Sladkovodní ekosystémy mají zásadní význam pro podporu globální biologické rozmanitosti, ale patří k nejohroženějším ekosystémům na planetě. To je částečně způsobeno nedostatečně účinným monitorováním a omezenou dostupností a přístupem k datům o biologické rozmanitosti.

Pro překlenutí této mezery GBIF spolupracuje s mezinárodními sítěmi a organizacemi na shromažďování informací o životě v řekách, jezerech, mokřadech a potocích a jejich okolí – poskytuje komplexní, volně přístupné a plně interoperabilní data na podporu porozumění, monitorování, ochrany a obnovy sladkovodní biodiverzity Země.

Ve spolupráci s předními organizacemi v této oblasti, jako je Sladkovodní síť pro pozorování biodiverzity (FW BON) a Ramsarská úmluva o mokřadech, se GBIF snaží shromažďovat, harmonizovat a sdílet kritické datové sady o biodiverzitě, které slouží jako informace pro vědu, politiku a úsilí o ochranu přírody na celém světě.