Caracterización taxonómica y genética de hongos cultivables del Piedemonte-Casanare y Magdalena Medio - Proyecto FIBRAS
Citation
Ecopetrol. S.A., Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (2023). Caracterización taxonómica y genética de hongos cultivables del Piedemonte-Casanare y Magdalena Medio - Proyecto FIBRAS. Ecopetrol S.A.. Occurrence dataset https://doi.org/10.15472/6zzwgi accessed via GBIF.org on 2024-12-10.Description
Bajo el marco del convenio Fibras No. 19-155, entre el Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt y ECOPETROL S.A.S y la Universidad de los ANDES, se llevó a cabo un muestreo de hongos. El muestreo se llevó a cabo entre marzo de 2021 y junio de 2021. El presente conjunto de datos contiene un total de 202 registros biológicos de hongos distribuidos en 3 filos, Ascomycota representado por 15 órdenes, Basidiomycota representado por 4 órdenes y Mucoromycota representado por 1 orden.Purpose
Aunar esfuerzos técnicos, administrativos y financieros entre el Instituto Alexander von Humboldt y la Universidad de los Andes para caracterizar la diversidad funcional de hongos y realizar la caracterización taxonómica y genética de hongos cultivables de las muestras ambientales, definidas por el supervisor del convenio por parte del Instituto, en el marco del Convenio No. 19-155 suscrito entre el Instituto Alexander von Humboldt y Ecopetrol S.A.
Sampling Description
Study Extent
Piedemonte, Casanare y Magdalena medio, Santander.Sampling
En cada punto de muestreo se tomaron 3 réplicas en un transecto de 20 m y recogieron muestras de agua, suelo y sedimento.Quality Control
Durante el procesamiento de las muestras se pusieron controles de contaminación ambiental dejando cajas de Petri con agar papa dextrosa abiertas con el fin de registrar el crecimiento de hongos que estaban presentes en el ambiente durante el tiempo en el que se procesaron las muestras.Method steps
- Toma de las muestras en campo: Manteniendo condiciones de esterilidad se tomaron muestras de agua suelo y sedimento en cada uno de los puntos de muestreo. Las muestra colectadas fueron transportadas en cadena de frío hasta su procesamiento en el laboratorio.
- Procesamiento de las muestras ambientales: - Aislamiento de los hongos: - Agua: Filtración al vacío para concentrar los propágulos contenidos en las muestras de agua. Los filtros obtenidos fueron depositados boca arriba en cajas de Petri con agar papa dextrosa. - Suelo y sedimento: Dilución y siembra en placa: Una muestra de suelo o sedimento (según corresponda), se suspendió en agua estéril y se procedió a diluir en una proporción de 1/10. Las diluciones 10e-1, 10e-3 y 10-5 se inocularon en cajas de agar papa dextrosa y agar rosa bengala por triplicado.
- Purificación de los aislamientos en cultivos axénicos: Siguiendo las recomendaciones básicas de bioseguridad en laboratorios de microbiología, los hongos aislados fueron subcultivados en agar papa dextrosa hasta obtener cultivos axénicos, es decir, con un único hongo presente en el medio de cultivo.
- Caracterización morfológica y genética de los aislamientos fúngicos: La caracterización morfológica se llevó a cabo a través de la descripción de rasgos micro y macroscópicos de cada aislamiento. Mientras la caracterización genética se llevó a cabo a través de la extracción de ADN, amplificación de uno o dos marcadores moleculares y la secuenciación de estos fragmentos por el método Sanger.
Taxonomic Coverages
Se obtuvo un total de 202 registros biológicos de hongos (Fungi) distribuidos en 3 filos, Ascomycota representado por 15 órdenes, Basidiomycota representado por 4 órdenes y Mucoromycota representado por 1 orden. La taxonomía propuesta sigue lineamientos básicos en micología y se basa en guías de identificación, claves dicotómicas, libros, artículos científicos y fue complementada con información genética.
-
Amphisphaerialesrank: order
-
Botryosphaerialesrank: order
-
Chaetothyrialesrank: order
-
Cladosporialesrank: order
-
Diaporthalesrank: order
-
Eurotialesrank: order
-
Glomerellalesrank: order
-
Helotialesrank: order
-
Hypocrealesrank: order
-
Microascalesrank: order
-
Pleosporalesrank: order
-
Saccharomycetalesrank: order
-
Sordarialesrank: order
-
Venturialesrank: order
-
Xylarialesrank: order
-
Cantharellalesrank: order
-
Sporidiobolalesrank: order
-
Trichosporonalesrank: order
-
Ustilaginalesrank: order
-
Mucoralesrank: order
Geographic Coverages
Piedemonte, Casanare y Magdalena medio, Santander.
Bibliographic Citations
Contacts
Ecopetrol. S.A.originator
position: Gerencia de Sostenibilidad y Descarbonización
Ecopetrol. S.A.
Carrera 7 # 32 – 42. Edificio San Martín Piso 32
Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO
Telephone: 60 (1) 2340000 Ext 54510
email: xiomara.sanclemente@ecopetrol.com.co
homepage: https://www.ecopetrol.com.co/
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
originator
position: Instituto de investigación
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Avenida Paseo Bolívar # 16-20
Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO
Telephone: 3202767
homepage: http://www.humboldt.org.co
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
metadata author
position: Instituto de investigación
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Avenida Paseo Bolívar # 16-20
Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO
Telephone: 3202767
homepage: http://www.humboldt.org.co
Paola Pulido-Santacruz
principal investigator
position: Investigadora
Instituto de Investigación de Rercursos Biológicos Alexander von Humboldt
Avenida Paseo Bolívar # 16-20
Bogotá, D.C.
Cundinamarca
CO
Telephone: 3202767
email: ppulido@humboldt.org.co
Ecopetrol. S.A.
author
position: Gerencia de Sostenibilidad y Descarbonización
Ecopetrol. S.A.
Carrera 7 # 32–42. Edificio San Martín Piso 32
Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO
Telephone: 60 (1) 2340000 Ext 54510
email: xiomara.sanclemente@ecopetrol.com.co
Nicolás Echeverry Montaña
custodian steward
position: Investigador
Universidad de Los Andes
Carrera 1 #18a - 12
Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO
Telephone: 3394949 ext. 2768
email: n.echeverrym@uniandes.edu.co
homepage: https://uniandes.edu.co/
Infraestructura Institucional de Datos
custodian steward
Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
Avenida Paseo Bolívar # 16-20
Bogotá, D.C.
110321
Bogotá, D.C.
CO
Telephone: 3202767
email: i2d@humboldt.org.co
homepage: http://www.humboldt.org.co
Paola Pulido-Santacruz
administrative point of contact
position: Investigadora
Instituto de Investigación de Rercursos Biológicos Alexander von Humboldt
Avenida Paseo Bolívar # 16-20
Bogotá, D.C.
Bogotá, D.C.
CO
Telephone: 3202767
email: ppulido@humboldt.org.co