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Corales de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle (CRBMco)

Citation

Salazar Hernandez J A, Londoño-Cruz E, Montoya-Cadavid E, Zapata Rivera F A (2025). Corales de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle (CRBMco). Version 7.4. Universidad del Valle. Occurrence dataset https://doi.org/10.15472/otu4ix accessed via GBIF.org on 2025-07-08.

Description

Este conjunto de datos hace parte de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle. Posee 458 registros de cnidarios, correspondientes a 95 especies, las cuales se encuentran repartidas en 3 clases (Anthozoa, Hydrozoa y Scyphozoa). Los organismos que dominan los registros en la colección son los corales duros (Anthozoa: Scleractinia) y los octocorales (Anthozoa: Octocorallia). Los registros provienen en su mayoría, de la región del Pacífico colombiano (79%), seguidos de la región del Caribe colombiano (21%). Estos registros datan desde el año 1970 hasta el año 2022, en donde el Biólogo Henry Von Prahl fue quien inició con la dirección de los esfuerzos para conformar seriamente esta colección en los años 1980's. Esta colección de referencia se estableció formalmente ante el instituto Alexander Von Humboldt en el año 2002.

Sampling Description

Study Extent

Pacífico colombiano y Caribe colombiano

Sampling

Los especímenes de cnidarios (en especial corales) son colectados manualmente en su mayoría, manejando gran precaución al momento de la extracción de las colonias. Luego, en caso de corales duros, se les realiza un tratamiento con hipoclorito para blanquear las colonias y dejar solo el esqueleto coralino. Para el resto de cnidarios, estos son fijados en alcohol al 70% y posteriormente, son envasados o empaquetados, con al menos un recambio de alcohol en el laboratorio. Finalmente, los organismos son identificados hasta el nivel taxonómico más bajo posible y se les asigna su respectivo numero de catalogo para el ingreso a la colección de referencia. Por otro lado, respecto al proceso de curaduría en general, se realizó recambio de alcohol al 70% a los lotes que lo requirieron y se renovaron/agregaron nuevas etiquetas a los lotes donde estuvieran deterioradas o no las presentaran.

Quality Control

Se realizó una limpieza de datos inicial, completando y depurando toda la información de los registros biológicos en el formato DwC ver. 4.0. Se estandarizaron los datos de fechas y coordenadas usando las herramientas "Date parsing" y "Coordinate conversion" respectivamente, de la plataforma web Canadensys. Además, para completar los datos de georreferenciación, se utilizaron las herramientas "Google Earth Pro v.7.3.6.9285" y el "Geoportal de la división político-administrativa del DANE (Colombia)", apoyándose a su vez, en la información del sitio de colecta registrado en los lotes. Se realizó una verificación cruzada de todos los registros y se corrigieron errores de ortografía y tipografía, así como depuración de comas y dobles espacios, usando la herramienta OpenRefine 3.5.2. Finalmente, se rectificaron y corrigieron/actualizaron los nombres taxonómicos en los registros biológicos, usando la herramienta "Match Taxa" de la página web World Register of Marine Species (WoRMS).

Method steps

  1. Curaduría de información: Recopilación de datos provenientes de los lotes
  2. Estructuración global de la información en el formato Darwin Core versión 4.0
  3. Depuración y completitud de la información faltante en los registros biológicos
  4. Limpieza de datos: de aspectos de forma (ortografía, tipografía, comas y dobles espacios), rectificación/corrección de coordenadas, fechas y nombres taxonómicos en los registros.
  5. Curaduría física: Se corroboró el estado del alcohol (en la colección húmeda), del recipiente/bolsa y de las etiquetas asociadas, reemplazando cada elemento por uno en perfectas condiciones en caso de ser requerido. En caso de que los organismos no estuvieran presentes en la colección, se reportaban como extraviados en la base de datos (CRBMeq-UV).

Taxonomic Coverages

Los 458 registros de cnidarios de la colección de referencia, están representados taxonómicamente por 3 clases, 7 órdenes, 28 familias, 51 géneros, 93 especies y 4 variedades.
  1. Anthozoa
    common name: Anémonas, Corales y Plumas de mar rank: class
  2. Hydrozoa
    common name: Hidras, pequeñas Medusas y pólipos coloniales rank: class
  3. Scyphozoa
    common name: Medusas rank: class
  4. Anthoathecata
    rank: order
  5. Leptothecata
    rank: order
  6. Malacalcyonacea
    rank: order
  7. Rhizostomeae
    rank: order
  8. Scleractinia
    common name: Corales duros rank: order
  9. Scleralcyonacea
    rank: order
  10. Siphonophorae
    rank: order
  11. Acroporidae
    rank: family
  12. Agariciidae
    rank: family
  13. Aglaopheniidae
    rank: family
  14. Astrangiidae
    rank: family
  15. Astrocoeniidae
    rank: family
  16. Briareidae
    rank: family
  17. Carijoidae
    rank: family
  18. Caryophylliidae
    rank: family
  19. Dendrophylliidae
    rank: family
  20. Faviidae
    rank: family
  21. Fungiidae
    rank: family
  22. Gorgoniidae
    rank: family
  23. Meandrinidae
    rank: family
  24. Merulinidae
    rank: family
  25. Milleporidae
    rank: family
  26. Montastraeidae
    rank: family
  27. Oculinidae
    rank: family
  28. Paramuriceidae
    rank: family
  29. Physaliidae
    rank: family
  30. Plexauridae
    rank: family
  31. Pocilloporidae
    rank: family
  32. Poritidae
    rank: family
  33. Psammocoridae
    rank: family
  34. Pterogorgiidae
    rank: family
  35. Rhizangiidae
    rank: family
  36. Stomolophidae
    rank: family
  37. Stylasteridae
    rank: family
  38. Scleractinia incertae sedis
    rank: family

Geographic Coverages

Este conjunto de datos posee información de 363 registros de cnidarios en el Pacífico colombiano, abarcando las regiones marino-costeras de los departamentos del Cauca, Valle del Cauca, Chocó y Nariño. Asimismo, se cuentan con 95 registros del Caribe colombiano, correspondientes a los departamentos del Archipiélago de San Andrés, Providencia y Santa Catalina, Bolívar, Córdoba, La Guajira y Magdalena. Los rangos de profundidades están comprendidos desde los 0 metros (superficie) hasta un máximo de 30 metros.

Bibliographic Citations

  1. WoRMS (2023). Cnidaria. Accessed at: https://www.marinespecies.org/aphia.php?p=taxdetails&id=1267 on 2023-02-17 -
  2. Brusca, R. C., Brusca, G. J., & Martínez, F. P. (2005). Invertebrados (1.ª ed., p. 1032). España: McGraw-Hill Interamericana de España S.L. ISBN-10: 8448602463 -
  3. Cantera, J. & Londoño-Cruz, E. (Eds.). 2011. Colombia Pacífico: Una visión sobre su biodiversidad marina. Programa Editorial Universidad del Valle, Cali, Colombia. 420 p. ISBN: 978-958-670-954-5 -
  4. Universidad del Valle (2014 -). Corales de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle, 486 registros, aportados por Lizcano-Sandoval, L.D. (Creador del recurso), Zapata, F.A. (Curador de la colección, Contacto del recurso) & Carmona, A. (Proveedor de los metadatos, Contacto del recurso), En línea, http://ipt.sibcolombia.net/valle/resource.do?r=corales_univalle, versión 1 (actualizado el 12/11/2014). -
  5. Bayer, F. M. 1981. Key to the genera of Octocorallia exclusive of Pennatulacea (Coelenterata: Anthozoa), with diagnoses of new taxa. Proceedings of the Biological Society of Washington 94: 902-947 (1981) -
  6. Breedy, O. & Guzmán, H. M. 2007. A revision of the genus Leptogorgia Milne Edwards & Haime, 1857 (Coelenterata: Octocorallia: Gorgoniidae) in the eastern Pacific. Zootaxa 1419: 1-90 -
  7. Breedy, O., Guzmán, H. M. & Vargas, S. 2009. A revision of the genus Eugorgia Verrill, 1868 (Coelenterata: Octocorallia: Gorgoniidae). Zootaxa 2151: 1-46 -
  8. Cairns, S. D. & Kitahara, M. V. 2012. An illustrated key to the genera and subgenera of the recent azooxanthellate Scleractinia (Cnidaria, Anthozoa), with an attached glossary. ZooKeys 227: 1-47 -
  9. Reyes, J., Santodomingo, N. & Flórez, P. 2010. Corales Escleractinios de Colombia. Invemar Serie de Publicaciones Especiales, No. 14. Santa Marta, 246 p -
  10. Verón, J. E. N. 2000. Corals of the world. Vol. 1-3. Australian Institute of Marine Sciences, Australia. 1381 p. -

Contacts

John Alexander Salazar Hernandez
originator
position: Estudiante de Pregrado
Universidad del Valle
Calle 13 # 100-00, Edificio E20 - 4061, Sección Biología Marina (Sede Meléndez)
Santiago de Cali
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Edgardo Londoño-Cruz
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Calle 25 No. 2-55, Playa Salguero, Santa Marta D.T.C.H.
Santa Marta
470006
Magdalena
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Telephone: (+57) (+5) 4380 808, ext. 252
email: erika.montoya@invemar.org.co
userId: http://orcid.org/0000-0002-9709-6787
Fernando Alberto Zapata Rivera
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position: Profesor
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John Alexander Salazar Hernandez
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Edgardo Londoño-Cruz
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