Corales de la Colección de Referencia de Biología Marina de la Universidad del Valle (CRBMco)

Study Extent

Pacífico colombiano y Caribe colombiano

Sampling

Los especímenes de cnidarios (en especial corales) son colectados manualmente en su mayoría, manejando gran precaución al momento de la extracción de las colonias. Luego, en caso de corales duros, se les realiza un tratamiento con hipoclorito para blanquear las colonias y dejar solo el esqueleto coralino. Para el resto de cnidarios, estos son fijados en alcohol al 70% y posteriormente, son envasados o empaquetados, con al menos un recambio de alcohol en el laboratorio. Finalmente, los organismos son identificados hasta el nivel taxonómico más bajo posible y se les asigna su respectivo numero de catalogo para el ingreso a la colección de referencia. Por otro lado, respecto al proceso de curaduría en general, se realizó recambio de alcohol al 70% a los lotes que lo requirieron y se renovaron/agregaron nuevas etiquetas a los lotes donde estuvieran deterioradas o no las presentaran.

Quality Control

Se realizó una limpieza de datos inicial, completando y depurando toda la información de los registros biológicos en el formato DwC ver. 4.0. Se estandarizaron los datos de fechas y coordenadas usando las herramientas "Date parsing" y "Coordinate conversion" respectivamente, de la plataforma web Canadensys. Además, para completar los datos de georreferenciación, se utilizaron las herramientas "Google Earth Pro v.7.3.6.9285" y el "Geoportal de la división político-administrativa del DANE (Colombia)", apoyándose a su vez, en la información del sitio de colecta registrado en los lotes. Se realizó una verificación cruzada de todos los registros y se corrigieron errores de ortografía y tipografía, así como depuración de comas y dobles espacios, usando la herramienta OpenRefine 3.5.2. Finalmente, se rectificaron y corrigieron/actualizaron los nombres taxonómicos en los registros biológicos, usando la herramienta "Match Taxa" de la página web World Register of Marine Species (WoRMS).

Method steps

1. Curaduría de información: Recopilación de datos provenientes de los lotes
2. Estructuración global de la información en el formato Darwin Core versión 4.0
3. Depuración y completitud de la información faltante en los registros biológicos
4. Limpieza de datos: de aspectos de forma (ortografía, tipografía, comas y dobles espacios), rectificación/corrección de coordenadas, fechas y nombres taxonómicos en los registros.
5. Curaduría física: Se corroboró el estado del alcohol (en la colección húmeda), del recipiente/bolsa y de las etiquetas asociadas, reemplazando cada elemento por uno en perfectas condiciones en caso de ser requerido. En caso de que los organismos no estuvieran presentes en la colección, se reportaban como extraviados en la base de datos (CRBMeq-UV).

Los 458 registros de cnidarios de la colección de referencia, están representados taxonómicamente por 3 clases, 7 órdenes, 28 familias, 51 géneros, 93 especies y 4 variedades.

1. Anthozoa
   common name: Anémonas, Corales y Plumas de mar rank: class
2. Hydrozoa
   common name: Hidras, pequeñas Medusas y pólipos coloniales rank: class
3. Scyphozoa
   common name: Medusas rank: class
4. Anthoathecata
   rank: order
5. Leptothecata
   rank: order
6. Malacalcyonacea
   rank: order
7. Rhizostomeae
   rank: order
8. Scleractinia
   common name: Corales duros rank: order
9. Scleralcyonacea
   rank: order
10. Siphonophorae
    rank: order
11. Acroporidae
    rank: family
12. Agariciidae
    rank: family
13. Aglaopheniidae
    rank: family
14. Astrangiidae
    rank: family
15. Astrocoeniidae
    rank: family
16. Briareidae
    rank: family
17. Carijoidae
    rank: family
18. Caryophylliidae
    rank: family
19. Dendrophylliidae
    rank: family
20. Faviidae
    rank: family
21. Fungiidae
    rank: family
22. Gorgoniidae
    rank: family
23. Meandrinidae
    rank: family
24. Merulinidae
    rank: family
25. Milleporidae
    rank: family
26. Montastraeidae
    rank: family
27. Oculinidae
    rank: family
28. Paramuriceidae
    rank: family
29. Physaliidae
    rank: family
30. Plexauridae
    rank: family
31. Pocilloporidae
    rank: family
32. Poritidae
    rank: family
33. Psammocoridae
    rank: family
34. Pterogorgiidae
    rank: family
35. Rhizangiidae
    rank: family
36. Stomolophidae
    rank: family
37. Stylasteridae
    rank: family
38. Scleractinia incertae sedis
    rank: family

Este conjunto de datos posee información de 363 registros de cnidarios en el Pacífico colombiano, abarcando las regiones marino-costeras de los departamentos del Cauca, Valle del Cauca, Chocó y Nariño. Asimismo, se cuentan con 95 registros del Caribe colombiano, correspondientes a los departamentos del Archipiélago de San Andrés, Providencia y Santa Catalina, Bolívar, Córdoba, La Guajira y Magdalena. Los rangos de profundidades están comprendidos desde los 0 metros (superficie) hasta un máximo de 30 metros.