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Código de barras genético de especies de anfibios y reptiles de México

Dataset homepage

Citation

León Régagnon V, Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad C (2020). Código de barras genético de especies de anfibios y reptiles de México. Version 1.7. Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/ljtlnc accessed via GBIF.org on 2021-03-09.

Description

El desarrollo del presente proyecto sentará las bases para la creación de una base de datos de secuencias de ADN de referencia, asociadas a la información taxonómica de cada especie de anfibios y reptiles en México. Esta base de datos servirá en un futuro cercano como un sistema de identificación rápida de especies. De esta manera, se abrirá al fin una vía de comunicación ágil entre los generadores de información taxonómica y los usuarios de ésta (ecólogos, conservacionistas, ecoguardias, etc.), poniendo a su alcance información valiosa en la planeación de planes de manejo y conservación. El objetivo general del presente proyecto es caracterizar genéticamente a especies selectas de anfibios y reptiles en México, con secuencias del gen Citocromo Oxidasa I (COI) para generar una herramienta de identificación rápida de dichas especies. Se obtendrán las secuencias parciales del gen COI para 108 especies de anfibios y reptiles de México, amenazadas y/o con problemas taxonómicos. En los casos necesarios se obtendrán las secuencias de otras regiones de ADN para lograr la diferenciación de las especies. Las secuencias se analizarán con metodologías de agrupación filogenética como parsimonia o análisis bayesianos. La información taxonómica, geográfica, la secuencia de COI, la fotografía de los ejemplares, y otras secuencias si es el caso se incorporarán al sistema BOLD (www.boldsystem.org).

Reino: 1 Filo: 1 Clase: 2 Orden: 3 Familia: 15 Género: 36 Especie: 104 Epitetoinfraespecifico: 4

Taxonomic Coverages

Reino: Animalia Filo: Chordata Clase: Reptilia, Amphibia Orden: Squamata, Anura, Testudines Familia: Anguidae, Ranidae, Craugastoridae, Microhylidae, Bufonidae, Dipsadidae, Colubridae, Phrynosomatidae, Natricidae, Hylidae, Iguanidae, Phyllomedusidae, Leptotyphlopidae, Kinosternidae, Leptodactylidae
  1. Animalia
    rank: kingdom
  2. Chordata
    rank: phylum
  3. Reptilia
    rank: class
  4. Amphibia
    rank: class
  5. Squamata
    rank: order
  6. Anura
    rank: order
  7. Testudines
    rank: order
  8. Anguidae
    rank: family
  9. Ranidae
    rank: family
  10. Craugastoridae
    rank: family
  11. Microhylidae
    rank: family
  12. Bufonidae
    rank: family
  13. Dipsadidae
    rank: family
  14. Colubridae
    rank: family
  15. Phrynosomatidae
    rank: family
  16. Natricidae
    rank: family
  17. Hylidae
    rank: family
  18. Iguanidae
    rank: family
  19. Phyllomedusidae
    rank: family
  20. Leptotyphlopidae
    rank: family
  21. Kinosternidae
    rank: family
  22. Leptodactylidae
    rank: family
  23. Mesaspis
    rank: genus
  24. Lithobates
    rank: genus
  25. Craugastor
    rank: genus
  26. Gastrophryne
    rank: genus
  27. Incilius
    rank: genus
  28. Imantodes
    rank: genus
  29. Leptophis
    rank: genus
  30. Sceloporus
    rank: genus
  31. Thamnophis
    rank: genus
  32. Dendropsophus
    rank: genus
  33. Geophis
    rank: genus
  34. Conophis
    rank: genus
  35. Ctenosaura
    rank: genus
  36. Agalychnis
    rank: genus
  37. Abronia
    rank: genus
  38. Leptodeira
    rank: genus
  39. Tlalocohyla
    rank: genus
  40. Hyla
    rank: genus
  41. Anaxyrus
    rank: genus
  42. Ficimia
    rank: genus
  43. Exerodonta
    rank: genus
  44. Leptotyphlops
    rank: genus
  45. Pituophis
    rank: genus
  46. Charadrahyla
    rank: genus
  47. Plectrohyla
    rank: genus
  48. Kinosternon
    rank: genus
  49. Ecnomiohyla
    rank: genus
  50. Lampropeltis
    rank: genus
  51. Pseudelaphe
    rank: genus
  52. Rhinella
    rank: genus
  53. Leptodactylus
    rank: genus
  54. Smilisca
    rank: genus
  55. Hypopachus
    rank: genus
  56. Diaglena
    rank: genus
  57. Bufo
    rank: genus
  58. Gerrhonotus
    rank: genus
  59. Mesaspis juarezi
    common name: lagarto escorpión de Sierra de Juárez rank: species
  60. Lithobates zweifeli
    common name: rana de Zweifel rank: species
  61. Lithobates brownorum
    common name: rana de Brown, rana leopardo de Brown rank: species
  62. Craugastor rupinius
    common name: rana de arroyo escarpado rank: species
  63. Gastrophryne olivacea
    common name: sapo boca angosta oliváceo, ranita olivo, rana pajarito rank: species
  64. Incilius mazatlanensis
    common name: sapo sinaloense, sapo pinto, sapito de Mazatlán, sapito pinto de Mazatlán rank: species
  65. Mesaspis gadovii
    rank: species
  66. Imantodes cenchoa
    common name: culebra cordelilla chata, cordelilla manchada rank: species
  67. Lithobates forreri
    common name: rana de Forrer, rana del zacate, rana, rana leopardo de Forrer, rana leopardo del zacate rank: species
  68. Leptophis diplotropis
    common name: ranera del litoral del Pacífico, ranera verde, culebra verde, güirotillera, culebra perico gargantilla rank: species
  69. Sceloporus horridus
    common name: lagartija escamosa tarasca, torosco, lagartija espinosa del pacífico, lagartija, chintete escamoso rank: species
  70. Sceloporus internasalis
    common name: lagartija escamosa verde, lagartija espinosa verde rank: species
  71. Sceloporus variabilis
    common name: lagartija escamosa panza rosada, lagartija espinosa panza rosada rank: species
  72. Lithobates montezumae
    common name: rana de Moctezuma, rana leopardo de Moctezuma rank: species
  73. Craugastor tarahumaraensis
    common name: rana ladradora tarahumara, rana ladrona amarilla rank: species
  74. Lithobates omiltemanus
    common name: rana guerrerense, rana leopardo de Guerrero, rana leopardo de Omilteme rank: species
  75. Mesaspis moreletii
    common name: lagarto escorpión sureño, lagarto escorpión, lagarto escorpión de Morelet rank: species
  76. Thamnophis mysocephalus
    rank: species
  77. Thamnophis proximus
    common name: culebra listonada occidental, culebra acuática rank: species
  78. Incilius nebulifer
    common name: sapo nebuloso rank: species
  79. Dendropsophus microcephalus
    common name: rana grillo, ranita amarilla, rana arborícola grillo amarilla, ranita arborícola, rana de árbol amarilla rank: species
  80. Craugastor pygmaeus
    common name: rana ladrona pigmea, rana pigmea de dedos libres, rana pygmea ladradora, rana ladradora pigmea rank: species
  81. Geophis semidoliatus
    common name: culebra minadora coralillo, coralillo falso, minadora coralilla rank: species
  82. Conophis vittatus
    common name: culebra guardacaminos rayada, culebra mexicana de dos líneas rank: species
  83. Ctenosaura similis
    common name: iguana negra de cola espinosa, iguana espinosa rayada, iguana negra rank: species
  84. Lithobates sierramadrensis
    common name: rana de la Sierra Madre Occidental, rana Sierra Madre rank: species
  85. Agalychnis dacnicolor
    common name: rana cara de niño, ranita verduzca, rana verde rank: species
  86. Abronia oaxacae
    common name: lagarto alicante oaxaqueño, escorpión arborícola de Oaxaca rank: species
  87. Lithobates spectabilis
    common name: rana vistosa, rana manchada rank: species
  88. Craugastor rhodopis
    common name: rana hojarasquera común, rana de hojarasca, rana ladradora polimorfa, rana ladrona polimorfa, rana de selva rank: species
  89. Geophis dubius
    common name: culebra minera de la Mesa del Sur, minadora de la meseta del sur rank: species
  90. Sceloporus mucronatus
    common name: chintete, lagartija escamosa de grieta sureña, chintete de grieta meridonial rank: species
  91. Leptodeira annulata
    common name: culebra ojo de gato bandada, serpiente escombrera, escombrera rank: species
  92. Lithobates neovolcanicus
    common name: rana neovolcánica, rana leopardo neovolcánica rank: species
  93. Tlalocohyla smithii
    common name: rana de árbol mexicana enana, ranita enana mexicana rank: species
  94. Thamnophis godmani
    common name: culebra listonada de Godman, culebra rayada, víbora de agua, víbora rayada, culebra listonada rank: species
  95. Leptophis mexicanus
    common name: culebra perico mexicana, ranera mexicana rank: species
  96. Sceloporus siniferus
    common name: lagartija escamoso castaño, lagartija espinosa de cola larga, lagartija escamosa cola larga rank: species
  97. Abronia taeniata
    common name: lagarto alicante de bromelia, escorpión arborícola de bandas rank: species
  98. Hyla eximia
    common name: rana de árbol de montaña, ranita de montaña, rana verde manchada rank: species
  99. Dendropsophus sartori
    common name: rana de árbol de Taylor, ranita amarilla de Taylor, ranita rayada, rana de árbol rank: species
  100. Anaxyrus kelloggi
    common name: sapo mexicano, sapito mexicano, sapito, sapo pequeño mexicano rank: species
  101. Mesaspis antauges
    common name: lagarto escorpión de Monte Orizaba, lagartija lagarto del Pico de Orizaba rank: species
  102. Geophis mutitorques
    common name: culebra minera de tierras altas, minadora de tierras altas rank: species
  103. Thamnophis melanogaster
    common name: culebra de agua de panza negra, víbora de agua, culebra de agua, culebra de agua de panza negra mexicana, culebra negra en Aguascalientes rank: species
  104. Lithobates vaillanti
    common name: rana verde, rana, rana de Vaillant rank: species
  105. Lithobates magnaocularis
    common name: rana del noroeste mexicano, rana leopardo del noreste de México, rana leopardo del noreste rank: species
  106. Incilius valliceps
    common name: sapo común, sapo costero, sapo del golfo, sapo rank: species
  107. Sceloporus formosus
    common name: lagartija escamosa esmeralda norteña, chintete esmeralda, lagartija espinosa esmeralda norteña rank: species
  108. Craugastor hobartsmithi
    common name: rana ladradora de Smith, rana ladrona pigmeo de Smith, rana ladradora pigmea rank: species
  109. Thamnophis chrysocephalus
    common name: culebra listonada cabeza dorada, culebra de agua nómada cabeza dorada rank: species
  110. Leptodeira maculata
    common name: culebra ojo de gato del suroeste, escombreara del suroeste mexicano rank: species
  111. Ficimia publia
    common name: culebra naricilla manchada rank: species
  112. Exerodonta smaragdina
    common name: ranita de pastizal, rana de árbol esmeralda, ranita esmeralda rank: species
  113. Leptodeira septentrionalis
    common name: culebra ojo de gato norteña, escombrera manchada rank: species
  114. Leptodeira splendida
    common name: culebra ojo de gato espléndida, escombrera ojo de gato rank: species
  115. Leptotyphlops goudotii
    rank: species
  116. Lithobates berlandieri
    common name: rana leopardo, rana leopardo del río Bravo rank: species
  117. Craugastor mexicanus
    common name: rana ladrona mexicana, ranita de hojarasca, rana ladradora mexicana rank: species
  118. Pituophis deppei
    common name: cincuate mexicana, culebra casera, alicante, cincuate, culebra sorda mexicana, ratonera rank: species
  119. Charadrahyla taeniopus
    common name: rana de árbol jarocha, calate jarocho rank: species
  120. Sceloporus grammicus
    common name: lagartija escamosa de mezquite, chintete de mezquite, lagartija, lagartija espinosa del mezquital rank: species
  121. Hyla arenicolor
    common name: rana de árbol color arena, ranita de cañon, ranita de las rocas rank: species
  122. Plectrohyla cyclada
    common name: ranita de borde bronceado rank: species
  123. Incilius perplexus
    common name: sapo confuso, sapo de la cuenca del rio Tepalcatepec, sapo perplejo rank: species
  124. Ctenosaura pectinata
    common name: iguana espinosa Mexicana, iguana negra, iguana de roca, iguana mexicana de cola espinosa rank: species
  125. Kinosternon leucostomum
    common name: abaniquillo de Hidalgo, pochitoque septentrional, casquito de labios blancos, tortuga pecho quebrado labios blancos rank: species
  126. Abronia graminea
    common name: lagarto alicante terrestre, escorpión arborícola de Tehuacán rank: species
  127. Incilius marmoreus
    common name: sapo marmoleado, sapo jaspeado rank: species
  128. Kinosternon integrum
    common name: casquito de burro, tortuga pecho quebrado mexicana, tortuga de agua, tortuga de río rank: species
  129. Geophis sallaei
    common name: culebra minadora de Salle, minadora de Sallé rank: species
  130. Exerodonta sumichrasti
    common name: rana de árbol de Sumichrast, ranita de Sumichrast, rana de árbol rank: species
  131. Ecnomiohyla miotympanum
    common name: rana de árbol orejas chicas, calate arborícola, calate rank: species
  132. Craugastor rugulosus
    common name: rana ladrona centroamericana, rana de tierra rank: species
  133. Sceloporus subpictus
    common name: lagartija escamosa pintada, lagartija espinosa de panza pinta rank: species
  134. Imantodes gemmistratus
    common name: culebra cordelilla centroamericana, cordelilla de la escamuda, culebra rank: species
  135. Mesaspis viridiflava
    common name: lagarto escorpión enano rank: species
  136. Lampropeltis triangulum
    rank: species
  137. Lithobates psilonota
    common name: rana espalda lisa rank: species
  138. Sceloporus jalapae
    common name: lagartija espinosa de Jalapa, lagartija espinosa del Valle de Tehuacán, chintete, lagartija escamosa jalapeña rank: species
  139. Pseudelaphe flavirufa
    rank: species
  140. Hyla euphorbiacea
    common name: rana de árbol de Los Altos del Sur, ranita de alta montaña rank: species
  141. Leptotyphlops tenuis
    rank: species
  142. Pituophis melanoleucus
    rank: species
  143. Geophis petersii
    common name: culebra minera de Peters, minadora de Peters rank: species
  144. Abronia deppii
    common name: escorpión arborícola de Deppe, escorpión arborícola, lagarto alicante rank: species
  145. Kinosternon hirtipes
    common name: tortuga pecho quebrado pata rugosa, casquito de pata rugosa rank: species
  146. Rhinella horribilis
    common name: sapo lechero, sapo común, sapo gigante, sapo verrugoso, sapo grande rank: species
  147. Thamnophis eques
    common name: culebra listonada del sur Mexicano, culebra de agua, culebra de agua nómado mexicano rank: species
  148. Abronia lythrochila
    common name: lagarto alicante labios rojos, escorpión arborícola de labios rojos rank: species
  149. Incilius tutelarius
    common name: sapo de Chimalapas rank: species
  150. Abronia mixteca
    common name: lagarto alicante mixteco, escorpión arborícola mixteco rank: species
  151. Abronia martindelcampoi
    common name: escorpión arborícola de Martin del Campo, escorpión arborícola rank: species
  152. Geophis bicolor
    common name: culebra minera del Altiplano, minadora de la meseta mexicana rank: species
  153. Abronia frosti
    rank: species
  154. Leptodactylus melanonotus
    common name: rana nidificadora de sabinal, rana del sabinal, ranita espumera de dedos marginados, ranita hojarasca rank: species
  155. Smilisca baudinii
    common name: rana arbórea de Baudin, rana arborícola mexicana, rana de árbol mexicana común, rana de árbol mexicana, rana trepadora rank: species
  156. Hypopachus variolosus
    common name: rana manglera, rana termitera, termitero balador, rana oveja común, rana ovejera rank: species
  157. Diaglena spatulata
    common name: ranita de cabeza espatulada, rana pico de pato, rana pico de pato del pacífico, rana de árbol cabeza de pala rank: species
  158. Geophis laticinctus
    common name: culebra minera de la Mesa Central, minadora de la meseta central rank: species
  159. Mesaspis monticola
    rank: species
  160. Gerrhonotus liocephalus
    common name: escorpión, lagarto escorpión texano, lagartija lagarto sureña rank: species
  161. Abronia fimbriata
    rank: species
  162. Abronia campbelli
    rank: species
  163. Mesaspis moreletii subsp. temporalis
    rank: infraspecificname
  164. Mesaspis moreleti subsp. fulvus
    rank: infraspecificname
  165. Mesaspis moreleti subsp. salvadorensis
    rank: infraspecificname
  166. Mesaspis moreletii subsp. moreletii
    rank: infraspecificname

Geographic Coverages

País: COSTA RICA (HEREDIA, SAN JOSE) País: GUATEMALA (ALTA VERAPAZ, HUEHUETENANGO, JALAPA, QUETZALTENANGO, QUEZALTENANGO, QUICHE, SAN MARCOS) País: HONDURAS (ATLANTIDA, CORTES, FRANCISCO MORAZAN, OCOTEPEQUE) País: MEXICO (CAMPECHE, CHIAPAS, CHIHUAHUA, CIUDAD DE MEXICO, COLIMA, DISTRITO FEDERAL, DURANGO, GUERRERO, HIDALGO, JALISCO, MEXICO, MICHOACAN DE OCAMPO, MORELOS, NAYARIT, OAXACA, PUEBLA, QUERETARO, QUINTANA ROO, SAN LUIS POTOSI, SINALOA, SONORA, TABASCO, TAMAULIPAS, TLAXCALA, VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE, YUCATAN, ZACATECAS) País: NICARAGUA (JINOTEGA)

Bibliographic Citations

Contacts

Virginia León Régagnon
originator
position: Responsable
Universidad Nacional Autónoma de MéxicoInstituto de BiologíaEstación Chamela
San Patricio Melaque
48980
Jalisco
MX
Telephone: 01 312 3161000 ext. 49003 01 315 35 10200 56229167
email: vleon@ib.unam.mx
CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad
metadata author
position: Dirección General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
MÉXICO
14010
Tlalpan
MX
Telephone: 50045000
email: patricia.ramos@conabio.gob.mx
homepage: https://www.gob.mx/conabio
Sonia Alejandra Careaga Olvera
administrative point of contact
position: Subcoordinadora en Información y Análisis
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
México
14010
Tlalpan
MX
Telephone: 50045000
email: scareaga@conabio.gob.mx
homepage: https://www.gob.mx/conabio
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