Skip to main content
Přihlášení

    Kostky výskytu druhů v GBIF

    Agregace dat o výskytu podle prostorových, časových a taxonomických rozměrů za účelem vytvoření "datových kostek" pro řízení biologické rozmanitosti a politická rozhodnutí

    Illustration of a Pacific Pilot Whale <a href="https://www.gbif.org/species/2440605"><i>Pacific Globicephala macrorhynchus</i> Gray, 1846</a> from The marine mammals of the north-western coast of North America, New York, 1974. Shared under <a href="https://creativecommons.org/publicdomain/mark/1.0/">Public Domain</a> by the <a href="https://www.biodiversitylibrary.org/page/16226214#page/145/mode/1up">Biodiversity Heritage Library</a>.
    Illustration of a Pacific Pilot Whale Pacific Globicephala macrorhynchus Gray, 1846 from The marine mammals of the north-western coast of North America, New York, 1974. Shared under Public Domain by the Biodiversity Heritage Library.

    GBIF umožňuje uživatelům vytvářet a stahovat datové kostky, které slouží jako základ pro modely a ukazatele minulé, současné a budoucí biologické rozmanitosti. Zatímco generování kostek se opírá o GBIF SQL download API, uživatelé mohou snadno definovat kostky výběrem požadované taxonomické, časové a/nebo prostorové dimenze z jednoduchého přednastaveného seznamu možností. Vygenerovaný dotaz SQL lze před spuštěním stahování dále upravit.

    Dimenze

    Možnosti generování kostek zahrnují

    Uživatelé mohou přidat další dimenze na základě kategorických údajů, např. stádia života, kategorie Červeného seznamu IUCN atd., a to upřesněním dotazu SQL.

    Měřítka

    Pro každou kombinaci kategorií dimenze (skupinu) se vypočítá měřítko. Minimálně se jedná o počet výskytů, ale uživatel může také přidat informace o souřadnicové a časové nejistotě.

    Formát, metadata a FAIRness

    Stejně jako u ostatních formátů pro stahování výskytu GBIF jsou kostky generovány jako soubory CSV s tabulátory. Metadata kostky budou zachována na stránce pro stažení, kde budou uvedeny podrobnosti o dotazu SQL, podkladových datových souborech GBIF, které se na kostce podílejí, a také odkaz na stažení kostky. Stejně jako běžným souborům ke stažení jsou i kostkám přiřazeny DOI pro snadné citování.

    Technická dokumentace a příklady

    Podrobné informace o možnostech vytváření, přizpůsobování a odesílání dotazů pro kostky výskytu naleznete v dokumentaci.

    Další informace o kostkách výskytu druhů

    • Desmet P, Oldoni D, Blissett M, Robertson T (2023). Specifikace kostek výskytu druhů a jejich výroba. https://docs.b-cubed.eu/guides/occurrence-cube/
    • Groom Q, Abraham L, Adriaens T, Breugelmans L, Clarke D, Fernández M, et al. B-Cubed: Cubub: Využití datových sad o biologické rozmanitosti připravených k analýze a cloud computingu pro včasné a akční monitorování biologické rozmanitosti. Biodiversity Information Science and Standards [Internet]. 2023 Aug 9;7. Dostupné z: https://doi.org/10.3897/biss.7.110734
    • Oldoni D, Groom Q, Adriaens T, Davis AJS, Reyserhove L, Strubbe D, et al. Occurrence cubes: a new paradigm for aggregating species occurrence data. 2020 Mar 25; Dostupné z: https://doi.org/10.1101/2020.03.23.983601

    B3 logo full

    Evropská unieVývoj kostek výskytu druhů GBIF je součástí pracovního balíčku 2 B³ (Biodiversity Building Blocks for policy), který vede Výzkumný ústav pro přírodu a lesy (INBO) a který je financován z programu Evropské unie pro výzkum a inovace Horizont Evropa (ID č. 101059592).