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Código de barras genético de especies de anfibios y reptiles de México

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Citation

León Régagnon V, Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad C (2018). Código de barras genético de especies de anfibios y reptiles de México. Version 1.5. Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/ljtlnc accessed via GBIF.org on 2018-12-13.

Description

El desarrollo del presente proyecto sentará las bases para la creación de una base de datos de secuencias de ADN de referencia, asociadas a la información taxonómica de cada especie de anfibios y reptiles en México. Esta base de datos servirá en un futuro cercano como un sistema de identificación rápida de especies. De esta manera, se abrirá al fin una vía de comunicación ágil entre los generadores de información taxonómica y los usuarios de ésta (ecólogos, conservacionistas, ecoguardias, etc.), poniendo a su alcance información valiosa en la planeación de planes de manejo y conservación. El objetivo general del presente proyecto es caracterizar genéticamente a especies selectas de anfibios y reptiles en México, con secuencias del gen Citocromo Oxidasa I (COI) para generar una herramienta de identificación rápida de dichas especies. Se obtendrán las secuencias parciales del gen COI para 108 especies de anfibios y reptiles de México, amenazadas y/o con problemas taxonómicos. En los casos necesarios se obtendrán las secuencias de otras regiones de ADN para lograr la diferenciación de las especies. Las secuencias se analizarán con metodologías de agrupación filogenética como parsimonia o análisis bayesianos. La información taxonómica, geográfica, la secuencia de COI, la fotografía de los ejemplares, y otras secuencias si es el caso se incorporarán al sistema BOLD (www.boldsystem.org).

Reino: 1 Filo: 1 Clase: 2 Orden: 3 Familia: 15 Género: 36 Especie: 104 Epitetoinfraespecifico: 4

Taxonomic Coverages

Reino: Animalia Filo: Chordata Clase: Reptilia, Amphibia Orden: Squamata, Testudines, Anura Familia: Colubridae, Kinosternidae, Anguidae, Phrynosomatidae, Ranidae, Hylidae, Bufonidae, Dipsadidae, Iguanidae, Leptotyphlopidae, Craugastoridae, Phyllomedusidae, Natricidae, Leptodactylidae, Microhylidae
  1. Animalia
    rank: kingdom
  2. Chordata
    rank: phylum
  3. Reptilia
    rank: class
  4. Amphibia
    rank: class
  5. Squamata
    rank: order
  6. Testudines
    rank: order
  7. Anura
    rank: order
  8. Colubridae
    rank: family
  9. Kinosternidae
    rank: family
  10. Anguidae
    rank: family
  11. Phrynosomatidae
    rank: family
  12. Ranidae
    rank: family
  13. Hylidae
    rank: family
  14. Bufonidae
    rank: family
  15. Dipsadidae
    rank: family
  16. Iguanidae
    rank: family
  17. Leptotyphlopidae
    rank: family
  18. Craugastoridae
    rank: family
  19. Phyllomedusidae
    rank: family
  20. Natricidae
    rank: family
  21. Leptodactylidae
    rank: family
  22. Microhylidae
    rank: family
  23. Ficimia
    rank: genus
  24. Kinosternon
    rank: genus
  25. Mesaspis
    rank: genus
  26. Sceloporus
    rank: genus
  27. Lithobates
    rank: genus
  28. Dendropsophus
    rank: genus
  29. Incilius
    rank: genus
  30. Abronia
    rank: genus
  31. Geophis
    rank: genus
  32. Imantodes
    rank: genus
  33. Hyla
    rank: genus
  34. Gerrhonotus
    rank: genus
  35. Ctenosaura
    rank: genus
  36. Leptotyphlops
    rank: genus
  37. Tlalocohyla
    rank: genus
  38. Plectrohyla
    rank: genus
  39. Craugastor
    rank: genus
  40. Pseudelaphe
    rank: genus
  41. Diaglena
    rank: genus
  42. Pituophis
    rank: genus
  43. Conophis
    rank: genus
  44. Leptodeira
    rank: genus
  45. Agalychnis
    rank: genus
  46. Bufo
    rank: genus
  47. Thamnophis
    rank: genus
  48. Leptodactylus
    rank: genus
  49. Exerodonta
    rank: genus
  50. Leptophis
    rank: genus
  51. Anaxyrus
    rank: genus
  52. Smilisca
    rank: genus
  53. Lampropeltis
    rank: genus
  54. Gastrophryne
    rank: genus
  55. Hypopachus
    rank: genus
  56. Charadrahyla
    rank: genus
  57. Ecnomiohyla
    rank: genus
  58. Rhinella
    rank: genus
  59. Ficimia publia
    common name: blotched hooknose snake, culebra naricilla manchada rank: species
  60. Kinosternon leucostomum
    common name: abaniquillo de Hidalgo, casquito de labios blancos, pochitoque septentrional, tortuga pecho quebrado labios blancos, white lipped mud turtle rank: species
  61. Sceloporus subpictus
    common name: lagartija escamosa pintada, lagartija espinosa de panza pinta, paintbelly spiny lizard rank: species
  62. Lithobates brownorum
    common name: Brown's leopard frog, rana de Brown, rana leopardo de Brown, x-túuts´ rank: species
  63. Lithobates psilonota
    common name: rana espalda lisa, smooth-backed frog rank: species
  64. Dendropsophus sartori
    common name: rana de árbol, rana de árbol de Taylor, ranita amarilla de Taylor, ranita rayada, Taylor's yellow treefrog rank: species
  65. Incilius valliceps
    common name: Gulf Coast Toad, múuch, sapo, sapo común, sapo costero, sapo del golfo rank: species
  66. Abronia taeniata
    common name: bromeliad arboreal alligator lizard, escorpión arborícola de bandas, lagarto alicante de bromelia rank: species
  67. Abronia oaxacae
    common name: escorpión arborícola de Oaxaca, lagarto alicante oaxaqueño, oaxacan arboreal alligator lizard rank: species
  68. Geophis sallaei
    common name: culebra minadora de Salle, minadora de Sallé, Salle's earth snake rank: species
  69. Kinosternon hirtipes
    common name: casquito de pata rugosa, Mexican rough footed mud turtle, tortuga pecho quebrado pata rugosa rank: species
  70. Imantodes cenchoa
    common name: blunthead tree snake, cordelilla manchada, culebra cordelilla chata rank: species
  71. Hyla eximia
    common name: mountain treefrog, rana de árbol de montaña, rana verde manchada, ranita de montaña rank: species
  72. Gerrhonotus liocephalus
    common name: escorpión, lagartija lagarto sureña, lagarto culebra, lagarto escorpión texano rank: species
  73. Lithobates berlandieri
    common name: otác, rana leopardo, rana leopardo del río Bravo, Río Grande Leopard frog, ziix hax ano quiij rank: species
  74. Ctenosaura pectinata
    common name: iguana de roca, iguana espinosa Mexicana, iguana mexicana de cola espinosa, iguana negra, Mexican spiny tail iguana, western spiny-tailed iguana rank: species
  75. Mesaspis viridiflava
    common name: dwarf alligator lizard, lagarto escorpión enano rank: species
  76. Abronia campbelli
    rank: species
  77. Abronia graminea
    common name: escorpión arborícola de Tehuacán, lagarto alicante terrestre, terrestrial arboreal alligator lizard rank: species
  78. Leptotyphlops goudotii
    common name: agujilla rank: species
  79. Sceloporus internasalis
    common name: lagartija escamosa, lagartija escamosa verde, lagartija espinosa verde rank: species
  80. Mesaspis moreletii
    common name: escorpión de Morelet, lagarto escorpión, lagarto escorpión de Morelet, lagarto escorpión sureño rank: species
  81. Lithobates vaillanti
    common name: rana, rana de Vaillant, rana verde, Vaillant's frog rank: species
  82. Sceloporus grammicus
    common name: chintete de mezquite, lagartija, lagartija escamosa de mezquite, lagartija espinosa del mezquital, mezquite lizard rank: species
  83. Lithobates magnaocularis
    common name: Northwest Mexico leopard frog, otác, rana del noroeste mexicano, rana leopardo del noreste, rana leopardo del noreste de México, ziix hax ano quiij rank: species
  84. Lithobates omiltemanus
    common name: Guerreran leopard frog, rana guerrerense, rana leopardo de Guerrero, rana leopardo de Omilteme rank: species
  85. Geophis petersii
    common name: culebra minera de Peters, minadora de Peters, Peter's earth snake rank: species
  86. Tlalocohyla smithii
    common name: rana de árbol mexicana enana, ranita enana mexicana rank: species
  87. Incilius nebulifer
    common name: coastal-plain toad, Gulf Coast Toad, sapo nebuloso rank: species
  88. Plectrohyla cyclada
    common name: ranita de borde bronceado rank: species
  89. Craugastor rugulosus
    common name: Central American rain frog, rana de tierra, rana ladrona centroamericana, rugulose rainfrog rank: species
  90. Lithobates montezumae
    common name: rana de Moctezuma, rana leopardo de Moctezuma rank: species
  91. Pseudelaphe flavirufa
    rank: species
  92. Diaglena spatulata
    common name: rana de árbol cabeza de pala, rana pico de pato, rana pico de pato del pacífico, ranita de cabeza espatulada, shovel-headed treefrog rank: species
  93. Craugastor pygmaeus
    common name: pigmy free-fingered frog, pigmy robber frog, rana ladradora pigmea, rana ladrona pigmea, rana pigmea de dedos libres, rana pygmea ladradora rank: species
  94. Pituophis melanoleucus
    rank: species
  95. Lithobates zweifeli
    common name: rana de Zweifel, Zweifel's frog rank: species
  96. Mesaspis monticola
    rank: species
  97. Conophis vittatus
    common name: culebra guardacaminos rayada, culebra listada, culebra mexicana de dos líneas rank: species
  98. Leptodeira septentrionalis
    common name: culebra ojo de gato norteña, culebra ojo de gato norteña; manchada, escombrera manchada rank: species
  99. Agalychnis dacnicolor
    common name: Mexican leaf frog, otác, rana cara de niño, rana verde, ranita verduzca, ziix hax ano quiij rank: species
  100. Geophis mutitorques
    common name: culebra minera de tierras altas, highland earth snake, minadora de tierras altas rank: species
  101. Lithobates forreri
    common name: Forrer's leopard frog, otác, rana, rana de Forrer, rana del zacate, rana leopardo de Forrer, rana leopardo del zacate, ziix hax ano quiij rank: species
  102. Thamnophis melanogaster
    common name: culebra de agua, culebra de agua de panza negra, culebra de agua de panza negra mexicana, culebra negra en Aguascalientes, Mexican blackbelly water snake, Mexican blackbelly watersnake, víbora de agua rank: species
  103. Abronia frosti
    rank: species
  104. Sceloporus formosus
    common name: chintete esmeralda, lagartija escamosa esmeralda norteña, lagartija espinosa esmeralda norteña, northern emerald spiny lizard rank: species
  105. Leptodactylus melanonotus
    common name: rana del sabinal, rana nidificadora de sabinal, ranita de pastizal, ranita espumera de dedos marginados, ranita hojarasca rank: species
  106. Leptodeira annulata
    common name: culebra escombrera, culebra ojo de gato bandada, escombrera, serpiente escombrera rank: species
  107. Craugastor tarahumaraensis
    common name: otác, rana ladradora tarahumara, rana ladrona amarilla, tarahumara barking frog, ziix hax ano quiij rank: species
  108. Exerodonta sumichrasti
    common name: rana de árbol, rana de árbol de Sumichrast, ranita de Sumichrast rank: species
  109. Abronia mixteca
    common name: escorpión arborícola mixteco, lagarto alicante mixteco, mixtecan Arboreal alligator lizard rank: species
  110. Geophis bicolor
    common name: culebra minera del Altiplano, Mexican plateau earth snake, minadora de la meseta mexicana rank: species
  111. Thamnophis mysocephalus
    rank: species
  112. Mesaspis antauges
    common name: lagartija lagarto del Pico de Orizaba, lagarto escorpión de Monte Orizaba, mount Orizaba alligator lizard rank: species
  113. Leptophis mexicanus
    common name: culebra perico mexicana, Mexican parrot snake, ranera mexicana rank: species
  114. Lithobates spectabilis
    common name: rana manchada, rana vistosa, showy leopard frog rank: species
  115. Craugastor hobartsmithi
    common name: rana ladradora de Smith, rana ladradora pigmea, rana ladrona pigmeo de Smith, Smith's pigmy tropical frog, Smith's pigmy robber frog rank: species
  116. Abronia deppii
    common name: deppe's arboreal alligator lizard, escorpión arborícola, escorpión arborícola de Deppe, lagarto alicante rank: species
  117. Lithobates neovolcanicus
    common name: rana leopardo neovolcánica, rana neovolcánica rank: species
  118. Imantodes gemmistratus
    common name: Central American tree snake, cordelilla de la escamuda, culebra, culebra cordelilla centroamericana rank: species
  119. Mesaspis gadovii
    rank: species
  120. Thamnophis proximus
    common name: culebra acuática, culebra listonada occidental, culebra palustre rank: species
  121. Geophis laticinctus
    common name: culebra, culebra minera de la Mesa Central, minadora de la meseta central rank: species
  122. Hyla euphorbiacea
    common name: rana de árbol de Los Altos del Sur, ranita de alta montaña, Southern highland treefrog rank: species
  123. Mesaspis juarezi
    common name: lagarto escorpión de Sierra de Juárez, sierra Juarez alligator lizard rank: species
  124. Anaxyrus kelloggi
    common name: little Mexican toad, sapito, sapito mexicano, sapo mexicano, sapo pequeño mexicano rank: species
  125. Thamnophis godmani
    common name: culebra listonada, culebra listonada de Godman, culebra rayada, Godman´s garter snake, godman's garder snake, víbora de agua, víbora rayada rank: species
  126. Abronia lythrochila
    common name: escorpión arborícola de labios rojos, lagarto alicante labios rojos, red lipped arboreal alligator lizard rank: species
  127. Geophis dubius
    common name: culebra minera de la Mesa del Sur, mesa del Sur earth snake, minadora de la meseta del sur rank: species
  128. Incilius marmoreus
    common name: sapo jaspeado, sapo marmoleado rank: species
  129. Hyla arenicolor
    common name: rana de árbol color arena, ranita de cañon, ranita de las rocas rank: species
  130. Incilius tutelarius
    common name: Chimalapas toad, sapo de Chimalapas rank: species
  131. Smilisca baudinii
    common name: common Mexican treefrog, Mexican smilisca, Mexican treefrogs, otác, quech, rana arbórea de Baudin, rana arborícola mexicana, rana de árbol mexicana, rana de árbol mexicana común, rana trepadora, tooter, x-túuts´, ziix hax ano quiij rank: species
  132. Leptotyphlops tenuis
    rank: species
  133. Sceloporus mucronatus
    common name: chintete, chintete de grieta meridonial, lagartija escamosa de grieta sureña, southern crevise spiny lizard rank: species
  134. Craugastor mexicanus
    common name: rana ladradora mexicana, rana ladrona mexicana, ranita de hojarasca rank: species
  135. Kinosternon integrum
    common name: casquito de burro, tortuga, tortuga de agua, tortuga de río, tortuga pecho quebrado mexicana rank: species
  136. Ctenosaura similis
    common name: black iguana, iguana espinosa rayada, iguana negra, iguana negra de cola espinosa rank: species
  137. Sceloporus horridus
    common name: chintete escamoso, lagartija, lagartija escamosa tarasca, lagartija espinosa del pacífico, torosco rank: species
  138. Geophis semidoliatus
    common name: coral earth snake, coralillo falso, culebra minadora coralillo, minadora coralilla rank: species
  139. Leptodeira splendida
    common name: culebra ojo de gato espléndida, escombrera ojo de gato rank: species
  140. Craugastor rhodopis
    common name: rana de hojarasca, rana de selva, rana hojarasquera común, rana ladradora polimorfa, rana ladrona polimorfa rank: species
  141. Leptodeira maculata
    common name: culebra ojo de gato del suroeste, escombreara del suroeste mexicano, southwestern cat-eyed snake rank: species
  142. Sceloporus siniferus
    common name: lagartija escamosa cola larga, lagartija escamoso castaño, lagartija espinosa de cola larga, longtail spiny lizard rank: species
  143. Incilius mazatlanensis
    common name: sapito de Mazatlán, sapito pinto de Mazatlán, sapo pinto, sapo sinaloense rank: species
  144. Lithobates sierramadrensis
    common name: rana de la Sierra Madre Occidental, rana Sierra Madre rank: species
  145. Lampropeltis triangulum
    common name: culebra real coralillo, milk snake rank: species
  146. Pituophis deppei
    common name: alicante, cincuate, cincuate mexicana, culebra casera, culebra sorda mexicana, ratonera rank: species
  147. Gastrophryne olivacea
    common name: great plains narrowmouth toad, otác, rana pajarito, ranita olivo, sapo boca angosta oliváceo, Western narrow-mouthed toad, ziix hax ano quiij rank: species
  148. Dendropsophus microcephalus
    common name: quech, rana arborícola grillo amarilla, rana de árbol amarilla, rana grillo, ranita amarilla, ranita arborícola, small-headed treefrog, x-túuts´, yellow treefrog rank: species
  149. Thamnophis eques
    common name: culebra de agua, culebra de agua nómado mexicano, culebra listonada del sur Mexicano, víbora rayada rank: species
  150. Sceloporus variabilis
    common name: lagartija escamosa panza rosada, lagartija espinosa panza rosada rank: species
  151. Hypopachus variolosus
    common name: chacmuch, múuch, otác, rana manglera, rana oveja común, rana ovejera, rana termitera, sheep frog, termitero balador, ziix hax ano quiij rank: species
  152. Charadrahyla taeniopus
    common name: calate jarocho, porthole treefrog, rana de árbol jarocha rank: species
  153. Exerodonta smaragdina
    common name: rana de árbol esmeralda, ranita de pastizal, ranita esmeralda rank: species
  154. Craugastor rupinius
    common name: cliffy stream frog, rana de arroyo escarpado rank: species
  155. Ecnomiohyla miotympanum
    common name: calate, calate arborícola, rana de árbol orejas chicas, small-eared treefrog rank: species
  156. Abronia fimbriata
    rank: species
  157. Sceloporus jalapae
    common name: chintete, Jalapa spiny lizard, lagartija escamosa jalapeña, lagartija espinosa de Jalapa, lagartija espinosa del Valle de Tehuacán rank: species
  158. Abronia martindelcampoi
    common name: escorpión arborícola, escorpión arborícola de Martin del Campo rank: species
  159. Incilius perplexus
    common name: sapo confuso, sapo de la cuenca del rio Tepalcatepec, sapo perplejo rank: species
  160. Thamnophis chrysocephalus
    common name: culebra de agua nómada cabeza dorada, culebra listonada cabeza dorada, golden-headed garder snake rank: species
  161. Leptophis diplotropis
    common name: culebra perico gargantilla, culebra verde, güirotillera, Pacific Coast parrot snake, ranera del litoral del Pacífico, ranera verde rank: species
  162. Rhinella marina
    common name: bezmuch, cane toad, giant toad, marine toad, múuch, sapo común, sapo gigante, sapo grande, sapo lechero, sapo verrugoso, totmuch rank: species
  163. Mesaspis moreleti subsp. fulvus
    rank: infraspecificname
  164. Mesaspis moreleti subsp. salvadorensis
    rank: infraspecificname
  165. Mesaspis moreletii subsp. temporalis
    rank: infraspecificname
  166. Mesaspis moreletii subsp. moreletii
    rank: infraspecificname

Geographic Coverages

País: COSTA RICA (HEREDIA, SAN JOSE) País: GUATEMALA (ALTA VERAPAZ, HUEHUETENANGO, JALAPA, QUEZALTENANGO, QUICHE, SAN MARCOS) País: HONDURAS (ATLANTIDA, CORTES, FRANCISCO MORAZAN, OCOTEPEQUE) País: MEXICO (CAMPECHE, CHIAPAS, CHIHUAHUA, COLIMA, DISTRITO FEDERAL, DURANGO, GUERRERO, HIDALGO, JALISCO, MEXICO, MICHOACAN DE OCAMPO, MORELOS, NAYARIT, OAXACA, PUEBLA, QUERETARO, QUINTANA ROO, SAN LUIS POTOSI, SINALOA, SONORA, TABASCO, TAMAULIPAS, TLAXCALA, VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE, YUCATAN, ZACATECAS) País: NICARAGUA (JINOTEGA)

Bibliographic Citations

Contacts

Virginia León Régagnon
originator
position: Responsable
Universidad Nacional Autónoma de MéxicoInstituto de BiologíaEstación Chamela
San Patricio Melaque
48980
Jalisco
MX
Telephone: 01 312 3161000 ext. 49003 01 315 35 10200 56229167
email: vleon@ib.unam.mx
CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad
metadata author
position: Dirección General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
MÉXICO
14010
Tlalpan
MX
Telephone: 50045000
email: patricia.ramos@conabio.gob.mx
homepage: https://www.gob.mx/conabio
Sonia Alejandra Careaga Olvera
administrative point of contact
position: Subcoordinadora en Información y Análisis
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
México
14010
Tlalpan
MX
Telephone: 50045000
email: scareaga@conabio.gob.mx
homepage: https://www.gob.mx/conabio
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