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Devenir un fournisseur de données SMIB
Devenir un fournisseur de données SMIB
Description des cours de la formation SMIB
Objectifs
L'implémentation d'un réseau SMIB
requiert de savoir utiliser divers logiciels. L'obligation
la plus basique est de mettre sur pied un noeud et de faire fonctionner
une application de fourniture de données sur un ordinateur faisant
office de serveur. Un des standards du SMIB actuellement utilisé pour la fourniture
de données est le protocole
DiGIR.
Le réseau DiGIR est conçu pour des données primaires sur
l'occurence des espèces découlant de spécimens dans les musées et de listes d'observations.
Le standard d'échange d'information est le Schéma XML DarwinCore comprenant 48 champs
répondant aux questions de base "quoi, où, quand, par qui" plus quelques informations
générales sur les caractéristiques des spécimens.
Un deuxième standard recommandé par le SMIB, déjà utilisé au niveau européen et qui sera bientôt
implémenté également au niveau du SMIB est le standard d'échange "Access to Biological Collection Data" (ABCD)
et les logiciels associés:
BioCase et ABCD.
Le schéma d'échange ABCD contient
dans sa version actuelle plus de 650 champs encore appelés concepts qui correctement agencés
permettent l'échange d'information plus pointue et adaptée à la nature des spécimens ou
des observations concernés.
Ce cours couvre l'installation des fournisseurs de données DIGIR et BioCASE
aussi bien sous des plateformes Windows que Linux.
Cette formation a pour but de faciliter le développement de réseaux de
fournisseurs DiGIR et BioCASE concernant les données primaires. Dans la plupart des cas
ces serveurs sont situés dans les Collections d'Histoires Naturelles ou dans
d'autres institutions qui détiennent ce genre de données. Il est vivement conseillé
que les participants à ce cours aient déjà accès à ce type de données ou se préparent à
former ceux qui détiennent ce genre d'information.
Auditoire cible
Ce cours est conçu pour:
- Des gestionnaires et des administrateurs système de noeuds SMIB. Il est vivement conseillé
au personnel des noeuds Participants ou des noeuds de données de participer
à ce cours.
- Les dépositaires de bases de données et les scientifiques qui désirent comprendre
comment le SMIB fournit les données.
Prérequis
Les participants devraient avoir des compétences techniques telles que décrites ci-dessous.
- Systèmes d'exploitation de Serveurs (Linux/Unix et/ou Windows
2000/XP):
Connaissance basique à intermédiaire.
- Bases de données relationnelles: Connaissance de base des concepts.
- Internet: Connaissances de base de serveurs WEB comme Apache
et IIS. Connaissances de base en XML.
Aperçu du contenu
Les participants auront tout d'abord une introduction au SMIB et à ses technologies, auront
une démonstration complète des installations, puis feront eux-mêmes l'installation
sur leurs postes de travail en Windows. A chaque formation, la couverture de ces systèmes d'exploitation
peut être adaptée à l'une ou à l'autre plateforme en fonction des besoins des participants. Des démonstrations
de l'installation sous Linux pourront également se faire si certains participants en font la demande.
Cette formation se déroulera sur 5 jours :
Lundi 21 Juin :
- Apprendre à se connaître
- Introduction des formateurs et des participants
- Se familiariser avec son poste de travail et avec les connections internet
disponibles
Présentation générale du SMIB
- Les Principes et les Objectifs du SMIB
- Le Système d'Information du GBIF
- Que sont les noeuds GBIF
Les participants auront l'occasion ensuite de présenter brièvement le type d'information sur la biodiversité dont leur pays ou organisation dispose. L'accent sera mis sur l'institution qui fait office ou est pressentie comme
noeud participant du pays ou de l'organisation, la liste des autres institutions du pays ou de l'organisation pouvant
participer au réseau SMIB comme noeuds de fourniture de données. Des informations sur la nature des données, leur état
d'informatisation, le type de système informatique éventuellement disponible, les systèmes de stockage de l'information
utilisés ou préférés (quels logiciels, comme par exemple Access ou simplement en Excel ...).
Mardi 22 Juin et Mercredi 23 Juin :
Présentation du modèle de données Darwin Core et de l'interface DiGIR ;
formation pratique à l'installation de DiGIR, sa configuration et sa mise en oeuvre.
De même le premier jour sera consacré à l'installation et à la familiarisation aux outils et le deuxième jour à des tests avec les données réelles éventuellement mises à disposition par les participants.
Jeudi 24 Juin et Vendredi 25 Juin :
Présentation du modèle de données ABCD et du "wrapper" BioCase,
formation pratique à l'installation du "wrapper" BioCase, sa configuration et sa mise en oeuvre.
Le premier jour sera consacré à l'installation et à la familiarisation avec les outils et si possible le deuxième jour à
des tests avec les données réelles éventuellement mises à disposition par les participants.
Programme d'une journée de formation type (Exemple DiGIR)
Introduction 90 min
- Les Principes et les Objectifs du SMIB 10 min
- Le Système d'Information du SMIB 30 min
- Que sont les noeuds GBIF 20 min
- Le Protocole DiGIR et le standar XML Darwin Core 30 min
Installation sur les postes de travail en Windows 90 min
- Qu'est-ce que le paquetage fourniture de données du GBIF 10 min
- Installer le paquetage de fourniture de données 15 min
- Configuration du fournisseur de méta-données 15 minutes
- Familiarisation avec un example de données sur la biodiversité utilisé lors de la formation 15 min
- Définition des ressources, incluant la mise en correspondance d'un échantillon de données avec Darwin Core 35 minutes
- Optionnel, répéter l'étape 2 sur un serveur Linux partagé (Toutes les autres étapes sont les mêmes) 10 min
Pause déjeuner ou souper
Introduction aux registres SMIB 60 min
- Qu'est-ce que l'UDDI 20 min
- Enregistrements des fournisseurs installés à l'UDDI du SMIB 10 min
- Explorer l'UDDI du GBIF 10 min
Accéder aux fournisseurs de données 30 min
- Recherche dans les fournisseurs installés en utilisant un portail de requête existant 30 min
Démonstrations et tests, en fonction des intérêts et du temps disponible 60 min
- Alternativement, introduction à l'outil de registre de données du SMIB 60 min
- Alternativement, démonstration de l'installation et de l'utilisation de la boîte à outil du Portail SMIB 60 min
Discussions 30 min
Retour d'information 15 min
Matériel
Le matériel de cours existe actuellement en anglais et partiellement en français.
Durée
Le contenu est prévu pour une durée de 7-8 heures. La durée totale avec les pauses est d'une journée ouvrable.
Les formateurs et langues disponibles
Les formateurs pour les cours actuels sont repris de la liste ci-dessous.
- Giorgos Ksouris (Grec, Anglais)
- Hannu Saarenmaa (Finlandais, Suédois, Anglais)
- Larry Speers (Anglais)
- Maria Auxiliadora Mora (Espagnole, Anglais)
- Patricia Mergen (Français, Allemand, Anglais, Néerlandais, Luxembourgeois)
- Frédéric Wautelet (Français, Anglais)
- autres (veuillez nous contacter si vous voulez être ajouté à la liste sur base volontaire)
Lieux, Dates et Inscriptions
Voyez http://www.gbif.org/Support/training/schedule
Pour les conditions requises de la salle de formation, voyez : http://www.gbif.org/Support/training/hosting/classroom/#01.
Les participants sont encouragés à apporter leurs propres ordinateurs portables qui correspondent aux conditions requises.
Egalement des portables plus légers qui n'ont pas les conditions requises peuvent être apportés pour accéder au serveur,
mais ne doivent pas être annoncés lors de l'inscription.
Notes de versions
Version 0.7, 2004-02-17 Envoyez vos commentaires à Hannu Saarenmaa
Traduction française par Patricia Mergen
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