Caracterización taxonómica y genética de hongos cultivables del Piedemonte-Casanare y Magdalena Medio - Proyecto FIBRAS

Study Extent

Piedemonte, Casanare y Magdalena medio, Santander.

Sampling

En cada punto de muestreo se tomaron 3 réplicas en un transecto de 20 m y recogieron muestras de agua, suelo y sedimento.

Quality Control

Durante el procesamiento de las muestras se pusieron controles de contaminación ambiental dejando cajas de Petri con agar papa dextrosa abiertas con el fin de registrar el crecimiento de hongos que estaban presentes en el ambiente durante el tiempo en el que se procesaron las muestras.

Method steps

1. Toma de las muestras en campo: Manteniendo condiciones de esterilidad se tomaron muestras de agua suelo y sedimento en cada uno de los puntos de muestreo. Las muestra colectadas fueron transportadas en cadena de frío hasta su procesamiento en el laboratorio.
2. Procesamiento de las muestras ambientales: - Aislamiento de los hongos: - Agua: Filtración al vacío para concentrar los propágulos contenidos en las muestras de agua. Los filtros obtenidos fueron depositados boca arriba en cajas de Petri con agar papa dextrosa. - Suelo y sedimento: Dilución y siembra en placa: Una muestra de suelo o sedimento (según corresponda), se suspendió en agua estéril y se procedió a diluir en una proporción de 1/10. Las diluciones 10e-1, 10e-3 y 10-5 se inocularon en cajas de agar papa dextrosa y agar rosa bengala por triplicado.
3. Purificación de los aislamientos en cultivos axénicos: Siguiendo las recomendaciones básicas de bioseguridad en laboratorios de microbiología, los hongos aislados fueron subcultivados en agar papa dextrosa hasta obtener cultivos axénicos, es decir, con un único hongo presente en el medio de cultivo.
4. Caracterización morfológica y genética de los aislamientos fúngicos: La caracterización morfológica se llevó a cabo a través de la descripción de rasgos micro y macroscópicos de cada aislamiento. Mientras la caracterización genética se llevó a cabo a través de la extracción de ADN, amplificación de uno o dos marcadores moleculares y la secuenciación de estos fragmentos por el método Sanger.

Se obtuvo un total de 202 registros biológicos de hongos (Fungi) distribuidos en 3 filos, Ascomycota representado por 15 órdenes, Basidiomycota representado por 4 órdenes y Mucoromycota representado por 1 orden. La taxonomía propuesta sigue lineamientos básicos en micología y se basa en guías de identificación, claves dicotómicas, libros, artículos científicos y fue complementada con información genética.

1. Amphisphaeriales
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2. Botryosphaeriales
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3. Chaetothyriales
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4. Cladosporiales
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5. Diaporthales
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6. Eurotiales
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7. Glomerellales
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8. Helotiales
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9. Hypocreales
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10. Microascales
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11. Pleosporales
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12. Saccharomycetales
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13. Sordariales
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14. Venturiales
    rank: order
15. Xylariales
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16. Cantharellales
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17. Sporidiobolales
    rank: order
18. Trichosporonales
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19. Ustilaginales
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20. Mucorales
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Piedemonte, Casanare y Magdalena medio, Santander.