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Código de barras genético de especies de anfibios y reptiles de México

Dataset homepage

Citation

León Régagnon V, Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad C (2023). Código de barras genético de especies de anfibios y reptiles de México. Version 1.13. Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. Occurrence dataset https://doi.org/10.15468/ljtlnc accessed via GBIF.org on 2023-09-24.

Description

El desarrollo del presente proyecto sentará las bases para la creación de una base de datos de secuencias de ADN de referencia, asociadas a la información taxonómica de cada especie de anfibios y reptiles en México. Esta base de datos servirá en un futuro cercano como un sistema de identificación rápida de especies. De esta manera, se abrirá al fin una vía de comunicación ágil entre los generadores de información taxonómica y los usuarios de ésta (ecólogos, conservacionistas, ecoguardias, etc.), poniendo a su alcance información valiosa en la planeación de planes de manejo y conservación. El objetivo general del presente proyecto es caracterizar genéticamente a especies selectas de anfibios y reptiles en México, con secuencias del gen Citocromo Oxidasa I (COI) para generar una herramienta de identificación rápida de dichas especies. Se obtendrán las secuencias parciales del gen COI para 108 especies de anfibios y reptiles de México, amenazadas y/o con problemas taxonómicos. En los casos necesarios se obtendrán las secuencias de otras regiones de ADN para lograr la diferenciación de las especies. Las secuencias se analizarán con metodologías de agrupación filogenética como parsimonia o análisis bayesianos. La información taxonómica, geográfica, la secuencia de COI, la fotografía de los ejemplares, y otras secuencias si es el caso se incorporarán al sistema BOLD (www.boldsystem.org).

Reino: 1 Filo: 1 Clase: 2 Orden: 3 Familia: 15 Género: 36 Especie: 104 Epitetoinfraespecifico: 4

Taxonomic Coverages

Reino: Animalia Filo: Chordata Clase: Amphibia, Reptilia Orden: Anura, Squamata, Testudines Familia: Ranidae, Craugastoridae, Microhylidae, Bufonidae, Anguidae, Dipsadidae, Colubridae, Phrynosomatidae, Leptodactylidae, Natricidae, Hylidae, Iguanidae, Phyllomedusidae, Leptotyphlopidae, Kinosternidae
  1. Animalia
    rank: kingdom
  2. Chordata
    rank: phylum
  3. Amphibia
    rank: class
  4. Reptilia
    rank: class
  5. Anura
    rank: order
  6. Squamata
    rank: order
  7. Testudines
    rank: order
  8. Ranidae
    rank: family
  9. Craugastoridae
    rank: family
  10. Microhylidae
    rank: family
  11. Bufonidae
    rank: family
  12. Anguidae
    rank: family
  13. Dipsadidae
    rank: family
  14. Colubridae
    rank: family
  15. Phrynosomatidae
    rank: family
  16. Leptodactylidae
    rank: family
  17. Natricidae
    rank: family
  18. Hylidae
    rank: family
  19. Iguanidae
    rank: family
  20. Phyllomedusidae
    rank: family
  21. Leptotyphlopidae
    rank: family
  22. Kinosternidae
    rank: family
  23. Lithobates
    rank: genus
  24. Craugastor
    rank: genus
  25. Gastrophryne
    rank: genus
  26. Incilius
    rank: genus
  27. Mesaspis
    rank: genus
  28. Imantodes
    rank: genus
  29. Leptophis
    rank: genus
  30. Sceloporus
    rank: genus
  31. Leptodactylus
    rank: genus
  32. Thamnophis
    rank: genus
  33. Smilisca
    rank: genus
  34. Dendropsophus
    rank: genus
  35. Geophis
    rank: genus
  36. Conophis
    rank: genus
  37. Ctenosaura
    rank: genus
  38. Rhinella
    rank: genus
  39. Agalychnis
    rank: genus
  40. Abronia
    rank: genus
  41. Leptodeira
    rank: genus
  42. Tlalocohyla
    rank: genus
  43. Hypopachus
    rank: genus
  44. Diaglena
    rank: genus
  45. Hyla
    rank: genus
  46. Anaxyrus
    rank: genus
  47. Ficimia
    rank: genus
  48. Exerodonta
    rank: genus
  49. Gerrhonotus
    rank: genus
  50. Leptotyphlops
    rank: genus
  51. Pituophis
    rank: genus
  52. Charadrahyla
    rank: genus
  53. Plectrohyla
    rank: genus
  54. Kinosternon
    rank: genus
  55. Ecnomiohyla
    rank: genus
  56. Lampropeltis
    rank: genus
  57. Pseudelaphe
    rank: genus
  58. Bufo
    rank: genus
  59. Lithobates forreri
    common name: otác (Seri), rana, rana de Forrer, rana del zacate, rana leopardo de Forrer, rana leopardo del zacate, ziix hax ano quiij (Seri) rank: species
  60. Lithobates brownorum
    common name: rana de Brown, rana leopardo de Brown, x-túuts´ (Maya) rank: species
  61. Craugastor rupinius
    common name: rana de arroyo escarpado rank: species
  62. Gastrophryne olivacea
    common name: rana pajarito, ranita olivo, sapo boca angosta oliváceo rank: species
  63. Incilius mazatlanensis
    common name: sapito de Mazatlán, sapito pinto de Mazatlán, sapo pinto, sapo sinaloense rank: species
  64. Mesaspis gadovii
    rank: species
  65. Imantodes cenchoa
    common name: cordelilla manchada, culebra cordelilla chata rank: species
  66. Leptophis diplotropis
    common name: culebra perico, culebra perico gargantilla, culebra verde, güirotillera, ranera del litoral del Pacífico, ranera verde rank: species
  67. Sceloporus horridus
    common name: chintete escamoso, lagartija, lagartija escamosa tarasca, lagartija espinosa del pacífico, torosco rank: species
  68. Sceloporus internasalis
    common name: lagartija escamosa verde, lagartija espinosa verde rank: species
  69. Sceloporus variabilis
    common name: lagartija escamosa panza rosada, lagartija espinosa panza rosada rank: species
  70. Lithobates montezumae
    common name: rana de Moctezuma, rana leopardo de Moctezuma rank: species
  71. Craugastor tarahumaraensis
    common name: otác (Seri), rana ladradora tarahumara, rana ladrona amarilla, ziix hax ano quiij (Seri) rank: species
  72. Lithobates omiltemanus
    common name: rana guerrerense, rana leopardo de Guerrero, rana leopardo de Omilteme rank: species
  73. Leptodactylus melanonotus
    common name: múuch (Maya), otác (Seri), rana del sabinal, rana nidificadora de sabinal, ranita espumera de dedos marginados, ranita hojarasca, ziix hax ano quiij (Seri) rank: species
  74. Mesaspis moreletii
    common name: lagarto escorpión, lagarto escorpión de Morelet, lagarto escorpión sureño rank: species
  75. Thamnophis mysocephalus
    rank: species
  76. Thamnophis proximus
    common name: culebra acuática, culebra listonada occidental rank: species
  77. Mesaspis viridiflava
    common name: lagarto escorpión enano rank: species
  78. Smilisca baudinii
    common name: otác (Seri), quech (Maya), rana arborícola mexicana, rana arbórea de Baudin, rana de árbol mexicana, rana de árbol mexicana común, rana trepadora, x-túuts´ (Maya), ziix hax ano quiij (Seri) rank: species
  79. Incilius nebulifer
    common name: sapo nebuloso rank: species
  80. Dendropsophus microcephalus
    common name: quech (Maya), rana arborícola grillo amarilla, rana de árbol amarilla, rana grillo, ranita amarilla, ranita arborícola, x-túuts´ (Maya) rank: species
  81. Craugastor pygmaeus
    common name: rana ladradora pigmea, rana ladrona pigmea, rana pigmea de dedos libres, rana pygmea ladradora rank: species
  82. Geophis semidoliatus
    common name: coralillo falso, culebra minadora coralillo, minadora coralilla rank: species
  83. Lithobates psilonota
    common name: rana espalda lisa rank: species
  84. Conophis vittatus
    common name: culebra guardacaminos rayada, culebra mexicana de dos líneas rank: species
  85. Ctenosaura similis
    common name: iguana espinosa rayada, iguana negra, iguana negra de cola espinosa rank: species
  86. Rhinella horribilis
    common name: bezmuch (Maya), sapo común, sapo gigante, sapo grande, sapo lechero, sapo verrugoso, totmuch (Maya) rank: species
  87. Lithobates sierramadrensis
    common name: rana Sierra Madre, rana de la Sierra Madre Occidental rank: species
  88. Agalychnis dacnicolor
    common name: otác (Seri), rana cara de niño, rana verde, ranita verduzca, ziix hax ano quiij (Seri) rank: species
  89. Abronia oaxacae
    common name: escorpión arborícola de Oaxaca, lagarto alicante oaxaqueño rank: species
  90. Lithobates spectabilis
    common name: rana manchada, rana vistosa rank: species
  91. Lithobates vaillanti
    common name: rana, rana de Vaillant, rana verde rank: species
  92. Mesaspis juarezi
    common name: lagarto escorpión de Sierra de Juárez rank: species
  93. Abronia graminea
    common name: escorpión arborícola de Tehuacán, lagarto alicante terrestre rank: species
  94. Craugastor rhodopis
    common name: rana de hojarasca, rana de selva, rana hojarasquera común, rana ladradora polimorfa, rana ladrona polimorfa rank: species
  95. Geophis laticinctus
    common name: culebra minera de la Mesa Central, minadora de la meseta central rank: species
  96. Geophis dubius
    common name: culebra minera de la Mesa del Sur, minadora de la meseta del sur rank: species
  97. Sceloporus mucronatus
    common name: chintete, chintete de grieta meridonial, lagartija escamosa de grieta sureña rank: species
  98. Leptodeira annulata
    rank: species
  99. Lithobates neovolcanicus
    common name: rana leopardo neovolcánica, rana neovolcánica rank: species
  100. Tlalocohyla smithii
    common name: otác (Seri), rana de árbol mexicana, rana de árbol mexicana enana, ranita enana mexicana, ziix hax ano quiij (Seri) rank: species
  101. Hypopachus variolosus
    common name: chacmuch (Maya), múuch (Maya), otác (Seri), rana manglera, rana oveja común, rana ovejera, rana termitera, termitero balador, ziix hax ano quiij (Seri) rank: species
  102. Thamnophis godmani
    common name: culebra listonada, culebra listonada de Godman, culebra rayada, víbora de agua, víbora rayada rank: species
  103. Diaglena spatulata
    common name: rana de árbol cabeza de pala, rana pico de pato, rana pico de pato del pacífico, ranita de cabeza espatulada rank: species
  104. Leptophis mexicanus
    common name: culebra perico mexicana, ranera mexicana rank: species
  105. Sceloporus siniferus
    common name: lagartija escamosa cola larga, lagartija escamoso castaño, lagartija espinosa de cola larga rank: species
  106. Abronia taeniata
    common name: escorpión arborícola de bandas, lagarto alicante de bromelia rank: species
  107. Hyla eximia
    common name: rana de árbol de montaña, rana verde manchada, ranita de montaña rank: species
  108. Dendropsophus sartori
    common name: rana de árbol, rana de árbol de Taylor, ranita amarilla de Taylor, ranita rayada rank: species
  109. Anaxyrus kelloggi
    common name: sapito, sapito mexicano, sapo mexicano, sapo pequeño mexicano rank: species
  110. Mesaspis antauges
    common name: lagartija lagarto del Pico de Orizaba, lagarto escorpión de Monte Orizaba rank: species
  111. Geophis mutitorques
    common name: culebra minera de tierras altas, minadora de tierras altas rank: species
  112. Incilius marmoreus
    common name: sapo jaspeado, sapo marmoleado rank: species
  113. Thamnophis melanogaster
    common name: culebra de agua, culebra de agua de panza negra, culebra de agua de panza negra mexicana, culebra negra en Aguascalientes, víbora de agua rank: species
  114. Lithobates magnaocularis
    common name: otác (Seri), rana del noroeste mexicano, rana leopardo del noreste, rana leopardo del noreste de México, ziix hax ano quiij (Seri) rank: species
  115. Incilius valliceps
    common name: múuch (Maya), sapo, sapo común, sapo costero, sapo del golfo rank: species
  116. Sceloporus formosus
    common name: chintete esmeralda, lagartija escamosa esmeralda norteña, lagartija espinosa esmeralda norteña rank: species
  117. Lithobates berlandieri
    common name: otác (Seri), rana leopardo, rana leopardo del río Bravo, ziix hax ano quiij (Seri) rank: species
  118. Craugastor hobartsmithi
    common name: rana ladradora de Smith, rana ladradora pigmea, rana ladrona pigmeo de Smith rank: species
  119. Thamnophis chrysocephalus
    common name: culebra de agua nómada cabeza dorada, culebra listonada cabeza dorada rank: species
  120. Leptodeira maculata
    common name: culebra ojo de gato del suroeste, escombreara del suroeste mexicano rank: species
  121. Ficimia publia
    common name: culebra naricilla manchada rank: species
  122. Exerodonta smaragdina
    common name: rana de árbol esmeralda, ranita de pastizal, ranita esmeralda rank: species
  123. Gerrhonotus liocephalus
    common name: lagartija lagarto sureña, lagarto escorpión texano rank: species
  124. Leptodeira septentrionalis
    common name: culebra ojo de gato norteña, escombrera manchada rank: species
  125. Leptodeira splendida
    common name: culebra ojo de gato espléndida, escombrera ojo de gato rank: species
  126. Lithobates zweifeli
    common name: rana de Zweifel rank: species
  127. Leptotyphlops goudotii
    rank: species
  128. Craugastor mexicanus
    common name: rana ladradora mexicana, rana ladrona mexicana, ranita de hojarasca rank: species
  129. Pituophis deppei
    common name: alicante, cincuate, cincuate mexicana, culebra casera, culebra sorda mexicana, ratonera rank: species
  130. Charadrahyla taeniopus
    common name: calate jarocho, rana de árbol jarocha rank: species
  131. Sceloporus grammicus
    common name: chintete de mezquite, lagartija escamosa de mezquite, lagartija espinosa del mezquital rank: species
  132. Mesaspis monticola
    rank: species
  133. Hyla arenicolor
    common name: otác (Seri), rana de árbol color arena, ranita de cañon, ranita de las rocas, ziix hax ano quiij (Seri) rank: species
  134. Abronia fimbriata
    rank: species
  135. Plectrohyla cyclada
    common name: ranita de borde bronceado rank: species
  136. Abronia martindelcampoi
    common name: escorpión arborícola, escorpión arborícola de Martin del Campo rank: species
  137. Incilius perplexus
    common name: sapo confuso, sapo de la cuenca del rio Tepalcatepec, sapo perplejo rank: species
  138. Ctenosaura pectinata
    common name: iguana de roca, iguana espinosa Mexicana, iguana mexicana de cola espinosa, iguana negra rank: species
  139. Kinosternon leucostomum
    common name: abaniquillo de Hidalgo, casquito de labios blancos, pochitoque septentrional, tortuga pecho quebrado labios blancos rank: species
  140. Kinosternon integrum
    common name: casquito de burro, tortuga de agua, tortuga de río, tortuga pecho quebrado mexicana rank: species
  141. Geophis sallaei
    common name: culebra minadora de Salle, minadora de Sallé rank: species
  142. Exerodonta sumichrasti
    common name: rana de árbol, rana de árbol de Sumichrast, ranita de Sumichrast rank: species
  143. Ecnomiohyla miotympanum
    common name: calate, calate arborícola, rana de árbol orejas chicas rank: species
  144. Craugastor rugulosus
    common name: rana de tierra, rana ladrona centroamericana rank: species
  145. Sceloporus subpictus
    common name: lagartija escamosa pintada, lagartija espinosa de panza pinta rank: species
  146. Imantodes gemmistratus
    common name: cordelilla de la escamuda, culebra, culebra cordelilla centroamericana rank: species
  147. Abronia campbelli
    rank: species
  148. Lampropeltis triangulum
    rank: species
  149. Sceloporus jalapae
    common name: chintete, lagartija escamosa jalapeña, lagartija espinosa de Jalapa, lagartija espinosa del Valle de Tehuacán rank: species
  150. Pseudelaphe flavirufa
    rank: species
  151. Hyla euphorbiacea
    common name: rana de árbol de Los Altos del Sur, ranita de alta montaña rank: species
  152. Leptotyphlops tenuis
    rank: species
  153. Pituophis melanoleucus
    rank: species
  154. Geophis petersii
    common name: culebra minera de Peters, minadora de Peters rank: species
  155. Abronia deppii
    common name: escorpión arborícola, escorpión arborícola de Deppe, lagarto alicante rank: species
  156. Kinosternon hirtipes
    common name: casquito de pata rugosa, tortuga pecho quebrado pata rugosa rank: species
  157. Thamnophis eques
    common name: culebra de agua, culebra de agua nómado mexicano, culebra listonada del sur Mexicano rank: species
  158. Abronia lythrochila
    common name: escorpión arborícola de labios rojos, lagarto alicante labios rojos rank: species
  159. Incilius tutelarius
    common name: sapo de Chimalapas rank: species
  160. Abronia mixteca
    common name: escorpión arborícola mixteco, lagarto alicante mixteco rank: species
  161. Geophis bicolor
    common name: culebra minera del Altiplano, minadora de la meseta mexicana rank: species
  162. Abronia frosti
    rank: species
  163. Mesaspis moreleti subsp. fulvus
    rank: infraspecificname
  164. Mesaspis moreleti subsp. salvadorensis
    rank: infraspecificname
  165. Mesaspis moreletii subsp. temporalis
    rank: infraspecificname
  166. Mesaspis moreletii subsp. moreletii
    rank: infraspecificname

Geographic Coverages

País: COSTA RICA (HEREDIA, SAN JOSE) País: GUATEMALA (ALTA VERAPAZ, HUEHUETENANGO, JALAPA, QUETZALTENANGO, QUICHE, SAN MARCOS) País: HONDURAS (, ATLANTIDA, CORTES, FRANCISCO MORAZAN, OCOTEPEQUE) País: MEXICO (, CAMPECHE, CHIAPAS, CHIHUAHUA, COLIMA, DISTRITO FEDERAL, DURANGO, GUERRERO, HIDALGO, JALISCO, MEXICO, MICHOACAN DE OCAMPO, MORELOS, NAYARIT, OAXACA, PUEBLA, QUERETARO, QUINTANA ROO, SAN LUIS POTOSI, SINALOA, SONORA, TABASCO, TAMAULIPAS, TLAXCALA, VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE, YUCATAN, ZACATECAS) País: NICARAGUA (JINOTEGA)

Bibliographic Citations

Contacts

Virginia León Régagnon
originator
position: Responsable
Universidad Nacional Autónoma de MéxicoInstituto de BiologíaEstación Chamela
Apartado Postal 21 Col. ND
San Patricio Melaque
48980
Jalisco
MX
Telephone: 01 312 3161000 ext. 4900301 315 35 1020056229167
email: vleon@ib.unam.mx
CONABIO Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad
metadata author
position: Dirección General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
MÉXICO
14010
Tlalpan
MX
Telephone: 50045000
email: patricia.ramos@conabio.gob.mx
homepage: https://www.gob.mx/conabio
Patricia Ramos Rivera
administrative point of contact
position: Dirección General de Sistemas
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad
Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
México
14010
Tlalpan
MX
Telephone: 50045000
email: patricia.ramos@conabio.gob.mx
homepage: https://www.gob.mx/conabio
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