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Código de barras genético de cinco grupos críticos de la flora de México

Dataset homepage

Citation

Gernandt D, Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad C (2021). Código de barras genético de cinco grupos críticos de la flora de México. Version 1.10. Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/au5bgj accessed via GBIF.org on 2022-05-21.

Description

Los códigos de barras genéticos consisten en secuencias cortas y estandarizadas de DNA que permiten la identificación de las especies de organismos conocidas y el descubrimiento de especies desconocidas. A diferencia de muchos animales (y otros eucariontes) para los que el gen mitocondrial CO1 es fácil de secuenciar y altamente informativo, las plantas terrestres presentan problemas particulares para la selección de un código de barras. Esto se debe a la baja tasa de substitución y la frecuencia de rearreglos del genoma mitocondrial. También existen problemas debidos a poliploidía y paralogía en los genes nucleares. Aunque existe consenso en que el genoma del cloroplasto es la fuente más prometedora de códigos de barras genéticos para plantas, la tasa de evolución relativamente baja de muchos genes de plástidos hace necesaria la concatenación de varias secuencias para incrementar la resolución. En este proyecto se generarán códigos de barras de DNA de cloroplasto de 319 ejemplares de c. 170 especies pertenecientes a nueve familias de plantas vasculares de gran relevancia biológica, ecológica, económica y cultural en México, incluyendo Agavaceae, Cactaceae, Crassulaceae, Cupressaceae, Orchidaceae, Pinaceae, Podocarpaceae y Taxaceae. En la selección de los grupos de estudio se priorizaron los taxones listados en la Norma Oficial Mexicana NOM-059-ECOL-2001. Los códigos propuestos consistirán de secuencias concatenadas de cuatro regiones en total. Candidatos por evaluar incluyen las regiones codificantes de los genes matK, rbcL y rpoC1, y los espaciadores intergénicos trnH-psbA, psbK-psbI y dos más hipervariables por definir en el curso de este estudio.

Reino: 1 Filo: 1 Clase: 1 Orden: 1 Familia: 1 Género: 13 Especie: 22

Taxonomic Coverages

Reino: Plantae Filo: Tracheophyta Clase: Equisetopsida Orden: Asparagales Familia: Orchidaceae
  1. Plantae
    rank: kingdom
  2. Tracheophyta
    rank: phylum
  3. Equisetopsida
    rank: class
  4. Asparagales
    rank: order
  5. Orchidaceae
    rank: family
  6. Eurystyles
    rank: genus
  7. Cyrtochiloides
    rank: genus
  8. Galeandra
    rank: genus
  9. Epidendrum
    rank: genus
  10. Vanilla
    rank: genus
  11. Clowesia
    rank: genus
  12. Oncidium
    rank: genus
  13. Laelia
    rank: genus
  14. Rhynchostele
    rank: genus
  15. Prosthechea
    rank: genus
  16. Pelexia
    rank: genus
  17. Cuitlauzina
    rank: genus
  18. Corallorhiza
    rank: genus
  19. Eurystyles borealis
    rank: species
  20. Cyrtochiloides ochmatochila
    common name: oncidium de abanico rank: species
  21. Galeandra greenwoodiana
    rank: species
  22. Epidendrum lowilliamsii
    rank: species
  23. Epidendrum dorsocarinatum
    rank: species
  24. Vanilla pompona
    common name: platanillo, plátano vainilla, vainilla, vainilla boba, vainilla pompona, vainillán, vainillón rank: species
  25. Clowesia thylaciochila
    rank: species
  26. Oncidium pollardii
    rank: species
  27. Laelia anceps
    common name: camote de San Diego, flor de todos los santos, lirio, vara de San Diego rank: species
  28. Rhynchostele rossii
    rank: species
  29. Rhynchostele cordata
    common name: manuelitos, odontoglossum acorazonado, tigrillas rank: species
  30. Prosthechea chondylobulbon
    common name: conchitas rank: species
  31. Vanilla parviflora
    rank: species
  32. Prosthechea pseudopygmaea
    rank: species
  33. Epidendrum parkinsonianum
    common name: baros, lirio, lirio pata de gallo, lirio pata de paloma, pata de gallo, pata de paloma rank: species
  34. Pelexia funckiana
    rank: species
  35. Cuitlauzina pendula
    common name: chorrito, cola de borrego, cuitlauzina perfumada, pozolillo rank: species
  36. Oncidium sphacelatum
    common name: flor de la santa cruz, flor de mayo, mayitos rank: species
  37. Prosthechea cochleata
    common name: araña, conchita, flor de concha, lirio, pulpito rank: species
  38. Epidendrum raniferum
    common name: lluvia de estrellas rank: species
  39. Corallorhiza striata
    rank: species
  40. Clowesia rosea
    rank: species

Geographic Coverages

Bibliographic Citations

Contacts

David Gernandt
originator
position: Responsable
Universidad Nacional Autónoma de MéxicoInstituto de Biología
MX
CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad
metadata author
position: Dirección General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
MÉXICO
14010
Tlalpan
MX
Telephone: 50045000
email: patricia.ramos@conabio.gob.mx
homepage: https://www.gob.mx/conabio
Patricia Ramos Rivera
administrative point of contact
position: Dirección General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
México
14010
Tlalpan
MX
Telephone: 50045000
email: patricia.ramos@conabio.gob.mx
homepage: https://www.gob.mx/conabio
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