del sol rank: species
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Mammillaria crucigeracommon name: biznaga con espinas en cruz, biznaguita rank: species
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Corallorhiza striatarank: species
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Cyrtochiloides ochmatochilacommon name: oncidium de abanico rank: species
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Callitropsis forbesiicommon name: ciprés, ciprés Guadalupe, ciprés brillante, ciprés de Tecate, ciprés negro rank: species
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Oncidium oliganthumrank: species
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Bletia urbanacommon name: chautle (Náhuatl) rank: species
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Galeandra greenwoodianarank: species
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Corallorhiza maculatarank: species
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Ariocarpus agavoidescommon name: biznaga maguey pequeño, magueycito, magueyito rank: species
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Sedum torulosumrank: species
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Prosthechea chondylobulboncommon name: conchitas rank: species
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Taxodium mucronatumcommon name: ahoehuetl (Náhuatl), ahuéhuetl (Náhuatl), cedro, chuche (Huasteco), ciprés, hauoli (Guarijío), jahuolí (Guarijío), jauolí (Guarijío), matéoco (Tarahumara), penhamu (Tarasco), penjamu (Tarasco), quitsincui (Zoque), sabino, t-nuyucul (Mixteco), tnuyucu (Mixteco), ya'ayitz (Zapoteco), yaga-chichicina (Zapoteco), yaga-guichi-ciña (Zapoteco), yaga-quichi (Zapoteco), yaga-quichiciña (Zapoteco), yagachicina (Zapoteco), yucun-datura (Zapoteco), árbol de Sta. María del tule, árbol del tule rank: species
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Prosthechea vitellinacommon name: manuelitos, toalxóchitl (Náhuatl), uts pîj (Mixe) rank: species
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Oncidium sotoanumrank: species
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Laelia crawshayanacommon name: lirio rank: species
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Ariocarpus trigonuscommon name: biznaga maguey chautle, chaute, chautle (Náhuatl) rank: species
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Echeveria coccinearank: species
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Clowesia rosearank: species
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Manfreda pubescensrank: species
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Papperitzia leiboldiirank: species
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Helleriella nicaraguensisrank: species
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Prosthechea citrinacommon name: aróracua (Tarasco), azucena amarilla, costicoatexóchitl (Náhuatl), costictexóchitl (Náhuatl), orquídea hojas de cebolla, tatzingueni (Purépecha) rank: species
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Echeveria kimnachiirank: species
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Pinus (Strobus) maximartineziicommon name: pino, pino azul, piñonero de Zacatecas, piñón, piñón real rank: species
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Sedum craigiirank: species
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Pseudogoodyera pseudogoodyeroidesrank: species
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Ortegocactus macdougalliicommon name: biznaga pistache de chico ortega rank: species
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Trichopilia galeottianarank: species
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Acharagma aguirreanarank: species
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Trichopilia tortilisrank: species
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Pinus (Pinus) radiatacommon name: pino, pino de Monterrey, pino radiata rank: species
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Galeoglossum tubulosumrank: species
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Ariocarpus fissuratuscommon name: biznaga peyotillo, chaute, chautle (Náhuatl), falso peyote, hikuli sunamé (Tarahumara), híkuli sunami (Tarahumara), peyote, peyote cimarrón, suname (Tarahumara), sunami (Tarahumara), tzuwiri (Tarahumara) rank: species
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Vanilla parviflorarank: species
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Pinus (Strobus) johanniscommon name: pino, pino piñonero, piñón rank: species
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Juniperus deppeanacommon name: aorí (Tarahumara), cedro, cedro blanco, cedro chino, cedro de incienso, ciprés, enebro, junípero, sabino, táscate rank: species
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Echinocactus parryicommon name: barrilito, biznaga tonel del lago guzmán rank: species
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Tacitus bellusrank: species
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Corallorhiza odontorhizarank: species
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Juniperus monticolacommon name: cedro, cedro blanco, cedro colorado, ciprés, enebro, enebro azul, sabino rank: species
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Agave petrophilacommon name: maguey rank: species
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Lycaste crinitarank: species
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Mammillaria candidacommon name: biznaga cabeza de viejo, biznaga de Ortiz-Rubio, bola de nieve, cabeza de viejo, viejita, viejito rank: species
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Mammillaria sanchez-mejoradaecommon name: biznaga de Sánchez-Mejorada, biznaguita rank: species
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Pinus (Strobus) flexiliscommon name: pino, pino enano, pino prieto, pino torcido rank: species
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Prosthechea pseudopygmaearank: species
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Agave (Littaea) polianthifloracommon name: maguey rank: species
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Epidendrum parkinsonianumcommon name: baros, lirio, lirio pata de gallo, lirio pata de paloma, pata de gallo, pata de paloma rank: species
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Pelexia funckianarank: species
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Echeveria amphoralisrank: species
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Echeveria elegansrank: species
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Epidendrum lowilliamsiirank: species
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Cuitlauzina pendulacommon name: chorrito, cola de borrego, cuitlauzina perfumada, pozolillo, uts pîj (Mixe) rank: species
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Manfreda potosinacommon name: amole cenizo rank: species
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Rossioglossum williamsianumrank: species
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Manfreda maculatarank: species
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Sigmatostalix mexicanacommon name: sigmatostalix mexicano rank: species
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Oncidium sphacelatumcommon name: anis nikte' (Español-Maya), flor de la santa cruz, flor de mayo, mayitos, zuch´ zuch´ jaz (Tseltal) rank: species
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Polianthes graminifoliarank: species
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Agave (Littaea) strictacommon name: maguey rank: species
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Oncidium incurvumcommon name: angelitos rank: species
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Corallorhiza bulbosarank: species
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Sedum suaveolensrank: species
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Picea chihuahuanacommon name: pinabete, pinabete de Nuevo Léon, pinabete espinoso, pinabeto rank: species
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Laelia furfuraceacommon name: flor de nochebuena, gihtsl (Mixteco), ita achaca (Mixteco), ita nchaca (Mixteco), ita ndeka morada (Mixteco), laelia de muertos, lirio de San Francisco, monja rank: species
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Epidendrum dorsocarinatumrank: species
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Corallorhiza macrantharank: species
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Oncidium suaverank: species
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Vanilla pomponacommon name: platanillo, plátano vainilla, segne-xeute (Totonaco), vainilla, vainilla boba, vainilla pompona, vainillán, vainillón rank: species
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Mormodes pardalinatarank: species
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Echeveria lauirank: species
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Manfreda variegatarank: species
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Phragmipedium exstaminodiumcommon name: tanal de bigotes rank: species
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Yucca carnerosanacommon name: palma, palma barreta, palma de San José, palma de San Pedro, palma de ixtle, palma loca, yuca rank: species
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Lophophora williamsiicommon name: bacánoc (Tarahumara), beyo (Otomí), biznaga, botones de mescal, camaba (Tepehuano del sur), chice (Cora), chíeé (Cora), curi (Cora), el capullo, el resplandeciente, hicori (Huichol), hicouri (Tarahumara), hikule waname (Huichol), hikuli (Huichol), hikuli walula saeliami (Huichol), ho (Mescalero-Chiricahua Apache), houanamé (Tarahumara), huanamé (Tarahumara), huatari (Cora), hícore (Huichol), hículi, hícuri (Huichol), híkoli (Tarahumara), híkori (Tarahumara), híkuli (Tarahumara), híkuli huanamé (Tarahumara), híkuli walúla (Tarahumara), icuri (Cora), jicore (Huichol), jicori (Huichol), jicule (Huichol), jiculi (Huichol), jiculi huanamé (Tarahumara), jicure (Huichol), jicuri (Huichol), jicurite (Huichol), jikuhl sik (Tepehuano del sur), joutouri (Tarahumara), jícoe, jícoli (Tarahumara), jícori, jíkuli (Tarahumara), jíkuri (Tarahumara), kamaba (Tepehuano del sur), kamba (Tepehuano del sur), meca, mezcal, pejote, pellote, peote, peyori, peyot, peyote, peyote seni, peyotl (Náhuatl), peyule, peyull, pezote, piote, piotl, piule, raíz diabólica, rhaitoumuanitari-hikuri (Huichol), saelíami (Tarahumara), señi, tuna de tierra, tzinouritehua-hikuri (Huichol), venado divino, xicora (Huichol), xicori (Huichol) rank: species
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Pinus (Strobus) remotacommon name: pino, piñón de Catarina rank: species
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Mormodes luxatarank: species
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Astrophytum caput-medusaecommon name: medusa rank: species
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Cypripedium irapeanumcommon name: flor de calavera, flor del pelícano, pichahuastle (Náhuatl), pichehuastle (Náhuatl), pipixihuatli (Náhuatl), pisahuastle (Náhuatl) rank: species
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Echeveria globulosarank: species
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Abies vejariirank: species
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Yucca mixtecanarank: species
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Prosthechea cochleatacommon name: am (Maya), araña, conchita, flor de concha, lirio, pulpito rank: species
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Lycaste aromaticacommon name: canela, canela ornamental, canelita, flor de canela, torito rank: species
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Pinus (Strobus) quadrifoliacommon name: pino, pino piñonero, piñonero, piñón, piñón bueno, piñón de California rank: species
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Masdevallia tuerckheimiirank: species
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Clowesia thylaciochilarank: species
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Epidendrum raniferumcommon name: lluvia de estrellas rank: species
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Furcraea parmentierirank: species
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Agave (Agave) luridarank: species
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Pseudotsuga menziesiicommon name: abeto, abeto Douglas, acahuite, cahuite, falso abeto, hayarín, hayarín colorado, oyamel, oyamel colorado, oyamel de barranca, pinabete, romerillo rank: species
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Coelia macrostachyarank: species
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Oncidium pollardiirank: species
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Oncidium poikilostalixrank: species
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Graptopetalum saxifragoidesrank: species
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Eurystyles auriculatarank: species
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Sedum frutescenscommon name: siempreviva rank: species
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Galeandra batemaniirank: species
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Coelia densiflorarank: species
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Geohintonia mexicanacommon name: biznaga del yeso rank: species
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Graptopetalum granderank: species
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Mormodes nageliirank: species
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Cypripedium mollerank: species
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Sedum platyphyllumrank: species
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Echinocereus delaetiicommon name: alicoche viejo chaparro, viejito rank: species
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Echeveria purpusiorumrank: species
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Echinomastus unguispinuscommon name: biznaga, biznaga bola de espinas de garra, nido de pájaro rank: species
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Agave (Littaea) dasylirioidescommon name: maguey, maguey intrépido rank: species
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Echeveria secundacommon name: conchita, oreja de ratón, siempre viva rank: species
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Prosthechea brassavolaerank: species
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Echeveria shavianarank: species
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Oncidium ornithorhynchumrank: species
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Beschorneria tubiflorarank: species
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Helleriella guerrerensisrank: species
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Phragmipedium humboldtiirank: species
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Prosthechea karwinskiicommon name: ita ndeka (Mixteco), orquídea hojas de cebolla rank: species
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Plectrophora alatarank: species
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Graptopetalum fruticosumrank: species
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Echeveria moraniirank: species
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Echeveria setosa var. deminutarank: infraspecificname
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Echeveria setosa var. minorrank: infraspecificname
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Pinus (Pinus) contorta var. murrayanacommon name: pino, pino de San Pedro Mártir rank: infraspecificname
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Echeveria setosa var. oteroirank: infraspecificname
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